Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKYG_11g0024390 OGI:11081610 | 16/16 KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:31433385-31449481
Gene Symbol -
DNA seq

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Protein seq

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Function Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:F7J0N2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_11g0024390 OsKYG_11g0024390.01 Chr11 31433385 31449481 + NAM
CDS seq

ATGGAGGGCGCCATGGTCAGCCTCCCCGGGAGGCTGGAGGAGCTAGTGCGTCGTCACGGCAGCAAGCTGCCCAAGGGTGCAGAGGAGGAGATATCGCTCATCAAGCAAGACCTCGAGAAAATAATATCCGTTCTCCATGGTCACAGCGAGCCAAAACTGGAGGGGCAGGCCATGGTGGTGAGGTGCTGGATGAAGGAGGTGCGCGAGCTCTCCTACGACATCGAGGACTGCATCGACCACTACGAGCACGCCTCAGCTTGGTCCAGTATTCATCGTAGTAAGATCACTCGGCGGCGATGGAGTTGGACGAGGGGCGAAAGGACCCCTCGGCTCCCTGAGAGGCTGAAGCAGCGGCTATGGATGGCGAACAAGATCAGAGAATTCAGCACTCGCTCGCAGGAGGCGCTTCAACGCCACGCCATGTACAACAACCTCAGTGGCATCGCCAGTACTGCTGCTTCTTCTACATGTGATGCATCTTCTAGCTCATCTTGGCATCCTGGACAGGATGGGAAGGAGAATGGTAAGGTCGGTATCGACTCCTCTGTGGACATGCTCAAAGGTTGGCTGACTGATGGAGAGGAGAAGCTCAAGGTGGTGTCCATTGTGGGAGTCGGAGGAGTCGGCAAGACGACGCTTGCTAACGAGCTGTACCGCAAGCTTCAATGGCAGTTCGAGTGCCAGGCATTCGTGCGCACATCGCAGAAGACTGATATGAGGAGGATTCTCACCAGCATGGTCTCGCAGGTTCGCCCGCAGCAGCCACCTGATAATTGGAAGGTGAATCTTGAGAAACAAGAGCGATGGAATTATATAAACAAGTCCTTAGGTTACAGTTTGATGACAAACCCTAATTTGGAAGGGATGAAACAACTACTGAATTTCTGTTACAACAATCTTCCTCAGCATTTGAAGGCGTGCATATTGTGTCTTATTATGTATCAAGAGGGTAACATAATTTGGAAGGATGATTTGGTGAATCAATGGATAGCTGAAGGTTTTATATTTGCAATTGAAGGGCATGTCAAGGAAGAAATTTCAAGAGTCTATTTTGATGAGCTTGTTGGTAGAAACATTATCCAGCCTGTACATATCAATAACAATGTTCACCATATGGTACTCAATTTTATTACATGCAAGTCGATGGAAGAAAATTTTATGGTTGCTATAGACCATTCACAGGCAGCTACAAGATGTGCTGACAAGGTTCGACGATTATCTATGCACTTCGGTAACATAGAAGATGCAACTCCACCAACTAATATAAGATTGTCCCAAGTTCGGACACTTGCCTTTTGGGGGGTCTTGAAGTGCATGTCTTTTATTACGGGGTTTCAACTTCTTAAAGTTCTAACTCTACATTTTTGGGGAGATGAGGATAGCATCAGCAGTTTTGATCTCACAAGAATTTCTGAACTTGTCCAACTGAGATATTTGAAGGTCACCTCTAATGTCACCTTAAAACTGCCAACCAAGATGCAAGGTCTACAATATTTGGAGACACTGAAAGTTGATGGAAATATAGATGGAGTTCCATCAGACATCATCCATTTGCCAGGCTTGCTGCATCTTAGTCTTCCTGCTAAGACAAACCTGCCCAGTGGAATCGTCCACATGACATCGCTTCGAACACTTGGATATTTTGATCTCAGCTGTAACTCAGCAGAGAATCTACTGAGCCTGGCTGAGCTGACCAATCTCCGGGATGTACAGCTCACCTATTCTGCTGCACATTCTGATGATCTGAAGAATAATATGCAATGCCTTGGATCCATTTTGGAGAAACTCAGCAACCTCAAGTCTATAACTCTGGCACAACCAGGCTCCTCTTATGCAAATACTCTGCACGTTGATAGTGCTACAAACATGAGGATATCTGTTGCTGGCTGGAGCATCCTGTCCTCTCCACCGGCCCTTCTTCAGAGGATTGAGTTGTTACCTATCCCGAATTGGATTGGGAAGCATGGAAATCTCCGCATTTTAAAGATTGGGATTAGAGAAATAACAAGTAATGATGTTGATGTTCTCGGAGGATTACCCGCACTCACTGTTTTGTCACTGTATGTCCATACAAAACCTATAGAAATGATTATCTTTGACAAGGAAGGATTCTCAATCCTGAAATACTTCAAGTTTAGATGCAGCGTAGCGTGGATGAAATTTGAGGCCGGTGCAATGCCTAATCTTCAGAAGCTCAGGCTAGGTTTTGATGTTCATCGAGCAGATCAACACGATACTATTCCAGTCAGAATCGAACATCTGTCTGGAGTTGAAGAGATCTATGCAAAAATAAGGGTCACCTCTACTGCTGATGATCTTTGTAGAAGATTTGCAGAGTCAGCATTGACTAACGCCGTTAGGATGCATCAAGGAAGTCCTAGTGTCAATATACGGTGTGTAGATTGGATCTTCGATGGTAAGGATGATAACATTGCCAAGAAACGAGAGGTAGAACATAGGATTTTGCAACAACAACCACATATTGTGAAAGAAGGCTCAAATGAGAAATCCGCATTTCTACAAAAGAACCTCGGGGAGGGAGCACATAAATCTGTTGGCAGCAGGAAGGAACCACAGATGGAAAGAAGGAAGGTGATCAGGATGAGTTATACAGAGGATGACGGCTTCAGCTGGAGGAAGTACGGGCAGAAGGACGTGGAAGGCGCCATGCACCCAACTACCCAAAGTAATTATTTCCGATGTGCCCACAAGATGACGACGGGCTGTAAGGCACGGAAGAAGGTGCAGCGCACCGACGGCGACCCGCTGATGGTCGACGTCGTATACAAGGGGGTTCACAGCTGTGCCGGCGTGCATTCCGACAGCCAGAGATCATCCGCCGCGAGCTCTAAGTCTAACCTGCGGCCGACGAAGAGCATACAGGTGAGGGCGAGCTCCAAGGACGTCGGCCCCCCAGACGACGGTTACAGCTGGAAGAGGTACGCCCAGAAGAACATCTTCGGCGCTAATTACCCAAGGTTAGTGGCTGATTAA

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Protein seq

MEGAMVSLPGRLEELVRRHGSKLPKGAEEEISLIKQDLEKIISVLHGHSEPKLEGQAMVVRCWMKEVRELSYDIEDCIDHYEHASAWSSIHRSKITRRRWSWTRGERTPRLPERLKQRLWMANKIREFSTRSQEALQRHAMYNNLSGIASTAASSTCDASSSSSWHPGQDGKENGKVGIDSSVDMLKGWLTDGEEKLKVVSIVGVGGVGKTTLANELYRKLQWQFECQAFVRTSQKTDMRRILTSMVSQVRPQQPPDNWKVNLEKQERWNYINKSLGYSLMTNPNLEGMKQLLNFCYNNLPQHLKACILCLIMYQEGNIIWKDDLVNQWIAEGFIFAIEGHVKEEISRVYFDELVGRNIIQPVHINNNVHHMVLNFITCKSMEENFMVAIDHSQAATRCADKVRRLSMHFGNIEDATPPTNIRLSQVRTLAFWGVLKCMSFITGFQLLKVLTLHFWGDEDSISSFDLTRISELVQLRYLKVTSNVTLKLPTKMQGLQYLETLKVDGNIDGVPSDIIHLPGLLHLSLPAKTNLPSGIVHMTSLRTLGYFDLSCNSAENLLSLAELTNLRDVQLTYSAAHSDDLKNNMQCLGSILEKLSNLKSITLAQPGSSYANTLHVDSATNMRISVAGWSILSSPPALLQRIELLPIPNWIGKHGNLRILKIGIREITSNDVDVLGGLPALTVLSLYVHTKPIEMIIFDKEGFSILKYFKFRCSVAWMKFEAGAMPNLQKLRLGFDVHRADQHDTIPVRIEHLSGVEEIYAKIRVTSTADDLCRRFAESALTNAVRMHQGSPSVNIRCVDWIFDGKDDNIAKKREVEHRILQQQPHIVKEGSNEKSAFLQKNLGEGAHKSVGSRKEPQMERRKVIRMSYTEDDGFSWRKYGQKDVEGAMHPTTQSNYFRCAHKMTTGCKARKKVQRTDGDPLMVDVVYKGVHSCAGVHSDSQRSSAASSKSNLRPTKSIQVRASSKDVGPPDDGYSWKRYAQKNIFGANYPRLVAD

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0685400 RBH 5.658151 4.260761 0.572070
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g45840 RBH 5.631825 5.050056 1.784015
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0685400 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0024350 RBH 0.0 0.0 0.381606
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0024250 SBH 0.0 2.672616 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0023770 SBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0023710 SBH 0.023583 0.155662 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0024120 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0438300 RBH 0.0263225 0.032052 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0024500 RBH 0.0 0.0 0.116773
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0436300 SBH 11.35386 0.322364 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0024380 RBH 0.0 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0023740 SBH 2.832259 19.498186 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0023610 SBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0023990 SBH 0.0 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G024000 SBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0024190 SBH 0.0 0.0 0.0
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