Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKYG_11g0023820 OGI:11077650 | 16/16 KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:30618355-30639950
Gene Symbol YR2, YR6, YR9, YR10, YR21, YR23, DRP-RP13, OsDRP-RP13, Osh359-2
DNA seq

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Function Putative disease resistance protein RGA4 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA39]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

MATILGSLVGSCVNKLQGIITEEAILILGVKEELRKLQERMKQIQCFINDAERRGMEDSAVHNWISRLKDVMYDADDIIDLASFEGNKLLNGHSSSHRKTTACSALSPLSCFSNIRVRHEIGDKIRTLNRKLAEIEKDKIFATLENTQPADKGSTSELRKTCHIVEPNLVGKEIVHACRKLVSLVVAHKEDKAYKLAIVGTGGIGKTTLAQKIFNDQKLKETFNKHAWICVSQDYTPVSVLKQLLRTMEVQHAQEESVGELQSKLESAIKDKSFFLVLDDLWHSDVWTNLLRTPLHAATSGIILITTRQDTIAREIGVEEPHRVDLMSPAVGWELLWKSMSIQDEKEVQNLRDIGIEIIQKCGGLPLAIKVIARVLASKDKTENEWKKILAKNVWSMAKLPKEISGALHLSYDDLPQHLKQCFLYCILFPEDWFLKRDELIMMWVAEGFVEVHKDQLLEDTAKEYYYELISRNLLQPVDTSFDQSECKMHDLIRQLACYLSREECYIGDLKPLVDNTICKLRRMLVVGEKDTVVIPCTGKEEIKLRTFTTDHQLQGVDNTFFMRLTHLRVLDLSDALVQTIPDYIGNLIHLRLFDLDGTNISCLPESIGSLQNLLILNLKRCKHLHSLPLATTQLCNLRRLGLAGTPINQVPKGIGRLKFLNDLEGFPIGGGSDNTKMQDGWNLEELAHLSQLRCLDMIKLERATPCSSTDPFLLTEKKHLKVLNLHCTEQTDEAYSEENARNIEKIFEKLTPPHNLEDLFVRNFFGCRFPTWLGTNHLPSVRSMTLVYCKSCVHLPSIGQLPNLKYLKIYGASAITKIGPEFVGCWEGNLRSTEAVAFPKLEVLIFYDMPNWEEWSFVEEEEEVQEEEASAAAKEGGEDGIAASKQKGEEAPSPSPRSSWLLPCLTRLDLVVCPKLRALPPQLGKQATNLKDLFIWGASSLKMVEDLVFLSSGLSIVGCEGLERISNLPQVRELRAGGCPNLRCVEELGGLEQLRLYKDMQDISSPWVSMLQEQHHQLNGDEHVLESPVWEHAQATGWATVGLTKPTLVNKKISGSEQVAGEQVVTVADGDMVLSAQPEKEMTAAMLLKSSGHAGSHYPVTGSNEAVAVGLAPHMTSIRRSDRSNSETALGIASADDDSLLKAMKRKAAINLDDQFAPYGARPALLASPQGTANEPFTSSCSASQLSFCSSLNRIGVSLGNNSAEVDFSIKALKHINVDKLKVIPKANSSFSLNQCRHG

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKYG_11g0023820 OsKYG_11g0023820.03 Chr11 30637042 30638823 + IsoSeq
CDS seq

ATGCCTTTGTATTTGTTCCAATTGATTAATATTTTAGTTATATCCCTAAGAAATAAAATAAGCGGGGTATATTGCCCTACCTACATGCTTATGTGTAGTTCATATGTGGCTTTT

Protein seq

MPLYLFQLINILVISLRNKISGVYCPTYMLMCSSYVAF

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.957821 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0676200 RBH 0.035527 0.072868 0.057889
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g44990 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0676200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0023700 RBH 0.0 0.0 0.306158
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0023430 RBH 0.000000 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0023110 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0022890 SBH 0.057065 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0023280 RBH 0.0 0.0 0.272932
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0410200 SBH 0.016715 0.3187185 0.003874
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0023940 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0431500 RBH 0.034717 0.3487665 0.031508
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0023780 RBH 0.0 0.141676 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0023840 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0023400 SBH 0.000000 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0022990 SBH 1.870009 0.0 3.727034
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0023070 RBH 0.000000 0.094757 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G023370 RBH 0.0 0.525740 0.169822
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0023800 RBH 0.0 5.158051 0.000000
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