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OsARC_11g0014900 OGI:11055410 | 16/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:18032536-18051390
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Function Protein HASTY 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q0WP44]

Transcripts

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_11g0014900 OsARC_11g0014900.02 Chr11 18032639 18051390 - NAM
CDS seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_11g0014900 OsARC_11g0014900.03 Chr11 18032639 18051284 - NAM
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_11g0014900 OsARC_11g0014900.04 Chr11 18032536 18051220 - IsoSeq
CDS seq

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Protein seq

MVQAVRMKLITLIMANSQMSLVMQEYRLLVGVIFISCLLSIPLSLKHFFLQQPIHGLRKRKICFPPSLV

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr11 18044850 18049468 - OsARC_11g0014900.04 OsARC_11g0014900.03,OsARC_11g0014900.04 All
MX Chr11 18044850 18050330 - OsARC_11g0014900.03 OsARC_11g0014900.03,OsARC_11g0014900.01 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.078193 0.742818 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0518900 RBH 2.024530 2.290184 26.428812
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g31770 RBH 1.311175 1.475178 6.330320
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0518900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0015390 RBH 0.0 0.0 24.747896
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0015350 RBH 0.701548 0.000000 12.453416
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0015300 RBH 3.795045 11.314961 45.147289
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0014860 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0015400 RBH 0.319548 0.0 38.799515
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0293300 RBH 2.8673305 3.7494975 22.2278025
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Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0304200 RBH 0.7049915 2.8571255 39.204374
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0015490 RBH 0.025784 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0015520 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0015170 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0014990 RBH 0.0 0.0 1.966592
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0015280 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G015110 RBH 0.030245 0.0 5.194794
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0015430 RBH 0.145158 0.0 15.346690
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