Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLiXu_11g0022990 | OGI:11077650 | 16/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:30367024-30394690 | ||||||||
| Gene Symbol | YR2, YR6, YR9, YR10, YR21, YR23, Osh359-2 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Putative disease resistance protein RGA4 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA39] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLiXu_11g0022990 | OsLiXu_11g0022990.02 | Chr11 | 30371563 | 30394689 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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| CDS seq | atggagcaagtgcaatcaccaagattggacccgaatttgttggctgctgggagggtaatctcagatccacagaggcagttgctttccccaagcttgaagagttggtcattgtggatatgcccaactgggaggagtggtcctttgttgaagaagaagaagtgcaggaggaggaagcagctgcagcagccaaggaagggggagaggatggaactgctgcttcgaagcaaaagggggaggaagccccgtcttcaaggtcgtcatggctgctgcctt
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| Protein seq | MEQVQSPRLDPNLLAAGRVISDPQRQLLSPSLKSWSLWICPTGRSGPLLKKKKCRRRKQLQQPRKGERMELLLRSKRGRKPRLQGRHGCCL |
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 1.870009 | 0.0 | 3.727034 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0676200 | SBH | 0.035527 | 0.072868 | 0.057889 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g44990 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0676200 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0023770 | RBH | 0.136767 | 3.948730 | 1.835728 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0023450 | RBH | 0.000000 | 0.906361 | 0.296845 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0023110 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0023010 | RBH | 0.279679 | 0.317584 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0023160 | RBH | 0.0 | 1.116425 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0410200 | SBH | 0.016715 | 0.3187185 | 0.003874 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0023940 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0431800 | RBH | 0.0247405 | 3.3243495 | 0.4231555 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0023780 | RBH | 0.0 | 0.141676 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0023790 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0023370 | RBH | 5.354241 | 22.313065 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0022900 | RBH | 0.169465 | 0.0 | 0.076431 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0023160 | SBH | 1.000644 | 37.502644 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G023580 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0023800 | RBH | 0.0 | 5.158051 | 0.000000 |
