Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_05g0024060 OGI:05070420 | 16/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr05:26738389-26772079
Gene Symbol RLCK190, OsRLCK190
DNA seq

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Transcripts

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OsARC_05g0024060 OsARC_05g0024060.03 Chr05 26738389 26742820 + IsoSeq
CDS seq

ATGGTTCCCGTGGGTGGACTCGACCAAATGGAGCCAGATATCATCGACGAAGAAAGTGCAGGATCTAGACAACGACATGTACGAGACGCCGACGGCGGTGATGCAGACGGCGATCACGCCGCGGAACGCCTCCAGGAACATCGAGTTCTCCTGGGACCCCGTGCCGCTGCCCAACGACCCGACGCCCGGGTACATCGCCATCTTCCACTTCTCCGAGCTGCAGCTCCTCCCCGGCAACGCCGTGCGCGAGTTCTACATCAACCTCAACGGCAAGCCGTGGTCCCTGACCGCCTTCAAGCCGGAGTACCTCTACAACGACGCCACCTTCAACCGGAACCCATTCCTACGGTACCCGCAGTACAACATCTCCATCAACGCCACCGCCAACTCGACGCTGCCGCCGCTCATCAACGCCGTCGAGGTGTTCTCCGTCATCCCCACTGCCACCATTGG

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Protein seq

MVPVGGLDQMEPDIIDEESAGSRQRHVRDADGGDADGDHAAERLQEHRVLLGPRAAAQRPDARVHRHLPLLRAAAPPRQRRARVLHQPQRQAVVPDRLQAGVPLQRRHLQPEPIPTVPAVQHLHQRHRQLDAAAAHQRRRGVLRHPHCHHW

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr05 26741822 26741936 + OsARC_05g0024060.03 OsARC_05g0024060.01,OsARC_05g0024060.03 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 1.170324 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_05g0525000 RBH 0.0 0.000000 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os05g44970 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os05g0524800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_05g0024230 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_05g0024120 RBH 0.0 3.785832 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_05g0024100 RBH 0.0 5.074499 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0032170 SBH 0.0 0.366733 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_05g0024150 RBH 0.0 17.616816 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_05G0404100 RBH 0.0051835 0.301636 0.0027315
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_05g0023730 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_05G0416300 RBH 0.001579 0.095063 0.006649
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_05g0023920 RBH 0.0 0.105892 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_05g0023810 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_05g0024000 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_05g0024010 RBH 0.000000 0.495400 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_05g0024060 RBH 0.0 5.186676 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_05G023440 RBH 0.0 1.724771 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_05g0023840 RBH 0.0 3.436628 0.0
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