Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLaMu_07g0018790 | OGI:07061800 | 16/16 | LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr07:22690681-22705585 | ||||||||
| Gene Symbol | SDRLK-41 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MAPVFFLLLFSQIFLCTAVDTINSTTPLSGMQKIVSKGGRFALGFYTPPQGNNTASGTGNYYIAIWYNNIPLQTTVWTANSDVPVSDPTTASLSIGSDGNLVLLDQSKNRQLWSTNVSVASNSTVAVIQDGGSLDLMDATNSSKVYWRSIDHPTNTWLPGGKLGLNKTTGVSQRLVPWRNNANPSPGLFSLELDPNGTTQYFIQWNDSITYWTSGPWNGNIFSLVPEMTAGYNYNFRFINNVSESYFIYSMKDDSIISRFTIDVNGQIKQWTWVPASENWILFWSQPRTQCEVYGLCGAYGSCNLNVLPFCNCIKGFNQKFQSDWDLQDFTGGCKRNVPLQCQTNSSSAQTQPDKFYSMVSVRLPDNAQSAVAASSQACQVACLNNCSCNAYTYNNSGCFVWHGDLINLQDQYNGNGGGTLFLRLAASELPDSKKSKKMIIGAVVGGVAAALIILAIVLFIVFQKCRRDRTLRISKTTGGALIAFRYSDLQHVTSNFSEKLGGGAFGTVFKGKLPDSTAIAVKRLDGLSQGEKQFRAEVSTIGTIQHVNLVRLLGFCSEGSRRLLVYEYMPKGSLELQLFHGETTALNWAIRYQIALGTARGLNYLHEKCRDCIIHCDVKPDNILLDESFVPKVSDFGLAKLLGRDFSRVLTTMRGTRGYLAPEWISGVPITPKADVFSYGMMLFELISGRRNADLGEEGKSSFFPTLAVNKLQEGDVQTLLDPRLNGDASADELTKACKVACWCIQDDENGRPTMGQVVQILEGFLDVNMPPVPRMAPPSKWKICSSFSFLILSIFHLYTSTSALTDTISRVQSLSGSTTVVSKEGNFELGFFSPGNTGNLYVGIWFRTTSKKAVIWVANRDNPVTSATSAELKISEDGNLVLLNKFGEPKWSSNGTWNKPRKSIVAVLLDNGNLILRDQGNSSDVIWQSFDHPTDTILSGQRFGINKITGEYQDRVSWKDPEDPAPGPFSNHVDLIRLNQYVSLWNQSKVYWQSGNWTGQAFTSIPGMPLNTEYNYVFINNSHQLKFIYTTKDVSIITRIVLTVNGQLQCHTWSNKSEEWIVQWSLPAALCDVYSVCGPFGVCKTGFDEKCYCLPGFRPVSSRSWDLGAWNQGCVRKTDISCVDSNKHNGQQEKHAFLKIANIKVPGNPMQLNVQSEEECRSICLNNCICTAYAHQHECIVWNSELRDLKQLSDGNVDAIDIYVRLAASDLQVQYNEHKTHHMRLIAVLGSTFVALCAFGAIIWTFRKRNATQKAFSNDDSLILYSYSFLQHCTKNFSDKLGQGSFGSVYKGSLPNSQMIAVKKLQGMRQGEKQFQTEVRALGRIHHTNLECHECIIHCDIKPENVLVDADFSPKVADFGLAKLMDRNFSRALTTMRGTIGYLAPEWIAGLPITSKADVYSYGMMLFEIISGKRNTELMESKTIKYFPVWAAVRISNGDISEVFDHRMHDTNVQELERACKVACWCIQDNEAHRPTMQQIVHILQGTRDVVLPPIPAFLQNLVEEYDPASYS |
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| Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64477] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLaMu_07g0018790 | OsLaMu_07g0018790.01 | Chr07 | 22690681 | 22705585 | - | NAM | ||
| CDS seq | atggctcctgtcttcttcctcctcctcttcagccaaatctttctctgcaccgcagtggacaccatcaactccaccacgccgctgtccgggatgcagaagatcgtctccaagggcggcaggttcgcccttggattctacaccccgccacaaggtaacaacaccgcctccggcaccggcaactactacatagctatatggtacaacaacataccgttgcagacgacggtgtggacggccaacagcgacgtgccggtgtctgacccgaccaccgcatccttgtccatcggcagcgatggcaatcttgtcctccttgatcaatccaagaacaggcagctgtggtcgaccaacgtaagtgtggcctccaactccaccgttgccgtcatccaggacggcggtagcctcgacctcatggatgccaccaattcatccaaagtctactggaggagcatagatcatccgacaaacacctggcttccgggcggcaagctggggctgaacaagaccactggtgtgagccagcggcttgtgccatggaggaacaatgcaaacccgtcccctgggctgttctcccttgagctggatcccaacggcacaacgcagtacttcatccagtggaacgactccatcacttactggaccagcggcccttggaacggtaatatcttcagtcttgtgcccgagatgacggccggttacaactacaacttccggttcattaacaatgtctcggagagctacttcatatactccatgaaggatgactcgatcatctcgcggttcaccattgatgtgaatgggcagatcaagcagtggacatgggtaccagcctcggagaattggatcttgttctggtcccagccacggacgcagtgtgaggtgtacgggctctgcggcgcatatggaagttgcaacctcaatgtcctgccgttctgcaactgcatcaaggggttcaaccagaagtttcagagtgattgggacctccaggattttactggtgggtgcaagagaaacgtaccgttgcagtgccagaccaactcaagctctgcacagactcagcctgataagttctattccatggttagtgtgaggctacctgataatgctcagagtgcagtggccgctagttctcaggcctgtcaggttgcttgcctgaataattgctcctgtaatgcttacacttacaataatagtggctgctttgtttggcatggggacttgattaacctccaagaccaatacaatgggaatggaggaggcacactcttcctcaggcttgcagcgtctgaacttccagactctaaaaagagcaagaaaAtgatcattggtgcagttgtaggtggagttgctgcagctttgataatccttgcaattgtgttgttcattgtattccagaaatgccgccgagacaggactcttcgcatatccaagactacagggggcgcactgattgccttccggtacagtgatctgcagcatgtcaccagcaacttctcagagaagctgggtggaggtgcctttggcacagtatttaaagggaagctcccagattcaacagccattgcagtgaagaggcttgatggactgagccagggggagaagcaattccgtgctgaggtaagcaccatcgggaccatccaacatgtcaatctggttcgcctacttggtttctgctctgaaggatcaagaagactgcttgtctatgagtacatgccaaagggctccctggaattgcagctgttccatggtgagacaacggcactgaactgggccataaggtatcaaattgcacttggaacagcaaggggcctaaattacctgcatgaaaaatgtagggattgcataatacactgtgatgttaagccagataacatactttTggatgagtcatttgtacccaaagtgtctgattttggtctagcaaagctcttaggGcgggatttcagccgtgttttgacaacaatgagagggacaaggggttaccttgcgcctgagtggatcagtggtgtgccgattactcctaaggcagatgtcttcagctatggcatgatgctcttcgaactcatatcaggcagaaggaatgctgatctaggggaggagggaaagtcctctttcttcccaactttggctgtaaacaaactccaggaaggtgatgtgcagaccttgttagaccccaggttgaatggagatgccagcgctgatgagctcacaaaagcttgcaaggttgcctgctggtgtatccaagatgatgaaaatggcagacctacaatgggtcaggtcgtccaaAttttagagggattccttgatgtcaacatgcctcctgttccaaggatggcccctcccagcaagtggaagatatgttcttccttttcttttctcatattatcaatcttccatctttacacaagtacttctgctttgactgatacaatctcaagagtccaatctctttctggtagtacaactgttgtctcaaaagaaggaaattttgagctgggattcttctctccaggtaatactggaaacctttatgttggtatatggttcagaaccacatcaaagaaggctgttatctgggtggccaaccgagacaatcctgtcacaagtgctacatctgcagagctcaagatatcagaggatggaaatttagtcctccttaacaagtttggagaaccaaaatggtcatcaaAtggtacttggaataaaccaagaaagtcaatagttgcagttcttcttgacaatggaaaccttattctgagggatcaaggtaactcttctgatgtaatctggcaaagctttgatcacccaacagacacaatactgagtgggcagagatttgggatcaataagatcaccggtgaataccaggatcgtgtttcttggaaagatccagaagatcctgcaccaggtcctttctccaaccatgtagatctaattagattgaaccaatatgtctctctctggaatcaatctaaagtttattggcagtctgggaactggacaggacaagcattcacatcgatccctggaatgccactaaatactgaatacaattatgttttcattaataatagtcaccagctcaagtttatatacaccacaaaggatgtatccataatcacaagaatagttcttaccgttaacggtcaactccaatgccatacatggtccaacaaatcagaggaatggatagtacaatggtctctacctgcagctctgtgtgatgtttattcagtctgtgggccttttggagtctgcaaaacaggttttgatgagaaatgctattgcctgccaggtttcaggccagtttcctcgaggagctgggatcttggagcatggaatcaaggttgtgttaggaaaacagatatctcttgtgttgactctaataaacataatggccaacaagagaagcatgcatttctcaagattgccaacatcaaagttccaggcaatccaatgcaattgaatgttcaaagcgaggaggagtgcagatccatatgcctgaacaactgcatttgtactgcatatgcacatcaacatgaatgcattgtttggaatagtgagctccgggatcttaaacaattgtctgatggtaatgttgatgctattgatatttatgtacgtcttgcagcatctgatcttcaagttcaatacaatgaacataagacacatcatatgaggctaattgcagtgctgggaagtacctttgttgcactatgtgcttttggtgcaataatttggacgtttcgaaaaaggaatgcaactcaaaaggctttctccaatgatgattctctcatcctatacagttactcttttttacagcactgcacaaagaatttctcagataagttggggcaaggtagttttggttcagtgtacaaaggatcactcccaaactctcaaatgatagctgtaaagaagcttcaaggaatgaggcaaggcgagaagcaatttcaaactgaggtgagggccttaggacgaattcaccacacaaatctggaatgccatgaatgcatcatacattgtgatataaaaccagaaaatgtacttgttgatgcggacttcagcccaaaagtggcagatttcggtcttgctaagcttatggatcggaattttagtcgggcactaacaactatgagaggaacaataggatatcttgcaccggaatggatcgcaggtcttcccatcacgtcaaaagcagatgtctacagctatggaatgatgttgtttgagataatttcaggcaaaaggaacacagaattgatggagagtaaaactataaaatactttcctgtctgggctgcagtcaggataagcaatggtgacatttctgaagtatttgatcatagaatgcatgacacgaatgttcaagagctggagagagcatgcaaggttgcatgttggtgcattcaggacaacgaggctcatagaccaacaatgcagcagatagttcatatcttgcagggcactcgagatgtcgtgttgcccccaataccggcatttctacaaaaccttgtggaagaatatgatcctgccagctactcatag
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| Protein seq | MAPVFFLLLFSQIFLCTAVDTINSTTPLSGMQKIVSKGGRFALGFYTPPQGNNTASGTGNYYIAIWYNNIPLQTTVWTANSDVPVSDPTTASLSIGSDGNLVLLDQSKNRQLWSTNVSVASNSTVAVIQDGGSLDLMDATNSSKVYWRSIDHPTNTWLPGGKLGLNKTTGVSQRLVPWRNNANPSPGLFSLELDPNGTTQYFIQWNDSITYWTSGPWNGNIFSLVPEMTAGYNYNFRFINNVSESYFIYSMKDDSIISRFTIDVNGQIKQWTWVPASENWILFWSQPRTQCEVYGLCGAYGSCNLNVLPFCNCIKGFNQKFQSDWDLQDFTGGCKRNVPLQCQTNSSSAQTQPDKFYSMVSVRLPDNAQSAVAASSQACQVACLNNCSCNAYTYNNSGCFVWHGDLINLQDQYNGNGGGTLFLRLAASELPDSKKSKKMIIGAVVGGVAAALIILAIVLFIVFQKCRRDRTLRISKTTGGALIAFRYSDLQHVTSNFSEKLGGGAFGTVFKGKLPDSTAIAVKRLDGLSQGEKQFRAEVSTIGTIQHVNLVRLLGFCSEGSRRLLVYEYMPKGSLELQLFHGETTALNWAIRYQIALGTARGLNYLHEKCRDCIIHCDVKPDNILLDESFVPKVSDFGLAKLLGRDFSRVLTTMRGTRGYLAPEWISGVPITPKADVFSYGMMLFELISGRRNADLGEEGKSSFFPTLAVNKLQEGDVQTLLDPRLNGDASADELTKACKVACWCIQDDENGRPTMGQVVQILEGFLDVNMPPVPRMAPPSKWKICSSFSFLILSIFHLYTSTSALTDTISRVQSLSGSTTVVSKEGNFELGFFSPGNTGNLYVGIWFRTTSKKAVIWVANRDNPVTSATSAELKISEDGNLVLLNKFGEPKWSSNGTWNKPRKSIVAVLLDNGNLILRDQGNSSDVIWQSFDHPTDTILSGQRFGINKITGEYQDRVSWKDPEDPAPGPFSNHVDLIRLNQYVSLWNQSKVYWQSGNWTGQAFTSIPGMPLNTEYNYVFINNSHQLKFIYTTKDVSIITRIVLTVNGQLQCHTWSNKSEEWIVQWSLPAALCDVYSVCGPFGVCKTGFDEKCYCLPGFRPVSSRSWDLGAWNQGCVRKTDISCVDSNKHNGQQEKHAFLKIANIKVPGNPMQLNVQSEEECRSICLNNCICTAYAHQHECIVWNSELRDLKQLSDGNVDAIDIYVRLAASDLQVQYNEHKTHHMRLIAVLGSTFVALCAFGAIIWTFRKRNATQKAFSNDDSLILYSYSFLQHCTKNFSDKLGQGSFGSVYKGSLPNSQMIAVKKLQGMRQGEKQFQTEVRALGRIHHTNLECHECIIHCDIKPENVLVDADFSPKVADFGLAKLMDRNFSRALTTMRGTIGYLAPEWIAGLPITSKADVYSYGMMLFEIISGKRNTELMESKTIKYFPVWAAVRISNGDISEVFDHRMHDTNVQELERACKVACWCIQDNEAHRPTMQQIVHILQGTRDVVLPPIPAFLQNLVEEYDPASYS
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.000000 | 1.440289 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_07g0553633 | RBH | 1.043140 | 0.000000 | 1.187818 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g36780 | RBH | 1.019066 | 0.818700 | 0.352990 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os07g0553633 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0019060 | RBH | 0.515142 | 5.935747 | 3.275156 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0018980 | RBH | 0.000000 | 0.527935 | 0.796439 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_07g0018950 | RBH | 0.538041 | 6.346584 | 6.634002 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_07g0018840 | RBH | 0.013028 | 0.021409 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_07g0018890 | RBH | 1.653443 | 9.811629 | 5.942275 |
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| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_07g0018730 | RBH | 8.575632 | 2.307000 | None |
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| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
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