Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_04g0005580 OGI:04027330 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:8127481-8146493
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q1MX30]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_04g0005580 OsKeNa_04g0005580.02 Chr04 8127481 8146493 + NAM
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_04g0005580 OsKeNa_04g0005580.03 Chr04 8127481 8146493 + NAM
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OsKeNa_04g0005580 OsKeNa_04g0005580.01 Chr04 8127481 8146493 + NAM
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A5 Chr04 8137266 8137388 + OsKeNa_04g0005580.01 OsKeNa_04g0005580.01,OsKeNa_04g0005580.03,OsKeNa_04g0005580.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.067250 0.901504 1.691618

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0226340 SBH 1.189854 1.123004 1.424481
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g15560 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0226340 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0004950 SBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0005200 SBH 0.0 0.0 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0005020 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0004930 SBH 0.0 0.0 2.347362
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0125800 RBH 0.048081 0.2694265 0.105891
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0005000 RBH 0.493003 0.281671 1.735155
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0133400 RBH 0.318297 0.413695 1.0462685
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0004790 SBH 0.225055 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0005110 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0004860 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0004750 SBH 0.0 0.0 0.140373
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0005010 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G005100 SBH 0.101089 0.370662 0.578283
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0004920 SBH 1.695326 36.677280 6.392571
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