Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_09g0007060 | OGI:09034040 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr09:11545454-11557806 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK268, OsRLCK268, - | ||||||||||
| DNA seq | atcgactgtgggctaagtgaccctccacacgtcgacaaggtcaccaacatctcgtacgtctccgatgacgcgtacatagcaaccggagaaaagcacgacatttcttcagggtacccatggcaatacaaggcagatcgaagcctgaggagcttcccgtccggcggccggaactgctacaccatcccctctgccgcgagaggccgaaagtacctcgtcagggcacggttcatgcacggcgactacgacggcgggggcaagagcctcgcggtcaagccggtgaagttcgacttgaacatcggcctcgacttctggtacaaggtcaccgtctccgacgctgcgataccatatacggccgaagcgatcgccgtcaccgtggccagctcgctgtcggtgtgcctgctggacaccggccatgggactccgttcatctcatcgctggagctgaggccgatgggcagcgacatgtacaccgacgccacggcgaaccaatcgcttgggctcgtcacacgcatcaacatgggcggggcggccaataccctcaggtctagcaacttgtcgatcagtcatttaatttccgtgttaatttgcactaacatcatctgtgctcgcacaaacttacgtgttgcagaatctttaagagcgccttccctccaaaactttactattacggtgttttatagttaaaaccgtaaaattacagtgtcatgtagctttctataggacattgtgactttacgattttagctataagacaccgcaacagtaaagttttggagggaatgcactcttaaaaattaaatatttactaaggatcacactcagtaaaatatttgttttcggttgaataggagaaatattatgtgaaatgttaggaatacccgtaggcccacacgttagctctcccttttctctcttcctcagtccacactgccccacgaccttttttttttgtaaaatttgccttttttttttaagtatccagtgcaaaataatttagttttttatagttataaattttgaaaacagtatttgcaagaaaagaacagtatccacatattataccttttctgttgcattatattttcttaattcagtaattatatgaaattcagaattgatgaatatatatataaagtagtacttgtggagttgtttactctagattttactccctccatcccataatataagacgcacacgtattccaagatttgacctttaaaacatttgacaaacatttagtataatatgaaatgtagcattggattgacatttaaatttactttcacatggttataattttgttgctacattatagtatatgaaaaattataaattaaaaattagtttgggagatcataccaattttgaccgcgccttatattataagatagagggagtagtttttaaatcttgactaacaagcagttcgaaaaattgtaaaaaaagaagtgtactcggtttaggtctcaatgcattttccataattaataatattgatttcagagtttataagcagtaataagttataccccattatagcattttcatgagttaataattaagaaatttggaattaataagtaataacgagcaaaatgaattggactctcaaccaaatagtatttttcctgatttaatgattctataattcggaactaataattaagtagcaagttgtatacatggattgaagcctcaattgtagtatatttttattaatttaattattctaaagtttgggattagtaagttgaatttgtagctaacatggacgcttgttttaatctaaaaaattctaactttgcacctcacatttattcattgtttttcgaattaacataggaatggttgtaaattaaatgctaaaagagtccatgatatttttaatggcatgttttgttgagcacaaatattctcctaagtacagtcataagtcacagcaatacaatccatgtaattaagaacttgatgtttatttctggttaacatgggagctttcttatattgtgcaattagtgtgtacacacacgcacgcacgcacgcgcgcgcgcgcgcacacacacacacttagatggttgtatggagatgaatcattactaataaaaacatttatacaaatagccaaaatacatttgtatatgcggttgagccaatagccctttaacgaaggtctgtagaattggtgcgttttcacatagaggtaaacagcaatcgtctcaagaaatgcattttcagatgctagctattgacctaacatgacatgtgaaaatcatttcggcatacgatcatattaagacaattgtatgtaaaaatggattattttgacaattaattagttaaaacaactacctttgaaaataagggcctctagaaatgaagctataattttataggtggttgtctaatcctccattaaaaatcgatttctagaggcaaagactgtctgtgaccacgagccctcctaacatactgtaaaagggggaaggggggggggggggtttatatagacggcctattaataaaatgtgaagtaaaatgtgggtattgtccttgaaaatagttttttaaattagaagtggattgatagatatatggacgggcaggatattgcatggatttatttactcaagccaaaagatttagttttcaatgtgtggagatatcttgaccgatatttcagtgtctcatgatgaacatgatatgtttatatgtgtgaagtgctagtcaatcccgtcaataagacctaaaacaactgccacatcggagttccacaagtggttctttatttgaagagaacgagtgaagtcaattgtacccccattcaacttgagcctgagcctagaaattagcctttagctctgaaacacgacccttaactgtccagaccaggcaaaatatcccctaacaagaatccaacccagttcttatggtgacttttataatgttgacatatataccctgtgttatattttacatttatttttaattggtgttttggtagtgaaaataaaacgatgttggaagaattactaatgccatagttgcaagtaatatccatatcgtgtgaagggacgagtagtcctatgtgagaagtagaatactcattcagaccatttggcatactcaacaatgcaactagtgccactaactttccctagtttacaactttacatacatatcccggtatgatagtggattgcaaaagtatatctcagaaagttggaaactttgaatggggatgcatatagactaattccttgattaaatgatagtaattatttccagtaatttaagagatattgaacccttagatgagaaatttcaaagaatatgacaggagggagggattaatgcatgttactttgcactatacaaagcctcctattaatgtgtatggctttgagagatagttgccatatccaacaattgtgtggtttaaataccgactcaatcggaagggactagggatcggtcgcccgatccaaatctgcaaaaatcgggcgttgacatcagcattatgtcaacgccacgcatatgtgcaaaactattttaaactaatttttctcttaaattatttatccaaatcatgaatcaattgcaccattaaattcgttgcaattaaatcttcaaaacaagactacacatggatatattccaacgaaaatattttttagcttattattgatttttttaaatgttgcacgatgttccaccagtatatcggaattgtttcactaactagatcaaaaatatttcaatcgtttaaatcgggtgttgtttcaccttatgtaaaaacaatgtttcagcaaatagcgaaagaatgtttcagttcactgtaacattagatatatagatagtgaaacattgtgactacactaggtgaaacatttttgctggaacaaaaaataaaacaaattcccttaatagagggtttccaaaatatgtggatgatttgttacaatggagtatgtggtggagacacatgacaggtgggggcaaagaacgtggtggggctaggcgcctgcatcacgcgcgtggggggtggggcgcgcggggggagcgcccaatctgctccacccccacgggtcgcttggtagccagcatttccggactcaatccctatcattatgaaggggaggaggtttgtccctccgtggctatacctatatagaggggaggaggttccttgtgcactataaaaggaagggaagaggatgaatgaaagaatgctcatctatctcaaattttgtgtctcatttttaacttcctccggtacaccatccctttggactatatatgcagcagaggttgcatcacccaaatgacatggctaatcgaagtttgatagagtggaaaaacaaagtttttatggtatttgttagtacaaattcaatttaaaatggtatagatacaattattcttataagatattattagaaattcaagaatgaggtgaaggaagaaaaacagtttaaagagtaaagtaagctccgataaaatagttttaacaaaatggaatctttccagaccgcagtatttccatgattgcattgtcaccgctgtgatatgcatgcatgctattttagaaccgtgcagctcagtgatatgtaaatgttccgAaaaaaaatcaaactaaaaaaagaacccacaagtttctggaagggtacttacaaatatcccactcttgttcactacttaaaaaaacatttttataggaggccagaacatatttttgtgggcggccataacctccgcctacattcaaaggcctgtgaaaatcaataatttttgcaggcatctaaatccacccgcctacgaaaatatttttagcgtaaaaaaaatcgccgcccccaatcttacccgccgccgccctcccctccgaccaccgccaccacgagctgtgccgccactagggttttgggagggagagggaggggaggggagctgcaccgccgccgacctcctgcctctgcgctgcctccgccgccgctgctgcc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| CDS seq | atgcacggcgactacgacggcgggggcaagagcctcgcggtcaagccggtgaagttcgacttgaacatcggcctcgacttctggtacaaggtcaccgtctccgacgctgcgataccatatacggccgaagcgatcgccgtcaccgtggccagctcgctgtcggtgtgcctgctggacaccggccatgggactccgttcatctcatcgctggagctgaggccgatgggcagcgacatgtacaccgacgccacggcgaaccaatcgcttgggctcgtcacacgcatcaacatgggcggggcggccaataccctcaggtacccaaacgatacacatgaccgtttctggtggtcacaagtttacatcgatatcacgccgtcgcataacatctctacaaatgatacccgcggtatgaattactactcaaatgactacatctatgttccggaagacgtcctccggaccgcggtcaccacgtccgccacttctgtccctctcaacatcactcaatcaccaaactggccgaccgattggacctactttcacttcctgcacttcgccaactttgagcagcagctacgtcaattagacatatattacggcaagaacaagtgggaatacagcccgctaagtttgtcttccatgcagccaacatacagcccgattgttgccagtttgtgtaacatctcaatagtcgccaccaacacctccgtgctaccacccatgctcaatgccatcgagatatactttggcatcccacgtaacgacagcgccacctctccagacgatgttgatgccataatggccattaaaactcaatatcaagtgaagaagaactggatgggcgacccatgtctacccaaggaatctctgtggactggattgcaatgtaggcaagacggggttgaatccaaaataatatcattatatgacaccaacgatggtgatccatgtaatgggaaatcaccaaagaagaaaaatatttttgtcctaactgttgctatagtgactcccgtagcggcagtgttattggtatcagctatactaatatgttgtttctgccagaagaaaatgaagcaacaaatgacactaggtttggtccaccaatacattcctcatagtgtgcagcctactggaatttcaaactccggaagccatgtcgacatcaaagatcatatactgatgtccaatgatcatgaattcacatatgaggatctggtaaagataacaaacaatttctcagagtgcattggtgaaggaggatttgggccagtctaccttggtcagttacaaggcagcagtattcaggttgctgtcaagatgtgttctcgaaaatcagtacatggacaaggaataagagaatttttagctgaggttgacagcttgaaaacggtacaccacaaatatctggtcatgttgattggatactgcacaaacaagaatcatttagcccttatttatgagtacatgcctaatggaagtctgtttgatcatttaagaggtttgagctctttgcgacttaaagctgtgtttttatataaactgtactacttcagcagcaggctcaccatgaaaagcgatgtgttcagctttggagtggttttgctagagattgtaactggcgaaccacccatcctcccaggcgttgggcatgttgtaaagtatgtgaaacagaaggccagcgacggtgaaatcagtgcgattgtcgacccacgtctccaaggggcatatgacatgggttcagtctggaaggttgtggacattgcactgatgtgcacaaaagaggtgtctgatgacaggccaacaatgactgaagtagtggagcaactgaaagatgccttggcactggaagaagcttgccataccgatggccgcagcgacaatagccatggaagtgtgaagccagatttatcggccaactggggaccatcagctagatga
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| Protein seq | MHGDYDGGGKSLAVKPVKFDLNIGLDFWYKVTVSDAAIPYTAEAIAVTVASSLSVCLLDTGHGTPFISSLELRPMGSDMYTDATANQSLGLVTRINMGGAANTLRYPNDTHDRFWWSQVYIDITPSHNISTNDTRGMNYYSNDYIYVPEDVLRTAVTTSATSVPLNITQSPNWPTDWTYFHFLHFANFEQQLRQLDIYYGKNKWEYSPLSLSSMQPTYSPIVASLCNISIVATNTSVLPPMLNAIEIYFGIPRNDSATSPDDVDAIMAIKTQYQVKKNWMGDPCLPKESLWTGLQCRQDGVESKIISLYDTNDGDPCNGKSPKKKNIFVLTVAIVTPVAAVLLVSAILICCFCQKKMKQQMTLGLVHQYIPHSVQPTGISNSGSHVDIKDHILMSNDHEFTYEDLVKITNNFSECIGEGGFGPVYLGQLQGSSIQVAVKMCSRKSVHGQGIREFLAEVDSLKTVHHKYLVMLIGYCTNKNHLALIYEYMPNGSLFDHLRGLSSLRLKAVFLYKLYYFSSRLTMKSDVFSFGVVLLEIVTGEPPILPGVGHVVKYVKQKASDGEISAIVDPRLQGAYDMGSVWKVVDIALMCTKEVSDDRPTMTEVVEQLKDALALEEACHTDGRSDNSHGSVKPDLSANWGPSAR |
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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g07550 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGD8] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_09g0007060 | OsKeNa_09g0007060.01 | Chr09 | 11545454 | 11557579 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgcacggcgactacgacggcgggggcaagagcctcgcggtcaagccggtgaagttcgacttgaacatcggcctcgacttctggtacaaggtcaccgtctccgacgctgcgataccatatacggccgaagcgatcgccgtcaccgtggccagctcgctgtcggtgtgcctgctggacaccggccatgggactccgttcatctcatcgctggagctgaggccgatgggcagcgacatgtacaccgacgccacggcgaaccaatcgcttgggctcgtcacacgcatcaacatgggcggggcggccaataccctcaggtacccaaacgatacacatgaccgtttctggtggtcacaagtttacatcgatatcacgccgtcgcataacatctctacaaatgatacccgcggtatgaattactactcaaatgactacatctatgttccggaagacgtcctccggaccgcggtcaccacgtccgccacttctgtccctctcaacatcactcaatcaccaaactggccgaccgattggacctactttcacttcctgcacttcgccaactttgagcagcagctacgtcaattagacatatattacggcaagaacaagtgggaatacagcccgctaagtttgtcttccatgcagccaacatacagcccgattgttgccagtttgtgtaacatctcaatagtcgccaccaacacctccgtgctaccacccatgctcaatgccatcgagatatactttggcatcccacgtaacgacagcgccacctctccagacgatgttgatgccataatggccattaaaactcaatatcaagtgaagaagaactggatgggcgacccatgtctacccaaggaatctctgtggactggattgcaatgtaggcaagacggggttgaatccaaaataatatcattatatgacaccaacgatggtgatccatgtaatgggaaatcaccaaagaagaaaaatatttttgtcctaactgttgctatagtgactcccgtagcggcagtgttattggtatcagctatactaatatgttgtttctgccagaagaaaatgaagcaacaaatgacactaggtttggtccaccaatacattcctcatagtgtgcagcctactggaatttcaaactccggaagccatgtcgacatcaaagatcatatactgatgtccaatgatcatgaattcacatatgaggatctggtaaagataacaaacaatttctcagagtgcattggtgaaggaggatttgggccagtctaccttggtcagttacaaggcagcagtattcaggttgctgtcaagatgtgttctcgaaaatcagtacatggacaaggaataagagaatttttagctgaggttgacagcttgaaaacggtacaccacaaatatctggtcatgttgattggatactgcacaaacaagaatcatttagcccttatttatgagtacatgcctaatggaagtctgtttgatcatttaagaggtttgagctctttgcgacttaaagctgtgtttttatataaactgtactacttcagcagcaggctcaccatgaaaagcgatgtgttcagctttggagtggttttgctagagattgtaactggcgaaccacccatcctcccaggcgttgggcatgttgtaaagtatgtgaaacagaaggccagcgacggtgaaatcagtgcgattgtcgacccacgtctccaaggggcatatgacatgggttcagtctggaaggttgtggacattgcactgatgtgcacaaaagaggtgtctgatgacaggccaacaatgactgaagtagtggagcaactgaaagatgccttggcactggaagaagcttgccataccgatggccgcagcgacaatagccatggaagtgtgaagccagatttatcggccaactggggaccatcagctagatga
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| Protein seq | MHGDYDGGGKSLAVKPVKFDLNIGLDFWYKVTVSDAAIPYTAEAIAVTVASSLSVCLLDTGHGTPFISSLELRPMGSDMYTDATANQSLGLVTRINMGGAANTLRYPNDTHDRFWWSQVYIDITPSHNISTNDTRGMNYYSNDYIYVPEDVLRTAVTTSATSVPLNITQSPNWPTDWTYFHFLHFANFEQQLRQLDIYYGKNKWEYSPLSLSSMQPTYSPIVASLCNISIVATNTSVLPPMLNAIEIYFGIPRNDSATSPDDVDAIMAIKTQYQVKKNWMGDPCLPKESLWTGLQCRQDGVESKIISLYDTNDGDPCNGKSPKKKNIFVLTVAIVTPVAAVLLVSAILICCFCQKKMKQQMTLGLVHQYIPHSVQPTGISNSGSHVDIKDHILMSNDHEFTYEDLVKITNNFSECIGEGGFGPVYLGQLQGSSIQVAVKMCSRKSVHGQGIREFLAEVDSLKTVHHKYLVMLIGYCTNKNHLALIYEYMPNGSLFDHLRGLSSLRLKAVFLYKLYYFSSRLTMKSDVFSFGVVLLEIVTGEPPILPGVGHVVKYVKQKASDGEISAIVDPRLQGAYDMGSVWKVVDIALMCTKEVSDDRPTMTEVVEQLKDALALEEACHTDGRSDNSHGSVKPDLSANWGPSAR
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|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_09g0007060 | OsKeNa_09g0007060.02 | Chr09 | 11557409 | 11557806 | + | IsoSeq | ||
| CDS seq | atgccttggcactggaagaagcttgccataccgatggccgcagcgacaatagccatggaa |
|||||||
| Protein seq | MPWHWKKLAIPMAAATIAME |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.171008 | 6.705332 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0358000 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g18530 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0358000 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0007060 | RBH | 0.0 | 10.680312 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0007040 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0007230 | SBH | 0.000000 | 0.0 | 0.582392 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0007180 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0007170 | SBH | 0.0 | 0.0 | 2.256052 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0198300 | SBH | 0.8216335 | 3.8622105 | 2.9796045 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_09g0007240 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.073622 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_09G0176200 | RBH | 0.623677 | 1.0631815 | 2.3892725 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0007200 | SBH | 0.034220 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0007040 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0006760 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_Ung0050910 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0006960 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G007570 | SBH | 0.046891 | 0.183770 | 0.529573 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0007370 | SBH | 0.152161 | 0.0 | 0.455310 |
