Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsIR64_09g0007060 | OGI:09033140 | 15/16 | IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr09:12224420-12239487 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK265, OsRLCK265 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Probable LRR receptor-like protein kinase At1g51890 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGG6] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsIR64_09g0007060 | OsIR64_09g0007060.01 | Chr09 | 12224420 | 12237275 | - | NAM | ||
| CDS seq | ATGAGTGTGTCGGGGATATGTCAACTCGCCGACGGTTTCCTAAGTATCGACTGCGGCCTGGAGGCAGATGATAGCTACCCAGACGATCTCACCGGCATCACTTACGTCCCAGACGGCCGTTACACCGACGCCGGCGAGAATCACAAGGTGACCACCGTATACCGCGAAGCTTGGTGGGGCCCTGACACACGTACTCTCTACACGGTCAGGAGCTTCCCATCTGCCGAGGGTCAGCGCAACTGCTACTCGCTACCCACCGACGTCCGGTCCAAGTACTTGGTCAGGCTGGAGTTCTTGTATGGCAACTACGACGGCTTGGACAGCTCGTCGCTAAAATTCAACCTTACCCTTGGTGTCAAACACTGGGACACCGTGAGTATAGACACCACCGACGGAAATGATGGTTATAATGTTCACGAAGCGGTGTTCGTGGCATGGGCGAGCTGGGCGCCGGTTTGCCTCATCAACATCGGCCAGGGCACGCCGTTCGTGTCCACGGTGGAGTTGAGGCCTCTCGGTATCTTGCCCTACCCGGCTGTCATGGGCAATGTGTCACTCTCCCTCTATGTTCGGAGCAACGTGGGATCGAGCCCTGATGATGACAAATTAGTAAGGTACCCTGATGATCAGTACGATCGGTTCTGGTTCACAGATGCATACACAGAAGCTGATCCCTCGACGACAAACATTTCCACCCAATCTACCATCCAACCTAGCACTGAATTTGCGGTGCCCTCGCCTGTTCTCCAGAAGGCCGTTGTGCCGAGTGGCAACTCCACAAAACTAGTATTCTTTTCTGACCAATTAGACGCCCTCCTTCATGACCACTTCGTGATTCTGCATTTCGCCGACTTCCAGAACAAGAAGTCCCGGGAATTTACAGTTTCCATAGACAACGGTGTGCAGAGCAGCCCATACAGTACACCATACCTAAAAGTTTTGTCCGTCACCGGCGGCTGGTCCAGCAATTCTGAAGGAAAGTATAACTTCACCATTGCTGCAACTGCCACATCAGCTCTGCCCCCGATCCTTAACGCTTATGAGGTCTACGGTCGCATCATCCATGATAATCCAACAACGTTCTCCCAGGATTTTGATGCGATCATGGCTATTAAATATGAATATGGAATAAAGAAGAACTGGATGGGTGATCCGTGTTTTCCACCTGAATATGTTTGGGATGGTGTGAAATGCAGCGATCCAGGTGATAAAATCATGAGGATAATATCTATTGATCTCTCCAACAGCGAATTGAATGGGTCGATATCTAATTCTTTCACATTGTTTACTGCCCTCAAGTACTTAAACTTATCATGCAATCAACTTAATGGGACAATTCCAGATTCCCTCCTCAAAAACAACGGATCAATTGATTTCAGTTACGAGTCTGATGGAAATATGTGCAAAACACATGCTACTCCATCCCTGTCAAGAAATACCTTAGCTGTTTCAGTAGTGGCCCCAGTGCTGGTACTGGCCATACTTGTTCTGGCATATTTGATCTGGAGAGCCAAAAGAAAGCTCAATACTTCTTCAACTGATCTTGCCATGGTACCAGAACTCATGGGTGCTCCTGGACATATCACAAATCATTGGGACCATCTACAAAAACCTGAAAATCGCCGATTCACATATCAGGAGCTAGAGAAGTTTACTGAGAACTTCAAACATTTAATTGGGCATGGAGGCTTCGGGCATGTGTACTACGGTTGTTTAGAAGACAGTACTGAGGTTGCTGTGAAGATGCGGTCTGAATTATCTTCACATGGGCTTAATGAGTTTTTAGCTGAGGAACATTTGGCACTTGTCTATGAGTACATGTCTAGAGGCAATCTTTGTGATTATCTAAGAGGGAAAACTGGTACGGGTGAAATTTTGAATTGGAAGACACGTGTAAGAGTTGCACTTGAAGCTGCACAAGGCCTGGATTATCTACATAAGGGTTGCAACCTACCAATAATTCATGGGGATGTGAAGACGAACAACATTCTGTTGGGTCAAAATTTTAAAGCAAAGATAGCAGATTTTGGACTATCGAAAACATATCATAGTGACTCCCAGACTCATATATCAGCCACTGCAGCTGGATCTATGGGTTATATTGACCCTGAGTACTACACCACTGGTAGGCTCACCGAGAGCAGTGATGTTTACAGTTTCGGCGTTGTTTTACTAGAGATAACAACTGGCGAGCCTCCTATAATACCTGAAAATGGTCACATTGTTCAACGTGTGAAGCAAAAGATTGTCAGCGGTAACATTAGCTCAGTTGCAGACGCACATCTTGGAGGTGCCTATAATGTTAGCTCCATATGGAAGGTTGTTAACATCGCCATGATGTGCACAATAGATATAGCTACTCAAAGGCCAAAGATGGGTGACGTGGTTGTGCAGCTGAAGGAAAGCCTAGACTTGGTGGAAGTTCATGGGGACAGGGGAGACATGGAAAACCTAGCAAGTGACACCATGTCTTCAATGTCGACATTTGGTCCATCGGCAAGATGA
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| Protein seq | MSVSGICQLADGFLSIDCGLEADDSYPDDLTGITYVPDGRYTDAGENHKVTTVYREAWWGPDTRTLYTVRSFPSAEGQRNCYSLPTDVRSKYLVRLEFLYGNYDGLDSSSLKFNLTLGVKHWDTVSIDTTDGNDGYNVHEAVFVAWASWAPVCLINIGQGTPFVSTVELRPLGILPYPAVMGNVSLSLYVRSNVGSSPDDDKLVRYPDDQYDRFWFTDAYTEADPSTTNISTQSTIQPSTEFAVPSPVLQKAVVPSGNSTKLVFFSDQLDALLHDHFVILHFADFQNKKSREFTVSIDNGVQSSPYSTPYLKVLSVTGGWSSNSEGKYNFTIAATATSALPPILNAYEVYGRIIHDNPTTFSQDFDAIMAIKYEYGIKKNWMGDPCFPPEYVWDGVKCSDPGDKIMRIISIDLSNSELNGSISNSFTLFTALKYLNLSCNQLNGTIPDSLLKNNGSIDFSYESDGNMCKTHATPSLSRNTLAVSVVAPVLVLAILVLAYLIWRAKRKLNTSSTDLAMVPELMGAPGHITNHWDHLQKPENRRFTYQELEKFTENFKHLIGHGGFGHVYYGCLEDSTEVAVKMRSELSSHGLNEFLAEEHLALVYEYMSRGNLCDYLRGKTGTGEILNWKTRVRVALEAAQGLDYLHKGCNLPIIHGDVKTNNILLGQNFKAKIADFGLSKTYHSDSQTHISATAAGSMGYIDPEYYTTGRLTESSDVYSFGVVLLEITTGEPPIIPENGHIVQRVKQKIVSGNISSVADAHLGGAYNVSSIWKVVNIAMMCTIDIATQRPKMGDVVVQLKESLDLVEVHGDRGDMENLASDTMSSMSTFGPSAR
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsIR64_09g0007060 | OsIR64_09g0007060.02 | Chr09 | 12225253 | 12239487 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGTGCATGCACAGACTATTTGTTTTGTTAATGTCAATAATTGATACAGCCGGTATAAAACATAGATGTCATGGTAGGCTCATGATAGGTGTGTATATGGCCCATAATATAAAGTTTGCGTCTACATATGTGTGTGAACTTTTACTCACATTAGCTTCGATATTC |
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| Protein seq | MCMHRLFVLLMSIIDTAGIKHRCHGRLMIGVYMAHNIKFASTYVCELLLTLASIF |
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| A3 | Chr09 | 12227320 | 12227760 | - | OsIR64_09g0007060.02 | OsIR64_09g0007060.01,OsIR64_09g0007060.02 | All |
| AF | Chr09 | 12233410 | 12239487 | - | OsIR64_09g0007060.01 | OsIR64_09g0007060.01,OsIR64_09g0007060.02 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.486405 | 0.0 | 0.034045 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0349700 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g18020 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0349700 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0006830 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0006830 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0007030 | RBH | 0.114287 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0006900 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0007000 | RBH | 2.922249 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0192500 | RBH | 0.7153825 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_09G0173400 | RBH | 0.01507 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0006900 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0006770 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0006750 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0006660 | RBH | 0.062537 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0006730 | RBH | 0.054246 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G007240 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0007070 | RBH | 0.179610 | 0.0 | 0.296643 |
