Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsKYG_11g0002200 | OGI:11005240 | 16/16 | KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:1585593-1596419 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MRSLLAFFAASILLASTTTTVHGVHIDPNDIIKTIEIVEKMVVLGGNNSFKFAEQAWHRSAAYGVNGPYHGASVWLPIWKVGVGPSEFSKSYLAIASPTVYPQFFGDDLPRLYIYSTNDGGVKLKCFNLECSFVQTSKKHAIGAKYDKFSTDDGPAVWWVSLMDEPIGYFHESAFAAPFIESFHNEMGGHVLDRRLGGRHTLTPMGSGMYPSDGLQNAACIHAYLAIAYTGADQVDDPVNTIVTHPKCYDVKDDGPDLYRPGINVAFGGPAFGQRNLRVFPLRRHIWDAVFQHGPYNCTIQRRWKKPVDSARTRQEGRTRDHKLDKLMIQLKNLRLALDLHELISQQRNGFASLQLLSRWRHEVGLNIEIGAFLKKYPHIFYIYVHPVKRNECCKVTPKMAELIAEEDAVIRENEPAIVKRLKKLLMLMKDGTLNMHALWLIRRELGLPDDYRAKEYTEKWLAESETKYVFPINLPAGFKIENGFREKLGNWQRLPYTKAYDKNDLHPIHNVGRLEKRIVGILHELLSLTVEKMIPLERLSHFRRPFGMEVNLRELILKHLGIFYISTKGSTQHVLLRESYSKGCLVDPNPVYNGKVFQREGALHHRLRAVLSLNYEQAAVEYSKEVRKRRGIIWKRQQMPTESSDHLSKTATMDAPFLSTSLAVLATLFLLALPLSAATHDILPLKSSLFVEEYETNILQSSDGTFSCGFYNITNAYNITSAFTFSIWYSNSADKAIVWSANRGRPVHSRRSEITLRKDGNIVLTDYDGTVVWQTDDPDYQYYENNRNLYNSTRIGSLDDYGEFFSSDLAKHQARVASDRSLGIKRRLTLDYDGNLRLYSLNNSDGTWTISWIAQPQTCMTHGLCGPYGICHYSPTPRCSCPPGYKMRNPGNWTQGCKPIVEIACDGKQNVTFLQLRNTDFWGSDQQRIEKVPWEVCWNTCISDCTCKGFQYQEGNGTCYPKSFLFNGRTFPTPFVRTMYIKLPSSLDVSKKPIPQSSIHDYTLSGLDCDHLNTITTEAVRNMNKIGGEEPKWFYFYGFIGVFFIVEVFFFAFAWFFVLRKEMRSSQVWIAEEGYRVMTSHFRMYSHRELVKATERFKHELGWGGSGVVYKGILDDDRAVVIKKLENVTQNREEFQDELHVISRINHMNLVRIYGFCSERFHRLLVLEYVENGSLANVLFNSKILLDWKQRFNIALGVAKGLAYLHHECLEWVIHCNLKPENILLDENLEPKITDFGLAKLLSRSGSNQNVSRARGTIGYIAPEWISGLPITAKVDVYSYGVVLLELVSGRRVFDLIVGEDKTKVHEMLKKFIKMICYRLDNEKSLWLAEFVDFRVGDEFNYLQAKTLVKLAVSCLEEDRKKRPTMESIVESLLSVDLARS |
||||||||||
Function | Putative receptor protein kinase ZmPK1 [UniProtKB/Swiss-Prot:P17801] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsKYG_11g0002200 | OsKYG_11g0002200.01 | Chr11 | 1585593 | 1596419 | + | NAM | ||
CDS seq | ATGAGGTCTCTTCTTGCATTCTTTGCAGCAAGCATATTGTTGGCTTCAACGACAACTACTGTTCATGGTGTACATATCGATCCCAATGACATTATCAAGACCATAGAGATAGTTGAGAAGATGGTGGTGTTGGGAGGAAACAACTCGTTCAAATTCGCGGAGCAGGCATGGCATCGAAGCGCGGCATATGGAGTGAATGGGCCATATCACGGTGCATCGGTGTGGCTTCCTATATGGAAAGTTGGGGTGGGACCCTCTGAATTCTCCAAGAGCTACCTCGCCATCGCCAGTCCAACAGTTTACCCTCAATTTTTTGGTGACGATCTTCCTCGGCTCTACATATACTCCACTAACGATGGTGGCGTGAAATTAAAGTGCTTCAACCTTGAGTGTTCTTTCGTCCAGACCAGCAAAAAGCACGCCATTGGTGCTAAATACGACAAGTTTTCCACGGATGATGGGCCGGCGGTGTGGTGGGTGTCGCTGATGGATGAGCCGATCGGCTACTTCCACGAGAGCGCGTTCGCGGCGCCCTTCATCGAGAGCTTCCACAACGAGATGGGAGGGCATGTGCTGGACAGGAGGCTGGGAGGGCGGCACACGCTCACCCCGATGGGCAGTGGCATGTACCCCTCCGATGGCCTCCAGAACGCAGCCTGCATCCATGCCTACCTCGCCATCGCCTACACCGGCGCCGACCAAGTCGACGACCCCGTCAACACCATCGTCACCCACCCCAAGTGCTACGACGTTAAGGATGATGGCCCCGACCTCTATCGCCCCGGCATCAATGTCGCCTTTGGTGGCCCTGCGTTTGGTCAAAGAAATCTGCGTGTCTTTCCCCTCAGAAGGCACATATGGGATGCGGTGTTTCAGCATGGTCCTTATAATTGCACCATACAGAGGAGGTGGAAAAAACCAGTTGATTCAGCAAGAACTCGACAGGAAGGCAGAACAAGAGATCATAAACTGGACAAGCTGATGATTCAACTGAAGAACCTGAGGCTAGCTTTGGATTTACACGAGTTGATATCTCAGCAGAGGAATGGCTTTGCATCTCTCCAACTCCTCTCCAGGTGGAGACATGAGGTTGGCCTAAATATTGAGATTGGCGCTTTCCTTAAGAAATATCCCCACATTTTTTACATTTATGTGCACCCAGTCAAAAGGAATGAATGCTGTAAGGTCACCCCAAAAATGGCTGAATTGATTGCAGAAGAAGATGCTGTCATCAGGGAAAATGAGCCTGCTATTGTTAAGCGGCTGAAGAAGCTCCTCATGCTAATGAAAGATGGAACTCTGAATATGCATGCATTGTGGCTCATAAGAAGGGAACTTGGCCTGCCTGATGACTATAGAGCGAAGGAATATACAGAAAAATGGTTAGCTGAATCTGAGACAAAATATGTTTTTCCTATAAACTTGCCAGCCGGCTTTAAGATCGAGAATGGTTTTAGGGAAAAGCTTGGGAACTGGCAGAGGCTTCCCTATACTAAGGCTTATGATAAGAATGATTTGCATCCAATCCACAATGTCGGGCGGCTCGAGAAACGTATTGTTGGCATTCTTCATGAACTTTTAAGCTTGACAGTAGAAAAGATGATACCACTTGAGAGGTTGTCCCACTTCAGAAGACCTTTTGGTATGGAGGTAAACCTGCGGGAGCTTATTCTTAAGCACCTTGGCATTTTCTACATCTCAACCAAAGGAAGCACACAGCATGTCCTTCTTAGAGAGAGTTACAGTAAGGGATGCCTGGTTGATCCAAACCCTGTCTATAATGGAAAGGTTTTTCAAAGAGAAGGAGCTCTGCATCATCGTCTTCGAGCAGTTCTTTCTTTGAATTACGAGCAAGCTGCTGTAGAATACAGCAAGGAAGTTCGTAAGAGACGGGGCATAATCTGGAAGAGACAACAGATGCCAACAGAGAGCTCAGACCATCTCTCCAAGACTGCAACCATGGATGCTCCATTTCTTTCTACTTCCCTTGCTGTTCTTGCCACCCTCTTTTTGCTTGCTCTACCATTGAGTGCTGCAACTCATGATATTCTACCACTGAAATCCTCTCTCTTTGTTGAAGAGTATGAAACCAACATCCTGCAGTCATCTGATGGCACATTCTCATGTGGCTTCTACAACATCACTAACGCCTACAACATCACTAGCGCCTTCACCTTCTCAATTTGGTACTCCAATTCAGCTGACAAGGCCATCGTATGGAGCGCAAACCGTGGCCGTCCCGTGCACTCAAGGAGATCAGAGATCACTCTGCGCAAGGATGGAAACATAGTCCTCACTGACTATGACGGCACAGTCGTGTGGCAAACTGACGATCCTGATTACCAGTACTATGAGAATAATAGGAACCTTTATAACAGTACAAGGATAGGTAGTCTTGATGATTATGGAGAATTTTTTTCGAGTGATCTTGCTAAGCATCAAGCCCGTGTTGCCTCTGATAGAAGCTTGGGGATTAAAAGAAGGCTTACCTTGGATTATGATGGTAATCTTAGACTCTATAGCTTGAATAACTCAGATGGAACATGGACAATTTCATGGATTGCTCAACCTCAAACATGCATGACTCATGGTTTGTGTGGTCCATATGGAATCTGCCACTATTCACCTACACCAAGATGTTCATGCCCACCTGGTTATAAGATGAGGAATCCGGGTAACTGGACACAAGGTTGCAAGCCTATTGTCGAAATTGCATGCGATGGTAAACAGAATGTAACATTTTTGCAACTTCGAAACACTGATTTTTGGGGTTCTGATCAACAACGTATTGAAAAGGTACCTTGGGAGGTGTGTTGGAACACTTGCATAAGTGACTGCACATGCAAGGGATTTCAATACCAAGAAGGAAATGGTACATGCTATCCAAAATCTTTTCTCTTTAATGGAAGGACTTTCCCAACACCTTTTGTGCGAACGATGTATATCAAACTTCCTTCAAGTTTGGATGTTTCAAAAAAACCCATTCCACAGTCTAGTATACATGATTATACACTAAGTGGACTTGACTGTGATCATTTAAACACAATAACCACAGAGGCAGTTCGTAACATGAATAAGATTGGTGGGGAGGAACCAAAATGGTTCTACTTCTATGGGTTTATCGGTGTGTTTTTCATTGTTGAGGTTTTCTTCTTCGCATTTGCATGGTTCTTTGTCTTGAGGAAGGAGATGCGGTCATCTCAAGTATGGATAGCTGAGGAAGGCTACAGGGTGATGACTAGTCATTTCCGAATGTATAGTCATAGAGAGCTGGTTAAGGCAACTGAAAGGTTTAAACATGAGCTTGGATGGGGAGGTTCAGGAGTTGTCTATAAGGGAATATTGGATGACGATCGAGCAGTGGTCATAAAAAAGTTGGAAAATGTCACGCAAAATAGGGAGGAGTTTCAGGATGAGTTGCATGTTATTTCAAGAATCAACCATATGAACCTAGTAAGAATATATGGTTTTTGCTCAGAAAGATTCCATAGATTGCTGGTCTTAGAGTATGTTGAGAATGGATCATTGGCTAATGTACTGTTCAACAGTAAAATCTTGTTAGATTGGAAGCAAAGGTTTAATATTGCTTTAGGCGTTGCAAAGGGACTGGCTTATCTTCACCATGAGTGCCTAGAGTGGGTCATTCACTGCAACCTAAAGCCAGAGAACATTTTGCTGGATGAGAATTTAGAACCTAAGATCACTGACTTTGGGTTGGCAAAGCTGCTTAGTAGATCTGGCTCTAATCAAAATGTTTCACGAGCACGAGGGACCATAGGTTACATTGCTCCAGAATGGATATCTGGTTTACCAATAACAGCAAAGGTTGATGTATATAGTTATGGAGTCGTTCTTCTTGAGCTAGTGTCAGGAAGACGAGTCTTTGATTTAATCGTTGGAGAGGATAAGACGAAGGTGCATGAGATGCTCAAGAAGTTTATTAAGATGATTTGTTATAGATTGGACAATGAGAAATCATTGTGGTTAGCAGAGTTCGTAGATTTCAGAGTGGGTGATGAATTCAACTACTTGCAAGCAAAAACTTTGGTAAAGTTGGCTGTGTCCTGCTTGGAGGAAGATAGGAAGAAAAGGCCAACAATGGAATCAATAGTGGAGAGCCTCCTTTCAGTTGATTTAGCTAGAAGTTAA
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|||||||
Protein seq | MRSLLAFFAASILLASTTTTVHGVHIDPNDIIKTIEIVEKMVVLGGNNSFKFAEQAWHRSAAYGVNGPYHGASVWLPIWKVGVGPSEFSKSYLAIASPTVYPQFFGDDLPRLYIYSTNDGGVKLKCFNLECSFVQTSKKHAIGAKYDKFSTDDGPAVWWVSLMDEPIGYFHESAFAAPFIESFHNEMGGHVLDRRLGGRHTLTPMGSGMYPSDGLQNAACIHAYLAIAYTGADQVDDPVNTIVTHPKCYDVKDDGPDLYRPGINVAFGGPAFGQRNLRVFPLRRHIWDAVFQHGPYNCTIQRRWKKPVDSARTRQEGRTRDHKLDKLMIQLKNLRLALDLHELISQQRNGFASLQLLSRWRHEVGLNIEIGAFLKKYPHIFYIYVHPVKRNECCKVTPKMAELIAEEDAVIRENEPAIVKRLKKLLMLMKDGTLNMHALWLIRRELGLPDDYRAKEYTEKWLAESETKYVFPINLPAGFKIENGFREKLGNWQRLPYTKAYDKNDLHPIHNVGRLEKRIVGILHELLSLTVEKMIPLERLSHFRRPFGMEVNLRELILKHLGIFYISTKGSTQHVLLRESYSKGCLVDPNPVYNGKVFQREGALHHRLRAVLSLNYEQAAVEYSKEVRKRRGIIWKRQQMPTESSDHLSKTATMDAPFLSTSLAVLATLFLLALPLSAATHDILPLKSSLFVEEYETNILQSSDGTFSCGFYNITNAYNITSAFTFSIWYSNSADKAIVWSANRGRPVHSRRSEITLRKDGNIVLTDYDGTVVWQTDDPDYQYYENNRNLYNSTRIGSLDDYGEFFSSDLAKHQARVASDRSLGIKRRLTLDYDGNLRLYSLNNSDGTWTISWIAQPQTCMTHGLCGPYGICHYSPTPRCSCPPGYKMRNPGNWTQGCKPIVEIACDGKQNVTFLQLRNTDFWGSDQQRIEKVPWEVCWNTCISDCTCKGFQYQEGNGTCYPKSFLFNGRTFPTPFVRTMYIKLPSSLDVSKKPIPQSSIHDYTLSGLDCDHLNTITTEAVRNMNKIGGEEPKWFYFYGFIGVFFIVEVFFFAFAWFFVLRKEMRSSQVWIAEEGYRVMTSHFRMYSHRELVKATERFKHELGWGGSGVVYKGILDDDRAVVIKKLENVTQNREEFQDELHVISRINHMNLVRIYGFCSERFHRLLVLEYVENGSLANVLFNSKILLDWKQRFNIALGVAKGLAYLHHECLEWVIHCNLKPENILLDENLEPKITDFGLAKLLSRSGSNQNVSRARGTIGYIAPEWISGLPITAKVDVYSYGVVLLELVSGRRVFDLIVGEDKTKVHEMLKKFIKMICYRLDNEKSLWLAEFVDFRVGDEFNYLQAKTLVKLAVSCLEEDRKKRPTMESIVESLLSVDLARS
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0 | 0.0 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0133001 | RBH | 0.015461 | 0.0 | 0.117650 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g03810 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0133001 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0002160 | RBH | 0.087627 | 3.981037 | 0.000000 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0002190 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0002180 | RBH | 0.0 | 0.527061 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0002170 | RBH | 0.0 | 0.027071 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0002120 | RBH | 0.0 | 2.359208 | 0.492291 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0030300 | RBH | 0.302388 | 1.723489 | 7.834597 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0002150 | RBH | 0.0 | 0.125747 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0029100 | RBH | 0.771435 | 8.7753835 | 0.736483 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0002050 | RBH | 0.0 | 0.027672 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_12g0002280 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0002190 | RBH | 0.0 | 2.858409 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0002130 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.052107 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0002200 | RBH | 0.0 | 0.313708 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G002140 | RBH | 0.035976 | 1.290772 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0002110 | RBH | 0.0 | 8.519257 | 0.0 |