Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_03g0020020 OGI:03041610 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr03:15788914-15798370
Gene Symbol -
DNA seq

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Protein seq

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Function RNA helicase aquarius [UniProtKB/Swiss-Prot:O60306]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_03g0020020 OsCMeo_03g0020020.01 Chr03 15788914 15798370 + NAM
CDS seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
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Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 3.074273 12.005527 17.648594

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os03g26960 RBH 3.303776 3.405191 2.446411
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os03g0387000 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_03g0020120 RBH 1.276149 13.927252 11.980931
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_03g0019980 RBH 0.580584 5.554024 5.755743
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_03g0020010 RBH 0.425052 0.581842 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_03g0019800 RBH 12.124653 26.833803 27.241135
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IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_03g0019580 RBH 1.009884 1.019200 2.431405
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_03G0257700 RBH 13.671044 22.8194065 35.8946475
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KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_03g0019830 RBH 1.614252 36.559086 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_03g0019930 RBH 7.552660 21.043715 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_03g0019770 RBH 1.648539 1.721704 2.130313
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_03g0019670 RBH 0.694218 12.113066 None
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NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_03g0019560 RBH 4.545279 33.741150 12.746469
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