Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_06g0022980 OGI:06071880 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr06:26061931-26069954
Gene Symbol BGAL15, OsBgal15, OsBGal15, BGAL12, OsBgal12, OsBGal12
DNA seq

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Protein seq

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Function Putative beta-galactosidase 10 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q67VU7]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_06g0022980 OsKeNa_06g0022980.01 Chr06 26061931 26069954 - NAM
CDS seq

atgaagacgaagacggcggcggcggcgacctgcctcgtggcgctgctggtggtggtgctcgcggaggcggccggcgtgggcggcaccaccgtcacctacaatgaccgcagcctggtgatcgacggcgagcggcgcatcatcatttcgggatctatccactatccgaggagcaccccggagatgtggcctgatctgatcaagaaagcaaaggaaggtggccttgacgcgatcgagacctacgtcttctggaacggtcatgagccccatcgccgccagtacaacttcgtggggaactacgatattgtcaggtttttcaaggagatccagaatgctggcctgtacgctattcttcgcatcgggccatatatttgcggcgaatggaactatggaggacttcctgcttggctacgtgatattcctggaatgcagttcagactgcataatgcgccatttgagaatgagatggaaatcttcacgactctcattgtcaacaagatgaaggatgccaatatgtttgctggacaaggaggcccaatcatcctggcacagattgaaaacgagtacggaaatatcatgggccaactgaacaataaccagtccgcgtctgaatacatccattggtgtgcggacatggctaacaagcagaatgtcggtgtcccatggatcatgtgtcagcaagatagcgatgtgccacacaatgtggtgaacacctgcaacgggttctactgccatgattggttcccgaataggacaggaatccctaagatttggactgagaactggactggatggtttaaagcctgggacaagccggatttccataggtctgctgaagatattgcttttgcagttgcaatgttcttccaaaagcgtggttctctccagaactactacatgtaccatggtggaacgaattttggtcgcacctcaggtggcccatacatcacaactagttacgactatgatgcgcctttggatgaatatggtaatctccggcaaccaaaatatggccacttgaaggacctgcactccgtgatcaagtccattgagaagattcttgtccatggggaatatgttgacaccaactacagtgataaagtcacagttaccaagtacaccttggactccacctcagcttgtttcatcaacaacaggaatgacaacatggatgttaacgtaacccttgatggaaccactcatcttctgcctgcttggtctgtgagtatcttgcctgactgcaagaccgttgccttcaatagtgccaagatcaaggcccaaacgactgtcatggtaaacaaggctaatatggtagagaaggagccggagagcttaaaatggtcatggatgcgtgaaaatttgacgcccttcatgaccgatgagaagggaagctataggaagaatgagctcttagagcagattgtcacatcaactgatcaaagtgattacttgtggtacagaacaagcattaatcacaagggtgaggcaagctacactttgttcgtgaacacaaccggccatgaactatatgcctttgtgaatggaatgcttgttggtcaaaaccattctccaaatggacactttgttttccagcttgagtcaccagcaaagcttcacgatggcaagaactacatttctcttttgagtgctaccattggccttaagaactatggccctttgtttgagaagatgcctgctgggatagttggaggaccagttaagttgatcgacaacaatggcaaagggattgatctctccaacagttcgtggtcatataaggctggcttggcaggtgagtataggcaaatccaccttgacaagcccggttgcacatgggacaacaacaatggcaccgtacctatcaacaagccctttacgtggtacaagactaccttccaagctccagccggtgaggacacggtggtggtggacctcctggggctaaacaagggcgtggcatgggtgaatgggaacaaccttggccgttactggccatcatacacagcggcggagatgggcggttgccaccactgcgactaccgtggagtttttcaggctgagggcgatggccaaaaatgcctcacgggatgcggtgagccgtcgcaacggttctaccacgttccacgctcattcctcaagaatggtgagcccaacacagtcattctctttgaggaggccggcggtgacccatcacacgtcagcttccgcactgtcgcagcgggctccgtgtgcgcgtccgctgaggttggggacaccatcacactatcctgcggtcagcacagcaagactatctcagccatcaacgtgactagctttggtgttgcgcgtggccagtgcggcgcctataagggcgggtgcgagtccaaggcagcgtacaaggctttcacagaagcatgccttgggaaggagtcatgcacagtgcaaatcaccaatgcagtcaccggctccgggtgcctctccaacgtcctcaccgttcaggcttcatgttga

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.675935

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0628500 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g42310 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0628500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0023160 RBH 0.0 0.0 2.616188
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0019870 RBH 0.0 0.0 0.116007
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0023090 RBH 0.0 0.0 7.878468
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_06g0022750 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0023170 RBH 0.0 0.0 6.539180
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_06G0399300 RBH 0.043922 0 0.00497
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0022640 RBH 0.0 0.0 0.799900
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0379900 RBH 0 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0023110 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0023060 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0022690 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_06g0023450 RBH 0.0 0.0 0.564983
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0022990 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G022720 RBH 0.0 0.0 0.748882
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0022960 RBH 0.0 0.0 5.752944
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