Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsGoSa_04g0001120 OGI:04004240 | 16/16 GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:1429578-1448033
Gene Symbol OsSLPP1, SLPP1, OsSub33, SUB33, OsSub34, SUB34, OsSub35, SUB35, OsSub37, SUB37, OsSub38, SUB38
DNA seq

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Protein seq

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Function Subtilisin-like protease SBT3.8 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SZY3]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsGoSa_04g0001120 OsGoSa_04g0001120.01 Chr04 1429578 1448033 + NAM
CDS seq

ATGCTCTTAAGCAGAGCGAACCACCccacgaagctatacattgtctaccttggggagagaagacacgatgatgctgatctcgtcactgcttcccaccatgacatgcttgcctctgttttgggaagcaaggaggcggctcttgagtccatcgtatacagctataggtacagtttctctggctttgctgcaaggctcacaaaaacacaagcgagcatcatacgagggttgcctgatgtggtcagcgtgagagagaaccatatccatcaattgcataccagtcgaagctgggatttccttggaatggactacaggcaaccaaatggcctgcttgccaaagctaaatacggggaagatattattattggtgttttagacacaggtatcacgcctgagtcaccaagcttcactgatgatggatatggtccccctccatccaaatggaaaggaatttgccaagtcggcccctcgttcgaggccaaaagttgcaaccgaaaacttatcggtgcacggtggtatatcgatgacgatactctaagcagcatgagcaagaatgaaattctatctcctagggacgtggaaggccacggcacgcacacggcctcgacagccggtggcaacatcgtccacaatgctagcattcttggtctagctactggaacagttcggggtggcgcgccccgtgcacgagtagccatgtacaagatttgttggtccggcagcggctgctccgctgccgtccagttgaaagccttggacgatgctgtctacgatggcgtcgatgtgttatcactttctcttggtagtccattggaagatctaggcaccttgcatgtcgttgccaaaggaatcccagttgtgtactctgctgggaacgatggacccattgctcagacagtggagaactcatcaccatggctgttaacggttgctgccgccaccatggatcgatccttccctgtggttatcaccttaggcgataatcataagtttgtggcacaatcctttgtcctttcacggcaaacgacaagtcagttaagtgagatacaagttttcgagggtgacgactgcaatgccgacaatatcaacagcacagtgaaggggaagacggtcttctgcttcgggacaaagctcgatccggagccagacatcaacagcatcatcaaggtgacgggtgagaaaggaggaacaggggtgatcatgccaaagtacaacaccgacacgctactgcaggacagccccctcactttgcctattccctttgtcgtagttgactacgagatcgcctacaggatataccagtactacaccaatgaaaatgatggcaccgcaaaagtgaagatatcattaacccaaacaacgattggaaaagtaactgcccctaaagtagcagctttctcatcgagggggcccagttctatatatccaggggttatcaagcctgatattgctgccgtaggtgttacgattttagcggctgcaccaaaggattttattgatttaggtatcccataccatttcgagtctggaacatcgatggcttgcccccatgtgagtggtatcgttgctgtactcaaatcactgcatcctgaatggtcacctgctgccctcaaatccgcaatcatgactacagcacttacctatgacaacaatgggatgccgataaaagctaatggaagagttgaaaagattgcggatccttttgattatggagcagggtttattaatccgaacatggcagctgatccagggctaatctacgacatctctgcatccgattatctcaagttcttcaattgcatgggaggactgggctcaggggacaactgcaccacagtaaaaggatcacttgctgacctgaacctcccgtccattgccatccccaacctcaagacattccaagtcgcgacacgcaccgtcactaacgttggccaggccaatgccgtgtacaaggcattcctccaaccccccgtcggcatcgagatggctgttgagccgccagtgttggtgttctctaaggatagaaaggtgcagagcttcaaggtgacctttaaagtgacgaggaggccaattcaaggagactataggtttggaagcttggcttggcacgatggtgtgcggcggcggcgacttccggctgcgtcggcggaaggcggcgccaaggcgggtaggagcctaggcagcgcgtcgggcggcggcgactgcagtctagtctgcagcgtgctcgtcggcggcttcggcagaggcttccggctgcggcgtgcgcggctgcgtcggcggcaggaggcgccgaggcgtgcaggcggcgcgtcgacggctgcggccgtgcggcgttggggctcggccaggcgtgcaggccgccagtccaccaggccaccacacagcgagaaatccatggcatggggaggtctcttcttgagcttcagccgtccctcacaggaccaacagaagtcatgcctttcagctgctggtggtttcaactatgatgcgcctctccatggtgcctcaagaccaaaatcagtagctaaattgactgcgggagatactgaagcaagtgacaaagcgcttgtcgagcgcggcttcttcgtgaaccgttcacgtgttctggttggctctggcactaccaccttcaaccatgccaaatccgcgcttctctcctggaagcatttggcactaggctgggcaaatgtggaacccgacacaccggtgaaggctggaacaaggttctgcatttgttacaaggagctgatcccttgggtcatgttgcccctccagattgcctatgtgaccgatggcaatggaggcaactcctcaggccatggaaaaggctgcgtttttgcttatggtagcggcactctacaaggccatctgctggcaggggaggagaggttctcggtgcagctggacgaagacgatcaggtgtggtacgaggtgatgtccttctcgaagccagcacacatcctgtccagcctctgctacccgtacgtgcagctgaggcagaagcatttcgcgcatcagtcagggcaggcactgctcaggcatgttgccagccgctccagggacacacgagtactcaatggattagcaactttttccatgtctgtcactgtcactagaagaagctttgctagtgcaagtgttcactgtcacaactttcttcgaaactcgcagccagacattgctgcaccaggggttgcgattttagctgcttcaccaaatactctagagttcaaaggtgtcccctaccattttgcttctggaacatctatggcttgcccacatatatctgggatcattgccgtgctcaagtcccttcatcctgaatggtcccctgctgccctcaaatccgcaatcatgactacagcaaatacctttgacaacaatgggatgcctatacaagctaatggaagagttccaaagattgccgatccctttgattatggagcaggctttgttaatccgatcatggcagctgatccaggcctcatctatgacatcaacccttctgattacctcaagttcttcaactgcatgggagggctaggctcacatgacaattgcacgacgataaaaggacccgtgattgacttgaacctgccatcgattgccattcccaacctcaggacatcccaaactgcagtgcgcactgtcactaacgttggtgaccagcatgatgctgtgtacaaagctttcctcgagcctcctgcaggaatcgagatggccgtcgagccaccagagctggtgttcagcaaggacaagaaggatcagagcttcaaggtgaccttcaaggcgacacggaaggtccatggggactacacatttggaagcttggcatggcatgatggaggcagccactgggttcgcatccccatcgccgttcgcaatgtgattgaagagatatattccaatatttcctaa

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Protein seq

MLLSRANHPTKLYIVYLGERRHDDADLVTASHHDMLASVLGSKEAALESIVYSYRYSFSGFAARLTKTQASIIRGLPDVVSVRENHIHQLHTSRSWDFLGMDYRQPNGLLAKAKYGEDIIIGVLDTGITPESPSFTDDGYGPPPSKWKGICQVGPSFEAKSCNRKLIGARWYIDDDTLSSMSKNEILSPRDVEGHGTHTASTAGGNIVHNASILGLATGTVRGGAPRARVAMYKICWSGSGCSAAVQLKALDDAVYDGVDVLSLSLGSPLEDLGTLHVVAKGIPVVYSAGNDGPIAQTVENSSPWLLTVAAATMDRSFPVVITLGDNHKFVAQSFVLSRQTTSQLSEIQVFEGDDCNADNINSTVKGKTVFCFGTKLDPEPDINSIIKVTGEKGGTGVIMPKYNTDTLLQDSPLTLPIPFVVVDYEIAYRIYQYYTNENDGTAKVKISLTQTTIGKVTAPKVAAFSSRGPSSIYPGVIKPDIAAVGVTILAAAPKDFIDLGIPYHFESGTSMACPHVSGIVAVLKSLHPEWSPAALKSAIMTTALTYDNNGMPIKANGRVEKIADPFDYGAGFINPNMAADPGLIYDISASDYLKFFNCMGGLGSGDNCTTVKGSLADLNLPSIAIPNLKTFQVATRTVTNVGQANAVYKAFLQPPVGIEMAVEPPVLVFSKDRKVQSFKVTFKVTRRPIQGDYRFGSLAWHDGVRRRRLPAASAEGGAKAGRSLGSASGGGDCSLVCSVLVGGFGRGFRLRRARLRRRQEAPRRAGGASTAAAVRRWGSARRAGRQSTRPPHSEKSMAWGGLFLSFSRPSQDQQKSCLSAAGGFNYDAPLHGASRPKSVAKLTAGDTEASDKALVERGFFVNRSRVLVGSGTTTFNHAKSALLSWKHLALGWANVEPDTPVKAGTRFCICYKELIPWVMLPLQIAYVTDGNGGNSSGHGKGCVFAYGSGTLQGHLLAGEERFSVQLDEDDQVWYEVMSFSKPAHILSSLCYPYVQLRQKHFAHQSGQALLRHVASRSRDTRVLNGLATFSMSVTVTRRSFASASVHCHNFLRNSQPDIAAPGVAILAASPNTLEFKGVPYHFASGTSMACPHISGIIAVLKSLHPEWSPAALKSAIMTTANTFDNNGMPIQANGRVPKIADPFDYGAGFVNPIMAADPGLIYDINPSDYLKFFNCMGGLGSHDNCTTIKGPVIDLNLPSIAIPNLRTSQTAVRTVTNVGDQHDAVYKAFLEPPAGIEMAVEPPELVFSKDKKDQSFKVTFKATRKVHGDYTFGSLAWHDGGSHWVRIPIAVRNVIEEIYSNIS

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsGoSa_04g0001120 OsGoSa_04g0001120.02 Chr04 1440675 1441679 + IsoSeq
CDS seq

atgttatatatgttgccactttcatatgtcgaacaattagtacttatatatgttaaagaatttggacttatgatcaattctatcaat

Protein seq

MLYMLPLSYVEQLVLIYVKEFGLMINSIN

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 3.698248 10.628968 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0121100 RBH 0.198895 0.203972 2.960203
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g02970 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0121200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0001010 RBH 0.076834 0.000000 16.435106
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0000970 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0000970 RBH 0.000000 1.489288 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0001060 RBH 0.0 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0001130 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0024700 RBH 4.3762215 0.0109265 0.5569105
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0001080 RBH 0.092469 0.180101 0.937968
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0024100 SBH 2.2369375 0.413918 3.1201365
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0001030 RBH 0.021065 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0001040 RBH 0.130286 2.141956 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0001220 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0001050 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0001230 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G001240 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0001140 RBH 0.0 0.0 16.939749
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