Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsIR64_12g0008200 OGI:12023260 | 16/16 IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr12:7985810-8002961
Gene Symbol RLCK366, OsRLCK366, RLCK373, OsRLCK373
DNA seq

GACGTCGCGCGCTGTGGAAGAAAAGACTAGAGAAGATTGACAAGTGATCATATGAGAGAGATGTCAACCCTAAGCCACCAGCACCACCATGTTCTCGTCCTCCAACTCATCCTACTTCTGCCCTTGCTCCACCTCGTCGTCCCCGGAACGCCAGCCGCCGCCGGCAAGTTCTCCGACGTGTTGGCGAGCGGCCGCAACGTGAGCGACGGCGACGTGCTCGTCTCCCCCGGCGGGTCCTTCACCCTCGGCTTCTTCTCCCCCGCGGGCGCCACCACCAGGAGGAGGTATCTCGGGATTTGGTTCTCCGTCTCGCCGGACGCCGCCGTCCACTGGGTGGCCAACCGTGACCACGCTCTCAACGACACCTCCGGCACACTGACGCTGACCGACGCCGGCGTCCTCCTCCTCCTCGACGGCTCCGGCAAGGTGGTGTGGTCCTCCTCCACCACCGCGCCGCCTTCCGCGACTACCTCCGCCGCGGCGCGGCTGCTCGATTCCGGCAACTTGGTGGTGCACGGGCAGGGCTCCGGCACCGCCCTGTGGCAGTCGTTCGACTACCCTACCAACACCTTGCTGCCCGGCATGAAGATCGGCAAGAACCGGTGGACCGGCGCCGAGTGGTACCTGCTGTCGTGGCGCTCCCCCGCCGATCCTTCTCCGGGGAGCTACAGGTACGTCACCGACGGCGACGAGGCGCTGCCGGAGAACGTCGTGCTCGACGGCAATGGCACCGAGGTGTACCGGACCGGGGTGTGGAACGGCAGGAGGTTCAACGGCGTCCCGGAGATGGCGTCGTTCGCGGACATGTTCAGCTTCCAGCTCACGGTCAGCCCGGGGGAGGTCACCTACGGTTACGTCGCCAAGGCCGGGGCGCCGTTCTCCCGCGTCGTGGTGACCGACGACGGCGTGGTCCGGCGGCTGGTGTGGGACGCCGCGACGCGGGCGTGGAAGACGTTCTTCCAGGCGCCGGGGGACTCCTGCGACAGCTACGCCAAGTGCGGCGCGTTCGGCCTGTGCGACAGCAACGCCGGCGCGACGTCGATTTGCCGGTGCGTCAGGGGGTTCAGCCCGGCGTCGCCGGCGGAGTGGTCGATGAGGGAGTACTCCGGCGGGTGCCGCCGGGACGTGGCGCTCGACTGCAGCACGGACGGGTTCGCCGTGCTGCGCGGGGTGAAGCTCCCTGAAACGCGCAACGCGTCGGTGGACATGGGCGTCAAGCTGGACGAGTGCAGGGCGAGGTGCGTTGCCAACTGCTCGTGCGTGGCGTATGCCGCGGCGGACTTGAGCGGCGGTGGGTGCATTATGTGGACAAAGCCTTTCGTCGATTTACGTTTCATCGACAATGGCCAGGACATCTACCAGCGGCTAGCGAAATCTGAAACAGGTAATTTAACCTAATTTTGATTTGTTGGTGTTCCATAAATGTGGTGGCTTTATATATCCTTAGGGAAATTGAATTTCTTTAAATCGTTGGAGGTTCTCATTTCAAACCCTGTCCTTACTAGTATTATACTTACAAGATAAGGCTAGAAGTTACATGTTAATTAATCAATAAAAAGAAAGAAAATAAAAATTATCATGTCAATAGGAGAAAAAAATAAAAGGTCGCGCTGGAGCAACAAAAGACATAGATTGTTCAAAAGGAATAGTTTCATGACTAGATTTCATGGATCGTGCTGGCATGCATGCCCGGGGACTTATAATATGATTAGCTAAGATCAACTCTAGCTGGACCTCTTAATACAACCCCAAATAATATTTAGGTTGAAGAAAAAGAAAGGTCCAAAATGGTCGTCCTACTAGGGCCGTGTTATAGGAAAGCCCTCGAATCACACCCCGCATCCCTAATTTTTGGGGGCGATCTAGACCGTAGCACATATCCATCATTTTTTCTGTGGCTGGACATATCCAACCGGCTGTGCCTCCCTTCCCATCATCCTCAACATCTCCACCCTCATTCCCCTTCCCCGGCCCATCCCCCTTCCGCCATCACCAGACCACTAGCTTCACCGGTGGACCAATGTTGTCGCTTGTCATCCTCCCACGCCAAGCTCCACAAGGATGTATCATATGCACGAATGCATCTATGCAAGGATGTCATGCTACATTAGTAACATGTACTTCCTCCGTTTCATAATATAAGATATTTTAGTATTGCCCACATACATTTAGTTGTTAATGAATCTAGACACATACATATGCCTAGATTCATTAACATCTAAATGAATGTAGGCAATGCTAGAAAGTCTTACATTATAAAACGGAGGGAGTAGCTAGTTAACTTTTTATTACATTTTTACCAAATGTATCATGTATATCTAGTGCCATTTGATTCAAGACCAGTGATTGCAATTTCAGAATGAAATTTCAGTAATTTCGCCCCCACTGGCAAGCACATATTTCACCTGAAAATTCCCCCTTTTTTTTCTATGTTTTTGTGAATCTGGTCAAATTTTATTCAAATTCATCCAAAATTTGTCAAATTTTAAAAAATATGCGGCTAAAAAATACCAAAATTTTGGTGATTTTGGTTCTTTTGCCTCCCCCCACTGGCAAAAAAACCCTGTTTCCAAATTGCAAACCATAGTCAAGACTAAGATTCGTTGGTCCTTATAAGCGCAAAGGGGAAAAAAACAAAGAGATAAAGGTTTTTCTATACTTTGGGCACCTTAGGGTAATAACCCTACGTCCTATTTAGGTTGTGTATATATATATATCGATGCCTATAAAGTACATGATACAAGAAGGGAAAGCTCTCGTCGAGACCTAAACGACTATCTCCTCAAGACCCTAATTAGCATGCTATGTCGTGGTTGTCGAGAGGTGTTGAATTTACACCCCTCAATTGTCCATCCACATTTCCAAATTGCAAGTTGGTCAACTTGGCAACAAGTTAGGACACTGTCCAAGCATTCCTCGTCGGCTCAAAATTAGACTAGGTTTCATATCTTTTTCAGGGACTCCTTCCTTATCTACTTAATTAAGACTATCCATGTTTTAGGGATTTCTTTCCATATAGAGCATTGTATATATGCAGTATTTTCGCTAAGGTATGCATATGTATGTGCAGTATCCTATATTTAATACAGCAAAAATTAGTAATGTAATGTTCCTTACAAAAAAAAAGTGTTGCAAAGAAGACCTATAGTTTTAGTCACATATTAATTAACGCACGATGTAAATTTGGATGATTAGTTGCTTCTCATGCAAGAGGCAGTACAGGAGCTCGAAGGAAAAGTGGAAGTGTAAACTGGGCAAACTAATAATATTAAATTAGTTTGAGGCACTTAGTTGCACGAGTAGACATGGATAATTTTAGAGGTAGAAACTACCTGGAATGTTAAACTTGGACGATTCCCACGCATGCATGTAACCATACAGGATCATAAATATGTGTGAATTTAATTACTCACTCACCACTAAAGTTACTAGACTTTTATAGCATTTACTATTTGTCAAAAAATAGACTTTTATGTATTTATATCCTATAAAAAGTGCCCGTGCGTTGTAATGGGTGAAGTTTCTTTTAATTATTATTATACAATTTAGTTAAGGTGAAATTCATCGTGAGAATTCGCTTCGATTTGTTTATTTTTACAAAATCATGGACGGTAATTGTCTCAAATTAGCATGCGAGTTTTTTTAGAGAGATTTATTATACGACTCTCCTTCTGTGTTTAAAAAAGCGAACGACCTTAAAATTAAAAACTGACTCAAACACATATTTGTATTTCCAAAAGTGAGTGAATTTAAAAACCGACTCAAACACGGATAACGTACTAAAGTACGTATAAAAACATCTTCAATTTTTATAATAGTAGAGATAGAGATATACCCAACCCCCTCTAGTATGGTCCGTATGTTTCTATATAGAGCCTCATCAATACTGTATGTTTAATTATGGCTTGTTTAAGTACAATCAGAAGGTGGATGAATGTTTAATGAGGGGCAATATGGACATTTCTCATGCTCCTGAATTTGTAGGAAACATTCTAAAAGTTGGAGGGAGTAAAAAACATGTGTATCTTGCAGTAAACAACATATTGGGCCTATGTGATTCGTCCATAAGTTAACTGTACAGAATTTTCGCAGGTATGCTTTGTTTAGTGTCATACCAGATTGTGTGACGAAGTTTCTAGAATTACTAAATTTATTGTTATGGAAAGACAGCACATCTGGCGCTAGATTTTTTTTAGAAAAATATGGGGCCCACGCCATCATATGTCATCATGCATGCATTGCAAAACTTTCTAAACAAACTTTAAAACTATTTTTTCACTTAAATTATCTATTCAAAGCATAATCCGATGGCACCATTAAATCGTTACAATTAAATCTTTAACACAAGACCACACATGGATATAATCCAACGAAAAAAATATTTAGCTTATTATTGAATTATTTTTAAATGTTGCGCATTGTTCCGCCAAGTAGATCGAAATTGTTTCACTATGTAGATCAAAAATGTTTCAATCGTTTAAAAAGCTGAAACACAATCAAATCAACTTATGGAACATTTTTCTACAACGTATGAAACAAATGGTTTGAAAAAATGGGTATTGTTTTACCATATATAAAACAATGTTTCAGCAAATAGTAAAAGGATGTTTCAATTCACTGCAACATTTAATCTATACATAGTGAAACAATACGAGTACACTAGGTGAAATATTTTTGGTGGAACAAAAAAATGAAACGGAGTCCATTAATAGAGGGATTCCATAATATTTGGGTGATTTGTTTCAAAGGAATATTTCAATTCACTGCAACATTTAATCCATACATAGTGAAACATTATAAGTATACTAGGTGAAACATTTTTTATGGAACAAAAAATAAAACGGATCCCCCTTAATAGGACGTTTCCGTTATATCCGGGCAAATGTTGCAACGGGGTGCGCTGTAGTGGGGTCATGTGACGGCGTGCAGAAGCGCGTGGTGGGGCCTGGGCGGCAGCGGTATGAGGCGCTCGATGCATACGTGCCTGCATCTGGCGCCTG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Protein seq

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Function Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-8 [UniProtKB/Swiss-Prot:O81905]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsIR64_12g0008200 OsIR64_12g0008200.01 Chr12 7985818 7995224 + NAM
CDS seq

ATGAGAGAGATGTCAACCCTAAGCCACCAGCACCACCATGTTCTCGTCCTCCAACTCATCCTACTTCTGCCCTTGCTCCACCTCGTCGTCCCCGGAACGCCAGCCGCCGCCGGCAAGTTCTCCGACGTGTTGGCGAGCGGCCGCAACGTGAGCGACGGCGACGTGCTCGTCTCCCCCGGCGGGTCCTTCACCCTCGGCTTCTTCTCCCCCGCGGGCGCCACCACCAGGAGGAGGTATCTCGGGATTTGGTTCTCCGTCTCGCCGGACGCCGCCGTCCACTGGGTGGCCAACCGTGACCACGCTCTCAACGACACCTCCGGCACACTGACGCTGACCGACGCCGGCGTCCTCCTCCTCCTCGACGGCTCCGGCAAGGTGGTGTGGTCCTCCTCCACCACCGCGCCGCCTTCCGCGACTACCTCCGCCGCGGCGCGGCTGCTCGATTCCGGCAACTTGGTGGTGCACGGGCAGGGCTCCGGCACCGCCCTGTGGCAGTCGTTCGACTACCCTACCAACACCTTGCTGCCCGGCATGAAGATCGGCAAGAACCGGTGGACCGGCGCCGAGTGGTACCTGCTGTCGTGGCGCTCCCCCGCCGATCCTTCTCCGGGGAGCTACAGGTACGTCACCGACGGCGACGAGGCGCTGCCGGAGAACGTCGTGCTCGACGGCAATGGCACCGAGGTGTACCGGACCGGGGTGTGGAACGGCAGGAGGTTCAACGGCGTCCCGGAGATGGCGTCGTTCGCGGACATGTTCAGCTTCCAGCTCACGGTCAGCCCGGGGGAGGTCACCTACGGTTACGTCGCCAAGGCCGGGGCGCCGTTCTCCCGCGTCGTGGTGACCGACGACGGCGTGGTCCGGCGGCTGGTGTGGGACGCCGCGACGCGGGCGTGGAAGACGTTCTTCCAGGCGCCGGGGGACTCCTGCGACAGCTACGCCAAGTGCGGCGCGTTCGGCCTGTGCGACAGCAACGCCGGCGCGACGTCGATTTGCCGGTGCGTCAGGGGGTTCAGCCCGGCGTCGCCGGCGGAGTGGTCGATGAGGGAGTACTCCGGCGGGTGCCGCCGGGACGTGGCGCTCGACTGCAGCACGGACGGGTTCGCCGTGCTGCGCGGGGTGAAGCTCCCTGAAACGCGCAACGCGTCGGTGGACATGGGCGTCAAGCTGGACGAGTGCAGGGCGAGGTGCGTTGCCAACTGCTCGTGCGTGGCGTATGCCGCGGCGGACTTGAGCGGCGGTGGGTGCATTATGTGGACAAAGCCTTTCGTCGATTTACGTTTCATCGACAATGGCCAGGACATCTACCAGCGGCTAGCGAAATCTGAAACAGGTAGGCCGCCGCACTGGAAGTTTCCTGTCGTCATAACAGTTGCAGTAGTGTTGGTGATTATTGTTGTTTTTGTTTTGGTTTGGGCTGTCAAGCGGAAGTCTCGTGAGGGGGGAATTCGACGAAGTGTCTCTCCGGGCATTACTTCCATTGACCGCATTACTTCCATTGACCGTGTTACACTACAAAATGCCACAGGAAATTTTGCGAAGAAAAACCTCATTGGCGAAGGAAATTACGGAAGAGTTTATAAGGGGATTTTACCCGCTGAATCAACTATAACAGGATCGCGTCAAGAAAATGAGATCGTTGCCGTAAAGCTGCTGCAACCATCAGGCACTGGCACTTTCGTAGCAGAATTGGAAGCTATGTTTAACGCGATTCATGTCAACCTTGTTAGGCTCCTTGCATTCTGCAGTGACAACGACGATCGGCATACAGGAGAAAAGTTCAGGGCACTAGTTTATGAATACATGCCCAACAACAGCCTGCACCACTACATATTTGCTCAGAATTCAGAGCTTCGTGCAATGCTGGACTGGCCGCTGAGGCTGAAAATTGTTGACGGTATCGTTGAAGGTATCCGGTACCTGCACGTGGGATCAAACACGCCTATTATCCATAGAGATCTTAAGCCTTCCAACATACTGCTGGGTAGGGATTGGACACCCAAGATATCAGACTTTGGCCTGGCGAGAGGTTACACAGCTCCAGAGTGCTGGCAGTTGGGGAGGGTAGAACCCGAGTCAGATGTCTACAGCTTCGGAGTGATTCTCCTTGAGATGATTAGCGGGAAACCAAATGGTCTCATGCAGCAGCTACTGCCACATGTGAGTACACCGATACCTTACAGAGTTTTAGATCAAAGGCAGAGCGCCTAG

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsIR64_12g0008200 OsIR64_12g0008200.02 Chr12 7985810 8002961 + IsoSeq
CDS seq

ATGGTCTCATGCAGCAGCTACTGCCACATGTGTGGAATCTCTGGTACAACAGTGGTGGCCCCGACTGCACCGCGGAGCTTCTTGATCCTGAAGTGCCTCCGCCTGACAAACAGAGCTTCCGTCGGCTCCAGATATGTGTCAAGGTTGGGCTGCTCTGCGTTCAGGAATCGTTCCAAATTAGGCCCAACATGTCAGTCGTTGCTGACA

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Protein seq

MVSCSSYCHMCGISGTTVVAPTAPRSFLILKCLRLTNRASVGSRYVSRLGCSAFRNRSKLGPTCQSLLT

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr12 7987193 7991176 + OsIR64_12g0008200.01 OsIR64_12g0008200.01,OsIR64_12g0008200.02 All
A5 Chr12 7994860 7995031 + OsIR64_12g0008200.02 OsIR64_12g0008200.01,OsIR64_12g0008200.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.193612 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0257900 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g15550 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os12g0257900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0008440 RBH 0.0 0.000000 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_12g0008550 RBH 0.0 2.281307 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0008580 RBH 0.0 9.139871 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0008400 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_12g0008260 RBH 0.0 0.000000 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0124200 RBH 0 0.0778465 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_12G0131900 RBH 0.009961 0.0554425 0.0077
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0008130 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_12g0008440 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_12g0008300 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0008300 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_12g0008470 RBH 0.000000 0.947466 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_12G008310 RBH 0.0 0.000000 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_12g0008200 RBH 0.0 0.0 0.0
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