Basic Info

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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ATGGCCTCCTCCCCCTCCGCCGTCGTCCTGCAGGCCGCCCTCGACGGCGACCTCCACCTCCTGTGTGAAATGGCCAAGAAGTTGGACCTGCGGGGATTCAAGGACATGAATGGGCGAAATGCGCTTCACTTGGCTGCAAGCTATGGGCATCTGGAGATCTGCAAGTTCCTGGTGGAGGAATCGGGCCTTGATGTCAACTCAGGCTCTCACAGAGGTGAGACACCAATACTTCTCGCCGCATGTGACGGGGACATTAATGTTTTAATATACCTTCTTGATCATGGTGGTGACCCAGCCATACCTAACGCGGGGGGCTTCACGCCGCTGCACTACGCAGCAGAGTACGGGCATGTTGATGTTGTGAGACTATTGCTGTCCAAAGGAGTTCATGTGGATCCTCTGAATTATAGTGGGGCCCCGCTGCACTTGGCTACCGCAAATGACCATGATCAGGTTGCGAAGGTTCTGCTTGAGCATGGTGCTGATCCCAACAGAGTTGTCAACCATGTCCTTTCACCACTCGTTGTTGCTTGCTGCAGCCACTCCTTGAAATGCATGAAGTTACTGATCAAGGCTGGTGCTGATGTGAATGATAGAAGTTCTACTGGACCAAGAACGACCCCTTTAGTGCTTGCAGTTGATGATGGATCAGCCGATATTGTCAAAATCTTGCTAGAGGCTGGAGCTGACCCTAACATTCGTAACGAGGATGGGAGGATTCCTATCATGATGGCAGCAGCTCGTGGTCAACGAGAGCTTGTTGAAATTCTGTTTCCTAGGACAAAACCAATTCCATTTCCTGTGGAAATACTAGTATCTGATTCGAAGTTAAATGCCAAGGAAGCATTTGCAGAGGGTGAATACATTACAGCAATCTACTTCTACACCAAGGCACTGGAAAAAGCCCCACTTGATGCCACCTTGTTCGCCAACCGCAGCCTCTGCTGGCTGCGGCTGCGAGAAGGAGACGTCGCTCTATTGGATGCGCGACGCTGCAAAGCCCTGCGCCCTGGTTGGTCCAAGGCATGGTACCGTGAGGGCGCGGCCCTCAGTCTCCTGAAGAACTACAGAGAAGCGGCGGCGGCTTTCACGGAAGCGCTGAAACTTGACCCTGAGAACTACGAGATCAAGATCGCGTTAAGAGAGGCGTTGGAGTACTGCCACATCTCTGATCTCACATTCTCTCTACAACCTTCTGGAACCGCGATGGCCCCCTCCCCTTCCGACGTCGCCCTGCAGGCCGCCCAGGACGGCAACCTCCGCCTCCTCAGGAAGATGGCGAAGAAGTTGGATTTGCGAGGAGTCAAGGACAAGAATGGCCTAAGCGCGCTTCACTTCGCTGCAAGCCATGGGCACCTGGATTGCTGCAAGTTCCTTGTGGAGGAATCGGGCCTTGATGTCAACTCGGTTGGTCACAAAGGTGAAACGCCAGTGTTCTATGCCGCGATCGATGGGAACGTTCAGGTTTTGGGGTACCTTCTTGATCATGGTGGTGACCCGGTGAAACCCGAGGAGAGGGGCTGCACGCCGCTGCACAATGCGGCAGAGAATGGGCATGATGAGGCTGTAAGACTATTGCTGTCCAAAGGAGTTCATGTGGATCCTCTGAATTATCGTGGGGCCCCACTGCACTTGGCTGCCTCAAAGGACCGGGTTCAAGCCATGAAGGTTCTGCTTGAACATGGTGCTGATCCCAACAGAGTTGTCAATCATATCTTTTCACCACTCATGATGGCATGCTGCGGGCACTCCTTGAAATGCGTGAAGCTACTTGTTGAGGCTGGCGCTGATGTGAACGGTAATAGTACCAATGGACCTACCCCTTTAACTGAAGCGGTTGATGACAGTTTAACCGATGTTGTCAAATTCTTGGTAGGGGCTGGAGCTGACCCTAACATTCCTGACGAGGAAGGGAGGATTCCTATCATGGTGGCAGCAGCTCGTGGTCAACGAGAGCTTGTTGAAATTCTATTTCCTCGGACAAAACCTATTCCATGTCTGCCAGATTGGAATGTTGACGGGATAATTAGAACTATGAGAACCACACGTATTGAACCTCAGGCAATGGATAAATCCCCACTTGATGCCACCTTGTTTGCCAACCGGAGCCTTTGCTGGCTGCGGCAGCGAGAAGGGGACAGAGCTTTACTGGATGCACAGCAGTGCAGGATGCTGCGCCCTGGTTGGTCCAAGGCATGGTACCGTGAGGGCGCAGCTCTCAGTTTCATGAAGGACTACAAAGGAGCAGTGGACGCATTCGGGGAGGCACTGAAACTTGACCCCATGAGCGACGAGGTCAAGAACGCGTTAAGGGAGGCGATCGAGTGTCTGAAGAGAGCTGCTTGA

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_12g0019410 OsKYG_12g0019410.01 Chr12 24488557 24499229 + NAM
CDS seq

ATGGCCTCCTCCCCCTCCGCCGTCGTCCTGCAGGCCGCCCTCGACGGCGACCTCCACCTCCTGTGTGAAATGGCCAAGAAGTTGGACCTGCGGGGATTCAAGGACATGAATGGGCGAAATGCGCTTCACTTGGCTGCAAGCTATGGGCATCTGGAGATCTGCAAGTTCCTGGTGGAGGAATCGGGCCTTGATGTCAACTCAGGCTCTCACAGAGGTGAGACACCAATACTTCTCGCCGCATGTGACGGGGACATTAATGTTTTAATATACCTTCTTGATCATGGTGGTGACCCAGCCATACCTAACGCGGGGGGCTTCACGCCGCTGCACTACGCAGCAGAGTACGGTGCGTTCCATGCTTTTCAGTTCACTCGCCATCTGTGGGATTTAAGGATGGTTCTTGCATACAAGTTGTTAGGAATCCTGTGTGCTAACATCGTTGTGCCCTCAGGGCATGTTGATGTTGTGAGACTATTGCTGTCCAAAGGAGTTCATGTGGATCCTCTGAATTATAGTGGGGCCCCGCTGCACTTGGCTACCGCAAATGACCATGATCAGGTTGCGAAGGTTCTGCTTGAGCATGGTGCTGATCCCAACAGAGTTGTCAACCATGTCCTTTCACCACTCGTTGTTGCTTGCTGCAGCCACTCCTTGAAATGCATGAAGTTACTGATCAAGGCTGGTGCTGATGTGAATGATAGAAGTTCTACTGGACCAAGAACGACCCCTTTAGTGCTTGCAGTTGATGATGGATCAGCCGATATTGTCAAAATCTTGCTAGAGGCTGGAGCTGACCCTAACATTCGTAACGAGGATGGGAGGATTCCTATCATGATGGCAGCAGCTCGTGGTCAACGAGAGCTTGTTGAAATTCTGTTTCCTAGGACAAAACCAATTCCATTTCCTGTGGAAATACTAGTATCTGATTCGAAGTTAAATGCCAAGGAAGCATTTGCAGAGGGTGAATACATTACAGCAATCTACTTCTACACCAAGGCACTGGAAAAAGCCCCACTTGATGCCACCTTGTTCGCCAACCGCAGCCTCTGCTGGCTGCGGCTGCGAGAAGGAGACGTCGCTCTATTGGATGCGCGACGCTGCAAAGCCCTGCGCCCTGGTTGGTCCAAGGCATGGTACCGTGAGGGCGCGGCCCTCAGTCTCCTGAAGAACTACAGAGAAGCGGCGGCGGCTTTCACGGAAGCGCTGAAACTTGACCCTGAGAACTACGAGATCAAGATCGCGTTAAGAGAGGCGTTGGAGTACTGCCACATCTCTGATCTCACATTCTCTCTACAACCTTCTGGAACCGCGATGGCCCCCTCCCCTTCCGACGTCGCCCTGCAGGCCGCCCAGGACGGCAACCTCCGCCTCCTCAGGAAGATGGCGAAGAAGTTGGATTTGCGAGGAGTCAAGGACAAGAATGGCCTAAGCGCGCTTCACTTCGCTGCAAGCCATGGGCACCTGGATTGCTGCAAGTTCCTTGTGGAGGAATCGGGCCTTGATGTCAACTCGGTTGGTCACAAAGGTGAAACGCCAGTGTTCTATGCCGCGATCGATGGGAACGTTCAGGTTTTGGGGTACCTTCTTGATCATGGTGGTGACCCGGTGAAACCCGAGGAGAGGGGCTGCACGCCGCTGCACAATGCGGCAGAGAATGGGCATGATGAGGCTGTAAGACTATTGCTGTCCAAAGGAGTTCATGTGGATCCTCTGAATTATCGTGGGGCCCCACTGCACTTGGCTGCCTCAAAGGACCGGGTTCAAGCCATGAAGGTTCTGCTTGAACATGGTGCTGATCCCAACAGAGTTGTCAATCATATCTTTTCACCACTCATGATGGCATGCTGCGGGCACTCCTTGAAATGCGTGAAGCTACTTGTTGAGGCTGGCGCTGATGTGAACGGGGCTGGAGCTGACCCTAACATTCCTGACGAGGCAATGGATAAATCCCCACTTGATGCCACCTTGTTTGCCAACCGGAGCCTTTGCTGGCTGCGGCAGCGAGAAGGGGACAGAGCTTTACTGGATGCACAGCAGTGCAGGATGCTGCGCCCTGGTTGGTCCAAGGCATGGTACCGTGAGGGCGCAGCTCTCAGTTTCATGAAGGACTACAAAGGAGCAGTGGACGCATTCGGGGAGGCACTGAAACTTGACCCCATGAGCGACGAGGTCAAGAACGCGTTAAGGGAGGCGATCGAGTGTCTGAAGAGAGCTGCTTGA

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Protein seq

MASSPSAVVLQAALDGDLHLLCEMAKKLDLRGFKDMNGRNALHLAASYGHLEICKFLVEESGLDVNSGSHRGETPILLAACDGDINVLIYLLDHGGDPAIPNAGGFTPLHYAAEYGAFHAFQFTRHLWDLRMVLAYKLLGILCANIVVPSGHVDVVRLLLSKGVHVDPLNYSGAPLHLATANDHDQVAKVLLEHGADPNRVVNHVLSPLVVACCSHSLKCMKLLIKAGADVNDRSSTGPRTTPLVLAVDDGSADIVKILLEAGADPNIRNEDGRIPIMMAAARGQRELVEILFPRTKPIPFPVEILVSDSKLNAKEAFAEGEYITAIYFYTKALEKAPLDATLFANRSLCWLRLREGDVALLDARRCKALRPGWSKAWYREGAALSLLKNYREAAAAFTEALKLDPENYEIKIALREALEYCHISDLTFSLQPSGTAMAPSPSDVALQAAQDGNLRLLRKMAKKLDLRGVKDKNGLSALHFAASHGHLDCCKFLVEESGLDVNSVGHKGETPVFYAAIDGNVQVLGYLLDHGGDPVKPEERGCTPLHNAAENGHDEAVRLLLSKGVHVDPLNYRGAPLHLAASKDRVQAMKVLLEHGADPNRVVNHIFSPLMMACCGHSLKCVKLLVEAGADVNGAGADPNIPDEAMDKSPLDATLFANRSLCWLRQREGDRALLDAQQCRMLRPGWSKAWYREGAALSFMKDYKGAVDAFGEALKLDPMSDEVKNALREAIECLKRAA

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
RI Chr12 24489351 24489727 + OsKYG_12g0019410.01,OsKYG_12g0019410.02 OsKYG_12g0019410.03,OsKYG_12g0019410.01,OsKYG_12g0019410.02 All
RI Chr12 24496719 24496847 + OsKYG_12g0019410.02,OsKYG_12g0019410.03 OsKYG_12g0019410.03,OsKYG_12g0019410.01,OsKYG_12g0019410.02 All
SE Chr12 24496847 24498450 + OsKYG_12g0019410.02,OsKYG_12g0019410.03 OsKYG_12g0019410.03,OsKYG_12g0019410.01,OsKYG_12g0019410.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0599900 RBH 0.000000 0.0 1.495135
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g40780 RBH 0.087377 0.103669 0.628659
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os12g0599900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0019700 RBH 0.000000 0.852965 1.608590
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_12g0019820 RBH 0.000000 0.0 1.243484
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0020140 RBH 0.148709 0.0 1.274304
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0019450 RBH 0.000000 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_12g0019060 RBH 0.207620 0.000000 5.677880
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0337600 RBH 0.965214 0.418421 17.753697
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_12g0018930 RBH 0.033913 0.000000 0.128630
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_12G0368000 RBH 1.3173265 0.6370245 5.7756065
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0019180 RBH 0.000000 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_12g0019320 RBH 0.504782 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0019350 RBH 0.000000 0.0 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_12g0019540 RBH 0.000000 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_12G019190 RBH 0.0 0.0 0.427780
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_12g0018940 RBH 0.0 0.0 0.868563
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