Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsGoSa_04g0001120 | OGI:04004240 | 16/16 | GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:1429578-1448033 | ||||||||
Gene Symbol | OsSLPP1, SLPP1, OsSub33, SUB33, OsSub34, SUB34, OsSub35, SUB35, OsSub37, SUB37, OsSub38, SUB38 | ||||||||||
DNA seq | 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CDS seq | ATGCTCTTAAGCAGAGCGAACCACCccacgaagctatacattgtctaccttggggagagaagacacgatgatgctgatctcgtcactgcttcccaccatgacatgcttgcctctgttttgggaagcaaggaggcggctcttgagtccatcgtatacagctataggtacagtttctctggctttgctgcaaggctcacaaaaacacaagcgagcatcatacgagggttgcctgatgtggtcagcgtgagagagaaccatatccatcaattgcataccagtcgaagctgggatttccttggaatggactacaggcaaccaaatggcctgcttgccaaagctaaatacggggaagatattattattggtgttttagacacaggtatcacgcctgagtcaccaagcttcactgatgatggatatggtccccctccatccaaatggaaaggaatttgccaagtcggcccctcgttcgaggccaaaagttgcaaccgaaaacttatcggtgcacggtggtatatcgatgacgatactctaagcagcatgagcaagaatgaaattctatctcctagggacgtggaaggccacggcacgcacacggcctcgacagccggtggcaacatcgtccacaatgctagcattcttggtctagctactggaacagttcggggtggcgcgccccgtgcacgagtagccatgtacaagatttgttggtccggcagcggctgctccgctgccgtccagttgaaagccttggacgatgctgtctacgatggcgtcgatgtgttatcactttctcttggtagtccattggaagatctaggcaccttgcatgtcgttgccaaaggaatcccagttgtgtactctgctgggaacgatggacccattgctcagacagtggagaactcatcaccatggctgttaacggttgctgccgccaccatggatcgatccttccctgtggttatcaccttaggcgataatcataagtttgtggcacaatcctttgtcctttcacggcaaacgacaagtcagttaagtgagatacaagttttcgagggtgacgactgcaatgccgacaatatcaacagcacagtgaaggggaagacggtcttctgcttcgggacaaagctcgatccggagccagacatcaacagcatcatcaaggtgacgggtgagaaaggaggaacaggggtgatcatgccaaagtacaacaccgacacgctactgcaggacagccccctcactttgcctattccctttgtcgtagttgactacgagatcgcctacaggatataccagtactacaccaatgaaaatgatggcaccgcaaaagtgaagatatcattaacccaaacaacgattggaaaagtaactgcccctaaagtagcagctttctcatcgagggggcccagttctatatatccaggggttatcaagcctgatattgctgccgtaggtgttacgattttagcggctgcaccaaaggattttattgatttaggtatcccataccatttcgagtctggaacatcgatggcttgcccccatgtgagtggtatcgttgctgtactcaaatcactgcatcctgaatggtcacctgctgccctcaaatccgcaatcatgactacagcacttacctatgacaacaatgggatgccgataaaagctaatggaagagttgaaaagattgcggatccttttgattatggagcagggtttattaatccgaacatggcagctgatccagggctaatctacgacatctctgcatccgattatctcaagttcttcaattgcatgggaggactgggctcaggggacaactgcaccacagtaaaaggatcacttgctgacctgaacctcccgtccattgccatccccaacctcaagacattccaagtcgcgacacgcaccgtcactaacgttggccaggccaatgccgtgtacaaggcattcctccaaccccccgtcggcatcgagatggctgttgagccgccagtgttggtgttctctaaggatagaaaggtgcagagcttcaaggtgacctttaaagtgacgaggaggccaattcaaggagactataggtttggaagcttggcttggcacgatggtgtgcggcggcggcgacttccggctgcgtcggcggaaggcggcgccaaggcgggtaggagcctaggcagcgcgtcgggcggcggcgactgcagtctagtctgcagcgtgctcgtcggcggcttcggcagaggcttccggctgcggcgtgcgcggctgcgtcggcggcaggaggcgccgaggcgtgcaggcggcgcgtcgacggctgcggccgtgcggcgttggggctcggccaggcgtgcaggccgccagtccaccaggccaccacacagcgagaaatccatggcatggggaggtctcttcttgagcttcagccgtccctcacaggaccaacagaagtcatgcctttcagctgctggtggtttcaactatgatgcgcctctccatggtgcctcaagaccaaaatcagtagctaaattgactgcgggagatactgaagcaagtgacaaagcgcttgtcgagcgcggcttcttcgtgaaccgttcacgtgttctggttggctctggcactaccaccttcaaccatgccaaatccgcgcttctctcctggaagcatttggcactaggctgggcaaatgtggaacccgacacaccggtgaaggctggaacaaggttctgcatttgttacaaggagctgatcccttgggtcatgttgcccctccagattgcctatgtgaccgatggcaatggaggcaactcctcaggccatggaaaaggctgcgtttttgcttatggtagcggcactctacaaggccatctgctggcaggggaggagaggttctcggtgcagctggacgaagacgatcaggtgtggtacgaggtgatgtccttctcgaagccagcacacatcctgtccagcctctgctacccgtacgtgcagctgaggcagaagcatttcgcgcatcagtcagggcaggcactgctcaggcatgttgccagccgctccagggacacacgagtactcaatggattagcaactttttccatgtctgtcactgtcactagaagaagctttgctagtgcaagtgttcactgtcacaactttcttcgaaactcgcagccagacattgctgcaccaggggttgcgattttagctgcttcaccaaatactctagagttcaaaggtgtcccctaccattttgcttctggaacatctatggcttgcccacatatatctgggatcattgccgtgctcaagtcccttcatcctgaatggtcccctgctgccctcaaatccgcaatcatgactacagcaaatacctttgacaacaatgggatgcctatacaagctaatggaagagttccaaagattgccgatccctttgattatggagcaggctttgttaatccgatcatggcagctgatccaggcctcatctatgacatcaacccttctgattacctcaagttcttcaactgcatgggagggctaggctcacatgacaattgcacgacgataaaaggacccgtgattgacttgaacctgccatcgattgccattcccaacctcaggacatcccaaactgcagtgcgcactgtcactaacgttggtgaccagcatgatgctgtgtacaaagctttcctcgagcctcctgcaggaatcgagatggccgtcgagccaccagagctggtgttcagcaaggacaagaaggatcagagcttcaaggtgaccttcaaggcgacacggaaggtccatggggactacacatttggaagcttggcatggcatgatggaggcagccactgggttcgcatccccatcgccgttcgcaatgtgattgaagagatatattccaatatttcctaa
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Protein seq | MLLSRANHPTKLYIVYLGERRHDDADLVTASHHDMLASVLGSKEAALESIVYSYRYSFSGFAARLTKTQASIIRGLPDVVSVRENHIHQLHTSRSWDFLGMDYRQPNGLLAKAKYGEDIIIGVLDTGITPESPSFTDDGYGPPPSKWKGICQVGPSFEAKSCNRKLIGARWYIDDDTLSSMSKNEILSPRDVEGHGTHTASTAGGNIVHNASILGLATGTVRGGAPRARVAMYKICWSGSGCSAAVQLKALDDAVYDGVDVLSLSLGSPLEDLGTLHVVAKGIPVVYSAGNDGPIAQTVENSSPWLLTVAAATMDRSFPVVITLGDNHKFVAQSFVLSRQTTSQLSEIQVFEGDDCNADNINSTVKGKTVFCFGTKLDPEPDINSIIKVTGEKGGTGVIMPKYNTDTLLQDSPLTLPIPFVVVDYEIAYRIYQYYTNENDGTAKVKISLTQTTIGKVTAPKVAAFSSRGPSSIYPGVIKPDIAAVGVTILAAAPKDFIDLGIPYHFESGTSMACPHVSGIVAVLKSLHPEWSPAALKSAIMTTALTYDNNGMPIKANGRVEKIADPFDYGAGFINPNMAADPGLIYDISASDYLKFFNCMGGLGSGDNCTTVKGSLADLNLPSIAIPNLKTFQVATRTVTNVGQANAVYKAFLQPPVGIEMAVEPPVLVFSKDRKVQSFKVTFKVTRRPIQGDYRFGSLAWHDGVRRRRLPAASAEGGAKAGRSLGSASGGGDCSLVCSVLVGGFGRGFRLRRARLRRRQEAPRRAGGASTAAAVRRWGSARRAGRQSTRPPHSEKSMAWGGLFLSFSRPSQDQQKSCLSAAGGFNYDAPLHGASRPKSVAKLTAGDTEASDKALVERGFFVNRSRVLVGSGTTTFNHAKSALLSWKHLALGWANVEPDTPVKAGTRFCICYKELIPWVMLPLQIAYVTDGNGGNSSGHGKGCVFAYGSGTLQGHLLAGEERFSVQLDEDDQVWYEVMSFSKPAHILSSLCYPYVQLRQKHFAHQSGQALLRHVASRSRDTRVLNGLATFSMSVTVTRRSFASASVHCHNFLRNSQPDIAAPGVAILAASPNTLEFKGVPYHFASGTSMACPHISGIIAVLKSLHPEWSPAALKSAIMTTANTFDNNGMPIQANGRVPKIADPFDYGAGFVNPIMAADPGLIYDINPSDYLKFFNCMGGLGSHDNCTTIKGPVIDLNLPSIAIPNLRTSQTAVRTVTNVGDQHDAVYKAFLEPPAGIEMAVEPPELVFSKDKKDQSFKVTFKATRKVHGDYTFGSLAWHDGGSHWVRIPIAVRNVIEEIYSNIS |
||||||||||
Function | Subtilisin-like protease SBT3.8 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SZY3] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsGoSa_04g0001120 | OsGoSa_04g0001120.01 | Chr04 | 1429578 | 1448033 | + | NAM | ||
CDS seq | ATGCTCTTAAGCAGAGCGAACCACCccacgaagctatacattgtctaccttggggagagaagacacgatgatgctgatctcgtcactgcttcccaccatgacatgcttgcctctgttttgggaagcaaggaggcggctcttgagtccatcgtatacagctataggtacagtttctctggctttgctgcaaggctcacaaaaacacaagcgagcatcatacgagggttgcctgatgtggtcagcgtgagagagaaccatatccatcaattgcataccagtcgaagctgggatttccttggaatggactacaggcaaccaaatggcctgcttgccaaagctaaatacggggaagatattattattggtgttttagacacaggtatcacgcctgagtcaccaagcttcactgatgatggatatggtccccctccatccaaatggaaaggaatttgccaagtcggcccctcgttcgaggccaaaagttgcaaccgaaaacttatcggtgcacggtggtatatcgatgacgatactctaagcagcatgagcaagaatgaaattctatctcctagggacgtggaaggccacggcacgcacacggcctcgacagccggtggcaacatcgtccacaatgctagcattcttggtctagctactggaacagttcggggtggcgcgccccgtgcacgagtagccatgtacaagatttgttggtccggcagcggctgctccgctgccgtccagttgaaagccttggacgatgctgtctacgatggcgtcgatgtgttatcactttctcttggtagtccattggaagatctaggcaccttgcatgtcgttgccaaaggaatcccagttgtgtactctgctgggaacgatggacccattgctcagacagtggagaactcatcaccatggctgttaacggttgctgccgccaccatggatcgatccttccctgtggttatcaccttaggcgataatcataagtttgtggcacaatcctttgtcctttcacggcaaacgacaagtcagttaagtgagatacaagttttcgagggtgacgactgcaatgccgacaatatcaacagcacagtgaaggggaagacggtcttctgcttcgggacaaagctcgatccggagccagacatcaacagcatcatcaaggtgacgggtgagaaaggaggaacaggggtgatcatgccaaagtacaacaccgacacgctactgcaggacagccccctcactttgcctattccctttgtcgtagttgactacgagatcgcctacaggatataccagtactacaccaatgaaaatgatggcaccgcaaaagtgaagatatcattaacccaaacaacgattggaaaagtaactgcccctaaagtagcagctttctcatcgagggggcccagttctatatatccaggggttatcaagcctgatattgctgccgtaggtgttacgattttagcggctgcaccaaaggattttattgatttaggtatcccataccatttcgagtctggaacatcgatggcttgcccccatgtgagtggtatcgttgctgtactcaaatcactgcatcctgaatggtcacctgctgccctcaaatccgcaatcatgactacagcacttacctatgacaacaatgggatgccgataaaagctaatggaagagttgaaaagattgcggatccttttgattatggagcagggtttattaatccgaacatggcagctgatccagggctaatctacgacatctctgcatccgattatctcaagttcttcaattgcatgggaggactgggctcaggggacaactgcaccacagtaaaaggatcacttgctgacctgaacctcccgtccattgccatccccaacctcaagacattccaagtcgcgacacgcaccgtcactaacgttggccaggccaatgccgtgtacaaggcattcctccaaccccccgtcggcatcgagatggctgttgagccgccagtgttggtgttctctaaggatagaaaggtgcagagcttcaaggtgacctttaaagtgacgaggaggccaattcaaggagactataggtttggaagcttggcttggcacgatggtgtgcggcggcggcgacttccggctgcgtcggcggaaggcggcgccaaggcgggtaggagcctaggcagcgcgtcgggcggcggcgactgcagtctagtctgcagcgtgctcgtcggcggcttcggcagaggcttccggctgcggcgtgcgcggctgcgtcggcggcaggaggcgccgaggcgtgcaggcggcgcgtcgacggctgcggccgtgcggcgttggggctcggccaggcgtgcaggccgccagtccaccaggccaccacacagcgagaaatccatggcatggggaggtctcttcttgagcttcagccgtccctcacaggaccaacagaagtcatgcctttcagctgctggtggtttcaactatgatgcgcctctccatggtgcctcaagaccaaaatcagtagctaaattgactgcgggagatactgaagcaagtgacaaagcgcttgtcgagcgcggcttcttcgtgaaccgttcacgtgttctggttggctctggcactaccaccttcaaccatgccaaatccgcgcttctctcctggaagcatttggcactaggctgggcaaatgtggaacccgacacaccggtgaaggctggaacaaggttctgcatttgttacaaggagctgatcccttgggtcatgttgcccctccagattgcctatgtgaccgatggcaatggaggcaactcctcaggccatggaaaaggctgcgtttttgcttatggtagcggcactctacaaggccatctgctggcaggggaggagaggttctcggtgcagctggacgaagacgatcaggtgtggtacgaggtgatgtccttctcgaagccagcacacatcctgtccagcctctgctacccgtacgtgcagctgaggcagaagcatttcgcgcatcagtcagggcaggcactgctcaggcatgttgccagccgctccagggacacacgagtactcaatggattagcaactttttccatgtctgtcactgtcactagaagaagctttgctagtgcaagtgttcactgtcacaactttcttcgaaactcgcagccagacattgctgcaccaggggttgcgattttagctgcttcaccaaatactctagagttcaaaggtgtcccctaccattttgcttctggaacatctatggcttgcccacatatatctgggatcattgccgtgctcaagtcccttcatcctgaatggtcccctgctgccctcaaatccgcaatcatgactacagcaaatacctttgacaacaatgggatgcctatacaagctaatggaagagttccaaagattgccgatccctttgattatggagcaggctttgttaatccgatcatggcagctgatccaggcctcatctatgacatcaacccttctgattacctcaagttcttcaactgcatgggagggctaggctcacatgacaattgcacgacgataaaaggacccgtgattgacttgaacctgccatcgattgccattcccaacctcaggacatcccaaactgcagtgcgcactgtcactaacgttggtgaccagcatgatgctgtgtacaaagctttcctcgagcctcctgcaggaatcgagatggccgtcgagccaccagagctggtgttcagcaaggacaagaaggatcagagcttcaaggtgaccttcaaggcgacacggaaggtccatggggactacacatttggaagcttggcatggcatgatggaggcagccactgggttcgcatccccatcgccgttcgcaatgtgattgaagagatatattccaatatttcctaa
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Protein seq | MLLSRANHPTKLYIVYLGERRHDDADLVTASHHDMLASVLGSKEAALESIVYSYRYSFSGFAARLTKTQASIIRGLPDVVSVRENHIHQLHTSRSWDFLGMDYRQPNGLLAKAKYGEDIIIGVLDTGITPESPSFTDDGYGPPPSKWKGICQVGPSFEAKSCNRKLIGARWYIDDDTLSSMSKNEILSPRDVEGHGTHTASTAGGNIVHNASILGLATGTVRGGAPRARVAMYKICWSGSGCSAAVQLKALDDAVYDGVDVLSLSLGSPLEDLGTLHVVAKGIPVVYSAGNDGPIAQTVENSSPWLLTVAAATMDRSFPVVITLGDNHKFVAQSFVLSRQTTSQLSEIQVFEGDDCNADNINSTVKGKTVFCFGTKLDPEPDINSIIKVTGEKGGTGVIMPKYNTDTLLQDSPLTLPIPFVVVDYEIAYRIYQYYTNENDGTAKVKISLTQTTIGKVTAPKVAAFSSRGPSSIYPGVIKPDIAAVGVTILAAAPKDFIDLGIPYHFESGTSMACPHVSGIVAVLKSLHPEWSPAALKSAIMTTALTYDNNGMPIKANGRVEKIADPFDYGAGFINPNMAADPGLIYDISASDYLKFFNCMGGLGSGDNCTTVKGSLADLNLPSIAIPNLKTFQVATRTVTNVGQANAVYKAFLQPPVGIEMAVEPPVLVFSKDRKVQSFKVTFKVTRRPIQGDYRFGSLAWHDGVRRRRLPAASAEGGAKAGRSLGSASGGGDCSLVCSVLVGGFGRGFRLRRARLRRRQEAPRRAGGASTAAAVRRWGSARRAGRQSTRPPHSEKSMAWGGLFLSFSRPSQDQQKSCLSAAGGFNYDAPLHGASRPKSVAKLTAGDTEASDKALVERGFFVNRSRVLVGSGTTTFNHAKSALLSWKHLALGWANVEPDTPVKAGTRFCICYKELIPWVMLPLQIAYVTDGNGGNSSGHGKGCVFAYGSGTLQGHLLAGEERFSVQLDEDDQVWYEVMSFSKPAHILSSLCYPYVQLRQKHFAHQSGQALLRHVASRSRDTRVLNGLATFSMSVTVTRRSFASASVHCHNFLRNSQPDIAAPGVAILAASPNTLEFKGVPYHFASGTSMACPHISGIIAVLKSLHPEWSPAALKSAIMTTANTFDNNGMPIQANGRVPKIADPFDYGAGFVNPIMAADPGLIYDINPSDYLKFFNCMGGLGSHDNCTTIKGPVIDLNLPSIAIPNLRTSQTAVRTVTNVGDQHDAVYKAFLEPPAGIEMAVEPPELVFSKDKKDQSFKVTFKATRKVHGDYTFGSLAWHDGGSHWVRIPIAVRNVIEEIYSNIS
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|
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsGoSa_04g0001120 | OsGoSa_04g0001120.02 | Chr04 | 1440675 | 1441679 | + | IsoSeq | ||
CDS seq | atgttatatatgttgccactttcatatgtcgaacaattagtacttatatatgttaaagaatttggacttatgatcaattctatcaat |
|||||||
Protein seq | MLYMLPLSYVEQLVLIYVKEFGLMINSIN |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 3.698248 | 10.628968 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0121100 | RBH | 0.198895 | 0.203972 | 2.960203 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g02970 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0121200 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0001010 | RBH | 0.076834 | 0.000000 | 16.435106 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0000970 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0000970 | RBH | 0.000000 | 1.489288 | 0.000000 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0001060 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0001130 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0024700 | RBH | 4.3762215 | 0.0109265 | 0.5569105 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0001080 | RBH | 0.092469 | 0.180101 | 0.937968 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0024100 | SBH | 2.2369375 | 0.413918 | 3.1201365 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0001030 | RBH | 0.021065 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0001040 | RBH | 0.130286 | 2.141956 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0001220 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0001050 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0001230 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G001240 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0001140 | RBH | 0.0 | 0.0 | 16.939749 |