Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLaMu_10g0008620 OGI:10038890 | 15/16 LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr10:13234929-13245293
Gene Symbol OsHDMA704, HDMA704, OsPAO11, PAO11
DNA seq

tcatgtcattgtgtaatcgatcgaagcctcttttatacattcttcatactttcccggcacatagcatttccatatccctccattggcaccgtctttttgacgctggccttccttgacacactcgatcagaatgtttgccgaggccttgcctatggagaaaagatttcacagatattaaatctgtacatatattgttaattaagtatataagtgttagtgtgtcatgcataggtgttttaatctttttccatactactgtacatttatctatatcttcaacaaagttacagcccattattagtaattattagtacactcaacatacaaacaaggtaattattagtacacctaaagactaacatgcaaccataccacgtcaatccactaatcatctaaacatcaacatgcatgcatattaattacatctataattcattacggtcaatgttaactataggcatacctcctatacatgggttgtggaatacgacaataccatatacctaataaatagtatacgagaagatatccttttaataaggaaatacaatagataaaaaggaaattattctcgaaatagaaggagttaaagtcctagtacaagaagataaggtctccttattccgtatcctgttctatttttctgagttctacttgaagaggaatatgatctcactgtaaatacaagacgccctaggaggagagaggtcatgccaagtcagaatacaagccaatacagatctagacaaatcaagggtaagtctagacatacccaatttggagccacacaggtcgacatgaggaatctagggctagccccaatctcgtcgagttcatattcgagaaggaaaactagattaggtcagtactcgtgtgatacggataaaggcaacaccggtatcggccaacgagagtagggctattacctatcaattaaagagatccgaacctgtataaaaaatattgtctcaatctcgtgtataccctggatccaacgatcccatgctctacaaacaccttagtcgggatatccatcttcgacaattacattctaaaccttaacatataagcatgctaaattatcatttctcataccattttcataatatttcaagccaaaccaaatccgtccatcagttttatactgtttaatatatattcatctaatattaaaccatgtataccacagcaaaacagggctttatctatttatatgatctattgaccctttgtcaaggcaattattatatatatataaatataTGtgtgtgtgtgtgtgtttattgacccagtttagttccaactttttcttcaaactttcaattttagtgtggaactaaacacacccatagttgaaaaggcatgcatgtggaaatcactgacctgcaagatatgctccatgaacataaccattgtagtgttggctcgtgtgctcaccagtgaagtacaccctcccaacgggtgccttaaaaaaaaagtaacagtaaaaataagataaatcagaatgacgaatggaacgtaatatatatatgcaggaatttgaagcctagagacaatttgtcatttaaactaaaactgaaaccgaatttcttttcgtgcgcaatatacatcatttatgtcgtgcataccctaatcagatcatattcgtagcgatcgacgccgatgggccagttggagaaactgcccctgaagaacctgtctgaccaccaccgcgggacaaggatgtcagtggcttccggcacatcctcacttgggaacatcttcctcaacacctccctggcttctgcctttgtcttctcgtctggttgctgctcgatccgcctcgactcgtcgtcggtgacagtaacaagaaggatgttggtaccagggtactcattctcaagatgctgcaagcaagcgatcagataacctcgatattatttatgatttacagtaaatcaacaagacttggaatgtcttgattactactttctcctttttaggttataagactttctagcattgttcacattgtctagattcattaacttccatatgaatgtggacaatgttaaaaggtcttataatataaaattataatatgaaacggaggtagtaaaatgtttgagatctttctacagcttcctaaatcagtaagctctgacaaattaatatatatatagttcctcttccaaaatatatagtccctctattccaaaatatatggtacaaatatacatgctcaagatagtgtacggtaatgcgttagtcctaacctgagatcactctatcccatatataaatcccgctttagctaaaaaaaatacaatggtacatgtctttttaaggtctttaatgacttatatcttttaaatcacattatttttaatctatttgcatcattgtactctactcaaaatatatgagaaaacgagatccatgtttaaaatattcaaacattttattactttaaaagtaatttatttaaattgtagaaataacttagatatgcaatataagtaactctttataacattaaaagtaattatattatgactgagttatagtaagaagctatgtggtgtaaattcacaagcaaaatgtagagaagatttatacaattatgaaagtgaattcaataaagtctaaaagtaatttacataaattataaaagtaacttagcacaaaatggaagtaaattgtcaacattagacgtaaattcattgtatggataaaaacatgggtctatctaaaaatctaatttaatcagcacaaattataaaatttgactaaaaaataataataaaagtaatcaactcagagcattattattaatatataagaagtaatttaatcaaatctaaatgtaatttatatatatgaacaaagtaacttacatatataataaaaataatttacaaacataaatatcttttcatcataatataataatgtaagatcttgttataaagatttaattgcaacgacgaacacaatgaacacaatggtgtaatcagattatagatctgataagtaatttaagaaaaaaaatttataagaaggaagaatagacatgtatatgacatagtaatagcaaagaagacatgcatgtctttagatgcctagtggtacttctctaatgtatgtggcatccaggacacctactgggcgagagcgcgccagcagcttaagccacggaaacacggcccgcgctcgcacacgatagcccttgattcagatcttaattttatttttgaaaacatacacacgtaattcagttaaaagttttttaaaaatatatcaaagttttaaatttatagttgaaatattttaaaattggagtaaaaagtttctacaatttgatttgatattttttgagttgaaagttttcaattattaaatgaacgttttgaaatttgagttgaaagttttcaattattggatgaaagttttaaaatttgagttcaaagttttaaaatctggacgtaaattttgaattttgagtttaaggttttaaatttgagttgaaaattttatattttgacttgaaagttttaaaattttgagtcaaaaatttaaaatttaagtaaaaaaaactgtacactatttttttggaaatattctgggttgattaTttttaaaatcaagctaagcattttaaaatttccggtacaaactaagtggagctaaaaaaatcaaaaattaaatctaatctatttaaatataaaaaggaatataagacaactgcctgcatgcgtgacttgtgaaaaacagtacgtacacgcgaattagtcacccatgtggcgtctcccattaagcctacatcgagaggcttaatatcttggtgttatattttggaaaggggggagtaagagaggaagttaattttgtgttggctgaagattaattcctatttttgtattgatcatctaaaattgccaaatcaatggtaacttcaaactagttgtggtgatgaactactggtgcttgcttggcatgatcgaacttgttaattacctgccatactgggaagtatcccctcctgctgctcgcatagaggaaaaactccgtgcccggtccatcaggccagaatttcctagggaacttgaggaagatcttcgtgtacaccgccatgtcgaattggtacatcgccatgttcttccattgctggtgaagcatatatatatcacatagtaaaaaattaatttaggaccacatatatgatcttagaaaaggcggagtcaagaaattaaagaactcaaccaagaactaataactgtcacttctcattgtctgaaaaaagaaaaaaaaagttttgttctgaagaagaactagttaggacaggaattgatcacggactggtaggtgtggcttgaaccgtatgagattgctctgcaggacgcctatgctgacggagaccatgacatagtcagccttatacaaccaaccatcctccgtcttcaccaccacgccgtctgatgtgtactttatcttcttcaccgcctagcaacccatgtagaaaaagtgaatccagagaagtctagtcgaaggatgattacttcaagaatatagaaaagaagtgaaatcacttccattattttaaaaagaaactagtacagaaccggacatcccaatcggtctattcgttatggaggcgagtgacccacactactaaaaaaagggtttttgcaaacgaccagatctgatttttgcatgcggacagatgatccgcatgcacgagaaggtctgcaaaaatacagatttttgcatgcggccagcacaaccgtatgcagaaattagattttcgcatacggatacttaagccgacacttaagccaactgggtttggttgctgcccattaaggtcatcggtgatgagccgcaacaaaacccggcccgttagcgaccgatgaccctcaatctttgttggggtttgattttgacccattacgaataacctatggtataaatagccccaagacattctaagaacaatatccgaacccagtgaactgttcata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CDS seq

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Function Polyamine oxidase 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64411]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLaMu_10g0008620 OsLaMu_10g0008620.01 Chr10 13234929 13245293 - NAM
CDS seq

atgctgtcgcatgccgggatcaccgacttgctgatcctggaggcgacggaccgtatcggcggccggatccggaagacggagtttgccgggatgaatgtggagatgggagctaactgggttgagggggtgaacatggaccctgctgacaagatcctcaaggaggttaaccccatctggagcatggtccatcacaagcttaagctcaacacctccctgtctaattacagccacctttcctccaacacctacatggaagaaggcgggcttcatgacaaaagctttgttcagaagacaattaacagggccagtgaagtgcagcaatatggggacaaactttcaagcaaactacacaatgaagatattacagtgatggccatgcaacgcttccatgatcacatgccatacggcccaacgaaaccggtggatatggtgattgactactacatgaatgactacgaattcgccgagccaccgcgtgtgacaagcttgcaaagcacccatcctcttccgacttttgcaaactttggcgatgatgtctgcttcgttgctgatcagcggggctttgaatcggtggtacattacattgccagcaagtatctcaagaccgatgctcgtactggtgccgttgttgacccaaggctcatgctgaacaaggcggtgaagaagataaagtacacatcagacggcgtggtggtgaagacggaggatggttggttgtataaggctgactatgtcatggtctccgtcagcataggcgtcctgcagagcaatctcatacggttcaagccacacctaccacaatggaagaacatggcgatgtaccaattcgacatggcggtgtacacgaagatcttcctcaagttccctaggaaattctggcctgatggaccgggcacggagtttttcctctatgcgagcagcaggaggggatacttcccagtatggcagcatcttgagaatgagtaccctggtaccaacatccttcttgttactgtcaccgacgacgagtcgaggcggatcgagcagcaaccagacgagaagacaaaggcagaagccagggaggtgttgaggaagatgttcccaagtgaggatgtgccggaagccactgacatccttgtcccgcggtggtggtcagacaggttcttcaggggcagtttctccaactggcccatcggcgtcgatcgctacgaatatgatctgattagggcacccgttgggagggtgtacttcactggcaaggcctcggcaaacattctgatcgagtgtgtcaaggaaggccagcgtcaaaaagacggtgccaatggagggatatggaaatgctatgtgccgggaaagtatgaagaatgtataaaagaggcttcgatcgattacacaatgacatga

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_10g0532100 SBH 1.888328 2.340761 4.969584
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os10g0532100 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_10g0008240 RBH 0.0 0.000000 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_10g0008290 RBH 0.0 0.000000 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_10g0008180 RBH 0.0 0.000000 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_10g0008490 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_10g0008340 RBH 0.0 0.000000 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_10G0199700 RBH 0 0.0292995 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_10g0008300 RBH 0.0 0.000000 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_10G0213500 RBH 0.0282515 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_10g0008100 SBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_10g0008120 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_10g0008520 RBH 0.0 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_10g0008060 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_10G008330 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_10g0008330 RBH 0.0 0.000000 0.0
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