Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsAzu_04g0009870 | OGI:04046380 | 16/16 | Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:16217410-16223155 | ||||||||
| Gene Symbol | WAK38, OsWAK38, WAK41, OsWAK41 | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | Wall-associated receptor kinase 5 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMN7] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsAzu_04g0009870 | OsAzu_04g0009870.01 | Chr04 | 16217410 | 16223155 | - | NAM | ||
| CDS seq | ATGATCCACTCACTACACGCCGCGAATTCCCTGCACCTGTTGCTAATTGTCTTCCTGCTGGCGACGACGCTACTGACATCGGCGAAGGATTTGGCTGTGCCAAGACGACATGGCATGGTTGTTCCATCAACGGCCACCCTGGCCGGTTGCCAGAATTCATGTGGCAATGTGACCTTCGTATATCCCTTCGGCATCGGCTCCGGCTGCTTCAGAAGTCCCGACTTCGAGCTCACCTGCGACTCCACCACACGCCCTCCGAAACTCCTCTTCCGCGATGGTATCACCCAAATTACTGACAGTATTAACATCGTTTCAACAGAGGTTTTGGGCCCTGATGACGGTGTTAGCATTCGTTTTTCCGATACCATCTCCATGAGAAATGCGTCCGTTGTCAGCTGGTCGTTAACTCCAAAATTGTTTGAAGATACTCTTGATGCTTCTTACCTGTCGCTGGCGGGACTACGTTTCTCCGGCTGTGACTTCGATGTTTATTGGTTAAATCCTCCATCAAACAACAAAGCAACTCCCAACTGCACAGCAACCTGTCCTAAAGGAGAAAGCACGGGTATGGTGTCTCATACACAGGATTGCAACGGCACTGGATGTTGCACTATCGACTTTGGTGCCGAGATAATTGTTTATTCATCATCTACTATCGAATTTAAATTCGTCCGCCGAGCAGAAACCAATCTGCACCATAACCGAAACTTGTCATGGGGTACGATCTATATCACTGATACTTATATAAGCCATACTACCAGTTGGAGCATCGTTGATCAACCAGACTGCGTAAGTGCCCGTAAAAACAAGACGAGCTATGCTTGTGTTAGCAACAAGAGCATTTGCAGGAACGCATCAGTCTTCGAGCAACATGGCTACAACTGCATGTGCCGTAATGGCTACATAGGAAATCCTTATATTCTGGATGGCTGTTCACTGGATAGTGGGTATAACCCATTACAACGGAAAATGAATTGTATCCGCCAGTGCGGGAATATCAGCGTTCCATTCCCATTTGGCTTGGAAGAAGATATTAATGAGTGCCTTCAACCAAATATCTGCCCCGAGATGTGCAATAATACTGTTGGAAAGTACACATGTGTTTCATGCCCTCGTAAGACAGAGTATGATCCAGTAGGAAGACGATGCTTACCGAAACGCCATAATCTTCTCTTAGGTATTGTGATTGGTTTGAGCGTTGGCTTCGGAATCCTACTTGTCTGCTTAAGTGGGGTTTTCCTTATTCGTCGATGGAGAAATGGCATCCAAAAACAACTAAGAAAGAAATACTTTCAGAAAAACAAAGGGCTTCTTCTAGAACAACTAATATGTTCAAATGAGAAACCAAGTGAGAATAAAATTTTCTCTTTGGAAGAGCTTCAGAAGGCAACAAACAACTTTGATCCTGCACGTATTCTAGGAAGTGGAGGACATGGTATTGTCTACAAAGGCATCCTATCTGACCAACGAGTTGTTGCTATCAAAAAACCAATAGTTATTAAGGAGGGAGAAATTAATCAATTTATCAACGAGGTTGCAGTTCTCTCTCAAATAAATCATCGAAATATCGTAAAACTACATGGATGTTGTTTGGAAACGGAAGTTCCATTATTGGTATATGATTTTATCCCCAATGGCTCACTTTTTAGCATTATTCATGCTAATCCAAGTAAAGAGGAATATTTGTCATGGGGTGATTGCTTAAGAATTGCTACCGAAGCTGCAGGTGCTCTCTATTACCTCCATTCCGCAGCATCAATGTCAGTTTTCCATCGTGATGTGAAATCCTCCAATATACTATTGGACGGGAAGTATACTGCTAAAGTTTCCGATTTTGGAGCTTCAAGATTGATTCCTATTGATCAAAGCCATGTTATTACAAATATACAAGGTACATTTGGATACTTAGATCCAGAATACTATCATACTGGACAACTAAATGAGAAAAGCGATGTTTATAGTTTTGGAGTTGTTCTAGTAGAGCTGCTTCTTAGAAAAGAGCCTATCTTTACAGATGAGTCTGGTTTGAACAAAAACTTATCAAACTACTTTCTTTGGGAGATAAAAGCCAGGCCTATTAGAGAGATAGTCGCCTCTCAAGTTCTTCAGGAAGCAACTGAGGATGAGATTAACACCATTGCCTCTCTTGCTAAGGAGTGCTTAAGGCTTCGAGGTGATGAAAGGCCAACTATGAAGGAAGTGGAAATGGCATTGCATTTTTTGCATAGTAAAATCAATGTTGTTGAGCAAAGTAATAATGAAAGTCATCCACTTCAACAACTTACAAGGCCACCACATCACAAAGCTATGACAATTGATACAGGCAACAAAGCTATTTTAGAATCTTCAAGTTGCTGCAACTTGGAGGGAGAGTTTATGTCATCTGCTAGTATACCACGGTGA
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| Protein seq | MIHSLHAANSLHLLLIVFLLATTLLTSAKDLAVPRRHGMVVPSTATLAGCQNSCGNVTFVYPFGIGSGCFRSPDFELTCDSTTRPPKLLFRDGITQITDSINIVSTEVLGPDDGVSIRFSDTISMRNASVVSWSLTPKLFEDTLDASYLSLAGLRFSGCDFDVYWLNPPSNNKATPNCTATCPKGESTGMVSHTQDCNGTGCCTIDFGAEIIVYSSSTIEFKFVRRAETNLHHNRNLSWGTIYITDTYISHTTSWSIVDQPDCVSARKNKTSYACVSNKSICRNASVFEQHGYNCMCRNGYIGNPYILDGCSLDSGYNPLQRKMNCIRQCGNISVPFPFGLEEDINECLQPNICPEMCNNTVGKYTCVSCPRKTEYDPVGRRCLPKRHNLLLGIVIGLSVGFGILLVCLSGVFLIRRWRNGIQKQLRKKYFQKNKGLLLEQLICSNEKPSENKIFSLEELQKATNNFDPARILGSGGHGIVYKGILSDQRVVAIKKPIVIKEGEINQFINEVAVLSQINHRNIVKLHGCCLETEVPLLVYDFIPNGSLFSIIHANPSKEEYLSWGDCLRIATEAAGALYYLHSAASMSVFHRDVKSSNILLDGKYTAKVSDFGASRLIPIDQSHVITNIQGTFGYLDPEYYHTGQLNEKSDVYSFGVVLVELLLRKEPIFTDESGLNKNLSNYFLWEIKARPIREIVASQVLQEATEDEINTIASLAKECLRLRGDERPTMKEVEMALHFLHSKINVVEQSNNESHPLQQLTRPPHHKAMTIDTGNKAILESSSCCNLEGEFMSSASIPR
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0367201 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g29880 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0367201 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0010640 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0007800 | SBH | 0.435917 | 2.075533 | 3.899006 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0007550 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0010270 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0295300 | RBH | 0.0188215 | 0.172501 | 0.0460255 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0010070 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0279400 | RBH | 0.1624525 | 1.2799765 | 0.0684115 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0010090 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0010260 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0010310 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0010800 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0010190 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G009340 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0009390 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
