Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsIR64_12g0002100 OGI:12004120 | 13/16 IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr12:1440483-1447828
Gene Symbol DLN251, OsDLN251
DNA seq

TTCCTGGATCCAGGTGACCAGGTCGGACAGCTGCGGTCAACGCAAACAACGAGTAAACGCAAGGCTGCAAGCAGAAAGGGTCAACGCGAACAACGAGTAAACGCAAGGCTGCAAGAAGAAAGGCGCAAGGTACGAGCCGTGCCGCGAGCAGCGGTGTGCGCTAGACGGAGCAGTGCAGCCACGGTAGACGTGCAGGCTGCATCGACAAAGGGCGGTCATCGGTGCTGCTCAAGGAGTAGCAGCAGGACCTCCAGGTAGCCGCGACCGTCGAAAGCATCAGCAGATCCCAAAATCAGTATGTGCCCTTCAATCTATCCTCAGCTCAGCTTTCTCGATGTGGATTCGTCCTCCAAATTCTTCTCTTGCCCTTAGCAAAATTGTCCATTTTATGTGTAATGAATCTGTGCTAAGATCTATGGATTCATTCTCCAATTCTCTGTGCTATTTCATTCTTTGTCCATGTCTTCGCGGTGAATAATCGGTGAAAAGTGGGCTCGAGTATGTCACAGCGAATCTCGGGAACTTCGTCCCGAAACGAGGCTTGACAATGTACCGATCGCAGCCGGATCTTGTCTGGTATAAGGCGGACGAGCGCCTCTATTGCTCCCTCACTGCGCCGCCGCCGTCGTCGTGTGAGGAGGATGGATGAGCGCTGCCGTTGTCGCGCCGAGTGGGATGGACGAGCGCCGAGCCGCTTGCGGGCCTCCCTCGCTCGCTTTGGGCTGGTGGTGGTCTGGCTTTGGGCTTTACCGCTTTAGTTATTGGGCCAGAAAATATTACTCGCTAGTTAGAAAGCTACTACTAATAGTTTGGCACGTTAGTTTAAGAACCTGAATCGAGAAAATAGAGAAGTGAAGGCCTCCTATGCATCTGCATCGCAATTGATCCACGATCGATCATCATTCCGGATCATCGTCCCGAAATTATTTTAAAATTTGTTGTTGTCCTATGTCGCTAACTAGTGTTTTAAAGAGCCATCTTTTGGAAGATGGAGCCTCAGACCGAGGTTGTGCTGTAGGTTCTCAGTGATGGGCCAGGGCTATAGTTAGGAGGGGTGAAATTGGAACACATACCAAGATGGATACGGATACAAGCAATACGGAGTATGGGTTACGGATATTTATTGGAATTCAAGTCAAAGCAACAACCGTACATATCAAATTTATAATAGACATTAAACCACTCTATGTATTCAAAATTGAAAAGGCAACTAGATTAATGCATATTAAAAATTAATAGTAGCAACTCTAGCATGACTGATTTACTGCATTTACATCATTAGTAGTTTTACCACTAGTATTTTAATCTTGCAGGGAGTTTTGCACTAGTAGTATAGTTTACTCTCATCAAACTAGCCGTACCTATGAGTTTACAAGTATAGTCAACCCAAAATGTGCATCCATGCATACTATTCACGGCTTCACGAATTATGCAAATACGTGACTGCGTGTGCGTTAATACCAAGGTACCCAATAGAGTTTGCAGGCGAGCACACGTCTCTCGTTTGTTTGCTCATGTTTCTTTGGGTTGTGTGCAATATTTAATCAGTAACTTTTGTTTTCTTTTTTTTATCAAGAGCCTGACGGCTCCCATTTCTTTTACTAGAAATGAAACATCGAGCTACAATAGTCTTCAGAAAAAAAACAGGAAAGTTCAAAAGCTAGCCCTATTACAAGGGTTCCTGACTCTTTTCAGAAGTTTTGCCTAAACAGATATCTAACAGTAAAAAAGAAGGAAAGGGAATTACAAAACATCATCACTTATATCTATCTCATCCCTTGATCCTTTTGGTGTTGATTCTCCATCCGAACTGCGAGTTGTAGACTTCAGTTACCGACTGTCTTATGAGTCTGGATCCCAGTAGCAGTCTTCTTCGACTTGCCTCCTCCTTCTGCAGTAGTGCCCAGGAATCAACCCAATGGCAAGCCAAAAAGATCACACCAGTGGGGTCTTTTGGATAAACTTTTTCAAAACAAGCTTTATTTCTAGATTTCCAGATGGCCCAAATTATAGCAGCCATTCCTACCATAACTAAGTCTTTCATGTTCTTATCAAGTTTTTTCAACCAATCTCCAAACATGTTTTGACCATCAAGGGCTGGGTTCAGATTCAGGACACAAATTGCAGTGTTCCACATTAATCTTGCCAGGGGACAGTCAAAAAACAAGTGTTGTATAGTCTCCTCTCTATCACAGAACTGACATTTTTTATCCCCTTTTCTCCAACCTCTCTTGTATAAATTGTCTTTTGTTAAGATCTTATTTTTGGTGAAGAGCCAAAAAAAACCTTAATCTTCAAAGGAGTTCTGAACTTCCAAATTTTTTTTCTGTGGGAAATGCACTTGTTGTAGCTTCAAAGCTTTGTAGAAAGAGTTCACACTGAAAATTCCATCCTTAGTTAAATTCCATCGTAGTTTGTCATTGCAGTTATCTTTTAACTGCAGATCACCCCAACTAGTATAAATTTTGTGCCAATCTCTCAATCTCCCTCCACTCAGGTCTCTCCTAAACTTGATGCAATTTATCCCTTTTTGTTTCAGTTTTGCCACAGTTATATGTTTTGTCAAAGTGATATTGTAAAGGTTGGGGAATTGTTCATTTAAAGGTTTGCCCCCTATCCAGCTGTCCTCCCAGAAAAGTGTATTTTCACCATTGCCTATCACCCTGGAGCAGAATTTCAGAAAGATGTTTTTGATCTCCATGAGCCCATGCCAGAAATGGGACTCTCCATTTTTAAATTTCAATAAAGATATGGGTTTGCAACCCATGTATTTACTTGTCAAAAAGCTTTGCCACCAACCTTCCTCATTTTCCAATCTCCAGATCCATTTCCCTAACAACGCTTTGTTCATTGTTTCCAAATCCAGGATCCCCAGGCCCCCTTGATCTTTGGGTGAACATACCACCGGCTATTGTACCAGATGATATTTTCTTATCCCTTGATCTTCTTGCCACAAAAATCTCCTCCTGTAAAAATCCAATCTCTCTCTAACTCCTTGTGGCAGTCTGTAGAAGGATATCATGTAAAGGGGCACATTGCTAAGGCTTGAATTGAATAAAATCAATCTTCCTCCAATAGATTGAAGTTTGCCACTTTGCCTTGCCAGCATCCCAATTTGTGTTCCATTTTTGTTCTCAGCGTTTTTCCAATTCATGTAACTTTTGTTTTCATGCTTATGTATTATTAGCTTATACATTTTTAATGTCATATTATTGTATGGACTGTTTTATGAATAAGTTTATTATATATATGTTTAATTGTAGAAGACAATAAAAAATAATTTTCATTACCACATATATATTTCTCTTTAACAGGATATGGCCTTTGCTGAATCAATATGGACCTTTATGCCAGGAAAGAAGGGATCAGTTGTTCAGGGGCCAAACACTAGAACTCTAACAAATGCTCATGATGGTATCTTGGATGATATTAATTGTGCTCAGATTGCTGGGAAGCATGTGGGAGATCATTCCAATTGTGCTAATGTCATCAAGGTAGATATATGCTATAACTTTCTATTAATTCTTGGTATCTTTTCAATTTTGATACATGTTAACTAGTGCCTTTTCCATAATGTCTGTTCCACATGTATTTTCACGCTTTGATATGAATATTTGAGTACATAGATTTGAATTATATTATACCATCTTTTCCTCCTTAGAAAACATAGCATGTTATGGTTAAAAGTATTGATGAAACTTCCTAGCTTTCCCTTTGAACCATGACAAACTCCCCATTCCAGAGATGCGCTTTCAATGATTTCAGATGGTCATGTATGTTGTTGGATAGCAGTTTATTCTTTGTATTGCAGCATTTCAAAACCGAATTACATCTGTGTTCGCTGCACGCAGTTGGGAACCTATCTCCAGCGCACGGAAAACGGAACGGTCCATTAGCGCGCGGTTAATTAAGTATTTGCTATTTTTTTAAAAAAATGGATCAATATGATTTTTTAAGTAACTTTCGTATAGAAATTTTTTTTGCAAAAAACACACCATTTAATAGTTTAAAAAGCGTGCGCGCGGAACACAAGGGAGATGAGTTAGGAACCCTTCCTACCGAACTAAGCACTTCTCAATTTTTTGTATGAAATTATTTTGATATTCCATACATTGTTGTATGTTTCATGCATGCAGGAGAATCCTTGTTTATCGTCTTCAAAACATTATGTTGGATTCTGTTCAGCGGATAGGTCCGCTGGGCCATCATGTGTTTCATTTACTCTTTCAGGCCTGACAATGAAAGGCTGGAGTCATATCATTGCTAGGAAAGCTAGTTCAATATCCTGAGAGACCTGGTGAACCATTCTGTCGATACTACATGAAGTTTGGGGAATGTAAACATATGATTTTCTGTAAATACAATCACCCAAAAGATAGGTTCAGTTGCAAGACCACAAACACTATCAGATCAGAATCCTTATGCCTGCATGACCAGGTTTGTGTGGGGTGAGTTTTTCATTATTTATTAGGAACAACTTCACTGTGAAAGAGCATATAGCCTAGTGGCTGCAGTGACTTAAGTAGCACTCCAAGGTCTTGAGTTTAAATCTCCACAGGAGCGAGATTAAGTTCCCTGTTTGATGGTATAGAAGCCCTTCTCTAAAAAAATTTAGAAGCCGGCTAAGTTTCTAAAAAAGGCGGCACATATCCATTAAAAAGGCATTTAAATCCAGTTGGATGTAGTTCCCTGTTTCTGTTTGATGTGCTAAGTTCCTAATTTTAAAAAGGCATTCAAGTTCCTAAAAAAGGCTGCATATATCCATTTAAAAGGTATTCAAATCCAATTCTGTTTGATATGCTAAGTTCCTAATTTTAAAAAGGCATTTAGTAGCTGGGTAAAAAATACCCTTCTCTAGAAAAAATGGTTCTTCTTACTGACCGGTTAGAAAATACACTTCTCTAAAAAAAAATTGGTTATTCTTACTGACCGAAAATACCCTTCTCAGAAAAAAACAAGGTTTTTCTTACTGACCGTGCAAAATCCGATTATAGCTGATA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CDS seq

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Protein seq

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Function Putative zinc finger CCCH domain-containing protein 64 [UniProtKB/Swiss-Prot:A3CEM4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsIR64_12g0002100 OsIR64_12g0002100.01 Chr12 1440483 1447828 + NAM
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0129550 RBH 0.0 0.0 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g03554 RBH 0.0 0.0 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os12g0129550 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0001950 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_12g0002160 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0002170 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0001970 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_12g0002110 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_12g0002130 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0002090 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_12g0001190 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_12G001090 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_12g0001280 RBH 0.0 0.000000 0.000000
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