Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsIR64_11g0012850 OGI:11042990 | 14/16 IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:16269125-16281789
Gene Symbol OsWSS1, AM14, OsAM14, OsARK1, ARK1
DNA seq

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Function Receptor protein kinase TMK1 [UniProtKB/Swiss-Prot:P43298]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsIR64_11g0012850 OsIR64_11g0012850.01 Chr11 16269125 16281789 + NAM
CDS seq

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Protein seq

MGRDARRLPLLPFLLLLLAAAAGVAESATDAEAIHDLARSVPALGWDGDNVCGFEGVTCERGGAGKVTELNLADRGLSGTLPDSLSSLTSLTALQLQGNALTGAVPSLARMGSLARLALDGNAFTSLPPDFLHGLTSLQYLTMENLPLPPWPVPDAIANCSSLDTFSASNASISGPFPAVLATLVSLRNLRLSYNNLTGGLPPELSSLIAMESLQLNNQRSDDKLSGPIDVIASMKSLKLLWIQSNKFTGPIPDLNGTQLEAFNVRDNMLTGVVPPSLTGLMSLKNVSLSNNNFQGPKPAFAAIPGQDEDSGNGFCLNSPGPCSPLTTTLLQVAEGFGYPYELAKTWKGNDPCSPAWVGIVCTSSDVSMINLSRKNLSGRISPALANLTRLARLDLSNNNLTGVIPDVLTTLPSLTVLNVANNRLTGEVPKFKPSVNVLAQGNLFGQSSGSSGRGGGSDGDSSSSDSAGGGKSKPNTGMIIGIIVAVIILFACIALLVHHRKKKNVEKFRPVSTKTSPAESEMMKIQVVGANGISNGSSAFPTELYSHVSAANSSNISELFESHGMQLSVEVLLKATNNFSEDCILGRGGFGVVFKGNLNGKLVAVKRCDSGTMGTKGQEEFLAEIDVLRKVRHRHLVALLGYCTHGNERLLVYEYMSGGTLREHLCDLQQSGFIPLTWTQRMTIALDVARGIEYLHGLAQETFIHRDLKPSNILLDQDLRAKVSDFGLVKLAKDTDKSLMTRIAGTFGYLAPEYATTGKVTTKVDVYAYGVILMEMITGRKVLDDSLPDDETHLVTIFRRNILDKEKFRKFVDPTLELSAEGWTSLLEVADLARHCTAREPYQRPDMCHCVNRLSSLVDQWKPTNIDEDDYEGETSEMGLHQQLEKWRCDDFTISDSDTFGSFNGDQDFVAGSTFAVVIVFTVMLIALIIALMRYMSKKSKADETIDSTRSSQDNKVHGEVINRWSGLYKFSKGEIEKAINYANSKICLGSGSAGQVYQGVLPSGQLVAIKHIHKSAMSGSFMREVEGLSKVRHPNLVCLFGYCDDGGDQYLVYEYCANGNLAQNLLRSDSVLSWPARVKILRDCASVLRFLHTHPDGCIVHRDIKLTNILLTESMEPKLSDFGLAKMLQMEETKVFTDVRGTIGYMDPEYITHSKLTCASDIYSFGVVALQLLSGRKVIELDTVARDSLTKKARDVVSGKKPLDEFIDPRVRDEVNIEDFVLILKIAVLCVAHSSVGRPTIKDVFEEMDKALTNTDSKVGRAREEINPSSTIQYQYATGLNIVVVHQIVVGNANTAMAIAVAGEEAIVFERQQERVVEQLAPSGRGTVQ

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.072639 0.767169 0.922685

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0448000 RBH 2.046002 0.889864 4.814898
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g26130 RBH 1.633807 0.546103 1.318961
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0448200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0012900 RBH 0.335021 1.325318 4.380001
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0012870 RBH 0.113032 1.952464 1.615793
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0012850 RBH 0.211995 3.931649 6.524388
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0012580 RBH 0.080457 0.395842 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0012940 RBH 0.737208 11.435864 4.722742
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0227200 RBH 0.029306 0.0200515 0.0067435
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0012770 RBH 0.032007 0.338735 0.202900
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0243000 RBH 7.3774775 7.464013 14.2218195
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0012940 RBH 0.074295 0.122900 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0013030 RBH 0.085634 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0012660 RBH 0.552988 20.746149 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0012520 RBH 0.265285 0.0 0.378438
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0012870 RBH 0.122650 4.094280 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G012740 RBH 0.138571 1.720221 1.616678
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0012830 RBH 0.381495 11.837672 4.638271
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