Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsLaMu_10g0008620 | OGI:10038890 | 15/16 | LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr10:13234929-13245293 | ||||||||
Gene Symbol | OsHDMA704, HDMA704, OsPAO11, PAO11 | ||||||||||
DNA seq | tcatgtcattgtgtaatcgatcgaagcctcttttatacattcttcatactttcccggcacatagcatttccatatccctccattggcaccgtctttttgacgctggccttccttgacacactcgatcagaatgtttgccgaggccttgcctatggagaaaagatttcacagatattaaatctgtacatatattgttaattaagtatataagtgttagtgtgtcatgcataggtgttttaatctttttccatactactgtacatttatctatatcttcaacaaagttacagcccattattagtaattattagtacactcaacatacaaacaaggtaattattagtacacctaaagactaacatgcaaccataccacgtcaatccactaatcatctaaacatcaacatgcatgcatattaattacatctataattcattacggtcaatgttaactataggcatacctcctatacatgggttgtggaatacgacaataccatatacctaataaatagtatacgagaagatatccttttaataaggaaatacaatagataaaaaggaaattattctcgaaatagaaggagttaaagtcctagtacaagaagataaggtctccttattccgtatcctgttctatttttctgagttctacttgaagaggaatatgatctcactgtaaatacaagacgccctaggaggagagaggtcatgccaagtcagaatacaagccaatacagatctagacaaatcaagggtaagtctagacatacccaatttggagccacacaggtcgacatgaggaatctagggctagccccaatctcgtcgagttcatattcgagaaggaaaactagattaggtcagtactcgtgtgatacggataaaggcaacaccggtatcggccaacgagagtagggctattacctatcaattaaagagatccgaacctgtataaaaaatattgtctcaatctcgtgtataccctggatccaacgatcccatgctctacaaacaccttagtcgggatatccatcttcgacaattacattctaaaccttaacatataagcatgctaaattatcatttctcataccattttcataatatttcaagccaaaccaaatccgtccatcagttttatactgtttaatatatattcatctaatattaaaccatgtataccacagcaaaacagggctttatctatttatatgatctattgaccctttgtcaaggcaattattatatatatataaatataTGtgtgtgtgtgtgtgtttattgacccagtttagttccaactttttcttcaaactttcaattttagtgtggaactaaacacacccatagttgaaaaggcatgcatgtggaaatcactgacctgcaagatatgctccatgaacataaccattgtagtgttggctcgtgtgctcaccagtgaagtacaccctcccaacgggtgccttaaaaaaaaagtaacagtaaaaataagataaatcagaatgacgaatggaacgtaatatatatatgcaggaatttgaagcctagagacaatttgtcatttaaactaaaactgaaaccgaatttcttttcgtgcgcaatatacatcatttatgtcgtgcataccctaatcagatcatattcgtagcgatcgacgccgatgggccagttggagaaactgcccctgaagaacctgtctgaccaccaccgcgggacaaggatgtcagtggcttccggcacatcctcacttgggaacatcttcctcaacacctccctggcttctgcctttgtcttctcgtctggttgctgctcgatccgcctcgactcgtcgtcggtgacagtaacaagaaggatgttggtaccagggtactcattctcaagatgctgcaagcaagcgatcagataacctcgatattatttatgatttacagtaaatcaacaagacttggaatgtcttgattactactttctcctttttaggttataagactttctagcattgttcacattgtctagattcattaacttccatatgaatgtggacaatgttaaaaggtcttataatataaaattataatatgaaacggaggtagtaaaatgtttgagatctttctacagcttcctaaatcagtaagctctgacaaattaatatatatatagttcctcttccaaaatatatagtccctctattccaaaatatatggtacaaatatacatgctcaagatagtgtacggtaatgcgttagtcctaacctgagatcactctatcccatatataaatcccgctttagctaaaaaaaatacaatggtacatgtctttttaaggtctttaatgacttatatcttttaaatcacattatttttaatctatttgcatcattgtactctactcaaaatatatgagaaaacgagatccatgtttaaaatattcaaacattttattactttaaaagtaatttatttaaattgtagaaataacttagatatgcaatataagtaactctttataacattaaaagtaattatattatgactgagttatagtaagaagctatgtggtgtaaattcacaagcaaaatgtagagaagatttatacaattatgaaagtgaattcaataaagtctaaaagtaatttacataaattataaaagtaacttagcacaaaatggaagtaaattgtcaacattagacgtaaattcattgtatggataaaaacatgggtctatctaaaaatctaatttaatcagcacaaattataaaatttgactaaaaaataataataaaagtaatcaactcagagcattattattaatatataagaagtaatttaatcaaatctaaatgtaatttatatatatgaacaaagtaacttacatatataataaaaataatttacaaacataaatatcttttcatcataatataataatgtaagatcttgttataaagatttaattgcaacgacgaacacaatgaacacaatggtgtaatcagattatagatctgataagtaatttaagaaaaaaaatttataagaaggaagaatagacatgtatatgacatagtaatagcaaagaagacatgcatgtctttagatgcctagtggtacttctctaatgtatgtggcatccaggacacctactgggcgagagcgcgccagcagcttaagccacggaaacacggcccgcgctcgcacacgatagcccttgattcagatcttaattttatttttgaaaacatacacacgtaattcagttaaaagttttttaaaaatatatcaaagttttaaatttatagttgaaatattttaaaattggagtaaaaagtttctacaatttgatttgatattttttgagttgaaagttttcaattattaaatgaacgttttgaaatttgagttgaaagttttcaattattggatgaaagttttaaaatttgagttcaaagttttaaaatctggacgtaaattttgaattttgagtttaaggttttaaatttgagttgaaaattttatattttgacttgaaagttttaaaattttgagtcaaaaatttaaaatttaagtaaaaaaaactgtacactatttttttggaaatattctgggttgattaTttttaaaatcaagctaagcattttaaaatttccggtacaaactaagtggagctaaaaaaatcaaaaattaaatctaatctatttaaatataaaaaggaatataagacaactgcctgcatgcgtgacttgtgaaaaacagtacgtacacgcgaattagtcacccatgtggcgtctcccattaagcctacatcgagaggcttaatatcttggtgttatattttggaaaggggggagtaagagaggaagttaattttgtgttggctgaagattaattcctatttttgtattgatcatctaaaattgccaaatcaatggtaacttcaaactagttgtggtgatgaactactggtgcttgcttggcatgatcgaacttgttaattacctgccatactgggaagtatcccctcctgctgctcgcatagaggaaaaactccgtgcccggtccatcaggccagaatttcctagggaacttgaggaagatcttcgtgtacaccgccatgtcgaattggtacatcgccatgttcttccattgctggtgaagcatatatatatcacatagtaaaaaattaatttaggaccacatatatgatcttagaaaaggcggagtcaagaaattaaagaactcaaccaagaactaataactgtcacttctcattgtctgaaaaaagaaaaaaaaagttttgttctgaagaagaactagttaggacaggaattgatcacggactggtaggtgtggcttgaaccgtatgagattgctctgcaggacgcctatgctgacggagaccatgacatagtcagccttatacaaccaaccatcctccgtcttcaccaccacgccgtctgatgtgtactttatcttcttcaccgcctagcaacccatgtagaaaaagtgaatccagagaagtctagtcgaaggatgattacttcaagaatatagaaaagaagtgaaatcacttccattattttaaaaagaaactagtacagaaccggacatcccaatcggtctattcgttatggaggcgagtgacccacactactaaaaaaagggtttttgcaaacgaccagatctgatttttgcatgcggacagatgatccgcatgcacgagaaggtctgcaaaaatacagatttttgcatgcggccagcacaaccgtatgcagaaattagattttcgcatacggatacttaagccgacacttaagccaactgggtttggttgctgcccattaaggtcatcggtgatgagccgcaacaaaacccggcccgttagcgaccgatgaccctcaatctttgttggggtttgattttgacccattacgaataacctatggtataaatagccccaagacattctaagaacaatatccgaacccagtgaactgttcata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Function | Polyamine oxidase 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64411] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLaMu_10g0008620 | OsLaMu_10g0008620.01 | Chr10 | 13234929 | 13245293 | - | NAM | ||
CDS seq | atgctgtcgcatgccgggatcaccgacttgctgatcctggaggcgacggaccgtatcggcggccggatccggaagacggagtttgccgggatgaatgtggagatgggagctaactgggttgagggggtgaacatggaccctgctgacaagatcctcaaggaggttaaccccatctggagcatggtccatcacaagcttaagctcaacacctccctgtctaattacagccacctttcctccaacacctacatggaagaaggcgggcttcatgacaaaagctttgttcagaagacaattaacagggccagtgaagtgcagcaatatggggacaaactttcaagcaaactacacaatgaagatattacagtgatggccatgcaacgcttccatgatcacatgccatacggcccaacgaaaccggtggatatggtgattgactactacatgaatgactacgaattcgccgagccaccgcgtgtgacaagcttgcaaagcacccatcctcttccgacttttgcaaactttggcgatgatgtctgcttcgttgctgatcagcggggctttgaatcggtggtacattacattgccagcaagtatctcaagaccgatgctcgtactggtgccgttgttgacccaaggctcatgctgaacaaggcggtgaagaagataaagtacacatcagacggcgtggtggtgaagacggaggatggttggttgtataaggctgactatgtcatggtctccgtcagcataggcgtcctgcagagcaatctcatacggttcaagccacacctaccacaatggaagaacatggcgatgtaccaattcgacatggcggtgtacacgaagatcttcctcaagttccctaggaaattctggcctgatggaccgggcacggagtttttcctctatgcgagcagcaggaggggatacttcccagtatggcagcatcttgagaatgagtaccctggtaccaacatccttcttgttactgtcaccgacgacgagtcgaggcggatcgagcagcaaccagacgagaagacaaaggcagaagccagggaggtgttgaggaagatgttcccaagtgaggatgtgccggaagccactgacatccttgtcccgcggtggtggtcagacaggttcttcaggggcagtttctccaactggcccatcggcgtcgatcgctacgaatatgatctgattagggcacccgttgggagggtgtacttcactggcaaggcctcggcaaacattctgatcgagtgtgtcaaggaaggccagcgtcaaaaagacggtgccaatggagggatatggaaatgctatgtgccgggaaagtatgaagaatgtataaaagaggcttcgatcgattacacaatgacatga
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0 | 0.0 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_10g0532100 | SBH | 1.888328 | 2.340761 | 4.969584 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | NA | NA | NA | NA | NA |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os10g0532100 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_10g0008240 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_10g0008290 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_10g0008180 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_10g0008490 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_10g0008340 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_10G0199700 | RBH | 0 | 0.0292995 | 0 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_10g0008300 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_10G0213500 | RBH | 0.0282515 | 0 | 0 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_10g0008100 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_10g0008120 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_10g0008520 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_10g0008060 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_10G008330 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_10g0008330 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |