Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsAzu_10g0012260 | OGI:10050670 | 16/16 | Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr10:17169078-17190628 | ||||||||
Gene Symbol | CYP71Z3, Oscyp71Z3, CYP71Z4, Oscyp71Z4, CYP71Z8, Oscyp71Z8 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Ent-cassadiene hydroxylase [UniProtKB/Swiss-Prot:Q6YV88] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsAzu_10g0012260 | OsAzu_10g0012260.01 | Chr10 | 17169386 | 17190628 | - | NAM | ||
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsAzu_10g0012260 | OsAzu_10g0012260.02 | Chr10 | 17169078 | 17172170 | - | IsoSeq | ||
CDS seq | GTACTCTGTAAGGTAGCCAGCTGCTCGATTTCGCACGTACTGTGTCATGGACGACAAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGCTGGCTCTGGCCGTGTCCGTCGTCTCCATCGTGACCATCTCCAAGCTGGTATATCGTGCAACCAACAAGCCGAGGCTGAACCTGCCGCCGGGGCCATGGACGCTGCCGGTGATCGGCAGCCTCCACCACCTCGTGATGAGGAGCCCCAGCATCCACCGCTCGATGCGGGCGCTCGCCGAGAAGCACGGCCCGCTCATGCAGGTGTGGCTCGGCGAGGTGCCCGCGGTGGTCGTGTCGTCGACGGAGGCGGCGGAGGAGGTCCTCAAGAACCAGGACGCCAGGTTCGCCGACCGGTTCATCACCACCACGCTCGGGGCCATCACCTTCGGCGGCGGCGACCTCGCCTTCGCCCCCTACGGCGAGCGGTGGCGCCACCTCAAGATGCTCTGCACGCAGCAGCTGCTGACCGCCGCGCGGGTGAGGTCATTCCGGCGGATCCGCGAGGAGGAGGTGGCGCGCCTGGTCCGGGACCTCGCCGCGTCCGCCGCCGGCGGCGGCGAGGTCGCCGTGAACCTCAGCGAGAGGGTCGCCAGGCTCGTCAACGACATCATGGTGAGGTGCTGCGTCGGCGGCCGGAGCAAGCACCGCGACGAGTTCCTCGGCGCGCTCTGCACCGCCCTGAGCCAGACGTCGTGGCTCACCGTCGCCGACCTCTTCCCGTCGAGCAGGCTCGCGCGGATGCTCGGCACGGCGCCGCGCAGGGCGCTCGCCAGCCGGAAGAAGATGGAGCTTATCTTGGAGCAGATCATACAAGAACGAGAGGAGATGACGACGGACAGGAGCGGCGATGGCGAGGCGGGGCCCACAAACGAGTGCTTCCTCGACGTCCTGCTCAGGCTTCAGAAGGAGGGGGACACACCAATCCCAATTACCATGGAACTCATCGTCATGCTTTT
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
A5 | Chr10 | 17170024 | 17171209 | - | OsAzu_10g0012260.02 | OsAzu_10g0012260.02,OsAzu_10g0012260.01 | All |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.339838 | 0.565423 | 0.741895 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_10g0439924 | RBH | 2.050892 | 3.986394 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os10g30380 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.146851 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os10g0439700 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0007480 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_10g0012470 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.058350 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_10g0012170 | RBH | 2.684195 | 8.254560 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_10g0012440 | RBH | 0.362286 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_10g0012190 | RBH | 2.274435 | 0.000000 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_10G0263400 | RBH | 0.6215445 | 0.992475 | 1.5297265 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_10g0012220 | RBH | 0.105513 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_10G0283600 | RBH | 1.227944 | 0.8644665 | 4.178055 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_10g0011960 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_10g0011920 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_10g0012350 | RBH | 1.926715 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_10g0011930 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_10g0012440 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_10G012300 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_10g0012250 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |