Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsIR64_09g0007360 | OGI:09032520 | 16/16 | IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr09:12613684-12636036 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MVPIALSPSDQFDGFLSIDCGLEANYSGGYTDDGSYGIVYVPDGRTAHTVAAQYDSERIRAELTLRSFPSGVRNCYTLPTVAGAKYLIRVVAFYGNYDGKNSSSTLQFDLHLGVNYWSTVIPDVTNTYEALFVAWANMAPVCLVNTGQGTPFVSTVELRPLADALYPDHVKANQSMAMYDRRIMGTTNADDRLWWAEDSNPLWGYINSTRSIQPESSTEVPSALLQKAVQVAGNGTMLDITWEDTTPTLQFTVFLHFADFQKSQPRQFDIYFNGHDKPYLYNPPYLAAGVVYSPSWYSDIDGQYNVTLVATAESKFVRQPIEWTNSRFPIYDSNGETYCNKTTSLTRSRNRSSAAILAISVAAPVLVVIALFIAYLMWKAKRKPNTSEYNPPRVPEPMNAPVSKKYHWDHLEKNENRQFTYEELEKITDNFQRLIGQGGFGYVYHGCLEDHTEVAVKIHSENSRHGLSEFLAEVQSLSKVHHKNLVSLVGYCTEKAHLALVVTGERPIIQGQGHIIQRVKVKVVAGDISFIADARLRGDYNVNSIWKVVEIAMLCTEPVAAQRPSMASVVAELKNSLALELSRDDGGHKAPDPPPHDAVAMSSTFGPSAR |
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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g51810 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FZB8] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsIR64_09g0007360 | OsIR64_09g0007360.01 | Chr09 | 12613684 | 12636036 | - | NAM | ||
| CDS seq | ATGGTTCCAATAGCGTTGTCCCCGTCGGACCAGTTCGATGGTTTCCTGAGCATCGACTGTGGGCTAGAGGCCAACTATAGCGGCGGATACACCGACGACGGAAGTTACGGCATCGTGTACGTACCCGACGGCCGGACGGCGCATACGGTCGCCGCCCAGTATGATAGCGAGCGCATACGTGCCGAACTGACCCTACGGAGTTTTCCCTCCGGCGTGCGGAACTGCTACACGCTGCCCACCGTCGCCGGTGCAAAGTACCTGATCAGGGTGGTGGCCTTCTACGGCAACTACGACGGCAAGAACAGCTCGTCGACGTTGCAGTTCGATCTGCACCTCGGGGTAAACTACTGGAGCACCGTAATTCCCGACGTCACCAACACGTACGAGGCGTTGTTCGTGGCGTGGGCAAACATGGCGCCGGTGTGCCTTGTGAACACCGGCCAGGGCACGCCGTTCGTTTCCACGGTTGAGCTGAGGCCACTCGCGGATGCGCTCTATCCGGACCACGTCAAGGCCAACCAGTCTATGGCCATGTATGACCGTCGCATCATGGGGACCACAAATGCTGATGATCGGTTATGGTGGGCAGAGGACAGTAACCCACTGTGGGGTTATATTAACTCCACACGGAGCATCCAGCCGGAATCCAGCACGGAGGTGCCCTCCGCGTTACTCCAAAAGGCCGTTCAGGTGGCTGGGAACGGCACGATGCTCGACATAACATGGGAAGACACCACGCCCACTCTCCAGTTCACGGTGTTCCTGCATTTTGCTGACTTCCAGAAAAGCCAGCCCCGTCAGTTCGACATCTACTTCAACGGCCATGACAAGCCGTATCTGTACAACCCACCATACCTGGCCGCTGGGGTTGTCTACAGCCCCAGTTGGTACAGTGACATCGATGGACAGTACAATGTCACTCTTGTGGCCACTGCCGAGTCGAAATTTGTCAGGCAACCAATTGAATGGACCAATTCCAGATTCCCTATTTACGACTCCAACGGAGAGACGTACTGCAACAAAACAACAAGCCTGACCCGATCAAGAAACAGATCATCAGCAGCTATCTTAGCTATCTCAGTAGCAGCTCCTGTGCTGGTTGTGATCGCACTTTTTATTGCGTATTTGATGTGGAAAGCGAAAAGAAAGCCCAATACTTCTGAGTACAATCCTCCCAGAGTGCCAGAACCGATGAATGCTCCAGTAAGTAAGAAATATCACTGGGATCATCTAGAAAAAAATGAAAACCGCCAATTCACCTACGAGGAGCTGGAGAAGATTACAGATAACTTCCAACGATTAATTGGACAAGGAGGCTTCGGGTACGTGTATCATGGTTGTTTAGAAGACCATACTGAGGTAGCTGTGAAGATCCATTCTGAAAATTCACGGCATGGGCTTAGTGAGTTTTTAGCCGAGGTTCAGAGCTTGTCAAAGGTCCATCACAAAAATCTTGTTTCTTTGGTTGGCTACTGCACAGAGAAGGCTCATTTAGCATTGGTAGTCACCGGTGAGCGTCCGATAATACAAGGCCAAGGCCACATCATTCAGCGTGTAAAAGTGAAAGTTGTGGCGGGTGACATCAGCTTTATTGCTGATGCGCGGCTCAGAGGTGACTACAATGTCAACTCCATATGGAAGGTGGTGGAAATTGCCATGCTGTGCACAGAACCTGTCGCTGCTCAAAGGCCATCGATGGCAAGTGTGGTTGCAGAACTGAAGAACAGTTTAGCATTGGAGTTATCTCGTGATGATGGGGGCCACAAGGCGCCAGATCCACCACCACATGATGCGGTGGCTATGTCATCTACATTTGGTCCGTCGGCAAGATGA
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|
|||||||
| Protein seq | MVPIALSPSDQFDGFLSIDCGLEANYSGGYTDDGSYGIVYVPDGRTAHTVAAQYDSERIRAELTLRSFPSGVRNCYTLPTVAGAKYLIRVVAFYGNYDGKNSSSTLQFDLHLGVNYWSTVIPDVTNTYEALFVAWANMAPVCLVNTGQGTPFVSTVELRPLADALYPDHVKANQSMAMYDRRIMGTTNADDRLWWAEDSNPLWGYINSTRSIQPESSTEVPSALLQKAVQVAGNGTMLDITWEDTTPTLQFTVFLHFADFQKSQPRQFDIYFNGHDKPYLYNPPYLAAGVVYSPSWYSDIDGQYNVTLVATAESKFVRQPIEWTNSRFPIYDSNGETYCNKTTSLTRSRNRSSAAILAISVAAPVLVVIALFIAYLMWKAKRKPNTSEYNPPRVPEPMNAPVSKKYHWDHLEKNENRQFTYEELEKITDNFQRLIGQGGFGYVYHGCLEDHTEVAVKIHSENSRHGLSEFLAEVQSLSKVHHKNLVSLVGYCTEKAHLALVVTGERPIIQGQGHIIQRVKVKVVAGDISFIADARLRGDYNVNSIWKVVEIAMLCTEPVAAQRPSMASVVAELKNSLALELSRDDGGHKAPDPPPHDAVAMSSTFGPSAR
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|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsIR64_09g0007360 | OsIR64_09g0007360.02 | Chr09 | 12632123 | 12633101 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGCGCTCTATCCGGACCACGTCAAGGCCAACCAGTCTATGGCCATGTATGACCGTCGCATCATGGGGACCACAAATGCTGATGTTACTGCGTATGTTCTTTCATGACAGTATAATTACTTCTATAAATATATAT |
|||||||
| Protein seq | MRSIRTTSRPTSLWPCMTVASWGPQMLMLLRMFFHDSIITSINIY |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| AF | Chr09 | 12632744 | 12636036 | - | OsIR64_09g0007360.02 | OsIR64_09g0007360.02,OsIR64_09g0007360.01 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.910574 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0358000 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g19500 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.129089 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0358000 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0007270 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0007250 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0007480 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0006980 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0007320 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0201500 | SBH | 0 | 0 | 0.0070865 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_09G0180300 | SBH | 0 | 0 | 0.0071475 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0006910 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0007150 | RBH | 0.184005 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0007050 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0007080 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0007010 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G007200 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0007080 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
