Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsAzu_02g0010660 OGI:02013220 | 16/16 Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:8509538-8526300
Gene Symbol -
DNA seq

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Function RING-H2 finger protein ATL32 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8W571]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsAzu_02g0010660 OsAzu_02g0010660.01 Chr02 8509538 8526300 - NAM
CDS seq

ATGAGCGGTGTCGCGGCGGCCCGGCGCTCGGCGGCGAGGGTGGGCGGTGGCAGCGGCGGGGGAGATGATGATTACGAGTGCCGGGCGTGCTACGGGGTCTCCGTGGCGTGCGTGTCGCTGCTCCTGTTCTGCGTGCTCGCGGCGTCGGTCAGCGTCACCAAGGCCTGCGCCGTGGCGGGGCTCGCCGTGCTGCTGTTCGGCGTGATCGGGTGGTTCGTGCCGCTGTGCGGCGCGGGGGGCCCGCCCGCGCGCGCCGGCGCCGCCGCGGGGGGCGGGGGGCGGGGAGCGGGCGCCGCGGGGGTGACGCGGTGCGCGTGCCGGCTCGTCGGCGCGGCGCTGATCGCCACGCTGCCGGCGTTCGTGTTCGAGGGCCCCGCGGAGGGCGGCGCCGGCGGAGGCGGCGGGAGCAAGCACGGCGGCAGCGTGCTGTGCGCGGTGTGCCTGGAGGACGTGGCGCGCGGCGAGACGGTGCGGCGGCTGCCGGCGTGCGGCCACCTCTTCCACAGGGACTGCGTCGACATGTGGCTGCACTCGCACACCACCTGCCCGCTCTGCCGCTGCGAGGTCTTGCCGCGGAAACCGGCGGCGAAACCTGCCCCGCCGCCGCCGGCGCAAGCCGCCGAATCGACGTCGGCGTATGCAGATCCCGATGCGTTGCCGCCGCGCGGCGGGGATGGTGGGTACCTCGCGTGCTACTCCGTCGTCATGGTCTGCGCGTCGCTGCTGCTGCTGTCGGTGCTCGCCGCCACGGTGAGCATCGCCAAGGCGTGCGTGTTCGCCGCGGCGGCCGCGGTGCTGTTCTGCGCCGTCGGCTGCGTCTCGCGGTGGTGCGGGGATGCCGGCGGGGCTCCGGCGGCGCTGCCGACGACAGCAGCGGCGGCGGAGGAGGCGCGGGCGAGGGCGCCCGCGGCGGCGGCGTGCGCGACGTGCGGGCTCGTCGGCGCGGCGATCGACGCGCTCCCGGCGTTCGCGTACGCGCGCCCTGCGGCCGACGACGGCGGCGGCGGCGGAAGCAAGTCGGGGAGGTGCGCGCTGTGCTCGGTGTGCCTGGAGGACGTCCAGGCCGGCGAGATGGTGCGGCAGCTGCCGGCGTGCAGGCACCTGTTCCACGTGGGCTGCATCGACATGTGGCTGCACTCGCACTCCACGTGCCCGCTCTGCCGGTGCAACGTCTCGCCGCCGGCGACCATCGTGGTGAAAGCCACAGCCACGTCGACGGCCACCGCCGCGGCGGCGGCGCAGCAGCTACCGGCTGACACGTTGCCGCCGTGCTGCTTCCGCGTGTACGGTCTGGCCATCGCCAACGCGGTGTCCATCGGCGGCACGAGCCTGCTCGTCTACCAGCTCGTCAGGCTGGCGCGGACGCCGGGGAGCAAGGGCGGCGTCGTGGCGCTCGCCATCTTCCTCGTGTTCTGGGTCAGCATCAACGCCGTCGCCTACTCGGTCTTCTGCGGCATGCTCTTCCCGTGGTCCGCGCTGAGGCGGTGCCTCGCGCCGCTCCCGAGCGCCGCCCGGTGGCTGCTCTGCCTGCCGTGCCGGTGCGCGCGGCGGCGGCGGCGGCGTCCGGCGACGAGCACCTCCTCGTCCGCTTCTGCTCTGCCACCGCACATGTACGTGCTGGAACGCGAGCCGCCGGTGAGGTGGGGGGCGCGGGTTGCGACGGCGGACGACATCCCCGCGTACGAGCAGCCGGCGGCGAGCGAGGGCGGCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGTGCGCGGTGTGCCTGGGCGAGGTGGAGAAGGGGGAGATGGTGAAGCGGCTGCCGGTGTGCCTGCACATGTTCCACCGGCGGTGCATCGATCCGTGGCTGCGCGACCACTCCACCTGCCCAGTCTGCCGGTGCGACGCCTTCGCCGCGCCGCCATTGCCGGCCCAAATGCCACGGGAGACGCCGACCGTGCGCGGAGGCGGAGGCGCGCGGGTGGCGACGGCGGACGACATCCCCGCGTACGAGCAGCCGCCTGCGGGAGAGGGCGAGGGCGGCGCGGCGGCGGCGCCGGAGTGCGCGGTGTGCCTCGGCGAGGTGGAGAAGGGGGAGATGGCGAAGCGGCTGCCGGCGTGCCTGCACGTGTTCCACCAGCGGTGCATCGACGCGTGGCTGCGGGGCAACTCCACCTGCCCGGTCTGCCGGCGCAACGCCTTCGCCACGGCGGCGCCGCCATTGCCGGCTCAAATGGTGTAG

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0248200 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g15020 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0248200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0018510 SBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0010760 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0010620 RBH 0.000000 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0010450 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0010570 RBH 0.263175 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0138200 RBH 0.0121965 0.2351895 0.050323
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0010330 SBH 0.026031 0.200497 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0145700 RBH 0.084576 1.0488735 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0010860 RBH 0.000000 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0010480 RBH 0.0 0.973875 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0010890 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0010830 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0010500 RBH 0.149334 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G010750 SBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0010550 RBH 0.0 0.0 0.0
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