Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_05g0024100 OGI:05070420 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr05:26644655-26678900
Gene Symbol RLCK190, OsRLCK190
DNA seq

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Function Putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g19210 [UniProtKB/Swiss-Prot:O65924]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_05g0024100 OsCMeo_05g0024100.02 Chr05 26644655 26658590 + NAM
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OsCMeo_05g0024100 OsCMeo_05g0024100.03 Chr05 26658353 26678900 + NAM
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atggagcaaaattttggaaggataccatcaatcactggcgtttggaactcagaatcaatgaacttcattcataattgcctcgccctcgccgccaccgccggcatactccaagctcgtgcccagcttgacagcaaagctacaactaatgtgtgtcgctgtcgccgactcgccgtaggtttcatcagcgtagactgtggcctcccggggaagacgagctacgtggacgacaagaccaagatttcctacgcggcggacgacggcttcaccgacggcggctcgttccacaacatctcggcggagtacttcgcaccggcgctctcggcgcgctactacaacgtgcgcagcttccccgacggcgcgcgcaactgctacacgctccggtcgctcgtggccgggcacaagtacctcatccgcgccaccttcatgtacggcaactacgacggcctcagcaagctgccaatcttcgacgtctacatcggcgtcaacttctggatgatggtcaacatcacggaccccgccggctcgacgctcctggaggccatcgtcgtcgtgccggacgacttcgtgcaggtttgcctcgtgaacaccggcaccgggacaccgttcatctccgggttggacctcaggcctctcaagaagaagctctacccgcaggcaaccgagacgcaaggcctgtccttgttcggtagatggaaattcgggccgaccagtaataccgaaatcatcaggtaccccgacgatccacgcgacagagtatggacaccttgggactcgccatcaaattggaccgagatatcaacgacgaggccggtgcagcagacatacgacgacctgttcgaggtgccaacggcggtgatgcagacggctattgtcccaatgtttgccacagacaacatcgagctcgcatgggtagcctacacacagcccaaggacccgtcgccggggtacatcgccatcatgcacttctccgagctggagctcagcccccccagccgtgatgtgcgagaattctacatcaacctcaacggcaacatgatgtacagcaagggctacaagccagtgtatctctacgcccacgccatctacaacaccaaccccttcctacgatacccgcagtacaatatctccatcaacgccacctataactcgacgatgcgaccgttcatcaacgccatggaggtgtactccgttttctccaccaccaccattggcacatatggtcaggacgcttctgccatgatggtgatcaaggaaaagtatcaggtgaagaagaattggatgggtgatccgtgcattccgacagaatttacatgggaaagtttgacatgcagctatgaaaactccaaacacgtaataaaaataaacctgtcctccagtggtttgagtggtgagatatcatcttcttttggggatctcaaggctcttcaatacttggatttgtcaaacaacaatttgacaggttcgattccggatgcactttcacagttaccttcattgacagtattatatggaaataatccaaacctctgcaccaacgacaattcatgtcaggcagcaaaacacaagagcaagcttgccatctacatagtcgctcctgtagttctggttctggtgatagtatcagtcacaatactactcttttgccttctaggacaaaaaaagaagcaaggatcaatgaacacttctataaagccgcaaaatgaggcgaactatgtgccgacaaatgacagcgatgggcatggttcatcaatgcagcttgagaaccgacgatttacatataaagatctggaaaagataacgaacaactttcaacgagtgctcggccgaggagggtttgggaaggtctacgatggcttcttggaagaaggtactcaagtggcagtcaaattgaggtctgaatcttccaatcaaggtgataaggaatttctcgtagaggctcaaattttaactcggattcaccataagaaccttgtctccatgatcggttattgcaagaatgggaaatacatggcacttgtctatgagtatataaacaacgggagacatttaacctggagggagaggcttcgaatagcgttagaatccgctcaagggctagagtacctacacaagtggtgcaatccgcctcttattcatagagatgtgaaggctaccaacattctattgaatgcgaggctagaggctaagattgctgattttggcttgtccaagtcattcaatcttgagaatggcacccatgtatctacgaacacgcttgttggtactcccggatacgtggatccagagtaccaagcaacaatgcaaccatcgaccaagagtgatgtctatagctttggtgtcgtcctgctagaactggtaacaggaaagtcggctgtcctacgtgatccagagcccataagcattatccattgggcgcaacaacgcctagaacagggtaatatcgaagaagtggtggatgcatgtatgtgtggcgaccatgatgtaattggtgtatggaaggttgcggacatcgcattcaagtgtaccgcgcaggtatcagcgcgacggcccactatgactgacgtggttgcgcagttacaagagtgccttgagcttgaggaggagcattgtgccgtcaatgatgcaaacaacaacttctacaccagcaataacagcaaacctaactcaagttatgacacatacgccgctgaccactctatcgatgtgagtcagaacagtgttgcatttgagatggagaaaaattttggaaggatgccatcaacagcccccggtttcattagcgtagactgcggcctcccggggaagacgagctacgtggacgacaagaccaagatatcctacgcggcggacgacggcttcaccgacggcggctcgttccacaacatctcggcggagtacatcacgccggcgctctcggcgcgctaccacaacgtgcgcagcttccccgacggcgcgcgcaactgctacacgctccggtcgctcgtggccggcctcaagtacctcatccgcgccaccttcatgtacggcaactacgacggcctcagcaagctgccaatcttcgacgtctacatcggcgtcaacttctggatgatggtcaacatctcggacccctccggcgcgacgctcctggaggccatcgtcgtcgtgccggacgacttcgtgcaggtttgcctcgtgaacaccggcaccgggacaccgttcatctccgggctggacctcaggcctctcgagaagaagctctacccgcaggcgaacgacaagcggggcctgtccttgttcggcagatggaactttggcccaattagtactaccgagttcatcaggtaccccgacgatccacacgacagaatatggatgccttgggtctcgccatcatattgggtcgaggtatcgacgacgaggccggtgcagcacacggacgaggacgtattcgacgcgccgacgaaggtgatgcagacggcgattgcgccgctcaacgcctcgagcaacatcgagttcgcctgggtaccctacacgcagcccaaggacccggcgccggggtacatcaccgtcatgcacttctccgagctgcagctccgctccagcaacgccacgcgccagttctacatcaacctcaacggcaacatggtgtttagccagggctacacgccggcgtacctctacgccgacgccatcttcaacagcaacccgttcctacgatacccgcagtacaacatctccatcaacgccaccgccaactcgacgctgccaccgatcatcaacgccatcgaggtgttctccgtcttctccaccgccaccgttggcacagatggtcaggatgcttccgccatgatggtgatcaaggaaaagtatcaggtgaagaagaactggatgggtgatccgtgcgttccaaagacgcttgcggatctgtcaaacaacaatttgacaggttcgattccagatgcactttcacagttgccttcgttggcagtattagatttgacaggaaatcaactcaatggttcaattccatctggacttctcaaaagaattcaagatggtaccctaaatataaaatacggaaataacccaaacctctgcaccaacgacaattcatgtcagccagcaaaacacaagagcaagcttgccatctatgtagctgttcctgtagttctggttttggtgatagtatcagtcacaatactgctcttttgccttctgggacgaaaaaagaagcaaggatcaatgaacacttccgtaaagccgcagaatgagacagcgagctatgtgccgacaaatggcagccatgggcatggctcatcaatgcagcttgagaaccgacggtttacttacaatgatttagagaagataacaaacaactttcagcgagtgctcggcgaaggagggtttgggaaggtctacgatggcttcttggaagatggcactcaagtggcagtcaaattaaggtctgaatcttccaaccaaggggataaggaatttctcgcagaggctcagattttaactcggattcaccacaagagccttgtatctatgatcggttattgcaaggatgggaaatacatggcacttgtctatgagtacatgtcagaaggaacccttcgagaacatatttcaggtaaaagaaacaacgggagatacttaacctggagagagaggcttcgaatcgcgctggaatccgctcaagggctagagtacctacacaagtggtgcaatccgcctcttattcacagagatgtgaaggctaccaacattctattgaatgcgaagctagaggctaagattgctgattttggcttatccaagacgttcaatcttgagaatggcacacatgtatctacgaacacgcttgttggcacacctggatacgtggatccagagtaccaggcaacaatgcaaccaacgaccaagagtgacgtctatagctttggtgttgtcctattggagctggtcacagggaagccggctgtcctacgtgatccagagcccataagtatcattca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Protein seq

MEQNFGRIPSITGVWNSESMNFIHNCLALAATAGILQARAQLDSKATTNVCRCRRLAVGFISVDCGLPGKTSYVDDKTKISYAADDGFTDGGSFHNISAEYFAPALSARYYNVRSFPDGARNCYTLRSLVAGHKYLIRATFMYGNYDGLSKLPIFDVYIGVNFWMMVNITDPAGSTLLEAIVVVPDDFVQVCLVNTGTGTPFISGLDLRPLKKKLYPQATETQGLSLFGRWKFGPTSNTEIIRYPDDPRDRVWTPWDSPSNWTEISTTRPVQQTYDDLFEVPTAVMQTAIVPMFATDNIELAWVAYTQPKDPSPGYIAIMHFSELELSPPSRDVREFYINLNGNMMYSKGYKPVYLYAHAIYNTNPFLRYPQYNISINATYNSTMRPFINAMEVYSVFSTTTIGTYGQDASAMMVIKEKYQVKKNWMGDPCIPTEFTWESLTCSYENSKHVIKINLSSSGLSGEISSSFGDLKALQYLDLSNNNLTGSIPDALSQLPSLTVLYGNNPNLCTNDNSCQAAKHKSKLAIYIVAPVVLVLVIVSVTILLFCLLGQKKKQGSMNTSIKPQNEANYVPTNDSDGHGSSMQLENRRFTYKDLEKITNNFQRVLGRGGFGKVYDGFLEEGTQVAVKLRSESSNQGDKEFLVEAQILTRIHHKNLVSMIGYCKNGKYMALVYEYINNGRHLTWRERLRIALESAQGLEYLHKWCNPPLIHRDVKATNILLNARLEAKIADFGLSKSFNLENGTHVSTNTLVGTPGYVDPEYQATMQPSTKSDVYSFGVVLLELVTGKSAVLRDPEPISIIHWAQQRLEQGNIEEVVDACMCGDHDVIGVWKVADIAFKCTAQVSARRPTMTDVVAQLQECLELEEEHCAVNDANNNFYTSNNSKPNSSYDTYAADHSIDVSQNSVAFEMEKNFGRMPSTAPGFISVDCGLPGKTSYVDDKTKISYAADDGFTDGGSFHNISAEYITPALSARYHNVRSFPDGARNCYTLRSLVAGLKYLIRATFMYGNYDGLSKLPIFDVYIGVNFWMMVNISDPSGATLLEAIVVVPDDFVQVCLVNTGTGTPFISGLDLRPLEKKLYPQANDKRGLSLFGRWNFGPISTTEFIRYPDDPHDRIWMPWVSPSYWVEVSTTRPVQHTDEDVFDAPTKVMQTAIAPLNASSNIEFAWVPYTQPKDPAPGYITVMHFSELQLRSSNATRQFYINLNGNMVFSQGYTPAYLYADAIFNSNPFLRYPQYNISINATANSTLPPIINAIEVFSVFSTATVGTDGQDASAMMVIKEKYQVKKNWMGDPCVPKTLADLSNNNLTGSIPDALSQLPSLAVLDLTGNQLNGSIPSGLLKRIQDGTLNIKYGNNPNLCTNDNSCQPAKHKSKLAIYVAVPVVLVLVIVSVTILLFCLLGRKKKQGSMNTSVKPQNETASYVPTNGSHGHGSSMQLENRRFTYNDLEKITNNFQRVLGEGGFGKVYDGFLEDGTQVAVKLRSESSNQGDKEFLAEAQILTRIHHKSLVSMIGYCKDGKYMALVYEYMSEGTLREHISGKRNNGRYLTWRERLRIALESAQGLEYLHKWCNPPLIHRDVKATNILLNAKLEAKIADFGLSKTFNLENGTHVSTNTLVGTPGYVDPEYQATMQPTTKSDVYSFGVVLLELVTGKPAVLRDPEPISIIHWAQQRLAQGNIEGVVDARMHGDHDVNGVWKATDIALKCTTQVSAQRPTMTDVVAQLQECLELEEGRCAISNANNNFYTDNNSNSNSSYDMYATDHSIDVSQNSAAFETERNFGRMPSTATGPAAR

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 5.074499 0.000000

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_05g0524732 RBH 0.0 0.000000 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os05g44960 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os05g0524732 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_05g0024230 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_05g0024120 RBH 0.0 3.785832 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0032880 SBH 0.0 8.153732 2.855016
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_05g0024060 RBH 0.0 1.170324 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_05g0024150 RBH 0.0 17.616816 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_05G0404100 SBH 0.0051835 0.301636 0.0027315
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_05g0023740 RBH 0.0 0.786827 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_05G0416300 RBH 0.001579 0.095063 0.006649
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_05g0023920 RBH 0.0 0.105892 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_05g0023820 RBH 0.0 12.158918 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_05g0024010 RBH 0.0 3.961019 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_05g0024010 RBH 0.000000 0.495400 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_05g0024050 RBH 0.0 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_05G023440 RBH 0.0 1.724771 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_05g0023840 RBH 0.0 3.436628 0.0
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