Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsIR64_04g0001150 | OGI:04004240 | 16/16 | IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:1415988-1445622 | ||||||||
| Gene Symbol | OsSLPP1, SLPP1, OsSub33, SUB33, OsSub34, SUB34, OsSub35, SUB35, OsSub37, SUB37, OsSub38, SUB38 | ||||||||||
| DNA seq | 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Transcripts
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| CDS seq | ATGTGGAGGCTCTCAAGGCCGTCTCTTCTTCTCACCTTTCTTCTCCACTTATTGCTTCAAACGGCATGGTCGTTGCACGCTCTAAAGCAGAGCGAACCACCAAGGAAGATATACATTGTCTACCTTGGGGAGAGAAAACACGATGATGCTGATCTTATCACTGATTCCCATCATGCCATGCTCACCTCTGTTCTGGGAAGCAAGGAGGAGGCTCTCGAGTCTATTGTGTACAGCTACAGATACAGTTTCTCTGGCTTTGCTGCAAGGCTCACAAAAGCACAAGCGAGCAAGCTACGGCGGTTGTCAGATGTGGTCAGCGTGAAAGAGAACCAAATCCACCAAATGCATACCAGTCGAAGCTGGGATTTTCTTGGAATGGACTACAGGCAACCAAATGGCCTGCTTGCTAAAGCTAAATATGGGGATGGCACTATAATTGGTGTCATTGACACAGGTATCACGCCTGAGTCAGCAAGCTTTGCCGATATTGGATATGGCCCCCCGCCAACCAAATGGAAAGGGATTTGCCAGGTTGGCCCATCGTTTGAGGCCATAAGTTGCAACCGGAAGCTTATCGGTGCACGGTGGTACATCGATGACGAGATTCTAAGTAGCATATCCAAGAACGAGGTTCTTTCTCCTAGGGATGTCGAAGGCCATGGCACGCACACAGCCTCAACGGCTGGTGGCAACATTGTCCACAATGTTAGCTTTCTGGGGCTAGCTGCAGGGACAGTTCGGGGTGGAGCGCCCCGTGCACGATTAGCCATATACAAGGCCTGTTGGTCCGGTTATGGCTGCTCCGGTGCCACCGTGTTGAAAGCCATGGACGACGCTGTCTATGATGGTGTTGATGTCTTATCACTTTCTATAGGTGGTACAAAAGAAAATGTGGGAACCCTACATGTCGTCGCTAATGGTATCTCGGTTGTCTATGCTGGTGGAAATGATGGTCCCATTGCTCAGACGGTGGAGAACCAATCACCATGGCTAGTAACGGTCGCTGCAACCACCATTGATCGGTCCTTCCCTGTGGTTATCACCTTGGGAAACGGCGAAAAGTTGGTGGCGCAATCCTTTGTCCTCCTGGAAACTGCAAGTCAGTTCAGTGAGATACAGAAGTACACAGACGAGGACACGGTGAAGGGGAAAATAGCCTTCTGCTTCATGGGAGAGATGTTGAATGATAAGCAGCAGACATCATACCCTGATGTCACCACGGCAGTGGCAGCCAAAGGAGGCAGAGCAGTCATCTTGCCGCTGTTCTACACCGAAACAATTCTCCAAGATGATCCCATCATCACTGATTTGGATATTCCGTTTGTCCCTATTGACTATGAGATGGCCCAAAGGATTGACGAGTACATCAGCAATGGTATAAATGGTAATTATATCCCAAGGGCAAAGATATCATTAACCCAAACGAGGATTGGAGATGAAATTTCTGCCCCAAAAGTCGCAGTTTTCTCATCGAGGGGGCCTAGTTCTATCTATCCTGGTGTTCTCAAGCCGGACATTGCTGCACCAGGGGTTTCGATTTTAGCCGCTGCTCAGATTCCATATTACAAAGGTGTTTCCTACCATTTCGATTCTGGAACATCTATGGCTTGCCCCCATGTAGCTGGGATCATTGCGGTGCTCAAGTCCATTCATCCAAAATGGTCACCTGCGGCTCTCAAATCCGCAATCATGACAACAGCACTTACATATGACAACAACGGGATGCCAATACAAGCTAATGGAAGAGTTCAAAAGATTGCTGATCCTTTTGATTATGGAGCAGGGTTTGTTAATCCGGTCATGGCAGCTGATCCAGGCCTTATCTACGACATCACCGCATCTGATTACCTCAAATTCTTCAACTGCATGGGAGGATTAGGCTCAGGGGACAATTGCACCACAGCGAAAGGATCACTTACTGACCTGAACCTCCCATCCATTGCCATCCCTAACCTCAGGACATTCCAAGCTATGACACGCACTGTCACCAATGTTGGCCAAGTTAATGCCGTGTATAAGGCATTCTTCCAAGCTCCAGCTGGTGTCGAGATGGCCGTCGAGCCACCAGTGCTGGTGTTCAACAAGGACAGAAGAGTGCAGAGAAGAGTGCAGAGCTTCAGGGTGACCTTCAAGGCTACACGAAAGGTGCAGGGTGACTACAGGTTTGGAAGCTTGGCATGGCATGATGGAGGCAGCCACTGGGTTCGGATCCCCATCGCCGTTCGTATCAGACGACACGATGATGCTGATGTCGTCACTGGTTCCCACCATGACATGCTCGCCTCTGTTTTGGGAAGCAAGGAGGTGGCTCTTGAGTCCATCGTGTACAGCTACAGACATAGTTTTTCTGGCTTTGCTGCAAGGCTCACAGAAGCACAAGCGAGCACGATACGAGATGTGATCAGCGTGAGAGAGAACCAAATCCACCGGTTGCATACGAGTCGAAGCTGGGATTTCCTTGGAATGGACTACAGACAGCCAAATGGCCTGCTAGACAAAGCTAAATATGGGGAAGATATTATTATTGGGGTTATCGACACAGGTATCACACCTGAGTCACCAAGCTTCGCTGATGATGGATATGGACCCCCTCCATCCAAATGGAAAGGAGTTTGCCAAGTCGGCCCTTCGTTCAAAGCAAAAAGCTGCAACCGAAAACTTATCGGTGCACGGTGGTACATCGATGATGATACTTTAAGAAGCATGAGCAAGGATGAAATCCTATCTCCCAGGGATGTGGTTGGCCATGGAACACACACGGCTTCGACGGCCGGTGGTAACATCATCCACAATGCTAGCATTCTTGGGCTAGCAGCTGGGATAGTTCGGGGTGGCGCGCCCCGTGCACGAGTAGCCATGTACAAGACATGTTGGAATGGTGTTGGCTGCTCCGCCGCCGGTCAGTTGAAGGCCATAGATGACGCTATCCACGATGGCGTTGATATATTATCACTTTCTCTTGGTGGCCCTTTTGAAGATCCAGGCACCTTGCACGTTGTTGCTAAGGGTATCCCTGTTACAGTGGAGAACTCATCACCGTGGCTGCTTACAGTTGCTGCGGCCACTATGGATCGGTCATTCCCTGTGGTTATCACATTGGGAAATAATGACAATGCTGAGAATATCCACAACACAGTGAAGGGGAAGATCGTCTTCTGCTTCTTTGGAACGAAGTTCGATTCGGAGCGAGATTACTATAACATCACCAAGGCAACGAGTGAGAAAGGAGGAATAGGGGTGATCTTGCCTAAGTACAACACCGACACACTACTGGGGGACACCCTCCTCACTTTGCCTATTCCCTTGGTCGCAGTTGATTATGAGATCACCTACAGGATATACCAATATATCAAAGAAAACGATGGCACCCCAAAAGTGAAGATATCATTAACCCAAACAACTATTGGAAAAGTTTCTGCTCCCAAAGTAGCAGCTTTCTCGTCGAGGGGGCCCAGTTATATTTATCCTGGGGTTCTCAAGCCCGACATTGCTGCACCAGGTGTTACGGTTTTGGCAGCTGCACCAAAGGCTTTTATGGATGCAGGAATCCCGTACCGTTTCGACTCTGGAACATCTATGTCTTGCCCCCATGTGAGTGGGATCATTGCGGTACTCAAGTCTTTGCATCCTCAATGGTCACCAGCTGCCCTCAAGTCTGCAATCATGACTACAGCACTTACCTATGACAATAACGGGATGCCGATACAAGCTAATGGAAAAGTTCCAAAGATTGCCGATCCTTTCGATTATGGAGCAGGGGTTGTTAATCCAAACATGGCAGCTGATCCAGGCCTCATATACGACATCGAACCATCAGATTACTTCAAGTTCTTCAACTGCATGGGAGGATTAGGCTCAGCGGACAATTGCACCACAGTGAAAGGATCACTTGCTGATTTGAACCTCCCGTCCATCGCCATCCCCAACCTCAGGACATTCCAGGCCACAACGCGCACCGTCACCAATGTTGGCCAGGCCAATGCCAGGTACAAGGCGTTCCTCTACCCCCCTGCTGGTGTCGAGATGACCGTCGATCCGCCAGTGCTAGTGTTCAGCAAAGAGAAGAAGGTGCAGAGTTTCAAGGTGACCATCAAGGCGACGGGGAGGCCAATTCAGGGGGACTATAGCTTTGGAAGCTTGGTGTGGCACGATGGCGGCATACACTGGGTTCGGATCCCAATTGCAGTTCGCATCTTGCCTTTCGTTACTTGCAACCCACATCTTACCAACCCTTTTTTCCAACACAACAACAGTGAAAGTGGTAGTTACGTCCCAAAAGCGAAGATATCCTTAACCCAATCTACAATTGAAGGTGAAATTTCTGCTCCAAAAGTCACAGCTTTCTCACTGTGGGGGTGTAGTTCTATTTATCCTGGTGTTGTCAAGATGGACATTGATGCACCACGGGTTTCAGTTATAGCCACTGCTCAGACTTCTTATGACAATGGTACCCCCTACCACATTAGTCCTGGAACATCCATTGGGATCATTGCTGTGCTCAAATCCCTGCATCCTCAATGGTCACCTGCCGCCCTCAAATCCACTATGATGATAACAGCAACTACCTATGACAACAACAGGATGCCAGTACGAAACATCCCAAAGGTTGCCGACCCTTTCGATTATGGAGCAGGTTTTATTAATCCAAACGTGGCAGCTGATCTAGGGCTCATCTATGACATCGCTGCATCTAACTATCTCAAGTTCTTCAACTGCATTGGAGGATTAGCCACAGGGGACAACTGCACAACGGCGAAAAGATCACTTGCTGACCTAAACCTCCCGTCCATTGCCATCCCCAACCTCAAGACGTTCTAG
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.000000 | 0.0 | 0.025580 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0120300 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g02980 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0121200 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0001010 | RBH | 0.076834 | 0.000000 | 16.435106 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0001060 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0001040 | RBH | 0.316864 | 6.007484 | 26.197163 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0001060 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0001020 | RBH | 1.103219 | 0.0 | 4.025638 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0024700 | RBH | 4.3762215 | 0.0109265 | 0.5569105 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0001160 | RBH | 0.000000 | 0.065039 | 2.071361 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0023800 | RBH | 0.6319025 | 0 | 0.02575 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0001010 | RBH | 0.036820 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0001300 | RBH | 0.0 | 2.367193 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0001210 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0001090 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.189317 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0001270 | RBH | 0.016501 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G001240 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0001250 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
