Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsARC_11g0024050 | OGI:11010520 | 16/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:28522664-28538263 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK354, OsRLCK354, PI65, Pi65(t), Pi65, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FL28] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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More
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_11g0024050 | OsARC_11g0024050.01 | Chr11 | 28522664 | 28532954 | + | NAM | ||
| CDS seq | ATGGCGCTTGGATCTCCAGTATGCATCATCGTGTCCGCTCTGCTGTTGATCACTTTGTCCCCTGCGGTTGCTGCTGCTGCTGCTTCTCCTCCAGGGAGGAGCAAGAGCAATGGCAGCGACAGCGATCTCGCTGCGCTGCTGGCTTTCAAAGCTCTCCGATCCCTACAACATTCTTGCCACCAACTGGACTGCCGGCACGCCGTTCTGCCGGTGGATGGGGATCACTTGCAGCCGGCGGCAGCGGCAGCGTGTCACCGGAGTGGAGCTGCCCGGAGTTCCCCTCCAAGGAAAGCTGACCCTCACATCGGTAACCTATCTTTCCTCTCCGTCCTTAACCTCACCATCACAAACCTCACGGGTTCAATCCCAGACGATATCGGAAGGCTGCATCGCCTCGAGCTCCTTGATCTTGGCAATAATGCTCTCTCAGGTGTCATCCCAGCCTCCATAGGCAACCTCACGAGGCTTGGCGTTCTTCGTCTCGCGGTTAACCAGCTCTCTGGACAAATCCCAGCCCATCTGCAGGGCCTGCACAGCCTTCGCAGCATCAACATTCGGAACAATGGACTCACTGGGTCGATCCCAAACAGTCTGTTCAACAACACCCCTTTGTTATCTTACCTCAACATTGCCAACAACAGCCTTTCTGGATCAATACCAGCCTGCATCGGCTCGTTGCCCATGCTTCAATTCCTTGACTTGCAGGTTAATCAACTTGCCGGACCAGTACCACCAGGCGTCTTCAACATGTCTATGCTAGGAGTTATTGCTCTTGCCTTGAACGGCTTAACTGGCCCTATCCCAGGCAACGAAAGCTTCAGACTCCCGAGTCTCTGGTTTTTCTCCATTGATGCCAACAATTTCACAGGTCCAATTCCACAGGGGTTCGCGGCGTGCCAGCAACTCCAAGTTTTTTCCCTCATCCAGAACTTATTCGAGGGTGCTTTGCCATCATGGCTGGGCAAGTTGACGAATCTCGTCAAGCTCAACTTGGGTGAGAATCACTTCGATGGTGGTTCAATTCCTGATGCGTTAAGCAACATTACCATGCTGGCTTCCCTAGAGCTCAGCACGTGCAACCTAACAGGAACCATTCCAGCAGATATTGGAAAGCTTGGAAAACTTTCAGATTTGCTTATTGCAAGGAATCAACTAAGGGGACCCATCCCTGCTTCTCTCGGCAACTTATCTGCATTATCATGCCTGGATTTGAGCACAAACCTGTTGGATGGATCTGTCCCAGCAACAGTTGGCAGCATGAACTCTTTGACATACTTTGTTATTCACGAAAATAGCTTACAGGGGGATCTCAAATTCTTGTCTGCTCTTTCCAACTGTAGGAAGCTTTCTGTCCTTGAAATCGACTCAAATTATTTCATCGGAAACCTCCCAGACTATGTGGGCAATCTATCAAGCACGCTGCAAGCATTCATCGCACGTCGAAACAATATATCCGGTGTCCTTCCATCTACAGTTTGGAACTTAACTAGTCTCAAGTATCTAGATCTTAGTAATAACCAACTGCACAGTACAATATCAGAATCAATCATGGATTTGGAGGTTCTACAGTGGCTTGATCTCAGTGAAAATAGCTTGTTTGGCCCCATACCGTCAAATATTGGCGTGCTGAAGAATGTTCAAAGATTATTTCTTGGTACAAACCAATTCTCCAGCTCCATATCGATGGGCATTAGTAACATGACCAAGTTAGAATACCTAGATTTATCTGATAACCAACTAGCATCCACTGTACCACCGAGCTTATTTCATCTTGATAGACTTGTTAAACTAGATCTGTCCCACAATTTCTTGAGTGGTGCATTACCGGCTGATATAGGCTATTTGAAGCAAATGAATATCATGGATCTCTCTAGCAACCACTTCACTGGCATCCTCCCAGATTCAATTGCACAACTTCAAATGATAGCCTACTTGAACCTATCAGTCAATTCATTCCAAAATTCAATTCCAGATTCTTTTCGTGTGCTTACCAGCTTAGAAACTTTGGATCTATCCCACAACAATATTTCCGGTACCATCCCGGAATACCTGGCCAATTTTACTGTCCTTTCCAGCTTGAACCTATCTTTCAACAACCTACATGGTCAAATACCAGAAACAGGTGTCTTCTCAAACATCACGCTGGAATCCTTGGTTGGGAACTCAGGGCTATGTGGTGCTGTCCGTTTAGGATTTTCACCATGCCAAACAACCTCTCCCAAAAGAAACCATCGGATTATAAAATACTTAGTCCCTCCTATAATTATCACAGTTGGAGCTGTAGCTTGCTGCTTATATGTAATTCTTAAATACAAAGTTAAGCATCAAAAGATGTCTGTTGGTATGGTTGACATGGCCAGCCATCAACTACTCTCCTACCATGAGCTTGCTCGTGCTACTAATGATTTCAGTGATGATAACATGTTGGGCCTCGGAAGCTTTGGAAAAGTTTTTAAGGGACAATTGAACAACGGTATGGTGGTTGCCATAAAAGTTATACACCAGCATCTGGAACATGCCATGAGAAGCTTTGACACCGAGTGTCACGTGCTCCGAATGGCTCGACATCGCAACTTGATAAAGATTCTGAACACTTGTTCCAACCTGGACTTCAGAGCACTGAGTAATTATCAAGTGGTACAACTAATGTTTGAGTATGGCTCCCTTGGTAAAGCGTCACGGAAGAGCGATGTATTTAGCTATGGGATCATGTTGCTTGAAGTGTTCACTGCGAAGAGACCAACAGATGCTATGTTTGTGGGAGAACTAAACATCAGGCAGTGGGTTCTTCAGGCATTTCCTGCAAACCTTGTCCATGTCGTAGATGGCCAACTTCTACAGGACAGCTCTTCTTCTACCAGTAGCATTGATGCCTTTCTTATGCCAGTGTTTGAGCTGGGCTTGCTCTGCTCGTCTGACTCACCAGAGCGAAGAATGGTGATGAGCGATGTTGTCGTGACGTTGAGGAAGATTAGGAAGGAAATGCCAGTACGGATATCTGTTGTGCTGCTGATCATCGCTTTGTCTGCAGTGACTTGTGCTTCTGCAGTTCCGAGCAAGAGCAATGGCAGTGACACTGACTATGCTGCACTGCTGGCTTTCAAAGCGCAGCTGGCCGACCCTCTCGGCATTCTTGCCAGCAACTGGACCGTCAACACACCGCTCTGCCGCTGGGTGGGCATCCGATGCGGCCGCCGCCATCAGCGCGTCACCGGCCTGGTGCTGCCAGGCATTCCCTTGCAAGGAGAGCTCAGCTCTCACCTCGGTAACCTCTCTTTCCTCTCCGTCCTCAATCTCACCAATGCCAGCCTCACGGGCTCAGTCCCAGAAGACATAGGAAGGCTCCATCGCCTAGAGATTCTTGAGCTTGGCTACAATTCTCTGTCAGGTGGCATCCCAGCCACCATAGGGAACCTTACAAGGCTTCAAGTTCTTTACCTCGAATTTAACCAGCTATCTGGCTCAATCCCCGCAGAGTTGCAGGGCCTAGGAAGCGTTGGTTTGATGAGCCTCCGGAGGAATTACCTCACTGGCTCAATTCCAAACAATCTATTCAACAACACACCTTTGCTAGCTTATCTCAACATTGGCAACAACAGCCTTTCTGGGTCGATACCAGCCTCCATCGGCTCTTTGTCGATGCTCGAACACCTTAACATGCAGGTCAACCTTCTCGCAGGACCGGTGCCACCAGGCATCTTCAATATGTCCACACTGCGTGTTATTGCACTTGGACTGAACACCTTCTTAACCGGCCCTATCGCGGGCAACACAAGTTTCAACCTACCAGCTCTCCAATGGCTCTCCATCGATGGCAACAATTTCACTGGTCAAATTCCACTGGGGCTCGCATCGTGTCAGTACCTCCAAGTTCTTTCCCTGTCTGAAAATTATTTTGAAGGTGTTGTCACAGCCTCAGCTGCATGGCTGAGCAAGCTCACGAATCTCACTATCCTTGTGTTGGGTATGAATCACTTTGATGCTGGTCCAATCCCTGCTTCACTAAGCAACCTCACCATGCTAAGTGTCCTAGATCTCTCATGGAGCAACCTCACTGGAGCCATTCCGCCAGAGTATGGACAGCTTGGCAAACTCGAGAAACTGCATCTCTCACAGAATCAGCTAACAGGAACCATTCCTGCATCTCTTGGTAACATGTCCGAATTAGCCATGCTAGTGTTGGAGGGAAACCTACTGAATGGATCATTACCAACAACAGTTGGTAGCATCAGATCGTTATCGGTACTTGATATTGGGGCAAACCGCCTGCAGGGGGGTCTCGAATTCCTGTCTGCTCTTTCTAACTGTAGAGAGCTTTATTTCCTTAGTATCTACTCCAATTATCTCACCGGGAACCTCCCAAACTACGTGGGTAACCTGTCTAGTACGCTGCGATTATTCAGTTTACATGGAAACAAGCTAGCTGGTGAACTTCCAACCACCATTTCCAATTTAACTGGCCTCCTTGTGCTAGACCTTTCGAATAACCAACTGCATGGTACAATACCAGAATCAATCATGGAGATGGAGAATCTCCTTCAACTTGATCTCAGTGGAAATAGCTTGGCTGGCTCTGTCCCATCAAACGCTGGAATGCTAAAGAGTGTAGAAAAAATATTCCTTCAGAGCAATAAATTCTCTGGCTCCTTACCAGAGGACATGGGCAACCTCTCCAAGTTAGAGTACCTAGTATTATCTGATAACCAATTATCATCAAATGTACCACCAAGTTTATCTCGTCTTAATAGCCTCATGAAGCTAGATCTGTCTCAAAACTTCTTGAGTGGTGTATTGCCAGTTGGTATAGGCGATTTAAAGCAAATTAACATCCTGGATCTCTCTACCAACCATTTTACTGGTAGCCTCTCAGATTCGATTGGGCAACTTCAAATGATTACTTACTTGAACTTATCTGTTAATTTATTCAATGGTTCACTTCCAGATTCTTTTGCTAACTTAACCGGCTTGCAGACTTTGGATCTATCCCATAACAACATTTC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|
|||||||
| Protein seq | MALGSPVCIIVSALLLITLSPAVAAAAASPPGRSKSNGSDSDLAALLAFKALRSLQHSCHQLDCRHAVLPVDGDHLQPAAAAACHRSGAARSSPPRKADPHIGNLSFLSVLNLTITNLTGSIPDDIGRLHRLELLDLGNNALSGVIPASIGNLTRLGVLRLAVNQLSGQIPAHLQGLHSLRSINIRNNGLTGSIPNSLFNNTPLLSYLNIANNSLSGSIPACIGSLPMLQFLDLQVNQLAGPVPPGVFNMSMLGVIALALNGLTGPIPGNESFRLPSLWFFSIDANNFTGPIPQGFAACQQLQVFSLIQNLFEGALPSWLGKLTNLVKLNLGENHFDGGSIPDALSNITMLASLELSTCNLTGTIPADIGKLGKLSDLLIARNQLRGPIPASLGNLSALSCLDLSTNLLDGSVPATVGSMNSLTYFVIHENSLQGDLKFLSALSNCRKLSVLEIDSNYFIGNLPDYVGNLSSTLQAFIARRNNISGVLPSTVWNLTSLKYLDLSNNQLHSTISESIMDLEVLQWLDLSENSLFGPIPSNIGVLKNVQRLFLGTNQFSSSISMGISNMTKLEYLDLSDNQLASTVPPSLFHLDRLVKLDLSHNFLSGALPADIGYLKQMNIMDLSSNHFTGILPDSIAQLQMIAYLNLSVNSFQNSIPDSFRVLTSLETLDLSHNNISGTIPEYLANFTVLSSLNLSFNNLHGQIPETGVFSNITLESLVGNSGLCGAVRLGFSPCQTTSPKRNHRIIKYLVPPIIITVGAVACCLYVILKYKVKHQKMSVGMVDMASHQLLSYHELARATNDFSDDNMLGLGSFGKVFKGQLNNGMVVAIKVIHQHLEHAMRSFDTECHVLRMARHRNLIKILNTCSNLDFRALSNYQVVQLMFEYGSLGKASRKSDVFSYGIMLLEVFTAKRPTDAMFVGELNIRQWVLQAFPANLVHVVDGQLLQDSSSSTSSIDAFLMPVFELGLLCSSDSPERRMVMSDVVVTLRKIRKEMPVRISVVLLIIALSAVTCASAVPSKSNGSDTDYAALLAFKAQLADPLGILASNWTVNTPLCRWVGIRCGRRHQRVTGLVLPGIPLQGELSSHLGNLSFLSVLNLTNASLTGSVPEDIGRLHRLEILELGYNSLSGGIPATIGNLTRLQVLYLEFNQLSGSIPAELQGLGSVGLMSLRRNYLTGSIPNNLFNNTPLLAYLNIGNNSLSGSIPASIGSLSMLEHLNMQVNLLAGPVPPGIFNMSTLRVIALGLNTFLTGPIAGNTSFNLPALQWLSIDGNNFTGQIPLGLASCQYLQVLSLSENYFEGVVTASAAWLSKLTNLTILVLGMNHFDAGPIPASLSNLTMLSVLDLSWSNLTGAIPPEYGQLGKLEKLHLSQNQLTGTIPASLGNMSELAMLVLEGNLLNGSLPTTVGSIRSLSVLDIGANRLQGGLEFLSALSNCRELYFLSIYSNYLTGNLPNYVGNLSSTLRLFSLHGNKLAGELPTTISNLTGLLVLDLSNNQLHGTIPESIMEMENLLQLDLSGNSLAGSVPSNAGMLKSVEKIFLQSNKFSGSLPEDMGNLSKLEYLVLSDNQLSSNVPPSLSRLNSLMKLDLSQNFLSGVLPVGIGDLKQINILDLSTNHFTGSLSDSIGQLQMITYLNLSVNLFNGSLPDSFANLTGLQTLDLSHNNISGTIPKYLANFTILISLNLSFNNLHGQIPKGGVFSNITLQSLVGNSGLCGVAHLGLPPCQTTSPKRNGHKLKYLLPAITIVVGAFAFSLYVVIRMKVKKHQMISSGMVDMISNRLLSYHELVRATDNFSYDNMLGAGSFGKVYKGQLSSGLVVAIKVIHQHLEHAMRSFDAECHVLRMARHRNLIKILNTCTNLDFRALILEYMPNGSLEALLHSEGRMQLEYGALGKASRKSDVFSYGIMLLEVFTGKRPTDAMFVGELNIRQWVYQAFPVELVHVLDTRLLQDCSSPSSLHGFLVPVFELGLLCSADSPEQRMAMSDVVVTLKKIRKDYVKSISTTGSSRSNSSDTDLSALLALKAQLSDPNNILHLTGNWTVGTPFCQWVGVSCSRRR
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0691800 | RBH | 0.156598 | 0.000000 | 0.927697 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g46960 | RBH | 0.337345 | 0.0 | 0.277000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0691800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0015230 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0024540 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0017360 | SBH | 0.000000 | 1.092289 | 0.270482 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0024120 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0024390 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0443800 | RBH | 0.028798 | 0.0706345 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0024780 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.072087 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0440500 | RBH | 0.005107 | 0.2015625 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0024680 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0024760 | SBH | 0.027641 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0024230 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0023910 | RBH | 0.018860 | 0.0 | 0.000000 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0024300 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G016140 | RBH | 0.0 | 0.588280 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0017670 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
