Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsCMeo_06g0018460 | OGI:06056220 | 4/16 | CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr06:19874393-19890085 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK206, OsRLCK206 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MPIWSSVDPVATVAQIAGVDAYGLISMVTERAEKVRRNKYECRQLAEHVETVGGLLHHVERDDPRIAAPLEKLEGTLREAVVLVSSCEASSYFRRFFRGAKIAEQFQRIKEKIDFYLQLFPVITCIYTTSVFSRRLDSAPHTQASSSNDDIGHLLTPAHQAAGFSLFDLFRIVDATDNFSLENKIGEGGFGRVYKGQLNGLPVAVKRCFVESSPERLSDFENEIKFIPRLQHRNIVTLKGYCIEGKERILVYEYMQNKSLDKFIFGPRTDWSLYWDRLFAIIEGIAQGIVYLHSHSGLKIIHRDLKLSNILLDSEMNPKISDFGTARSGFPNKGLRTDTVSGTYGYMAPEYSTRGIFSGKSDVFSFGSLLLEIVSGKRNGTWYSFRERKSISLHEYAWRLVFEEKNPERLIRSSLRISVGGDAPHLMGQIVGCAHIALLCVQEDPEDRPSMWDVVLMLHGGVAALSALPTPKQPARRYGGGREQRPKFREELGSATGLVLKSMSIMAISWHVARTTASSFLMHRTMEKIDTTTTMRRCLLLSHAPLPYAVVCHLQQVNVGARMGEDQRRKKRPKGGRDGKGEQTGREPVRHRH |
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| Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g67520 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64793] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsCMeo_06g0018460 | OsCMeo_06g0018460.01 | Chr06 | 19874393 | 19890085 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgccgatatggagcagtgtggacccggtggcgactgtggcccagatcgccggcgtggacgcctacggtctgatcagcatggtgacggagcgggcggagaaggtgcggcgcaacaagtacgagtgccggcagctggcggagcacgtggaaacggtcggggggctcctgcatcacgtggagagggacgacccgcggatcgccgccccgctggagaagctggaggggacgctccgggaggccgtcgtgctcgtctcctcctgcgaggccagcagctacttccgccgcttcttccgcggcgccaagatcgccgagcagttccagcgcatcaaggagaagatcgacttctacctccagctcttccccgtcatcacctgcatctacaccaccagcgtcttctccaggcgtcttgactcagcacctcacacgcaggcatcttcaagcaatgatgatattggacacctattgacaccagcccaccaagccgcagggttttcattgttcgacttatttcggatagtggatgctacagataacttctcgctggaaaacaagatcggcgagggtgggtttggtcgtgtttacaagggacaactgaatggacttccagttgctgtcaagagatgcttcgtggaatcgagcccagagcgtctgtctgactttgaaaacgagattaaattcattcctaggctccaacatagaaacatcgtgacgctcaagggatactgcatcgaaggaaaagaaaggatcttggtttacgagtatatgcaaaacaaaagcctcgataaattcatatttggcccaagaaccgattggtctctctactgggataggttgtttgcgataattgaaggtatagctcaagggattgtgtaccttcactcgcactcggggctaaagattatccacagggaccttaagctcagcaatattctattggattctgaaatgaatcctaagatttctgattttggtacggcaagatccggttttccgaacaagggtctcaggacagacactgtttcaggaacatacggttacatggctccggaatattcaaccagaggaatattttcgggtaaatcggatgtgttcagctttggcagcctgcttcttgagatcgtaagtggaaagcggaacggaacttggtactcgtttagagaaaggaagtccataagtcttcacgaatatgcatggaggctggtgttcgaggagaagaacccggagaggctgatccggtcgtccctgcgcatcagcgtgggcggcgacgcgccacacctgatgggccagattgtgggctgcgcgcacatcgcgctgctgtgcgtccaggaggacccagaggaccgcccgtccatgtgggacgtcgtgctgatgctccacggtggcgtggcagcgctctcggcgctgccgacgccgaagcagccggcgcgccgctacggcggcggcagggagcagcgccccaagttccgggaggagcttgggtcagcgacgggcctggttcttaaatcgatgtccatcatggcaatttcttggcatgttgcacggaccactgcctcctccttcctcatgcatcgcacaatggagaagatcgacacaaccaccaccatgcgtcgctgcctcctcctttctcatgcgccgctgccctatgccgtcgtgtgccaccttcagcaagtgaacgtcggtgccaggatgggagaggatcagaggagaaagaagagaccgaaggggggaagagatgggaagggggaacaaacagggagggaacctgttcgccatcgccattga
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| Protein seq | MPIWSSVDPVATVAQIAGVDAYGLISMVTERAEKVRRNKYECRQLAEHVETVGGLLHHVERDDPRIAAPLEKLEGTLREAVVLVSSCEASSYFRRFFRGAKIAEQFQRIKEKIDFYLQLFPVITCIYTTSVFSRRLDSAPHTQASSSNDDIGHLLTPAHQAAGFSLFDLFRIVDATDNFSLENKIGEGGFGRVYKGQLNGLPVAVKRCFVESSPERLSDFENEIKFIPRLQHRNIVTLKGYCIEGKERILVYEYMQNKSLDKFIFGPRTDWSLYWDRLFAIIEGIAQGIVYLHSHSGLKIIHRDLKLSNILLDSEMNPKISDFGTARSGFPNKGLRTDTVSGTYGYMAPEYSTRGIFSGKSDVFSFGSLLLEIVSGKRNGTWYSFRERKSISLHEYAWRLVFEEKNPERLIRSSLRISVGGDAPHLMGQIVGCAHIALLCVQEDPEDRPSMWDVVLMLHGGVAALSALPTPKQPARRYGGGREQRPKFREELGSATGLVLKSMSIMAISWHVARTTASSFLMHRTMEKIDTTTTMRRCLLLSHAPLPYAVVCHLQQVNVGARMGEDQRRKKRPKGGRDGKGEQTGREPVRHRH
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 3.862845 | 0.371549 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_06g0541600 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.558725 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os06g34970 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.368361 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os06g0541600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_06g0018710 | RBH | 0.0 | 1.296504 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_06g0018540 | RBH | 0.0 | 2.062967 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0010070 | RBH | 2.651315 | 7.964316 | 9.238035 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_06g0026850 | SBH | 0.115142 | 0.000000 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_06g0027350 | SBH | 1.816901 | 6.939420 | 6.334772 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_06G0323000 | SBH | 1.232202 | 1.879501 | 1.2376425 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_06g0026750 | SBH | 0.216433 | 0.169879 | 0.000000 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_06G0298200 | SBH | 1.879062 | 2.5793595 | 5.5449775 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_06g0027250 | SBH | 0.0 | 0.061900 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_06g0027330 | SBH | 0.112782 | 0.000000 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_06g0026910 | SBH | 0.000000 | 13.318043 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_06g0027540 | SBH | 0.476786 | 0.370502 | 0.119095 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_06g0027160 | SBH | 0.000000 | 4.111788 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_06G027090 | SBH | 0.154315 | 0.871074 | 0.722812 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_06g0027160 | SBH | 0.493683 | 11.884049 | 0.000000 |
