Basic Info

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Function Disease resistance protein RPM1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q39214]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

MAEIAVLFVIKKIGIAVAGDTLKLAIPLFAKKTELKKVELVTALPVNMRQIKKELEIINAFLKELGMNGYKGEVVETWIRQVRRLAHDMEDVVDEFMYVVGKNKHKKSWACVKKIIKKPKPLFSLDEIATKADMINTELVELSKRLDRWTRPLSSGIYVPPTNYNSEQQLYLPGYDYSINDNELVGIDKNRQTLIESLRLEDCSLRIIAVWGMGGLGKSTLVNDIYKNEAIVSNFNCHAWLCISQSSKMHDIWQNMLKELCGEDNRGVDAENMNNRELRLELAKILRQKRYLIILDDVWLAADLLKIREVLVDNGLGSRVIITTRIEEVASIAEDGCKIRLEPLNNHDAWLLFCRKAFPKTENHMCPPELHQCGMDIVNKCGGLPLALVTIGSLLSLKPRNKKEWRLFYNQLISEVHNNENLNRVEKILNLSYKHLPNYLKNCFLYCAMFPEDYIIQRKRLIRLWIAEGFIEQKGTCSLEDVAEGYLTELVRRSMIQVVARNSFNRIQCLRMHDILRELAIFQSKKESFSTVYDDTHGVVQVGSDSRRVSVLQCNSEIRSTVDPSRLRTFLAFDTSMALSSASYFIFSESKYLAVLELSGLPIETIPYSVGELFNLRYLCLNDTNVKEFPKSITKLLNLQTLSLERTQLLNFPRGFSNLKKLRHLLVWKLVDATYKSLNNWESLEPFEGLWNLKELQSLCEVRATRDFVSKLGNLSQLRSLCITYVRSSHCAQLCNSLSKMQHLTRLHIRAMNEDEVLLLDDLMLPNPLEKLDLLGQLSKGTLESPFFTTHGNELLQLELSRCQLTVNLVAWLSKLSNLTELRLTRVYTGQQLSFHANCFPNLKKALLWDLQQVNQIYIQEGALSSLQYLHIDSLMELRDVPTGIEFLRSVKEAYFTMMHSDFVRNLRTGKVNHIPKVYWSTQGKFQSPVRVSAEPANLPGESSTNPQWRIGDHRLTGEREDDAGGTLAFAVAEASGGGGGGGRRNRRDVGAAVTGLSALVRSISGAARELFDI

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A5 Chr09 19543961 19544293 - OsIR64_09g0014190.01 OsIR64_09g0014190.01,OsIR64_09g0014190.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.000000 0.109314

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_09g0479600 RBH 0.0 0.138649 0.681184
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os09g30230 RBH 0.0 0.093147 0.175150
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os09g0479600 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_09g0014180 RBH 0.000000 1.826449 0.439964
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_09g0014130 RBH 0.0 0.0 0.258095
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_09g0014380 RBH 0.0 2.291975 1.419287
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_09g0014210 RBH 0.025478 0.073760 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_09g0014300 RBH 0.158131 2.597712 0.170243
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_09G0307500 RBH 0.5540585 1.370784 1.330408
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0021550 SBH 0.139610 0.807660 1.722041
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_09G0297600 RBH 0.530318 1.447696 2.8422325
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_09g0014170 RBH 0.0 0.038216 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_09g0014020 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_09g0014060 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_09g0013960 RBH 0.057877 0.0 0.087831
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_09g0014020 RBH 0.018382 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_09G014510 RBH 0.0 0.956962 0.116765
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_09g0014270 RBH 0.071551 4.118673 0.730405
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