Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_02g0017700 OGI:02050150 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:17428839-17449869
Gene Symbol ANK1, OsANK1, TPR42, OsTPR042, TPR042, OsTPR42, TPR43, OsTPR043, TPR043, OsTPR43
DNA seq

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Function Ankyrin-1 [UniProtKB/Swiss-Prot:P16157]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
SE Chr02 17434386 17436260 - OsCMeo_02g0017700.02 OsCMeo_02g0017700.02,OsCMeo_02g0017700.01 All
SE Chr02 17436399 17438128 - OsCMeo_02g0017700.01 OsCMeo_02g0017700.02,OsCMeo_02g0017700.01 All
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Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 1.130409

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0493050 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g29130 RBH 0.0 0.0 0.227543
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0493050 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0017660 RBH 0.0 0.0 0.803980
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0017790 RBH 0.0 0.0 0.485911
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0017720 RBH 0.0 0.0 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0017610 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0017530 RBH 0.0 0.000000 5.401129
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0286500 RBH 0 0 2.3462615
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0017310 RBH 0.0 0.0 0.401503
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0307900 RBH 0 0.0047485 12.2169555
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0017810 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0017410 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0017950 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0017730 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0017440 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G017890 RBH 0.0 0.0 1.309286
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0017620 RBH 0.0 0.0 1.881160
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