Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsGoSa_07g0001890 | OGI:07004740 | 16/16 | GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr07:1514450-1567243 | ||||||||
| Gene Symbol | RLK, RLCK221, OsRLCK221, YK35, RLCK237, OsRLCK237 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MDGIPSTISASGDHDQFIYTGFTGSNLTLDGAAKITATGLLGLTNDSFWIKGHASHPAPLRFRKSPNGTVQSFSVSFVFGILSSFGDIRGHGFAFFIAPSNDFSTAFPIQFLGLLNDINNGSSTNHLFAIELDTIRNDEFGDIDNNHVGIDINSLNSVRSSYAGFYNDNNGALTNVSLIGDKPMQVWVEYDGNAAQIDVTLAPLGIGRPKRPLLSVVYNLSIVLTDQAYLGFSSSTGLSTGHHYVLGWSFGLNIPAPIIDPIKLPKLPNLSPKPQSKLLEIVLPIASAIFVLAIGVAIVLLVRRHLRYKEVREDWEVEYGPHQGLLELTNGTVNQKGHAFHPTPFRLRKPPNSAVQSFSASLVFGIVVSPLLHASTEGMAFFLAPSSNFSDALPAQYLGLFNYSNNGNLSNYVFAVEIDTAQNNEFMDIDGNHVGIDICDLHSATSSSAGYYDDITGSFRNLSLISGKAMQIWINYDGEATWIDVALAPFKMARPTKTLLSMSYNLSAVLTNVAYIGLLAATGQIESRHYILGWSFSMNGPAPPFFTAHLPNLPKAHVDGKATQLILLPLISPLATPTFVFLVILAIFFFVRRRLRYAELREDWEIEFGPHRFSFKDLYLATEGFKNSHLLGTGGFGRVYKGLLSKSKSQIAVKRVSHESRQGIREFVAEVVSIGRLRHRNIVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDNYLYGHSNRPILDWIQRFRIIKGVASGLWYLHGEWEQVVIHRDIKASNVLLDEEMNARLGDFGLARLYDHGTDMQTTRLVGTIGYLAPELLQNGKASPLIDVFAFGIFVLEVTCGRRPIEHKMNSDQLKLVDWVIDCWNERSLLEAMDPKLQNEYDADEAFLALKLGLLCSHQSPAARPSMWHVMQYLNHDLPFPELAPMDMVQNRQVGSPVAYCQSVVSDGTITGLSEGSMKQYTLPIILFLTISISLLAISASGDHDQFIYTGFTGSNLTLDGAAKITATGLLGLTNDTFRIKGHASHPAPLRFRKSPNGTVQSFSVSFVFGILSSFGDIRGHGFAFFIAPSNDFSTAFPIQFLGLLNDINNGSSTNHLFAIELDTIRNDEFGDIDNNHVGIDINSLNSVRSSYAGFYNDNNGALTNVSLIGDKPMQVWVEYDGNATQIDVTLAPLGIGRPKRPLLSVVHNLSTVLTDQAYLGFSSSTGLSTGHHYVLGWSFGLNIPAPIIDPTKLPKLPNLSPRPQSKLLEIVLPIASAIFVLAIGVAIVLLVRRHLRYKEVREDWEVEYGPHRFAYKDLFDATKGFKNKNLVGTGGFGRVYKGVFPNSRLEVAIKRVSYESKQGIKEFVAEVVSIGHLQHRNVVKLLGYCRRKGELLLVYDYMANGSLDKYLYRQEGKPTLNWGQRFQIIKDIASGLLYLHEEWDKVVIHRDVKASNVLLDKQLNGRLGDFGLARLYDHGTDPQTTHVVGTIGYLAPELVHRGKATTLTDVFSFGIFILEVTCGQKPIKEDSQGRQLILVDWVLQNWHKGSLLDTVDVKIQGNYDIGEACLVLKLGLMCSHPFPNVRPNVRQVMQYLDGDVPLPELKPEHFSFDMLALIQKQNEANIPHMEHLSLLLPLIALALNLAITMSEDQFVYSGFSGRNLTLDGAATVTDDGVLELTNRTVHIKGHAFYPTPWQFRKTPNGTVQSFSINFVFGMIPVYSNEKCTDGMTFVISPTSDMSSAQDSQYLGLLNKTSDGKASNHIFAVELDSSRNTEFHDIDDNHVGIDINNLTSVQSRPAGFYSDNKSIFNNLSLCSYKPMQVWVDYNEDTTQIKVTMAPIEVGKPLRPLLSEIHNLSLVLEEPSYIGFSASTGPINTLYCVLGLSLGINRPAPAIDLSKLPKLPRVSPKPRTKLLEIILPIATATFILIVGTTIVLLVRRRMRYAELHEDWEAEFGPHRFSYKDLFHATDGFKNRNLLGLGGFGKVYKGVLPTSKLHVAVKRVSHDSKQGMKEFIAEIVSIGRLRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYEYMPNGSLDKYLYCEDSKPMLDWAQRFQIIKGVASGLFYLHDRWEKIVIHRDVKASNVLLDGEMNGRLGDFGLAKLYDHGADPQTTHVVGTMGYLAPELARTGKATPLTDVYAFGIFILEVTCGQRPIDNYADDNSQMLIDCVVEHWHKGSLTNMLDKRLLGDYDADEFSFFNTFTSYARVLLLDLFFFLFISNLSALATGEDQFIYSGFNGANLTLDGVASVTPDGLLKLTNGTLRLQGHAFHPTPFSFKKKPNGTVNSFAVSYIFAIYCLRPVICGHGIAFVVSVSKNFSTAMASQYLGLINDHNNGDPTNHFFAIELDTNQNDEFNDVNNNHVGIDINSLTSLNSSSVGYYTDSNGNFNNITLTSYKMMQVWLEYNGDNRQINVTLAPIKMAKPVKPLLSTYYDLSTVLTDMAYVGFSSSTGSFVARHYVLGWSFGINKPAPAIDISKLPKLPYEGEKTHSKVLEITLPIATATFVLAMIALIILLIRRRLRYAEIREDWEVEFGPHRFSYKDLFCATEGFKNKNLLGIGGFGRVYKGLLPTSKLEIAVKRISHDSNQGMKEFVAEIVSIGHLQHRNLVQLHGYCRRKSELILVYDYMSNGSLDKHLYGQENNSTLTWAQRFQIIKDIASGLLYLHEEWEKVILHRDIKPSNILLDDNMNGRLGDFGLARLYDHGTDPQTTHVVGTIGYLAPELARTSKATPLTDVFAFGMFVLEVTCGRKPIDHTAQDNQLMLVDWVLHCWHQGFLNDAVDIKLQGVYNIDEACLALKLGLLCAHPFINKRPSMRHVTQILNREMELPELTPTHMSFNMLSLMQNQGFDPETMTNQFLISNSTLSDLSEVRQTSHTKFFFLFLLVSFGINCASFTNTSDDQLLYLGFTGANLITDDTTVVTSNGLLELTNGTINRKGHAFYPSPLHFRKSHNNKVHSFAVSFVFAIRSSYPRMSLHGLAFVVSPSINFSNALAIQYLGLLNSKNRGSKSNHILAIEFDTILNIEFEDIDDNHVGIDINDLHSIKSHSAGYYDDRNSSFQNMSLISGDAMQAWVDYNGEDKKISVTMAPIKMAKPKRPLILISYDLSTVLKEPSYIGFSASTGLVDSRHYILGWSFGMNKPAPMINVNKLPKLPRQGPNPQPKLLAITLPIASATFVILFCGVFITIVRRRLRYVELKEDWEIEFGPHRFSYKDLFHATHGFDNKNLLGAGGFGKVYKGVLPSSKLEVAVKRVSHESRQGMKEFVAEVVSIGRIRHRNIVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDAYLYNNELKPTLSWDQRFWIIKGIASGLFYLHDKWEKVVIHRDIKASNVLLDTEMNGRLGDFGLARLYDHGTDLQTTHVVGTMGYLAPELVCTGKASPLTDVFAFGAFLLEVTCGQRPVNHSSQDSPAVLVDWVLEHWQKGLLTNTVDARLQGDYNIDEACFVLKLGLLCSHPFTNMRPNMQQVMQYLDGDVPLPELTQMDMSFSIISMMQDEGFNPYTLSSYPPPGTSIVRCLTEQTKEQLGSLHVSLAVSLSDKDRKGIEDYAEDSCSLASYMIRVKPGLLPVQPSPKHLCTFWHLNSLVLHKLHMENQPVLFSAVFILYVSFLGPFCASSGEESFVYSGFASTGAANLTLDGSAMVTTTGLLQLTDSMPNIQGHAFYPTPLRFKKQSNGIVQSFSVAFVFGIISPYSDASTDGMAFVVAPNKGFPDAKAAQFLGLLNISSDNSTSNHMFAVEIDTAQNTELDDIDGYHVGIDINSLHSKKSQHIGFYNDQHGGLLKNLTLTGSNCKPVQVWVDYDGETTQINVTLAPIKVTKPTRPLLSVPFNLSTVLTDQAYIGFSAATGPLTSHYYVLGWSFAMNAPAPPIEISRLPRLPCPGDNRLQKILQILLPIVAVALIFIVVMIIVRRQQRYAELREDWEVEFGPHRFSYKDLFNATEGFKSKHILGVGGFGKVYKGVLRTSKHEVAVKKVSHGSNQGMKEFISEVVSIGHLRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDKYLYGEDNKPVTCGRWPISNSAHHGRKMLVDWVLQHWHQGSLPETVDPKLHGIYNVDEACLVLTLGLMCSHPIPGARPIMRQVMQYLDGDAPLPEFTPATLNSSLLAIMHNEGVDPYVAQYPWSGNSLGTMTPDIFVALQTTLHDPQYASRRKA |
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| Function | L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XUN6] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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aacacatgtggctggtacctttggatatatagcaccagagatggcgcgcaccggtaaggcatcccctctaacagacgtatatgcatttgccatttttgttcttgaggtaacatgtgggcgaagacctattaacaattacacgcatgatagcccgacaatattagttgattgggttgttgagcattggcaaaaaggatcactgacaagcacactggacgtcagattacaaggagaccacaatgcagatgaggtgaatcttgttttaaagctagggctgttgtgtgcaaatccaatttgtaccagaaggcccggtatgcgtcaagtcatgcaatacctcgacaatgagatgccacttcctcggttgatgcccacaaacttgagttatagcatgttgggatattTgcaaaacgacggtttcgaccagtacaaatctgtgccatctacagtttgcagcaacaacctgacatcgagcctcacgagtggaagatga
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| Protein seq | MPVVNRWCFLPILLFIFILLLVIILPSLATTLGDGQFVYYGFANSNLIVHGAATVSPEGLLELTNGTVNQKGHAFHPTPFWLRKSPNSAVQSFSASLVFGIVSPLLHASTEGMAFFLGPSSNFSDALPAQYLGLFNYSNNGNLSNHVFAVEIDTAQNNEFMDIDGNHVGIDICDLHSATSSSAGYYDDITGSFRNLSLISGEAMQIWINYDGEATWIDVALAPFKMARPTKTLLSMSYNLSAVLTDVAYVGLSAATGQIESRHYILGWSFSMNGPAPPFFTAHLPNLPKARVDGKATKLILLPLIFPLATPTFVFLVILAIFFFMRRRLRYAELREDWEIEFGPHRFSFKDLYLATEGFKNSHLLGTGGFGRVYKGLLSKSKSQIAVKRVSHESRQGIREFVAEVVSIGRLRHRNIVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDNYLYGHSNRPILDWIQRFRIIKGVASGLWYLHGEWEQVVIHRDIKASNVLLDEEMNARLGDFGLARLYDHGTDMQTTRLVGTIGYLAPELLQNGKASPLTDVFAFGIFVLEVTCGRRPIEHKMNSDQLKLVDWVIDCWNERSLLEAMDPKLQNEYDADEACLALKLGLLCSHQSPAARPSMWHVMQYLNHDLPFPELAPMDMVQNRQVDSPVTYCQSVVSDGTITGLSEGSTKLILCFLLLFLTLNLSASSTGGDHERFMYAGFTGANLTMDGSAKIIPTGLLALTKDTFRAQGHALHPAPLRFGQSNGMVTSFSVSFVFGILSSFVDIRGHGFAFFIAPTNNFSSAFPIQFLGLLNDKNNGSLSNHLFAIEFDTIRNDEFGDIDNNHVGIDINSLNSMQSYHAGFYDDKGGTFTNLSLIGGGPIQVWIEYDGYTTLTNVTIAPLGMARPIRPLLSVTCDLSTVFTNQSYLGFSSSTGLSTGHHYVLGWSFGMNSPAPIIDSTKLPKLPEPPNSGPRTQSILLILPLIGSILLVLIIGIVVLLVRRQLVYKEVREDWEVEYGPRRFAYQDLFRATRGFKNNNLVGIGGFGKVYRGVLPISKLQVAVKRVSYGSKQGIKEFIAEVVSIGNLQHRNIVQLFGYCRRKNELLLVSCGQKPIRQNSEGKHLILVDWVVENWHKGSLLDTMDRRLQGNYNIDEACLALKLGLLCSHPFSNARPNMRQVLQYLDGDVQLPELNRPAMEHLACFLLFLTSFTTVSIGQDQFIYNGFSGSNLILDGTAMVTPNGILELTNGASTYETSYALYPTPWQFLKVPLQSFSVNFVLFMAPSIRCPDSMAFMIFPSKGLKNDQRESNLAVNFLSCQDKRFLENNENDISISINSSFSRPLETHPAGFYDDKNGIFNDLPLVGGKAVQIWVDYDGEATQMNVTIAPLKLTKPLRPTLSAILNISTILDEGVSYIGFSSGANNVGALNYVLGWSFGMNSPAPTIDIIKLPKLPRFGPKVRSKTLKIVLPIVITTVILLVGAAVTALVWRRKRYAELYEDWEVEFGPYRFSYKYLFDATEGFNNEKILGVGGFGKVYKGVLPDSKLEVAIKRVSHESKQGIKEFIAEIVSIGRIRHRNLVQLLGYCRRKDELLLVYDYMPNGSLDKYLHCKEGKYTLDWAKRFQIIRGVASGLFYLHEKWEKVVIHRDIKASNVLLDAEMNGHLGDFGLARLYEHGNDPQTTHVAGTFGYIAPEMARTGKASPLTDVYAFAIFVLEVTCGRRPINNYTHDSPTILVDWVVEHWQKGSLTSTLDVRLQGDHNADEVNLVLKLGLLCANPICTRRPGMRQVMQYLDNEMPLPRLMPTNLSYSMLGYLQNDGFDQYKSVPSTVCSNNLTSSLTSGR
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 1.448470 | 0.0 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_07g0130100 | RBH | 0.620625 | 0.630843 | 0.718654 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g03890 | RBH | 0.542379 | 0.378909 | 0.074016 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os07g0130400 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0009630 | RBH | 0.401883 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0001940 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.361887 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_07g0010430 | RBH | 2.233815 | 0.0 | 7.144199 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_07g0020380 | RBH | 0.144208 | 0.011003 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_07g0001920 | RBH | 0.396331 | 0.0 | 0.252515 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_07G0027500 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_07g0001930 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_07G0024300 | RBH | 2.189326 | 3.6027705 | 3.4794355 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_07g0001900 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_07g0020340 | RBH | 0.305669 | 1.843393 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_03g0035830 | SBH | 6.400653 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_07g0002050 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_07g0020190 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_07G002040 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_07g0002040 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
