Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsGoSa_01g0019700 | OGI:01061840 | 6/16 | GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:20720117-20744039 | ||||||||
| Gene Symbol | GSL9, OsGSL9, SEM1, GSL9, OsGSL9 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Callose synthase 7 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SHJ3] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsGoSa_01g0019700 | OsGoSa_01g0019700.01 | Chr01 | 20720117 | 20744039 | - | NAM | ||
| CDS seq | atggcgacggggggaggggggttgtcggggccgcagccgtcgctgcggcggggcttgtcgagggcgttcaccatgaggccggaggggtactccgggGaggacggcggggagtacagcgaggagagcgagctggtgcctaactcgctcgcccccatcgtccccatcctccgcgccgccaacgagatcgaggaggagaaccagcgcgtcgcctacctctgtcggtttaccgcgttcgagaaggctcacaccatggatccaaactcaggtggacgaggagttcggcaattcaaaacatacctcttgcataggctggagaaggatgaacacgagacacagcgcagacttgcaggaacagatgcgaaagagattcagcggttttatgagcattattgtaaaaaaaAtcttgtggacggtcttaagacaaaaaaaccggaggagatggctagacactatcagattgcgtccgtcctatatgatgtgctaaaaaccgtgacacctgaaaaatttcacgctgagtttgatatatatgctaaagaggttgaaaaggagaaagcttccttctcacactacaacattctaccccttaatatttctggtcagcgacaaccagtaatggaaattcctgagattaaagcagcagtggaccttcttcgcaagatagacggcctcccgatgccaaggcttgatccagtttctgctgaaaaagagacagatgtacctactgtccgtgatttgtttgattggctctggctgacatttggatttcagaaaggcaatgttgagaatcagaaggagcatttgattttgctgcttgcaaatattgatatgagaaaaggggctaatgcctaccaaagtgacagacacaatcatgtgatgcatagtgatacagttagatccttgatgaggaaaatctttgaaaactacatttcttggtgccgatatttacatttggagtcaaacataaaaattccaaacgatgcctccacaCaacaacctgagattctttacatagggttgtatttgctgatctggggtgaagcttctaatagccatcagtacaagaacacaattatacccatgtgtttattcatggaacatatggcaagggatttgtatgacatcatatctgatagaagacaagattttgatccaccctttcggcgagaggggagtgatgatgcctttctacagcttgttattcaacccatctacagtgttatgaagcaggaagctgcaatgaataaacgtggtaggacaagccactcaaagtggaGaaactatgatgacctgaatgaatacttttggtcaaagagatgcttcaaacagcttaaatggccgatggattcagcagctgacttttttgcggttcctctgaaaattaaaactgaagagcatcatgatcgtgtgattaccagacggagaatacccaaaacaaattttgttgaagttcgtacatttttgcacctattcagaagttttgatcgaatgtgggctttctttatattagccttccaggcgatggtaattgttgcttggagcccttctggattaccgtctgctatttttgatcctactgttttcagaaatgttttgacaatattcataacggctgcatttctgaacttcctgcaagccacgcttgagataattcttaactggaaagcttggaggagtctggagtgctcgcagatgatacgatatatcctgaaatttgttgtagctgttgcttggttgataattcttcctacaacggtattggagcgttcaaattctcgcattattagattttttttgtggtggacacagccaaagctatatgttgcccgaggcatgtaTgaggatacatgttcacttctaaagtatacattattctggatactattgctcatatgcaagctcgccttcagtttctatgttgagcataatttaggtgttgtaattactgtatgggcaccaattgtcatgatccggacccttggaatgttaagatcacgattcgaggcaattccaatagcatttggcaaacatcttgtgcctggacatgatagtcaaccaaagagacacgagcatgaggaagacaaaattaacaagttctctgacatatggaatgcatttattcactctttgagagaagaagacttaataagcaatagagttgttgatagaatacatgataggattgaagatagcataagacgtcagtcacttagaactgatgaagacattgaaccgataaagacacaaattgccaatttgttacaagatataatggaaatcatcacacaggatattatgaagaatggacaaggtattttgaaggatgaaaacagaaacaatcaattgtttgcaaatataaatctggattcagtaaaagataaaacttggaaggagaaggcttcaactattattgacaacgaaagaatctgcaatatatgtacctacaaacttggatgctcgtcgcaggatcactttctttgcaaactcacttttcatgaaaatgccaaaggctccacagatgaatggaagaattttcttgagaggatagaatttcaaccaacggatgaagaatcactgaaaacaaagatggatgaaatccggccctgggcatcttatagggggcaaacactcaccagaactgttaaactggaacatcgtagaacagtagagtcttctcaacaggggtgggccagtttcgatatggcacgggcaattgctgatatcaaatttacctatgttgtctcttgtcaagtctatggaatgcaaaagacatccaaggatcccaaagacaaagcttgctatttaaacatccttaatctcatgtacccatcgttacgtgttgcttatattgatgaagtagaagctccagctggtaatgggacaacagagaagacttattattctgttcttgtcaaaggaggtgaaaagtatgatgaggaaatttatcgcatcaagcttcctggcaaacctacagatattggagagggaaaacctgaaaatcaaaaccatgccattgttttcaccaggggagaggcactccaggccattgatatgaatcaggataattacctcgaagaggcatttaaaatgagaaatgtgctggaggagtttgagagtgaaaagtatggaaagagaaaacccactatattaggcctccgtgagcacatttttactgggagtgtttcatcacttgcttggtttatgtccaaccaagagaccagttttgttaccattgggcaacgagtcttggctaatcctctcaaggttcggttccattatggtcatcctgatattttcgatagactcttccatattactagaggtggcataagtaaagcctcaaagactataaatctaagtaagccgtgcatctcatacatgtttacaaatccattacctagcatgcagttactgaaacgcaattttcttataggttttaattcaacaatgagagaagggaatgtcacacatcatgagtatatgcaagttggtaaggggcgtgatgTGggaatgaatcaaatttcaagctttgaagctaaggttacagtacttacagtttatgtgtttctatatgggaggttatatctagttatgagtggtctggaaaggtctattttgctggatccacgtatcgagcagaacattaagcctcttgaaaacgcactggcctcgcagtcttttttccagctaggtttgctgcttgttctccctatggtaatggaagttggcttagaaaagggattccgcacagcattaggagagtttgttatcatgcagcttcagctggcatctgtGtttttcacattccagcttggcaccaaaacgcactactacggaagaacaatactgcatggcggggctaaatacagacctacaggtcgtggatttgttgtctaccatgcaaagtttgctgacaattaccgcatgtactcccgcagccactttgttaaaggacttgaactgttgatacttctggtggtttatttagtgtatggaagttcctaccgcagctcaagcatgtacctatttgtcaccttctccatatggttcctggttgcatcttggctcttcgcaccctttatcttcaatccgtcatgcttcgaatggcagaagacagttgatgactggacagattggaggaagtggatggggaaccgtgggggtatcggcatgtctgtggatcaaagctgggaggcttggtggataagtgagcaggagcaccttaggaagactagcattcgctctctcctcttggaaatcattctttcgctccgcttcttgatctatcagtacggtattgtgtaccatctgaacatagcacgccgcAGCAAAAGCATTCTGGTATATGGATTGTCATGGCTGGTTATGCTCTCAGTCCTAGTAGTTCTAAAGATGGTTTCGATTGGGCGACAGAAGTTTGGAACAGATCTGCAGCTTATGTTCCGCATTCTCAAGGGCCTCCTGTTCCTTGGTTTTGTCTCTGTGATGGCTGTATTATTCGTCGTTTGTAACCTCACAATTTCGGATGTTTTTGCTAGTATTCTTGGGTTCATGCCTACTGGTTGGTGCATTCTTCTGattgggcaggcatgttcgccgttggtgaagaaggcaatgctgtgggattccatcatggagctcgggaggtcgtacgagaacctgatgggactcgtcctcttcctccccatcggcctcttgtcatggttccccttcgtgtccgagttccagacacgactgctcttcaaccaggccttcagccgtggcctccagatctcaaggatcctcgccgggcaaaaggacattggagaggaatga
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More
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 12.198498 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g34900 | RBH | 0.230828 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0533100 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0020210 | RBH | 0.098734 | 4.081545 | 1.152183 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0019840 | RBH | 0.000000 | 3.622456 | 0.364054 |
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| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0019550 | RBH | 0.0 | 0.130892 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0019450 | RBH | 0.314304 | 7.345913 | 7.205016 |
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| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
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