Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsLaMu_01g0023390 | OGI:01013090 | 16/16 | LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:25039205-25056444 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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CDS seq | 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Function | Receptor-like protein EIX2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q6JN46] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLaMu_01g0023390 | OsLaMu_01g0023390.01 | Chr01 | 25039205 | 25056444 | - | NAM | ||
CDS seq | atggtagcagatcaaaagcctttcaacatgactgcacctccaaggctccttgcacaaggagccactgctacgactgcagtactcctgttctttcttgtcttccaagcacaatccgcctctccctttgatcgagcaaacacaacgacgacgccaggcgccgtcggtgggatttgcgttccaagtgagcggaaggcgctcacatccttcaagaatagcttcttggacccttctggccgtctttcttcgtggcgaggggaagactgctgccagtggaagggagtccggtgcgacagcacaactgggcatgtcatcgagctcgatcttcgcaacactttcgtcacagagaatggggattggtgtggtggtttaaatgaaggcggtgggcatcggttgaccttgcaaacagatgagatgagcccctccatcgttgaattgcaacacctgaggtatcttgatttgagcaacaatgagttcaagggtacaagtttacctagttttataggttctctcaacaacttgaggtatctcaacatctccttcacatgttttgggggaactacaccttcccagcttggtaacctctcgaacttacattaccttgacattcgctcttccatttatgaaagcgtgtcagatctttcatggctgctaggtctccctttgttaaggtatcttgatatgagtgaagtggatctcagctctgtaaggaactgggtccatgcagtgaacaagcttcctgctcttcaagtccttgtcttatctagctgtgggcttaacagtacagtctctactctacctaattccaacctcacaaatcttgaggtcctagatttatcagacaacccgttttgctctcctctccaacacaactggttttgggatctcacgacacttaaaaagcttgttctatctgattgcggatggtctatagggcctattcctgatgcattaggaaacatgtccacccttgaggtcatagttctaagtagcaactatgacatctatccatcaaatagctatctattaggtaacataccaacaacattgaaaaatatgtgtaatttacaagtgtttgatttacatggcattaatattcatgcacccatatccgaactgatggagagactaccaaagtgttcatggaataagttgcatgagatggacctgcaagatgcaaatttgacaggggagctaccattttggataggaaatctgacaagtctcagttatcttgatctttctcagaatatgattggtggctctatacctggtggagtggaaaagctgacaagtctcaaatatcttgatctctcccagaacatgctagttggacatttacctattggaatgggatacctgacaggtctcacttttctagacctctctcaaaacaggttggttggtcatttacctgttggaataggaagcctgacaggtctcaccattcttgacctctctcagaacaggctggttggtcatttacctgttggaatgggaaacctaacaggtctcaccattcttgacctctctcagaacaggctggttggtcatttacctgttggaatgggaaacctaacaggtctcaccattcttgacctctctcagaacaggctgattggcaatatacctgttgggattggagcacttggcaacttgactgaattgagctttttccaaaatagattaaccggtgtgctttcagaacatcattttgcaaatctaaagagactggaatttctcgacctttcaggaaactccctaaaattagatttcaaggaaggttggattcctccctttagattaacgataggatattttacatcatgtgacttggggcctcagttccctacatggataagatgggtaaccgacaaagctaaccagcctaccctggatatttcaaatacaggaataaatgatgaccttcctagctggttttggacttttttgtctaatgtttacaggttggacttgtcaatgaatcaactacggggatctttaccagagaagttaccagcaaacctcacaattcccattctaaaggtactgcggcttcactacaatcaaatctcaggcaccattccagcatgtttctgtcaattcagtggtttggaagaaataaatctgtcacacaatcgactaactggggaaatcccacaatgctcaatcgatacatttggttcgtcattcggtgttatagatatgagtagtaacaatctatctggtaaattccctagcttccttcgaaaggctagatcattatcttttcttgatttgtcatataacaagttatctggaaatatgccgacgtggattgcagagagaatgcccagcctggaagtgttgattttaagatcaaacatgttctgtggtaacctttctatgaattttagtgagagtaatcaacttcattttttggacatagcacataacaacatatcaggaagtctaccttcatccgtaagaaacttgaccgccatgaaatattctaaatcagattatctaaattacactggggccagcatatccatatccataaaaaaccaggagctaaactatacctttcaaagcacaaattatattgtgttgattgacttgtcatataatagtttaactggacatattccaagagaaatatctgaactcaagggccttcaaagtttgaatctctctggcaaccaacttaatggagaaattccatataatattggtgctttaaggagattagagtccctagacgtatcctacaatgagttagttggcgaaattccctcaagtttatcagaccttacttttctgagcagtttaaacatgtcctacaacaatttatcaggaagaatcccctcaggacaacagctacaaacactcaacaatctttatatgtacatcggcaatcctggtctctgcggccctcctcttcccaccaactgttccacgaacaaaacaaatcaaattgtccatggtgaacatgatgatgcctcacatgatacgatatatttgtaccttagcacgagcgcaggatttgcggtggggctctgggcagtgttctgcaccttcttgttcaagaaagcatggaggatcgcctactttcagcttaatgatcagatatatgacaagatctatgtgcaaatggctatcaatcatgcctcgtccgacgccgagaagaacggcggctgtattccgaaggagagatctgctcttctggccttcagagcaggtttatcagaccctggaaacatcctttcgtcatggaagggtgatgactgctgccactggaagggagtccggtgcagcaacagaaccggccatatagtcaagctcgatctccaaacccgtggctgctacaccgaccctgaatatccatgggttgagtcggaaccaggactgggaggcaacataagctcctcgttgcttatcttacaacggttgcaatatctggacctgagctgtaacaacttcagtggggttcgcataccggagttctttggttctctcaaaaacttgagatatctcgacctatcagactcgagcttcagtggaaggataccaccgcagctcggtaatctctccaacttgcactatttacatataactaactattccagtgatatatactccacggatatcacttggttgtcacgcttgtcttcccttgagtacctaaacttggaccgtgtgaatctcagtactgcggtggactggcttttggtgctgaacatgcttccatctcttaaagctctcattttgcctgggtgccaacttagtaccagcgttgattctcttccatattacaacctaacatcccttgaaacactagacctttgggctaacagtttccacaagagaatcacacccaactggttttgggatttaactagacttaagcatctagatatcacggggaatggtttctatggcccgtttccctacgagataggaaatatgacctctatcgtcgaacttgatttatcattgaatgaacttgtgggcatgataccagcgaacatgaagaacctatgtaacttggaaaggtttgttgcctacggtaccaacatcaatggaagcataacagagttattcaatcaattgcccagatgttccaggaataagctgcaagagttgtttctaccgagctgcaatttgactggaaggctgccaacaacactggacttaaacttgagctggcttgatctcagtaataacaatctcacaggtccaattccactttgggtaggcaagcttacaaatctaacaatattggatctcagcttcaataaactggaaggggtcatacatgaaggccatttatcaggcctagcaaggctatattggttgaccttgtctaacaacctcctagccatcagagtgaattcaacctgggttcctcctttcaagcaaataacacaaattgaacttaggtcctgccagttagggcctaaattcccaacttggctcagatggctaacacatgtaaaaaatcttgatatctcaaacacaagcatatctgacaaggttcctgactggttctggattgcagcatcctcagtgacatatctgaatatgaggaacaataatattagaggagtcctcccacctagaatggaatccatgagagcaattgcaatggatatcagttccaaccagttaagtggtccactacccaagcttccggtgaatttaaccggtttagatctcagcaaaaataatttgtctgggcctctgccatcagatctaggagcgccagttctaatgtcacttattctatatgacaactcaatttctggtgcaattacatctttgtgcaagatgcactttctgctgttgctggatatttcaggaaacaagctgactggaccaattcctgattgcatagccaattcaagctcagaaatctccacaggtttaagtatctctaatttgagcttaagaaacaataacctctccgggcaatttccttcttttcttcagaactgcaaaaacctcatttttctggatcttag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Expression
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Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0279800 | SBH | 4.516546 | 3.064296 | 18.462210 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g41770 | SBH | 0.102326 | 0.0 | 0.047600 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0279800 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0012610 | SBH | 3.314848 | 19.322317 | 18.064363 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0024050 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0024360 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0023750 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0012200 | SBH | 16.795937 | 24.858669 | 37.170464 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0395800 | SBH | 0.083564 | 0.830832 | 0.0183955 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0012130 | SBH | 1.553266 | 1.584764 | 2.542441 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0384700 | SBH | 0.309498 | 0.2416125 | 0.5060555 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0012140 | SBH | 0.391875 | 0.322095 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0036330 | SBH | 1.919805 | 83.656090 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0012120 | SBH | 5.845068 | 31.972692 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0012280 | SBH | 2.698003 | 2.435953 | 4.170121 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_03g0022530 | SBH | 1.990411 | 13.395518 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G036920 | SBH | 1.021385 | 31.786877 | 25.667589 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0023430 | SBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |