Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLiXu_Ung0043290 OGI:08027770 | 13/16 LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) ChrUN-Ctg321:14570-38478
Gene Symbol -
DNA seq

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Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLiXu_Ung0043290 OsLiXu_Ung0043290.01 ChrUN-Ctg321 14570 38478 - NAM
CDS seq

ATGGATACAAGGCCCATAATCCATGACACCTGCTCCGGCGGATCTGGCGGCGCCGTCGCAGAGGCGAAGGACAGCGGCGCGCCAGAGGCGGAGGGCCCGTCGGCCAGGCCGGCAGCGAGGCGGTGGCGGAAGCCGCGGAGGCAGGCCGGCGTGGATGGGGTCGGTGGAGGTGGCGGCGACCTGGTACGACAGCGGGAGGGAGTCAATGCGAGGGGGTTCAGGCAAGGGAGTCAATGCGAGGGAGTTCAGGCGAGGCTGGCGGCGTGGCTCGCACCGCGGCGGCTCCTCTCCTCCGGCGGCAAGGTGCTCGGCGAGGAGGAGAAGGCTGCCGAGAACATCTACATCAAGCTCTAG

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Protein seq

MDTRPIIHDTCSGGSGGAVAEAKDSGAPEAEGPSARPAARRWRKPRRQAGVDGVGGGGGDLVRQREGVNARGFRQGSQCEGVQARLAAWLAPRRLLSSGGKVLGEEEKAAENIYIKL

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.000000

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_08g0009010 SBH 0.516940 0.000000 2.574315
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_08g0009060 SBH 0.0 0.0 1.054948
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_08g0009030 SBH 0.142248 0.310218 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_08g0008970 SBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0009050 SBH 0.436637 0.757534 1.420534
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_08g0008580 SBH 0.009361 0.263181 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_08g0008770 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_08g0008610 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_08g0009320 RBH 0.0 0.094419 0.278390
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_08g0008750 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_08g0008790 SBH 0.0 5.253487 0.000000
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