Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_07g0025710 | OGI:07060020 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr07:27799114-27815287 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | gatgtttaccaacgataacaggctggattaccaactgttttttggtactagaggggattttagacttcttggctggaatgggctgctggttgtgatggtatatttgtcggttgtgccggtgctcctgtcaaagtatgtatcacatgccgccattgttggtatggtaatgatgtcagttgcaattggtcggatgttgcctctaggactattatgcaatccgcttcgccgtgccatatcactgtggagcccattacttgcaatcctattgatcggtccgtctatacgacaagcacatgatgatggttacaaaaactcaaatatcaggacattaccgtacttgcaccgagtactatgtttctttgtccttttaccaacaatcagcaggctacggttcccatgtatagtaaaactagttggcaatgttctatgcagaaaactgttaccttggcgtcaactcgttctaaacatgtgtatgcttgctgcgatagtgatgctggtattcattttcagtgatgagctaacttatcaacttatgataatagtatatgaagtttctgctttactgtttctgtcatctggcaacttccagattccagcagctgttgtgcgtgtcgtcctcgcactgacacaacttttaaatggtaatgatggtgagaacgataacgagcaaaacctcaagacatcactagacatcttctatgggatggtgctggggcaagggatactctacattgtggcctgcttggtggaggcattttcattcatccctcggagatacctcatccaccgtggcggatttggaggtcagatgggagtggaatatgccaattcgtactatgcatatgcctttgagaaatgcatgggaggggctgtgcttgctccaaagaagatcagcctcatcacatttgccatggattcactcaactcagactcatccaggaagaagctctatggggctcagatgctgcacaaatttctcaaaaaggagcagttaaggaccaaaacaatcacaaaactcaccaatgacaccaggacagtagtctcattgttcgatatgctggactggaaaagcgatggggatgaacaaatcagattatttgccgcaaagatcactgccgagcttgctggtagcctccgagttgttcaaatccctggggcaacacagcttgtagcctcactagttctggacactgatcaccaacagacaacaagggatcattttctgttcattgatagccaagtgggaagagaagactcaccaattcagcaagttggcatgggccaacagaactccccagtacttaagtacttgaaacaagtggcaagatattgtttgattccggtggatgagccatctaacaggcgtcaacaaaactcaagtatgctcagatggtggaagcggatcacaaaacgctggtcaattccagaggaggagccatccagggaccaagatttcctcccagtacaaggactgctaattcttgagaggcttgctaactttgatcctggaaactgcatggaaatcagcagaacaataggcctcatctcaaagatgatagattttacaagctacagaaatcatatgacaagtactaacgaagcccaccaaataatgttggcaagtttgtcacttagggtgctgagaagacttgcaagtactgaagggaagctaggtgtaactctgcgacaacagattttggaacatccattcgtattgagcaaccttgcagagatcttgaatgacagtgggagcaaccatgaacagaagcagttggcagcagaaatactgaaaaaccttgccatggatagaaacactagtaaggacatcgagcacatccgagtaatcatcagcagtttgatgtgtagatttctcagccgagatccatcctcaagtacaaattgtaatcacttgctacggaaaactgctggtcaagcactggcgatgctggcaatggagagtaaagataactgtttggttatgttaatggaaccagggtatgcgttcattagagaacttacagctacgatccataatgacaggtacaaatgtataacagcaagcctgttgtggagtatgtgcgagcatgctcagtgtaagctcagcaactcagacctgaagggactatctgacatcttgagattggtgagctgcaaattcttctctcttttttttataaagacagaaaaactgctaattcaagtgtcaagtgcgatactggaggtggatactgtaactactattttcatgtgctttctatctgtactgtctcataaattatcagggagaactgacttagagtttgcacatttttttttcaaatattgacaggcataaacatctgtgctcctaatattgatagcattgttaactcatgtcatgaaattgactaatgtgaacccatcaacatgcaaaaactactcatgtattgtacatccgacaactaagtatactgtcagaaatatcctggatgacctttaactaaatactccctccgtttcaggttataagactttttaacattgctcacattcatatagatgttaatgaatctaggcacacatatatgtatatattcattaacatatatatgaatatggacaatgctagaaactcttataatatgaaacagaggaagtaggtaaaaatgtagccgaagtttgttgaatatttttactaacaatggtttattgcctcacatggtgtggctacttccactacaggtgctggaaggaataatgcatacaaaaggagcagaactagaggtccttattggccttagttcacaaatatgtaaatgcattcctgaagacttcgcccgagaactagagaaaggccagattaaggagagatttgtaaagaggcttgtcgatgaacttaatgcacatatgagacccagtccttattgtcccagtatcaggagggtgattgttcaacatgctatatacttgatggagttcaatcctcgctacgcaaatgatttccataaatgctggatggtggaagcattatcaaaggtagaaagtacaccctcaagggttgaaaactacaggttgctttcaggcgacatgggactcatggagcacagcacagcagtttccactcttgtggccagagcaaaaaagctgatgggtcgtgactctcgtgagtgggcacggagcatcagcagtgccacctgactttgtaatacgtaggttgtactactacaacgacttctaaataaacaggctcagattcctcacaaaaatcggatctatgatacagttgaactagtacaatatcgaatacacacaattcgaagattgcaacaaaataatagaagaaggtagaactggcgaaatgtagcagggctaaggaaggagtattaaaacgcacctttcccctcctatttggtgtcagtagtacagttgatgcgcagccacgaatgtgttggcaactttttgtgacaacttgacaagcacgatcgcagcacctaacgctttgcggtgatctcagagtcaccaaccacctcaatctagtaaaagctaaactaagatgggttttgataaactaaaccggctagcggagccgatctagatagaacgaaggataactacccgtctcgtgggcaaaacggaaggttttcaagacaaacctacagagaggtgtcacactctcgctgcggcggcggacgatttacgacgtaaatcgacaaagatggacaaactaaactaaaactagaagcaaaagtaaaagaacgattcgattgattgatagttgattgagagattacaattgaaccagccttgtctcttatataggggttggtcttgccttctacaggccctcctccacgtccaactcgggatagaatccaaaggaaacctgaaacatgccttcccaagcaagaaaacctcgagacccaacgaaacagactcgggctcggactctgccggtcagaccggccacacaccgccggtctgaccggagttcaagccgcggtctaaccggcatatacacggcggtcagacaggcctcttagaggaaaacactctattttattcctagatgctaaatttgagtgtaaacagaaggtgcagcaaattgcattccctggtgatagcaaatttgggtgaacccagaagatgggttcaggcatttaaccaaactgaagtgcagtccggcaggtggatctccggcgagcgcgacccgcaacccacgcccagaataaaagggagacgggggaagcatatgagggagagaggcggtgtacctttcactgtcggccatggattggaataggagcggactcgtcggcgggcgtcgatgcctgagcctcccgtcgccagcgcgctctacgcctctacccgagtcggcgagtcgcccctccttgagctctagtgccgcactaggcagggtgatggaccaaagcgaaggagcacacggcccatatagcatgacggcccactttgcgctccaggacaggttgaagccaaattaatttgtgtttgtgacgcaatacggcccatttgttttcagaggggcctgtagtcctctggaccggtgggccgtcactcccacgaaccttttttaaagaatcgcaatgaactttttaaaaaaaaacattgcacatggtattatttcgaggttttattacattattagcaaatgttgaatgtggttttatttgatgtttcaaaagttacaaattgatgtttcatatatgatgtaaaaatgtttcagttaaaaaatatatttttattcgaaatatactcatgtaatgatcttgttgtgaagatttaactgtatagtcatattgtaaattcggtaagtaagttaggagaaaaatagtatttgaagttaactagtaataacatacacattgggagcatgaagagagggacccaatgaatggctacatcgcttatatacaaagctgccgagaattgagcctcaaatcagcgtttgccgctggcgtggcccttgccggggcgtgacacgtcgtccggcccttctccggagc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| Function | - | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_07g0025710 | OsKeNa_07g0025710.01 | Chr07 | 27799114 | 27815287 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgtttaccaacgataacaggctggattaccaactgttttttggtactagaggggattttagacttcttggctggaatgggctgctggttgtgatggtatatttgtcggttgtgccggtgctcctgtcaaaaaaactgttaccttggcgtcaactcgttctaaacatgtgtatgcttgctgcgatagtgatgctggtattcattttcagtgatgagctaacttatcaacttatgataatagtatatgaagtttctgctttactgtttctgtcatctggcaacttccagattccagcagctgttgtgcgtgtcgtcctcgcactgacacaacttttaaatggtaatgatggtgagaacgataacgagcaaaacctcaagacatcactagacatcttctatgggatggtgctggggcaagggatactctacattgtggcctgcttggtggaggcattttcattcatccctcggagatacctcatccaccgtggcggatttggaggtcagatgggagtggaatatgccaattcgtactatgcatatgcctttgagaaatgcatgggaggggctgtgcttgctccaaagaagatcagcctcatcacatttgccatggattcactcaactcagactcatccaggaagaagctctatggggctcagatgctgcacaaatttctcaaaaaggagcagttaaggaccaaaacaatcacaaaactcaccaatgacaccaggacagtagtctcattgttcgatatgctggactggaaaagcgatggggatgaacaaatcagattatttgccgcaaagatcactgccgagcttgctggtagcctccgagttgttcaaatccctggggcaacacagcttgtagcctcactagttctggacactgatcaccaacagacaacaagggatcattttctgttcattgatagccaagtgggaagagaagactcaccaattcagcaagttggcatgggccaacagaactccccagtacttaagtacttgaaacaagtggcaagatattgtttgattccggtggatgagccatctaacaggcgtcaacaaaactcaagtatgctcagatggtggaagcggatcacaaaacgctggtcaattccagaggaggagccatccagggaccaagatttcctcccagtacaaggactgctaattcttgagaggcttgctaactttgatcctggaaactgcatggaaatcagcagaacaataggcctcatctcaaagatgatagattttacaagctacagaaatcatatgacaagtactaacgaagcccaccaaataatgttggcaagtttgtcacttagggtgctgagaagacttgcaagtactgaagggaagctaggtgtaactctgcgacaacagattttggaacatccattcgtattgagcaaccttgcagagatcttgaatgacagtgggagcaaccatgaacagaagcagttggcagcagaaatactgaaaaaccttgccatggatagaaacactagtaaggacatcgagcacatccgagtaatcatcagcagtttgatgtgtagatttctcagccgagatccatcctcaagtacaaattgtaatcacttgctacggaaaactgctggtcaagcactggcgatgctggcaatggagagtaaagataactgtttggttatgttaatggaaccagggtatgcgttcattagagaacttacagctacgatccataatgacaggtacaaatgtataacagcaagcctgttgtggagtatgtgcgagcatgctcagtgtaagctcagcaactcagacctgaagggactatctgacatcttgagattggtccttattggccttagttcacaaatatgtaaatgcattcctgaagacttcgcccgagaactagagaaaggccagattaaggagagatttgtaaagaggcttgtcgatgaacttaatgcacatatgagacccagtccttattgtcccagtatcaggagggtgattgttcaacatgctatatacttgatggagttcaatcctcgctacgcaaatgatttccataaatgctggatggtggaagcattatcaaaggtagaaagtacaccctcaagggttgaaaactacaggttgctttcaggcgacatgggactcatggagcacagcacagcagtttccactcttgtggccagagcaaaaaagctgatgggtcgtgactctcgtgagtgggcacggagcatcagcaacggtcgtcgtcgtagaagccagttagccatggcgaacgccaccggcgggaagcacagcgtccagatacgaggtgagcaggtcgaagctgcaggcaagatggccaccccagaaaaatggctgaatcgcttcgttcgcgtggtggcgctgatagagaggacgggcaacgcgctcggcacgctggccttcacctgggctaccgtcatcctcctcggcggctaccccaccttagttgcaactggcatgatgttgtctccaacagctctgaaactactatgcaatccgcttcgccgtgccatttcgctctggagcccattatttgcaatcctattgctgggtgtgtgtatacgagtacaacgagatcgtggttccaaaaacacaaagaccagccggacattattgctccggttcccgtgtatagtaaaactagttggcaatgttctaggcagaaaactgttaccttggcgtcaagttattctaaacatgtgtatgcttgcagcgatagtgatgctggtattcactttcagtgacgagctaccactttcaatcgtatacgacgtttctgttttactgttgctgtcatttggcaacttccagattccagcagcaactgtgcgtgtcgtcctcgcattggcaggtattctacatcaaaaggacgaaccaaaaaaggaagtcaagccggattgcgagaaaaaagatgataatgacagcaaaaacctcaaggcatctctaatcatattctatgggatggtgctggggcaagggatactttacattgtggcctgcttgctggaggtattttcattcatccctcggaaatacctcatccgccatggcggattgggaggccagatgggagtggaaaatgtcaatttgtactatgcatatgcctttgagaaatgcatggaaggggctgtgcttgctccaaagaagatcagccttatcacatttgccatggattccctcaactcagactcatccaggaagaagctctatggggttcagatgctgcataaattactcaaaatggagcagttaaggaccaaaacaattacaaaactcaccaatgacaccaagacagtagcctcattgttcgatatgctggactggacaagcgatagggattcagaaatcagattattcgctgcaaaggtcactgccgagcttgctggtagcctccgagttgttcaaatccctgggacaacgcagcttgtagcctcacttctggacactgatcaccaacagacaacaagggatcattttctgttcattgatagccaagtgggaagagaagactcaccaattcagcaagatggcatgggccaacagaactccccagtacttaagtacttgaaacagatggtaatatattgtttgataccggtggacgagccatctaacgtggatgaacaaaactcttgtatggtcagatgctggaagcagatcacaaaatgctggtcagttccagaggaggagccatccacggaccaagatttcctcccagtacaaggactgattattcttgagaggcttgctaactttgatcttggaaactgcatggaaatcagcagaacaggcctcatctcaaagatgatagattttacaagctacagaaatcatatgataagtactaatgaagcccaccaaataatgctcgcaagtttgtcacttagggtcctgagaagacttgcaagtactgaagggaagttaggtgtaactctgcgacaacagattttggaacataccttcatattgagcaaccttgcagagatcatggatgacaatgggaacagccatgaactgaagcagctggcagcagaaatcctgaaaaaccttgccatggatagaaacactagtgcagacattgggcacatccgagtgatcatcagcagtttgatgcgtgcatttctcagccaagatccatcctcaagtacaaattctaatcacttgctatggaaaaatgccggtcaagcactggcaatgctggcaatggaaagtagagataactgtttggatgacaggttcaaatgtatagcagcaagcctgttgtggaatatgtgcgagcatgctcaatctgagctcagcaactcagaccttaaggaattgtcttacatcttacgagagactagagatagaaaaactgctaatttaagtgtcaattgcaatactggactactggagggagaaccgacctgcagtttccacattgtttttcaaatattgacaagcatgcacatctgtgctcttaatattgatagcattgtgctggaaggaataatggatgcagaaggggcagaactagaggtccttattggccttagttcacaaatatgtcaagtcattcctgaagactttgcccgagaagtagagcatggtcaaattaaggaaaaattcataaagaggcttgtcgaagtgcttaatgcacatatgaaacccagtgttcattgtcccagaatcaggagggtgattgttcagcatgccatatacttgatggaattcaattctcgctatgcaaatgatttccacaagtgctggatggtggaagcactatcaatggtggaacgtacaccctcgagggctgaaaactacaggttgctttcaggcgacacaggactcatggagcacaacacaccacttactgctcttgtggccagagcaaaagagctgatgggtcgtgaatgggtacggggcatcagcagtgtcacctaa
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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| Leaf | Root | Panicle | |||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g45480 | RBH | 0.0 | 0.056248 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os07g0648900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0025660 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0025740 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_07g0025560 | SBH | 0.049186 | 0.537736 | 0.329784 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_07g0025540 | SBH | 0.0 | 0.018999 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_07g0025760 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
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| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_07G0458300 | RBH | 0.0409145 | 0.049848 | 1.5721155 |
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| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_07g0025720 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_07g0025540 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_07g0025770 | RBH | 0.0 | 0.069202 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_07g0025460 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
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| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_07g0025470 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
