Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKYG_12g0018920 OGI:12063980 | 12/16 KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr12:23907400-23929993
Gene Symbol -
DNA seq

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Function B3 domain-containing protein LOC_Os12g40080 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2QMT6]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_12g0018920 OsKYG_12g0018920.01 Chr12 23907400 23922409 + NAM
CDS seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_12g0018920 OsKYG_12g0018920.02 Chr12 23922412 23929993 + NAM
CDS seq

ATGTTTGCAAAGAATGTCCAAGGTCTGATTTCTGGAGTAGCCAAACTAGAAGTTCCAGATGGCAAAACATATGATGTTGAGATATCTAAGGAACATAATGAGTTAGTATTTCGATCTGGATGGGAGGTGTTTGCCATTGCTTATGAACTCGAACAGGGTGATATCTTGGCTTTTGGTTACAGTGGGAACTCCCACTTCAAAGTTCAGATATTTAATCCAAGTAATTGTGAGAAAGAGTTATCCTGTGTTGTGATGAACAGGAGCATCTCTGATGATAACCATCGACAATCACCCAGAAGGGAAAGGATGAACAAGCCTAGCACAACATGCATGGACTGCATTACAAATCATTATTGGCTCCATATGGATGACAGGGAAAGATATTTCTTTAAGGTTATGATGAGTGTGAGTGATATCAAGGATGAACTGGCTATACCGAAAAAGTTTGCGGCCAATGTCAGAGGGAAGATACCTGAACAAGTCAGACTAGAAGTGTCAGATGGTAAAATGTATAACGTTCAAGTTACTGAGGAACAGGATGAGCTGGTCCTTCGATCTGGATGGGAAAATTTTTCCAGTACTTACCAACTTAAACATGGTGATCTCTTGGTGTTCATACATAGTGGGCACTCCCACTTCAAAGTTCTAATATTTGATCCAAGTTGTACCGAGAAAGAGTTCTCCTGTGTTGTGACGGACAACACTAGTCATGTGCATGAGAGGAGCATTTCTCATGATAATCATTTGCAATCACCAAGGAGTGAAATCTTGGGAAAGAATTATAGTCTTTGCTCTAGTAGGAAACGGTCAAGGATGAATCCAGCAGACTATCCTTCACAGAGACCAGACGTCCCATCTTCTGAAGACATTAAGGATCCCATGAGTTCAGGTGGCCTCCAGAAGTCAAAAAAGTCTTGCTATGTTTTACCAATGTTGTACAATATGACTAGTGCACAAGAGGCAGAAGTTCTCGCTCTTGAGAAGAAAATTCAACCTCAAATTCCACTGTACATCACAGCTATGGACAAGACAAGTGTGGCAAGTGGATCACTGGTCTTCTGTAAGAATTATGCTGTCAGATATCTTCTTGACCAAAATAGGACCATCAAACTATGTCAATCTGGTGGTAGCAAGACATGGGACATCAGTTTGGACATGGACACTGATGATCTATATGCCCTCTCTACTGGCTGGTTGGACTTCTTTCGCGGCAATCTGTTGCAAGAAGGTGACATCTGTGTATTTGAAGCTTCAAAGAGCAAGAGAGGAGTGGCATTAACATTTCATCCTTTCAAAGAAAGTCATTGCCCAAAGTCATCAGAATATACCCTTTCCACCAAGAGTCCTACACGTAGAGTTCCTAAGCGGGACTATTTTGCAACAAATCTTACTAATCTAACTGATCAACAAGAGAGGAAGGTTAAAAACAAAATAAAATCTATACAGTCTGATATCCCCATTTTCTTGTCTGTCATGCGCAGTTCCAACTGTACCCGTCAAAGTTCTCTGTGCTTCAGCGTGAAATACGCTTCAAAGTATCTCCCACATAAAGACCAAAATATGAGGCTGCGGCTGCCGGAGACGAAATATAAGTGCAAAGCTGCGTTACATATCGACACAAGCACCAATCTTCACAAGCTTCTCAAAGGCTGGGGGAAATTTGTCAACGATAACAAATTAGAAATACATGATATCTGCCTCTTCCAGCTTATGAAAAACAAGAAAAAGCTTACAATGACCATCCATATCATTCGAAAAGGCGAGATGGAAAAATCTCACAGAGTCTGCAAGAATTGTGTTGCAAATCATTATTGGCTCCACATGGACAATCACGGAAAGAGTTTCATCAAGGTTATGATTACTGATTTCAAAAATGGAGTGACTATACCAGCGAAGTTTGCACGCAATTTCGGAGGGCAGATGTCTGGAACAGTCAAACTCGAAACTCGCAATGGTAAAACATATGAAGTTCAAGTTGCCAAGGAACTAAACAATCTTGTCCTCCGATCTGGATGGGAAAGATTTGCCAGTGCTTATGAGCTTGAAAAGGGTGACATTTTGGTGTTCATATACAGTGGAAACTCCCACTTCAAAGTCTGGATTTATGATCCAAGTGCTTGTGAGAAAGAATTACCCTGTATCATAACGGAACAGCTTCCTCGTGTACAACAAAGGAGCATCTCTCATAATAATCATACTCAATTGAAAAGGAATGCAAAGTCAGCTAAGCTGTATGTTGATAGCTCTGGTCACAGTAAGGAAACTTCAGAGACAAATCCAGCAAACTCTCCTTCATGGAAACCAACTGAAAGGGTCCCATCTTCTGAAGAACTTGATGAACCCGTGGATTTGGCCAACGTCCAGAAGGCAACCAAGTCTTTCTATTCGTTACCAAGGATGTGCAATATGACCAGTGCACAAAAGGCTGAAGTAGATGCTCTTGAGAAGAGAATTAAACCTCAAATTCCATTTTACATCACAGTCATGGACAAAGCAAGTGCGACTGACGGATTACTGGCCATCTCGAAGGATTATGCTGTCAGTTATCTTCTTGACAAAAATGAGACCATCAAACTATGTCATTCTGGTCGTAGCATGACATGGGATATCAGTTTGGACATTGACACTGATGATCAGTATGCCCTTTCAACTGGTTGGTTGGACTTCATTCGCAACAATCATTTGCAAGAAGGTGATATCTGCGTATTCGAAGCATCAAAAAACAAGAGGGGAGTTGCATTGATATTTCATCCTTTGAAGCAGAGCCATCACCCAAAACCGCCAGGATGTGTTCCTTCCACCAAGTTTCCTAGGCATGGAGTTAGTAAGCCTAACTACATTGTGTCAAGATTTACCACTCTATCTGGTCAGCTTAAAATAAAAGTGGAAGCCAAAGTACAAGCTATTCAATCCGAAATCCCCATTTTTGTAGCTGTCATGCGGGAAAGCTTCATTAGAGGCAGGTCAAGATATATGTGCTTCAGTGCAAAATATGCTGCCAAATATCTCCCACGGGAGAAGAACAAAATTATGAGTCTTCGACTGCCCAATAAGAGCTACAAGTATAAGGCTGTATTCAAGATCAATAACAAAGTTCATAAACTTGGTGGAGGATGGGGGAAATTTGTCGATGACAACAAAATAAAACTAGGTGATATCTGCCTCTTCCAGCTCATGAAAAACAAGAAGAAGCTCATGATGATGGTCCATATCATCCGAAAATCTGAGTTCTGCTGA

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Protein seq

MFAKNVQGLISGVAKLEVPDGKTYDVEISKEHNELVFRSGWEVFAIAYELEQGDILAFGYSGNSHFKVQIFNPSNCEKELSCVVMNRSISDDNHRQSPRRERMNKPSTTCMDCITNHYWLHMDDRERYFFKVMMSVSDIKDELAIPKKFAANVRGKIPEQVRLEVSDGKMYNVQVTEEQDELVLRSGWENFSSTYQLKHGDLLVFIHSGHSHFKVLIFDPSCTEKEFSCVVTDNTSHVHERSISHDNHLQSPRSEILGKNYSLCSSRKRSRMNPADYPSQRPDVPSSEDIKDPMSSGGLQKSKKSCYVLPMLYNMTSAQEAEVLALEKKIQPQIPLYITAMDKTSVASGSLVFCKNYAVRYLLDQNRTIKLCQSGGSKTWDISLDMDTDDLYALSTGWLDFFRGNLLQEGDICVFEASKSKRGVALTFHPFKESHCPKSSEYTLSTKSPTRRVPKRDYFATNLTNLTDQQERKVKNKIKSIQSDIPIFLSVMRSSNCTRQSSLCFSVKYASKYLPHKDQNMRLRLPETKYKCKAALHIDTSTNLHKLLKGWGKFVNDNKLEIHDICLFQLMKNKKKLTMTIHIIRKGEMEKSHRVCKNCVANHYWLHMDNHGKSFIKVMITDFKNGVTIPAKFARNFGGQMSGTVKLETRNGKTYEVQVAKELNNLVLRSGWERFASAYELEKGDILVFIYSGNSHFKVWIYDPSACEKELPCIITEQLPRVQQRSISHNNHTQLKRNAKSAKLYVDSSGHSKETSETNPANSPSWKPTERVPSSEELDEPVDLANVQKATKSFYSLPRMCNMTSAQKAEVDALEKRIKPQIPFYITVMDKASATDGLLAISKDYAVSYLLDKNETIKLCHSGRSMTWDISLDIDTDDQYALSTGWLDFIRNNHLQEGDICVFEASKNKRGVALIFHPLKQSHHPKPPGCVPSTKFPRHGVSKPNYIVSRFTTLSGQLKIKVEAKVQAIQSEIPIFVAVMRESFIRGRSRYMCFSAKYAAKYLPREKNKIMSLRLPNKSYKYKAVFKINNKVHKLGGGWGKFVDDNKIKLGDICLFQLMKNKKKLMMMVHIIRKSEFC

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0591500 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g40080 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os12g0591500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0019210 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_12g0019320 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0019660 SBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0018980 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_12g0018580 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0329900 RBH 0.0214435 0 0.01045
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_12g0018450 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_12G0359300 RBH 0 0 0.7347095
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0018690 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_12g0018930 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_12g0018840 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0018870 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_12g0019050 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_12G018710 SBH 0.0 0.0 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_12g0018400 SBH 0.0 0.0 0.607428
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