Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKYG_11g0004870 | OGI:11010520 | 16/16 | KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:3639145-3676491 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK312, OsRLCK312, HWI1, 25L1, RLCK314, OsRLCK314, 25L2, Hwi1 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKYG_11g0004870 | OsKYG_11g0004870.02 | Chr11 | 3650685 | 3676491 | + | NAM | ||
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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AAATCATGGGCTTTGTAATGGGGCAATGGAGCTGGACCTACCCAGATGCGCTACTATATCTTCTAGTGTTAGTAAGCACAAACCATCTCATCTACTCATGTTTTTTGTCCCATTTGCCAGTGTGGTTTCACTAGCTATGGTCACATGTATCATCCTGTTTTGGAGGAAAAAACAGAAAAAAGAATTTGTCTCGTTACCTTCTTTTGGTAAGAAGTTTCCCAAAGTTTCTTATAGGGATCTAGCTAGGGCAACAGATGGGTTCTCTGCATCCAATTTAATTGGCACCGGAAGATATGGTTCAGTATATATGGGGAAGTTATTTCATAGTAAATGTCCAGTTGCTGTGAAAGTCTTCAATCTTGACATAAGAGGAACACAGAGGAGCTTTATATCAGAATGTAATGCTTTAAGAAATCTTCGGCATCGCAACATTGTACGGATTATAACAGCTTGCTCAACAGTTGATTCGAAAGGAAATGATTTCAAGGCTTTAATTTATGAATTCATGCCCAGAGAATGCGCAGAGAGTGGTCAAGTTTCAACAGCCACAGATGTTTACAGCTTTGGTGTCGTTCTCCTTGAGATATTCATCCGAAGGAGGCCAACAGATGACATGTTTAATGATGGACTGAGCATCGCAAAATTTGCAGAGTTGAACCTCCCTGATAAGGTGTTGCAGATTGTTGATCCCCAGCTGCAGCAAGATCTGGAGACTTGCCAAGAAACCCCGATGGCCATAAAAAAGAAACTCACAGATTGCCTGCTTTCAGTCCTAAAACCAAAATTGGAACTAGCCATGAAAGCTCCTTCAGTTGGAGAGCTTCTCTTGGTGTTCATAGCCTGCTCTTGCTGTGCACATGTCGTTGTCTGCAGCTCGTTGCCTGGAAATGAGACAGACAGACTGTCACTGCTTGAGTTCAAGAAGGCGATCAGTGGTGATCCACAGCAATCCCTGAATTCTTGGAATGAAAGCACCCACTTCTGCAAGGACGTCTTGTGCAGGGCGAAAGCTCCACTCCGTGTCACTTCTCTGAACCTGACAGATTGTGGTTTAGCAGGCAATATCTCTCCATCAATTGCCAACCTGACATTCCTAAAGTCTCTTTCTCTGGGTAAAAATTCATTCTTTGGAGAAATCCCTGCATCACTTGGCCACCTGCATCGCCTACAAACTCTTGTTTTGAGTTACAACAAATTGCAAGGGAGGATACCTGATCTGGCAAACTGTTCTAACCTCAGGTCCCTATGGCTTGATCGCAATAATCTTGTCGGAAAAATTCCAAATTTGCCGCCTCGGCTTCAAGAGCTTATGCTTCATGTTAACAACCTGAGTGGAACTATCCCTCCTTCTTTGGGCAATATCACAACGCTAACTAAGTTTGGTTGTGCATTTAACAATATTGAGGGTAACATCCCAACTGAATTTGAAAGGTTGCCTGGGCTTCAGTATTTATCAGTCAATACCAATAAGTTAGCAGGTTGGTTTCAACTAGCCATCCTAAATATTTCCACTCTTGTTACTCTTGATCTTGGTGCGAATAATCTTCGGGGGGAGGTACCATCTAATCTTGGAAACTCTTTGCCCAACCTCCAGTATCTCATATTGTCAGACAACTTCTTTCATGGGCATTTCCCTTCTTCATTGATAAATTCTTCCAAGCTGAACCTTATTGACATGGCAGAGAATAATTTCACTGGGGTGATCCCTAGCTCCATTGGAAAGCTTGCAAAACTCAACGTTTTGAGTCTTCAGTTGAATCAATTTCAAGCTGGCACCAAGAAAGAGTGGGAGTTCATGGATAGCCTGGCCAATTGTACTGAGCTAGAAGTTTTCTCCGTAGCGAGAAATCATTTACAAGGCCAAGTACCAAGCTCACTAAGTAATATTTCTTCTCAGCTTCAGTATCTATATTTAGGGAAAAATCAACTATCTGGAGGTTTTCCTTCTGGAATAGCAAAATTCCACAACCTAATTATTTTAGGATTGGATCACAATCAATTTACAGGTGTTGTTCCAGAGTGGCTTGGAACTCTTCAAGCATTACAAAAATTAAGCTTGCTTGACAACAACTTCATAGGGTTTCTTCCAACCTCCCTTTCAAATTTGTCTCAATTGAGTGAACTCTTTTTGGGCTCTAACAAATTTGACGGGAACATACCACTAGGCTTGGGTGACCTCCAAATGCTTCAAGTATTGAGTATTTCCAACAACAATATTCAAGGTAGGGTACCCAAGGAGATCTTCAACCTTCCAACAATAACGGAAATTGATTTATCGTTCAACAAGCTATTTGGGCAACTTCCTACTGAAATAGGCAATGCCAAACAACTTGCATCTTTAGAGCTTTCCTCCAATAATCTAGAAGACATCAGGTTGGATAGAAATGCTTTTACTGGAATCATCCCTACTTCATTAGGCAACATAAGAAGCTTAAAAGTTCTCAATTTGTCTCACAATAAATTAACTGGATCAATACCAGTATCGCTTGGCAACCTACAGCTTCTTGAGCAACTTGATTTGTCATTCAACCATCTTAAGGGCAAGGTCCCGACAAATGGTGTTTTCATGAATGAAACTGCCATACAGATTGATGGAAAATCATGGGCTCTGTGGTGGAGCAATGGAGTTGCACCTACCAGAATGTTCTATGACTCCAAATCCAACCAAATCTAA
More
|
|||||||
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.120554 | 0.0 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g07160 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0173432 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0004920 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0004850 | RBH | 0.051975 | 0.000000 | 0.916183 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0004910 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.784180 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0004780 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0004690 | RBH | 1.542370 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0061200 | SBH | 0.3629345 | 0.024787 | 0.005779 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0004770 | RBH | 0.065024 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0062000 | RBH | 0.2778095 | 0.5982645 | 5.1810125 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0004660 | SBH | 0.048991 | 0.035928 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0004820 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0004840 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0004770 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.561966 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0004800 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G004850 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0004770 | RBH | 0.000000 | 2.348453 | 0.000000 |
