Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsKeNa_08g0008570 | OGI:08025640 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr08:9012557-9032201 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsKeNa_08g0008570 | OsKeNa_08g0008570.01 | Chr08 | 9012557 | 9032201 | + | NAM | ||
CDS seq | atggcaatcaagaggacatggcaactttggttgctctctcttctcacacatgccatcctattgttcacagccagctctcagtccatcaatggagatgacctctcagcactcctgtcattcaaatccctcataaggaacgacccaagagaggtgctgtcctcgtgggacaccagcagcaacactaccaacatgacagcacctgtcttctgccgatggaccggcatttcctgcaacgatcgccggcatccaggtcgtgttaccaccctcaatctgagcgatgccggcctagtcggcaccatatcccagcagcttggaaacctgacccacctccgtgtccttgatctgtcaaccaacagtcttgatggagatatcccaatcagccttggcggttgcccaaagcttcatgccatgaacttgagcatgaaccatctgtcagtgtcggccacaacaatcttaccggtgatattccccaagtcactctccaacgtcaagaggaacttcatccatggccaagatttgagttggatgggcaacctcacatcattgagagactttattcttgaaggcaacattttcactggtaacatccctgaaacttttggtaagatacttaaccttacttacttcagtgtccaaaataatcaattggaaggccatgttcctctatcaatcttcaatatttcttccataagaatcttggatcttggcttcaatagactgtcaggatcacatccactcgatatcggcattaaacttcctaggataagtcgttttaacacaattaataaccgtttcgagggtataataccacccaccttgtcaaatgcatctgcacttgaagtattgcttcttcatggaaacaactaccatggcattattcctagggaaattggcatccatggtaacctgaaggtatttgtgttaggatacaacgcgctccaagccacacgatctagtgattgggaatttatgacatcactgaccaactgtagcagcttaacaaggctagatgttgcacacaaaaacctcgttggtgaaatgccaattaacattgccaacctgagcaaagagctcatagggatttacctaagtgaaaaccaaataactgggaccatacctgaagatttatggaagctcaataaacttacttctctcaacctgtcctgcaacctcttcacaggaaccttacctcctgatattggccgccttccaataatcaattctatctttatgtcacataatagaatcactgggcagattccacaaccattaggcaatatctcacagttgatctttctatctctgtctaataatcttctggatggcagcattccaattagccttgggaacctcacaaaacttaatctcttggatctttccagtaatgccttgatgggccaaatcccacaagagatacttacaataccttcccttaccttacttctcagcctctccaacaatgctctaagtggctccattccaacacagattgggcacttgaacaacctcatcaaaatggacctctcaatgaataagctatctggtgaaatcccaaaagctattggcagctgtgtccaattgagtttcctaaatttttatagaaaccttctccaaggacaaatcccagaaagcctgaacaatttgaggagccttgaaacccttgatctgtctaacaacaacttggcaggtcctgtacctttatttcttgcaaacttcacgctcctaactaatctaaacctctccttcaacaaactgtcaggtcctacaaggatgaaacctaacatcgttgataatgaaaacccatttctttatgagacgaatgagaggatatcttatgccgaactacaagcagcaaccgagtcattctcaccggcaaatttgattggttctggaagcttcggcaatgtatacattggaaatctaattattgatcagaatctagtgcctgttgcaatcaaagttcttaatcttgaccaaagaggagccagcagaagtttcctgagcgagtgtgatgctcttaggagaattcgacaccggaaacttgtcaaggtgatcactgtctgcagtggcttagaccaaaatggtgatgaattcaaggcacttgtcctagaattcatttgcaatggaagtttggatgagtggctgcatgcaacaagtacaacaaccagcacaagctacagaaagctaaatatggtggaaaggctgcatattgctgttgatgttgcagaggcattggaatatcttcaccatcatattgtgccgccgatagttcactgtgatattaaaccaggcaacattcttctagatgacgacatggtggcacatgttaccgactttggtctagcaaagataatgcattctgaaccacgcatacaaagcagctcattagtaattaaaggaacaattggatatgtcccaccagaatatggagcgggatctcaagtatccatggatggtgacatatatagctacggggtgttgttactggaaatatttactggaagaagaccaactgacaattttatcaatggtataacaagtcttgttgactatgttaagatggcctatcctaacaatctactggaaatattggatgctagcgcaacctacaatggaaacactcaagaattggtagaactagttatttatcctatatttcgacttggtctaggatgctgcaaggaatcaccaagggaaagaatgaagatggatgatttcggtcttgatgtggcagaggcattggaatatcttcaccatcatattatgctgtctatagttcactgtgatattaaaccaagcaacattcttctagacgatgacatggtgacgcaagctacagactttggtctagcaaagataatgaatattgctgaaccgtgcaaagaaagcagctcatttgtaactaaaggaacaattagatatgtcgcaacagaatatggctcagggtctccggtctctatggatggggacatatatagctacaggctttcgatgctctctcttctcacacatgccctcctcttgctcacagcctcctcacagaccatcaatggagatgacctctcggcactcatgtcattcaaatccctcataagaaacgacccaagaggggtgctgtcctcttgggacgccatcggcaatggtaccaacatgacagcacctgtcttctgccaatggaccggcgtgacttgcaatgatcgccaataccccagtcgtgttaccactctcaatctgagagatgctggcctaaccggcaccatctcccagcagcttggcaacctgactcacctccatgtccttgatctgtcagccaacagtcttgatggtgatatcccaaccagccttggcggttgcccaaagcttcgttcgttgaactttagcaggaaccatctgtcaggtaccatccctgctgatcttggaaagttatcaaaacttgctgttttcgacattggccacaacaatcttacctgtgatattcccaagtcactctccaacctcacaacactaacaaagtttatcgtcgagaggaacttcatccatggccaagatttgagctggatgggtaacttgacaacattgacacactttgttcttgaagggaacagtttcactggtaacatccccgaaacttttggtaagatggttaagcttatttacttcagtgtccaagataatcacttggaaggccatgttcctttatcaatcttcaatatttcttccattagattctttgatcttggcttcaatagactgtcaggatcacttccactcgatgttggtgttaagcttcccaggataaatcgttttaacacacttgctaaccattttgagggtataataccacccaccttctcaaacgcatctgctcttgaatccttgcttcttcgtggaaacaactaccatggcattattcctagggaaattggcatccatggtaacctgaaggttttttcgttaggagacaacgcactccaagccacacggcctaatattggaaagaacaaccttgttggtgcaatgccaattaacattgcaaacctgagcaatgagctatcatggattgacctaggtggcaaccaaataattgggaccatacctgaagatttatggaagtttaacaaacttacttctgtcaacctgtcatataacctcttcacaggaacattacctcctgatattggcgggcttccaaggctcaattctttctacatatcccataatagaatcgatgggaaaattcctcagtcattaggaaatatcacacaattgagctatctgtctctgtctaataattttctagatggcagcattccaactagccttggcaacttcacaaaacttgaagtcatggatctttcttgtaacagcttgacaggtcaaattccacaagaaatacttgcaataacgtcccttaccagacgcctaaacctctccaacaatgctctaattggctccattccaacacagattgggctcttgaacagccttgtcaaaatggatatgtcaatgaataagctgtctggtggaatcccagaagctattgggagctgtgtccaattgagttccctaaattttcaaggaaatcttctccaaggacaaatcccaaaaagcctaaacaatttgaggagccttcaaatccttgatctctctaagaacagcttggaaggtcgcataccagaatttctagcgaacttcacgtttctaactaatctaaacctctccttcaacaaactatctggcccagttccaaatacagggatttttcgtaatgtcactatagtgttactcttaggaaataaaatgttatgtggtggccctccatacatgcaattcccttcatgctcatatgaagattctgaccaggcttcagtgcatcgacttcatgtcttaatcttttgcattgttggaactttaatttcctctatgtgttgcatgactgcatactgcttcattaagagaaagatgaaactgaatgttgttgataatgagaacctatttct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Protein seq | MAIKRTWQLWLLSLLTHAILLFTASSQSINGDDLSALLSFKSLIRNDPREVLSSWDTSSNTTNMTAPVFCRWTGISCNDRRHPGRVTTLNLSDAGLVGTISQQLGNLTHLRVLDLSTNSLDGDIPISLGGCPKLHAMNLSMNHLSVSATTILPVIFPKSLSNVKRNFIHGQDLSWMGNLTSLRDFILEGNIFTGNIPETFGKILNLTYFSVQNNQLEGHVPLSIFNISSIRILDLGFNRLSGSHPLDIGIKLPRISRFNTINNRFEGIIPPTLSNASALEVLLLHGNNYHGIIPREIGIHGNLKVFVLGYNALQATRSSDWEFMTSLTNCSSLTRLDVAHKNLVGEMPINIANLSKELIGIYLSENQITGTIPEDLWKLNKLTSLNLSCNLFTGTLPPDIGRLPIINSIFMSHNRITGQIPQPLGNISQLIFLSLSNNLLDGSIPISLGNLTKLNLLDLSSNALMGQIPQEILTIPSLTLLLSLSNNALSGSIPTQIGHLNNLIKMDLSMNKLSGEIPKAIGSCVQLSFLNFYRNLLQGQIPESLNNLRSLETLDLSNNNLAGPVPLFLANFTLLTNLNLSFNKLSGPTRMKPNIVDNENPFLYETNERISYAELQAATESFSPANLIGSGSFGNVYIGNLIIDQNLVPVAIKVLNLDQRGASRSFLSECDALRRIRHRKLVKVITVCSGLDQNGDEFKALVLEFICNGSLDEWLHATSTTTSTSYRKLNMVERLHIAVDVAEALEYLHHHIVPPIVHCDIKPGNILLDDDMVAHVTDFGLAKIMHSEPRIQSSSLVIKGTIGYVPPEYGAGSQVSMDGDIYSYGVLLLEIFTGRRPTDNFINGITSLVDYVKMAYPNNLLEILDASATYNGNTQELVELVIYPIFRLGLGCCKESPRERMKMDDFGLDVAEALEYLHHHIMLSIVHCDIKPSNILLDDDMVTQATDFGLAKIMNIAEPCKESSSFVTKGTIRYVATEYGSGSPVSMDGDIYSYRLSMLSLLTHALLLLTASSQTINGDDLSALMSFKSLIRNDPRGVLSSWDAIGNGTNMTAPVFCQWTGVTCNDRQYPSRVTTLNLRDAGLTGTISQQLGNLTHLHVLDLSANSLDGDIPTSLGGCPKLRSLNFSRNHLSGTIPADLGKLSKLAVFDIGHNNLTCDIPKSLSNLTTLTKFIVERNFIHGQDLSWMGNLTTLTHFVLEGNSFTGNIPETFGKMVKLIYFSVQDNHLEGHVPLSIFNISSIRFFDLGFNRLSGSLPLDVGVKLPRINRFNTLANHFEGIIPPTFSNASALESLLLRGNNYHGIIPREIGIHGNLKVFSLGDNALQATRPNIGKNNLVGAMPINIANLSNELSWIDLGGNQIIGTIPEDLWKFNKLTSVNLSYNLFTGTLPPDIGGLPRLNSFYISHNRIDGKIPQSLGNITQLSYLSLSNNFLDGSIPTSLGNFTKLEVMDLSCNSLTGQIPQEILAITSLTRRLNLSNNALIGSIPTQIGLLNSLVKMDMSMNKLSGGIPEAIGSCVQLSSLNFQGNLLQGQIPKSLNNLRSLQILDLSKNSLEGRIPEFLANFTFLTNLNLSFNKLSGPVPNTGIFRNVTIVLLLGNKMLCGGPPYMQFPSCSYEDSDQASVHRLHVLIFCIVGTLISSMCCMTAYCFIKRKMKLNVVDNENLFLNETNERISYAELQAATNSFSPANLIGSGSFGHVYIGNLIIDQNLVPVAIKVLNLSQRGASRSFLTECDALRRIRHRKLVKVITVCSGSDQNGDEFKALVLEFICNGTLDEWLHANTTAVRRSYTRINLMKRLHIALDVADALEYLHHHIVPPIVHCDIKPSNILLDDDLVAHVTDFGLARIMNIAEPFKESSSFVIKGTIGYVAPEYGSGSQVSMDGDIYSYGVLLLEMFTGRRPTDNFNYGTTSLVDYAAYPNNILEILDASATYNGNTQDIIELVVYPIFRLGLACCKESPRERMKMNDQAQQVAPPLSPVISEGRDVEDADPNLPGFFKNPSHLSDDEIGEDRSPLAAEPDGFLGDDEGDNAPSESDIATELDDLDSA
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.616447 | 0.0 | 0.077008 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os08g0248100 | RBH | None | None | None |
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KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_08g0008600 | RBH | 0.0 | 0.317231 | 0.154258 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_08g0008670 | RBH | 0.137900 | 0.0 | 0.664060 |
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PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_08g0008470 | RBH | 33.848236 | 0.0 | 2.667310 |
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IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_08g0008480 | RBH | 0.545056 | 0.0 | 0.386033 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_08G0136400 | RBH | 1.3248695 | 0.1704665 | 0.6135175 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_08g0008040 | RBH | 0.486234 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_08g0008220 | RBH | 0.161131 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_08g0008080 | RBH | 2.314076 | 0.000000 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_08g0008790 | RBH | 0.057422 | 0.148740 | 0.286391 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_08g0008250 | RBH | 0.0 | 1.022617 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_08G008470 | RBH | 0.054983 | 0.0 | 0.000000 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_08g0008300 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.716900 |