Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsIR64_01g0024700 OGI:01013090 | 16/16 IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:26387876-26409299
Gene Symbol CYP72A1, OsCYP72A1
DNA seq

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Function Cytochrome P450 72A15 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LUC5]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsIR64_01g0024700 OsIR64_01g0024700.01 Chr01 26387876 26402467 + NAM
CDS seq

ATGGTTCTTGGAGCCGGGTTGAGGTGTCCAGCCTCCGTGCCATGGAGCTCGCTGGCGTACGGTCTCCTGGGCCTGGTGCTCCTGTGGCAGGGCGGCCGGCTGCTGCACCGGCTGTGGTGGCTGCCGCGGCGGCTGGAGCTGGCGCTGCGCGCGCAGGGCCTCCGCGGCACGCGCTACCGCTTCCTCACCGGCGACCTCGGGGAGCACGGGCGGCTAAACAGGGAGGCCTGGGCGAGGCCGCTGCCGCTGCGGTGCCACGACATCGCGCCGCGCGTCGCGCCGTTCCTCCACAGCAGCGTCAGGGAGCACGGCAAGGCGTGCTTCTCATGGTTCGGCCCGATCCCCAAGGTGACCATCGCCAACCCGGACCTGGCCAAGGACGTGCTGTCCAACAAATTCGGTCACTTGGAGAAGCACAAGTTCCAGGGTCTGACGAAGCTGCTCTCCGACGGCGTCGCCAGCCACGAGGGCGAGAAGTGGGTTAAGCACAGGAGGATCCTCAACCCGGCTTTCCATCTCGAGAAGCTCAAGCGCATATGCTGCCGGCGTTTTCTACGTGCTGCGAAGAGCTGA

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsIR64_01g0024700 OsIR64_01g0024700.02 Chr01 26402446 26409299 + NAM
CDS seq

ATGCAGAGCCTGACCGGAGATGTCATTTCTCGCACCGCATTCGGAAGCAGCTACCTTGAAGGGAGAAGGATCTTCCAGCTGCAGGCAGAGCAAGCTGAGCGCCTCTTGAAATGCGTTCAGAAGATTATTATTCCGGGTTACATGTCCTTACCTACTAAAAACAACCGGAAGATGCATCAAATAAAGAAAGAGATTGATTCGATTCTACGGGGTCTAATTGGGAAAAGAATGCAAGCTATGAGAGAAGGTGAAAGCACCAAGGATTATCTACTGGGCCTGTTGCTCGAGTCAAACATGAGACACACGGCAGAGCATGGTCAGTCAAGCCAAGGGTTGACGATCGAGGAGGTGACAATGATCCTCTACGAGGTTCTTCGGCTGTATCCACTGGCCGTGACCTTGACTCGGCAAACATATAAGCAGATTGAGATCGGAGGCGTCACTTACCCCGCTGGCGTGATCATCGAGCTCCCCTTGCTGCTCATCCACAGTGACCCAGACATATGGGGAAGTGATGTGCACAAGTTTAATCCAGAGAGGTTCGCTGAGGGGATTTCCAAGGCATCCAAGGATCCAGGCGCGTTCCTACCATTTAGTTGGGGCCCGAGAATCTGTATTGGCCAAAACTTCGCGTTGCTTGAGGCCAAGATGGCGTTGTGTATGATTCTTCAACACTTGGAGCTTGAGCTCGCTCTGTCATACACTCATGCACCACAAAGTTTACCTGTTGAAAGCAGGAGATTAAAAGTTTGGGCGTTCGTCAGCGACGTGCGAGGGCATTGGGCATCGGCGTCCCCTGCTCAGTCGTGGAGCAGAGGATGGCGTTGTCCCCTGCTCCCCGCCGCCGCCACCTCCCCTGCCGCTCATCTCGCCGCGGCCGCCGCCGGTGGCGCTTCCCTCCTACGCGACTCGCCGGCCGGGGCCGAGCGGGAGGCGCCGCTGGCGGCGGCGGCGGCGCCGGCGGGGAGGGGCGTCGGGAGGGTGGGGCGCCGGCGAGGAGAGTCCACAGCAATGGTTTTTGGAGAGTTGTTCAGCCGAGCCTCACTGCCACCACCATGGAGCCTCCTGGCGTACGGCCTCGTCGGGCCGGTGCTTCTGTGGCAGGCCGGCCGCCTGCTCGACCGGCTGTGGTGGCGGCCGCGGCGGCTGGAGCGCGCGCTGCGCGCGCAGGGGCTCCGCGGCACCGCGTACCGGTTCCTCCTCGGCGACCTCAGGGAGTTCGGCCGGCTCAACGAGGAGGCGTGGTCGTCGGCGCCGCTGCCGCTGGGCTGCCACGACATCGTGCCCCGGGTCACCCCGTTCGTGCACCGCAACGTGCGGGATAACGGCAGGCCGTGCTGCTTCTCCTGGTTCGGCCCCATCCCCAGCGTCACCATCACCGACCCCGCCCAGCTCATGCTGCCGGCGTTTTCTACGTGCTGTGAAGAGCTTGTCGGGAAATGGATGGATTCCCTTGGTCCCGACGGTTCGTGCGAGCTGGATGTTTGGCCGGAGATGCAGAGTCTCACCGGAGATGTCATCTCTCGCACGGCATTCGGCAGCAGCTACAGTGAAGGAAGGAGGATCTTCCAGCTGCAGACTGAGCAAGCTGAGCTCTTCATAGGAGCCATTCAGAAGATCGTCATTCCGGGTTACATGTACTTGCCTACCAAAAAGAACAGAAGGATGCGGAGGATCAACAGTGAGGTTGAATCCATTCTGCGAGGAATAATTGGAAAAAGGATGCAGGCCATCGCGGAAGGCGAAAGCACCAACGATGATCTGCTGGGCCTGCTGCTCGAGTCCAATATGAGGCACGCAGACGAGAATGGACGATCCAGCCCAGGGATGACAACTGAAGATGTTATCGAGGAGTGCAAGCTGTTCTACTTCGCAGGAATGGAGACAACGTCAGTGCTGCTCACATGGACCATGGTTGTTCTGAGCATGCACCCGGAATGGCAAGACCGTGCAAGGGAGGAGGTTCTTGGTCTGTTTGGGAGGGACAAACCTGAGTACGAAGGCCTCAGCCGACTCAAGACGGTCACCATGGTTTTATACGAGGTTCTTCGGTTGTACCCGCCGGCGATCGTCTTCAGCCGGAAGACGTACAAGGAGATGGAGATCGGGGGCGTCGTGTACCCCAGAGGCGTGATCCTCGAGCTGCCTGTGCTGTTTATCCACCACGACCGCGAAATCTGGGGCAGAGACGTGCACGAGTTCAGGCCGGAGAGGTTCGCCGAGGGGATCTCCAGGGCGTCCAACGACCGCGGCGCGTTCCTCCCGTTTGGCTGGGGGCCGCGGGTCTGCATCGGCCAGAACTTCGCGCTGCTCGAGGCTAAGATGGCCTTGTGCATGATCCTCCAGCGCTTCGAGTTCGAGCTCGCTGCGTCCTACACCCACGCACCGCACACCGTCATGACGTTGCATCCCATGCACGGCGCGCAGATGAAGCTTAGGATGATCTAA

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.048869 0.211820 0.028109

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0627933 SBH 2.017400 4.386762 0.624634
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g43774 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0627933 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0026010 SBH 0.380584 1.018520 0.660300
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0025650 SBH 0.089938 0.415210 0.324732
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0025980 SBH 0.343233 0.0 1.553312
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0025300 RBH 0.000000 0.027641 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0025040 RBH 0.0 0.000000 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0421000 SBH 0.892174 1.455999 0.3114915
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0409800 RBH 1.3210485 4.3304605 0.3144385
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0024990 RBH 0.053336 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0024960 RBH 0.451164 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0025220 RBH 4.601038 5.917767 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0025230 RBH 0.000000 0.0 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0025100 RBH 0.081292 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G025350 RBH 0.087947 0.756523 0.201044
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0025100 SBH 0.0 0.000000 0.227597
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