Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsIR64_03g0041270 OGI:03099680 | 15/16 IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr03:38102044-38112463
Gene Symbol CDKF;3, CDKF;3, Orysa;CDKF;3
DNA seq

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Function Cyclin-dependent kinase F-3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q84SN3]

Transcripts

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsIR64_03g0041270 OsIR64_03g0041270.03 Chr03 38102176 38112460 + NAM
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsIR64_03g0041270 OsIR64_03g0041270.05 Chr03 38102303 38112463 + NAM
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr03 38103183 38103441 + OsIR64_03g0041270.03 OsIR64_03g0041270.01,OsIR64_03g0041270.05,OsIR64_03g0041270.04,OsIR64_03g0041270.03,OsIR64_03g0041270.02 All
A3 Chr03 38111695 38111847 + OsIR64_03g0041270.05 OsIR64_03g0041270.07,OsIR64_03g0041270.05,OsIR64_03g0041270.01,OsIR64_03g0041270.06,OsIR64_03g0041270.04,OsIR64_03g0041270.03,OsIR64_03g0041270.02 All
RI Chr03 38103441 38103681 + OsIR64_03g0041270.02 OsIR64_03g0041270.01,OsIR64_03g0041270.05,OsIR64_03g0041270.04,OsIR64_03g0041270.02 All
AF Chr03 38102044 38102667 + OsIR64_03g0041270.01 OsIR64_03g0041270.01,OsIR64_03g0041270.05,OsIR64_03g0041270.04 All
AF Chr03 38102176 38102667 + OsIR64_03g0041270.02,OsIR64_03g0041270.03 OsIR64_03g0041270.05,OsIR64_03g0041270.03,OsIR64_03g0041270.04,OsIR64_03g0041270.02 All
AF Chr03 38103311 38109274 + OsIR64_03g0041270.06 OsIR64_03g0041270.06,OsIR64_03g0041270.07 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.706436 2.781554 4.526316

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_03g0847600 RBH 2.169305 2.881180 12.928047
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os03g63020 RBH 1.485531 1.653241 3.073236
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os03g0847600 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_03g0042010 RBH 2.643593 40.007977 19.868130
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_03g0041700 RBH 0.844257 6.402783 8.786367
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_03g0041740 RBH 3.529394 37.551003 27.775454
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_03g0041990 RBH 0.561401 0.539815 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_03g0041540 RBH 8.086625 43.665920 44.276772
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_03G0609800 RBH 23.8627435 45.6050985 38.608412
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_03G0611400 RBH 28.462725 26.6935455 38.7211115
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_03g0041820 RBH 0.761150 0.697134 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_03g0041770 RBH 1.653927 39.243298 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_03g0041460 RBH 16.202608 70.714546 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_03g0041510 RBH 1.672351 3.305047 4.342748
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_03g0041560 RBH 1.444055 16.745239 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_03G041320 RBH 1.909800 6.766165 6.250403
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_03g0041000 SBH 5.345015 25.712814 25.585241
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