Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsGoSa_11g0004870 | OGI:11010520 | 16/16 | GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:3640851-3678183 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK312, OsRLCK312, HWI1, 25L1, RLCK314, OsRLCK314, 25L2, Hwi1, XA21, Xa21*, Xa21, OsXA21 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MLLRRRKHEGNSTSLPSFGRKFPKVPYNELAEATEGFSESNLIGKGRYGYVYRGNLFQGTNVVAIKVFNLETMGAQKSFIAECNALRNVRHRNLVPILTACSSIDPNGNDFKALVYEFMPMGDLYNLLYAPQCDSNLRHITLAQRIGIVADVADAMDYLHHNNQGTIVHCDLKPSKILLDDNMTAHVGDFGLARFNFGSTTASLGDTNSTSSAAIKGTIGYIAPECAGGGQVSTAADVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFKDGLTIAKFTEINIPDKMQDIVDPQLAQELGLCEEAPMADEESGARCLLSVLNIGLCCTRLAPNERISMKEVASKMHGIRVICSTLGNETDRLSLLEFKNSITLNPHQSLISWNDSTHFCSWEGISCSSKNPPRVTAIDLRSQGLVGHISPSLGNLTFLRNLSLATNGFTGQIPESLGHLRRLRSLYLSNNTLQGIIPSFANCSQLTVLWLDHNDLAGGFPDGLPLGLQELQLSSNRLVGTIPPSLSNITALRKLSFAFNSITGSIPGELGTLSGVEILYASSNRLLGGFPEAILNMSALVALSLSTNSFSAELPSGIGSSLPNLRQLAIGINFFHGDIPSSLANASNLVKIDISENNFTGVVPASIGKLANLTRLNLEMNQLHARSKQDWEFMDSVANCTQLQGISIARNQMEGENQLSGSFPSGIANLPNLIILGLDYNRFSGSVPQWLGGLKKLQKLSLSTNSFTGYLPSSLSNLSHLTEILLDTNQFIGNIPSSFGNLQFLTTITITDNNLHGGVPKEIFRIPTIAEVGLSSNNLSGDIPNTLSNCENLQHVELDQNNFSGGIPTSFGKLISLKFLNLSHNKLSGSIPVSLGDLQLLEQIDLSFNHLTGQVPTKGIFKNSTSMQIDGNLTLCGGALELHLPECPFTPSNTTKGKLPVLLKVVIPLASMVTLAIVILVLYLIWKGKQRTNSISLPSFGREFPKVSYKDLARATNGFSTSNLIGEGRYGSVYQGQLFQDINVVAIKVFSLETKGAQKSFIAECNALRNVQHRNLVPVLTACSSIDSSGNDFKALVYEFMPRGDLHKLLYSTPHDETSSDLCYISLAQRLSIVVNVSNALAYLHHNHQGTIIHCDIKPTNILLDDNMTAHVGDFGLARFKNDSRQSFGNSHLPSSFAINGTVGYVAPECAGGGQISTAADVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFKDGLSIAKFTEMNIPDKMLQIVDPRLVQELSLCKEDSVINDENGAQCITAVGQLILVLMACSSHAVICSTFGNGTDQLSLLEFKKAISLDPQQSLMYWNDSTNYCSWEGVSCSLKNPGRVTSLNLTNRALVGHISPSLGNLTFLKYLALPKNALSGEIPPSLGHLRRLQYLYLSGNTLQGSIPSFANCSELKVLWVHRNILTGKFPADWPPKLQQLQLSINNLTGAIPASLANISSLNVLSCVYNHIEGNIPNEFAKLPNLQTLYVGSNQLSGSFPQVLLNLSTLINLSLGLNHLSGEVPSNLGSALPNLEIFELPVNFFHGRIPSSLTNASNLYFLELSNNNFTGLVPRTIGELNKLQMLNLEWNQLQAHREQDWEFLQSLGNCTELQVFSMTGNRLQGHVPSSLGNLSDQLQELHLAESKLSGIANLQNLIIVALGANQFTGVLPEWLGTIKTLQKVSLGSNLFTGAIPSSFSNLSQLGELYLDSNQLVGQLPPSFGTLPILQVLIVSNNNLHGSIPKEIFRIPTIVQINLSFNNLDAPLHNDIGKAKQLTYLQLSSNNISGYIPSTLGDCESLEDIELDHNVFSGSIPASLENIKTLKVLNLSYNNLSGSIPASLGNLQLVEQLDLSFNNLKGEVPTKGIFKNTTAIRVGGNPGLCGGSLELHLLTCSSTPLNSVKHKQFIFLKVVLPIAIMTSLVIAISIMWFWNRKQNRQSISSPSFGRKFPKVSYSDLVRATEGFSASNLIGRGRYGSVYQGKLFPERNLVAVKVFNLETRGAGKSFIAECNALKNVRHRNLITILTACSSIDSSGNDFKALVYEFMPRGDLHNLLYSTRDGDGSSNLYYVSLAQRLNIVVDVSDALAYLHHNHQGSIVHSDLKPSNILLDDNMTAHVGDFGLAAFKSDSAASSFGDSSLTSSFAIKGTIGYVAPECAGGGRVSTASDIYSFGIVLLEIFIRRKPTDDMFKDGLSISKYTEINFPDKMLQIVDPQLLRELDICQETSINVEKNEVCCLLSVLNIGLHCTKLVPGERMSMQEVMPIGLLLLVLIAWSSEAVICNSLNESEIDRRSLLEFKKGISMDPQKALMSWNDSTLLCNWEGVLCRVKTPRRVTSLNLTNRGLVGKISPSLGNLTFLKFLLLPTNSLTGEIPSSFGYLHRLQFLYLSNNTLQGMIPDLTNCSNLKAIWLDSNDLVGQIPNILPPHLQQLQLYNNNLTGTIPSYLANITSLKELIFVSNQIEGNIPNEFAKLPNLKVLYAGANKLEGKFPQAILNISTLTGLSLAYNNLSGELPSNLFTYLPNLQDLGLAANLFQGHIPNSLANASKLYMLDIALNYFTGIIPTSIGKLTELSWLNLEHNRLQARSKQDWEFMTSLANCSELNIFSMKDNLLEGHVPSSLGNLSVQLQHLLLGTNKLSGDFPFGIANLPGLTMLGLEDNKFTGIVPEWLGSLQNLQGIELANNFFTGVIPSSLANISMLEELFLESNQLYGYIPSSLGKLNVLSVLSMSNNSLHGSIPEEIFRIPTIRKISLSFNNLDAPLHDDIGNAKQLTYLQLSSNNITGYIPSTLDNCESLEDIELDHNVFSGSIPTTLGNIKTLKVLKLSNNNLTGSIPASLGNLQLLEQLDLSFNNLKGEVPTKGIFKNATAMRVDGNEGLCGGSLELHLLTCSNKPLDSVKHKQSILLKVVLPMTIMVSLVAAISIMWFCKRKHKRQSISSPSFGRKFPKVSYHDLVRATEGFSTSNLIGRGRYGSVYQGKLFEGRNVVAVKVFNLETRGAGKSFIAECNALKNVRHRNLVTILTACSSIDSAGNDFKALVYEFMPQGDLHNLLYSTRDGDGSSNLRNVSLAQRLSIAVDVSDALAYLHHNHQGTIVHSDIKPSNILLNDDMTAHVGDFGLARFKSDSATSSFVNSNSTSSIAIKGTIGYVAPECAEDGQVSTASDVYSFGIVLLEIFIRKKPTDDMFKDGLSIVKYTEINLPEMLQIVDPQLLQELHIWHETPTDVEKNEVNCLLSVLNIGLNCTRLVPSERMSMQEVASKLHGIRDEYLRGD |
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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsGoSa_11g0004870 | OsGoSa_11g0004870.01 | Chr11 | 3640851 | 3654837 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsGoSa_11g0004870 | OsGoSa_11g0004870.02 | Chr11 | 3652391 | 3678183 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 2.079502 | 1.579314 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0004860 | RBH | 0.373688 | 0.0 | 0.783316 |
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| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0004820 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
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| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0004790 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
