Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLima_04g0001120 OGI:04004240 | 16/16 LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:1424466-1433910
Gene Symbol OsSub33, SUB33
DNA seq

atgagcaagaatgaaattctatctcctagggatgtgaacggccatggcacacacacggccacaacagccggtggcaacatcgtccacaatgctagctgtcttggtctagctaccgggacagttcggggtggcgcgcctcgtgcacgagtagtcatgtacaaggcttgttggtctgggggtggctgctcaaccgctgatcagttgaaagctatggatgatgatgtccatgacggtgttgatatactatcactttctattggtggtccatttgaaaatcaaggaaccttgcacgtcgttgccaagggcatcccagttgtatacgctgctgggaatgatggacccatcgctcagacggtggaaaactcatcgccatggctgctaactgttgctgcagccaccattgatcggtcattccctgtggttatcaccttgggaaataatgataagtttgtggtatatatatcatttactgtcgagttgttcattccctgtgcagtttatttattctgacttgaacttgatctaattaaTtttcaccaatgtggtggtgcttgtaggcacaatcctttgtcgTttcagggaaaagtgcaagccagttcagtcagataaaactttacatgggagacgagtaagtgtgggaaagcaaatagtactaactaaaatagatgacaattaattcctctcatgttgttgaaggaacatatgtaaccgtgttatggatactacaagcatatggtacactaaattacgctcgcgatacatgaacttgtgctcgcgatacatgaacttgtgtagtgggtataaatagatacaacaatttgcaaattgctcacattaatataataactatctagctggtgcgaaccgggccaaaatgatccatacaagtaaaattgttctaaattagcacacacTGatgacataatagcatacacgtatgactgtgatttggagatcttatttctcatccaaataaaagagaaattagatgtgcaaaagtttaTTtttcatgtctaggatagagtatttatttcatttaatttcttcggaaaatttgatcctctatataattcgtgtaatgtttatttatatgttcaagaccacgacaatttttatctgtacaattatctcctaaaagaacattcattgaaagtgtatttttatgatcgggcattttttattattttgttttctcattggtctaaatcttgaaaATatcataataataataataataataataataataataataataataataataataataatacattgtcagtataaaattttgatgtgtaacattaattacacaccattatgtatcatattagattaattttacttgtgtgaattggtttggcctaggttcgcacgaactacccaagttattgtaccggattaaacaatttgcaagttgttgtatctatttacacctaccatacaagttatgtactatcaactcaatttactcaaaataaaaagaaaaaaaaaacgctcatgttcaccaacATatatagtactagtttatatatggataaatacatattatacattgtagaaatgatagttgtgtatgtttcaataaagtgaaaatgatgtggagataatcatttgacagtgcttgcatattgagttctaaaaatacaacaaaattaaaatgatatgttataTttgcctgataTttaaaatactctagataataattactaatgagtgataatgtggcacacttgtgatttaaaatactataacaattgctagtgggtaatgatttggcacacttgtatgttgagctttaagagttagtgggcactgatagggtatgaatattcatatgttaacaactcttactcctttattgagttgcatccactgctatagatctggatatccatgatggatcacttgtgactagtgaacatgatccataagagatgacttttctctaaaggatcaaaagtagctcatttaaaatatgtctattgggaatgatatgttgtatatataaggtcatctttaatggttcataattataatccttcatagatgatcgattacatatcacaactgtgaccaatcatagatggcatgtcatagtggtgcgaatgttatctttgatgggtggtagttacggttgtcggtgatgtgtgaaaatttaaatttttgaattttgcaaataatcttagatggagacctacgctacataaaaaagttgtagatctcaataatatcaacaactttatactccccccgtccaaaaatattagacttatttcatattttgatttttcgaaataagttagttataTttgaagtctacatgtatctaagacttagataaagagataaataaaaTaaaatgtttgatcgaaacccgtggagttaTCttaatactcattggttgcatgcatcctgcattcatacactcctttgatatctttattacatgaaagatgagttaattttctcagaatcttgataacaaaagtaatatgTtttttggatggagaaattaattggcaacatttagtttatactccctctgtctagcaatatatgggattattcccaattaagcacaaattaaggaagagaagaaagtatatacaagacatctattatgtgaaaagacaactatttgacatgttgagtgatctatagagagtacacatttgaaaataaactagtaaagtttgacaggagagaatgaatttaaaagtgcaccataggttaccattaatgcctttgtcagggccttatctgcttaaataagtttgctgctatccttgttgccttggtataacaaaaaatcctctatattcttgaacaaatgaagaggggattatcccctatattcttggacAGagggagtaattgacaatatttttatttgagatcatccacatacccgaatattcattataaaggttgaTttatttaaaaatgtacaaacgaccttttagttgatagcctctttatttgaagtcacctagagtgttaactatatcttactccctccatctcatagtataagaaattttgagtttttgcttgtagcgtttgaccacttatcttatttaaatttttttgaaattattatttattttatttgtgatttaatttattatccacagtattttaagcataactttttattttttatatttgtaaaaaaaattgaataagacgagtgatcaaatattataaacaaaaactcagaatcccttgtattatggaacagagggagtacatgatttagatagaaatagtgaataagacatcgagcagttatgctctctgtgtgagttggtaaggatgctcttcgcagagaggaaactctcgagtttgaaacttatcaaatgcatgcatgtctatatatattgctcgattaatcaaaatacttgtgggtactgtgtggtaccacgtacaggggctagtgatattaaaattattttcttagcTtttttttTGCATTTAACATTCAAAAATTGTCATTGCTAACTTTTCATCAGGGATGGTTCGTGAGTTACAACCCGTCGAAGTTGATTCTAGTACAGATAATTTATCCACCCATTATTGATGACTTATTTGTGTGATGGTTGTTTACCCGTCAGAGATGATATTTTGTCATCATTGACAACTCATCAGAGGCGAGGCCTATACCTGACATAGAAATGGCTTGTAACTCATCACAAATGAGGGATTCCTTGATTGTGATCATAGCAAATAAAATCTAGCTTCAACATCGTTTATGCTACTAGCGAGCGAGCACTCCAACAGAGAGTGAGTGTCTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTACCTACCTACCTACCTATCTATATGACCACTCATCCGTACACCCAGGTGTATATACTTTCCTTTTTAATGGATGATGCATTAGCATCCAAATTAACCGTAGAAAAATGTAAAATTATTAATTTTCAAATCACTGCATGCATGTGCACAGCTGCTCACTGGATTTGGTGCACATTTGAACGAGAGCGTTGGCATGCAGTTGCTTTGAAATTTTCTTTCCAGTATACTACATCGATCCGTACTGAATGAGTATATACTGTTTTTCTGTTTGATCAGTACATATACTACTTTTTCATATGCTCAGTATATTAGGTATTCTACGTTTTTGTTTGATACTGCACGTACTACTTttttgtttggtcagtatatactgaacatattactttttatgtttggtaagtgtatactgcatcatcgtggctaaaggagtttatactgcttttttgtttggtcagtatataccacgtagactactttataTTtggtcagtataatccactttgtggtatactggtagatacaatatactgttggaacgaccgaatgagtatacactgacatatcttggaatgaatatatactgattttttttaaacgagtatatactgacttatcttggaatgagtatgtactgatttttgtctgagtggatatgcactgatgagctgggctataccgaTttTATGAACTGAGATATACTGATTTCTACATATAATGAAAGGATGCAACTTTCCTTTGCCATTACATACTACAAATCTGGTTCATCCTTTTCTTTTTGTCAGTACATACTACAAATTAATCCATGTTCATAGTCCATTTTAGTCGTATATACTACATTTCTCAATGGAGCAGTATATACTTTTTTCAAGTACTTTTAGTACGTATATTTTTCTCCAAAGAAAGCAGTATATATGATCTTTTACTTAGTATATATACAACTGACTATATCATATCATAGATAAAAAAGACAGTATATAACAAAAAAAAAAGAGCAGTACATATTGTAGAAGAACGAGCATTATGTAATCATACTGAGTACTCGATCAAGGTATCATCGGCTTGACAGCACGAAGATGAATAATCATGTGCCATATATATATGGCCATTTAGCAGCAGTAATGGGAACTCGATCTAGCAGAAAAGAATGAGGAACGGCATGGC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CDS seq

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Protein seq

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Function Subtilisin-like protease SBT3.15 [UniProtKB/Swiss-Prot:F4JJL8]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLima_04g0001120 OsLima_04g0001120.01 Chr04 1424466 1433910 + NAM
CDS seq

atgagcaagaatgaaattctatctcctagggatgtgaacggccatggcacacacacggccacaacagccggtggcaacatcgtccacaatgctagctgtcttggtctagctaccgggacagttcggggtggcgcgcctcgtgcacgagtagtcatgtacaaggcttgttggtctgggggtggctgctcaaccgctgatcagttgaaagctatggatgatgatgtccatgacggtgttgatatactatcactttctattggtggtccatttgaaaatcaaggaaccttgcacgtcgttgccaagggcatcccagttgtatacgctgctgggaatgatggacccatcgctcagacggtggaaaactcatcgccatggctgctaactgttgctgcagccaccattgatcggtcattccctgtggttatcaccttgggaaataatgataaggaaaagtgcaagccagttcagtcagataaaactttacatgggagacgaCTAGACTACTACAACATCACCAAGGCAACGGGTGAGAAAGGAGGAAAAGGGGTGATCTTGCCTCAGTACAACACCGACATACTGCTGGGAGATGACCTCCTCACTTTGCCCATTCCCTTTGTCCCAGTCGACTACGAGATCACCTACAGGATATACCAGTACATCAAcggagaaaatgatggcacaccaaaaatgaagatatcattcacccgaacaaccattggaactgaagtttctgcccccaaagtagcagttttctcgtcgagggggcccagtcctatctatcctggggttctcaagcctgacattgctgcaccaggtgttacggttttggcagctgcaccaaaggcttttatggatgcaggaatcccgtaccgtttcgactctggaacatctatgtcttgcccccatgtgagtgggatcattgcggtactcaagtctttgcatcctcaatggtcaccagctgctctcaaatccgcaatcatgactacagcacttacctatgacaactacggtatgccgatacaagctaatggaaaacttccAaagattgccgatcctttcgattatggagcagggtttgttaatccgaacatggcaactgatccaggcctcatctatgacatcgacccgttagattacttcaagttcttcaattgcatggcaggattaggctcaggggacaattgcaccacagcaaaaggatcacttgctgacctgaacctcccgtccatcactatacccaacctcaggacgtaccaggctgcaacacgcacagtcaccaatgtcggccaggacaatgcagtgtacaaggcgttcctccagcccccggacggtgttgagatggccgtcaagccggcggttctggtgttcagcaaggagaaggtgcagagcttcaaggtgacctttaaggtgacgaggaggcagactcaaggggactataggTTtggaagcttggcatggcacgatggtggcgaccactgggttcgaatccccattgcggttcgcattgtgattgaagatatctactccaagatctcctaa

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0120300 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g03796 SBH 2.413355 0.741397 0.523150
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0126600 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0001000 SBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0000960 SBH 0.0 0.000000 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0001030 RBH 3.400398 0.0 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0001060 SBH 0.0 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0001130 SBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0024700 SBH 4.3762215 0.0109265 0.5569105
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0001150 SBH 0.000000 0.0 0.025580
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0023800 SBH 0.6319025 0 0.02575
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0001030 SBH 0.021065 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0001110 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0001240 RBH 2.105212 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0000960 SBH 0.146996 0.0 0.446234
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0001150 RBH 0.030854 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G001070 SBH 0.102419 0.0 0.128318
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0001120 SBH 0.305872 0.0 0.0
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