Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsARC_11g0009750 | OGI:11026340 | 16/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:8803124-8809873 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | CTCTCTAGTTTTATACTCCATCTCGCTCGCTCACTCATGTCACTCGTCAGCCACTTCCGGTGTCCATCCAATTCCCCAGCAACCGCGGCGCCGATCGAGTTCTTGGGCTCCGGCGGCAGCCGGCCGGTGTTGGGCGCGCGACGGAGCCCCGGCCACCTGCAGCTAGCCGTACAGCCGCCGGCGGCCGGTGTATACAGGTATCTCTCTGGATTCTGTTTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTCTTTTGGATCGAATCGGCCCCATCGCTCGCTCCGAGAAGGCGGCGTTGATCCGCGCCAGCGCCACGGTTTCGAGGGGCTGTGTGTGCCCCCGATTTAGCGGAGGAGGGCACGGTGGTTTCGAGGGGTCCCGAGAAATTCGTGAGTTTTTCATCCTGCACTTCACTTTGTTTTCTTGCTTATCGCCGTGTTTGGTGTTGCTAATAGCAGTTATTACTTATTCTTATTACTATTACTATTATTATTATTACTCACTCCGTTTTATAATGTATGTGTTTAGATTTATTAGTATCTAAATTAATGTAGGCAATGTTAGAAAGTCTTACATTGTGAAACGGAGCAGGTATTATTTTTGGAGTAAATTTCAGAAATGGGACAAAGTTATGAAAAACCACGGGTATTAATGACGAGTGGCACATAACCACATATGACATATTTATGGTCTCATTGTTTTCTAAAACCCAACCTTTATTGGAATTTTGATAAATTCCAGCATATCTATGGTTTAGAACTTTAAGTAAATTCACGCTTAAAGTGCATAAGGGTGATATTTTGTGAAACTTTAAAATCATAATACCTGACAGCGGCGGAGCCAAGGCCCGGCCAGCACAGGCAGGCGCCTAGGCTCCGCCACATGCATCCATGCATTAGAGCTAAATATAGCGTTTAGCCATTAGCCTAGCTTCACATACACCATTAGATTAGCACTAATTATCATACTTGGTTATTAGCCAGCGGCCTAATTTCGCTTCTTATTCATGATAAAATGCTATATGTATTTTTGTTTACTTGTTAATTTGTTATCTATCGTTAGGTTTGCCCATGCCTAAAAAAAATTCTAGATCTGCCACTGATACCTGAGGTTGTGTCATGTTATAAAACCTGTGGTTATTTACAACTTCACCAAAAAACACAATGTTTTCTGAAATTTGTTCTTATTTTTATTATAAAGATGCATAGCCACCACTACGGGGTTTCCCAAACCACCGGGGCCGGGGTTACCGCGACCCAGCGGTAAGCACGGTTACCGCGCAGTAACCACGGTAACCGTGAAAAACCGTACAAAACCGTGCAAAATTTATCAAAAATTCAAATTATATTTTAAATTTATTTCAATTTAAGGAGGTTACCGTGGTATTTATATTACCGTACCCCGCGGTAAGCCCGGTAACCGTGGTAACCGCGCGGTTACAGTCAGTAAGTCGAACCCTGCCACTACCCACTGTTCTATATGCACACACCTGTAAGCAAGTCCACTTAATAAACACAAAGTGACGGATGTCAGAAGCAAATTTCCAACCTCACTATAAAATAGTATTAAAAGGGTACTTGTGTGCTTGCAATATTGTAGGTATAAGTATTGATCCCTGGTGTGTGAAGTCATGTATGAAATATTTTGTTATATGCCATTTTCGAAGATGGCATTCAGATGTGCAAGTGCACAAACAAACTATAGTTGTGGTATATTAACCTGTCAAGCTATTAGCTATACTTGAGGGGAGGGACCTAATGTTTTTCTTTGAACCAAGTGATGGGACCTAACCTTTACAGCCTGTTTGGCAACAATTGGGAGGAGGAATGAGAGTTCAGTTAACCAGTAAAATACTCTCTGTGTATCTTACACTGGTTTTGGGCCAAAATAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGCTTCCAAGCAGGTCCTAGTATGTTTCCGACATTTTCTAGCTTATGTGAGCTAGAAAGTAGACATGTTCAAACGTTATTCTCCTTGTGATCTGAAACTTAAAGACTCTGTGTACTCAATCAAGTAGGATTATAGGAAGCTACTTAGTTTGCTTCACCTTGAGGTCTTGTGAAAATGTTGTTCATCATTTTCTTTTTGTTCACATACATGATGGATGTCCACTATTACTGTTTTCGCATTTTGGATTGAGTTAGCAATTATTCTGAATATTTTGCAAAAAACTCAACATGAATAGAATTCCCCTTACATGGTGAGTGATTAAACAGCTAGATGATGGTGGGAGCAACGGTTTCAGCTTCAGCGGGGGTGATGAACTCTCTGCTTGGGAAGCTCTCCACCTTGCTGGACAAAGAGTATACAAAGCACAAAAATGTGGAAAAGGATGTGATGTTCCTGCAAAGGGAGCTACCCAGCATGGAGGCTGTGCTGCAGAAACATGCAATGCAGGACGAGCTTGATGTTCAATTGAAGGCCTGGGTGAGTGAGTTGAGAGAGCTGGCATATGACATTGAGGACTCCATTGATGCTTTCATGGTGCGCATTGAGCACTATAGTGATGAGTCTGCTGGAATTAAGGGGTTTATGAGTAAGAAAATCCACAAGCTCAAGAAGCTCCGTTGTCACCATAAATTTTCGGCGGTGTTTCTTGAACTAAAAGAGCGTGTCGTTGAAGCAAACGAGCGGCGAAGAAGATATGAGGTTGATGGGTCCACATCTGGAACCACAACCAGTGATTGCTTGTTGATTCCCGGTTGCCAGCACTCTATTCTGGTTTAGATGAGCTTGTAGGAATCAAGGGTCCAAGGGATTGTATAATCAAGTTGCTAACTTATGAAGCTGATAGTGGCCCATCAAGACAGCAACTCAAAGTAGTGTCCATTGTGGGATGTGGAGGTCTGGGCAAGACAACACTTGCCAATCAAGTCTATAAGGAAATCAATGGCCAATTTGATTGTAAGGCTTTTGTGTCTATGTCCCAGAAACCAGACATGAGGAAGATCTTAATGGATCTACTATCTCAAATACTGGGGAATGGTAGCCCCATGTGCTTTGATGAACAGCGACTCATTGACAAGCTTCGGGAGTTCCTAAAAGATAAGAGGTATTAAAACTGAACTTTATTGTTTCATAATTGCAAGATAATAATAAAATTATTGAAAAAAAACTGCAATTTTTAAAAGTATCAGGTGTTAACATTCTGTAAAAAAGTCCAAGTCAAGACAAACAGAGAGAGATATTAAATGTGAACTATACACAATACACATATGTGTATACATCCCTTACATGGTAGAAGAGTCCTTAAAATCTTCATTTGTGCCTTAATCTTTGGACATGTCTGAGACATATTAGATCTGTCTGGTCTATGTAATTTCACCTTATCAATACTTAATTTTCCTTCTTTTTTAAATGACCTATTGGATTAGTGTTAACCATGCCATTTTGTAGTTTCGTATTTTTATACTCTTGTTTCTTCTTTCGATCTTTAAATTTTTTTTTCCGTAGATTCAACTGGATTGTAGTTTTTATTTATAAGCAAGTGACATTGTGACATGGGGATACTGTGAAATAGCTATTGACAATAAATCAAATATTAAAGTCCCTACAAGAGATGATAACAGGAAATTAGGAGTGAACTTTGAACAGTTTTTGAAAATGACTTGGTTTTGCGCCTTATCTAAAGCAATATGAAATATGGTTTTCAACGGAAACGTACACAGCTAGTTGTCATGTGCCATGGAATATTAGGTACAGAGCTTATTTGTATTCCAGTTAAGTATAGGCCCTATACTTTTAGAGTAAGGCGTCTAGTGAAAACGATGGCATCTGCGGAGTCATGTGAAGGAGATTGACTTGAGTTTTTAGCAATTACATTGTTAAGTTCACTATGACAGCCCGGCCAAAAAAAGTTCACTATGACCATTGTATTTGTTTTAAAGCTCCATGGAAGCCCCAATTGATGCAAAAGACAAGGCATTGTGTTCAGTTAGCTGTTTGGGAGGGCAATGTGTGCTTTATTTTGTGTAGAAGGACTGCTATATTTTTTTGTGTTGTCTGCATACTGCTTATTCCCAATTTCAAACAGATGCATCAATAACAATTTTGCGTCTTAAGTCACCTTAGAGAATTTGGTCAGGGCTTCCCCTCATATACAAGTTTCGGTAAACCTTGGGACATTTTGTATGCCATTCAGATATGTCATGAGAAAATCAGACCTACATAAAACAAGTACACACACAGATGCAGTATTATTTTAGTAAAAATATATACATGTAATAAAAACAGTTCTTATAAACTGTTCACAAATTTATGCAAATAGGTTGTGATGTTTATATATCATAAGAATAATAATATAGTTTTTAATATTTCAGAAACACCATTGGCACCTTGTAACTGCTGATATATCTCTCAATTCTGCTAAGTTCTACCTAACGCTTGATAAAATGTCACCAAAATCTGTACAGGTACCTGATCGTTATTGATGATATTTGGAGCACATCAGCATGGGAGATTGTGAAGTCTGCATTTCCTGATAATAATCTTCGCAGCAGAATAATTACAACAACGCGCATCATGGATGTAGCTAAATCATGTTCTGCTAATCTCCAGGAATATGTTTACACCATCAAACCACTTAATCATCAAGACTCTAGCAAGCTGTTTGTTAAAAAAATTTTCCCTTCTGGGTGTGGTGTTCCTCAACATCTGAAAGAAGTTTCGAATGCAATACTGAAAAAATGTGGTGGTTTGCCACTGGCTATACTTATTATAGCTGGTTTGTTGGCTAGTAAGTATGATAGGAAGGATGAGTGGGAGGCAGTGCATAATTCTATTGGCTCTGAACTTGGCAAAAATCATACTTTGGAAGGATTCAGAAGGATTTTGATGCTTAGTTTTTATGACCTGCCTCATGATTTGAAAACCTGCTTCTTATATCTAAGTATATTCCCGGAGGATGACCTGATTGTAAGAAAACAATTGGTGTGGAAATGGGTTGCGGAAGGGTTTATTAGAAAAGTGCGTGGTAAAAGACCAGATCAAGTTGCAGAGAGCTACTTTTACGATCTTATCAATAGAAACATGATCCAAGCAGTGGGTGTTCAGTACAAAGGTAACATATATGGTTGTCGAGTTCATGATTTAGTGCTTGACCTTATCAGATCTCTATCAGCACAAATCAACTTTGTTATCGCGATTGATGATAAAGGGTATGAATCTTCTCCTAGGAAGATTCGTCGGCTGTCCTTGCAAGCTAGTAATTTGGAAGATCAAGAAATGCAGAAACTTGTGAGTAATCAATCCCATATCCGCTCACTCATTATGTTCAGGGCCTTTAAGAAAGCACCTGATCTTTTCAAGTTCCATGCTCTGCGTATTTTGGATTTATCCGAGTGCAATTGTTTGGAGGACCACCACATTACATGTATAGTGAATTTGTTTCAGCTGAGGTATCTGAGCCTCCCTTGCAGAATCACTGAACTCCCCGAGCAAACCGGGAACTTGCAACATCTAGAGGTACTGAACATCAGGCGTTGCATGATCAAAACATTGCCAGAACCCATTGTTAAACTTGGGAAACTCATGTGCCTACACGTGAAGTCTGGGGTGAAACTGCCGGATGAGATTGGGAGAATGCAAGCTCTCCAGGAGCTGGAGAGTATCTCCATCCCATGTAACTCTGTGAGGTTAATTGAGGAGATTGGTAGGCTGACAAGATTGCGAAGACTTACTGTTGAAACAACAAGCACTACTGAGAAAATGGGAGACCAAGAAGTGAGGTTCAGGGAAATGTTGGTCAGTTCCCTCACCGAGTTGGGCAGAAATGGCCTTGAGTCACTCTGTATCAGCTACCCTCATGGACAGAACTTCATCCTGGATTCATTGTTTGGCTCTGGCTGCTCTCTTCCAAAGTTTCATGAGCTTGACATAAAGAATTACCTTTGTTGGGTTCCAAGGTGGATAACTATGCTTAGTAGCCTTGTGCACTTATGCCTATCCATGTATGATATTGACGAGGAAGATATGCGAGTTCTGAATGGCATCTCCACCCTGCTATTTCTCCATTTAGAATTAAGGAATCCACCTGAAGAGAGGCTAGTCATTGGTTGCGATGGACTCAGACATCTGAACGAGCTACATGTGTTCTGCCAACATTCCACAATGCCATTGACGTTCGCGCCTGGAGCAATGCCAGAGCTCCACCGTTTACGCCTCGAATTCGGGGCGAGGGAGACGTTGCGCATGTATGGTGATTTTGATTTCGGCATCGAGCATCTTTCGGGACTCCGGGATATCAGAGTTGACATTAACTACTACTCTGGTGGCACTGACATGGATGCAGAAGCAGTGGCTGCCAAGGATGCTATCACCACTGCTTCCATCATCCATCCAAACCGCCCCTTACATGATGTCCGAATGCATGTCACCATGATGTTTACCCTGAAGGAGGCTGCTCAGTCGGTTGGGCTCCAAAGCGCCACGAAAGAATTGAATTTAGGGACGGATTTTCAGCGCACTTTCGTCCAAATTGGTAATGAAACCTCTTTGCCAACTTACTACCAATATATGTCTTTCCTGCTTGTTCAGTTTAGTTACATTTCCTTTTGTTTTTAAATCCATCAGAAGACCTTGATAATCCAGAAGTTCTGCGAAAACTACAGCAGCTATTATCACCTGAGTCTTCGACACGGAACCAGTAGCTTGGGACTTGAAGAAACAACGTATGTATCTTCTGGAAATCTGGCCATCAAGATCAGGTGCGAGTATGGCAAATTGATTGAAATTCGTATAAAAATC
More
|
||||||||||
| CDS seq | ATGATGGTGGGAGCAACGGTTTCAGCTTCAGCGGGGGTGATGAACTCTCTGCTTGGGAAGCTCTCCACCTTGCTGGACAAAGAGTATACAAAGCACAAAAATGTGGAAAAGGATGTGATGTTCCTGCAAAGGGAGCTACCCAGCATGGAGGCTGTGCTGCAGAAACATGCAATGCAGGACGAGCTTGATGTTCAATTGAAGGCCTGGGTGAGTGAGTTGAGAGAGCTGGCATATGACATTGAGGACTCCATTGATGCTTTCATGGTGCGCATTGAGCACTATAGTGATGAGTCTGCTGGAATTAAGGGGTTTATGAGTAAGAAAATCCACAAGCTCAAGAAGCTCCGTTGTCACCATAAATTTTCGGCGGTGTTTCTTGAACTAAAAGAGCGTGTCGTTGAAGCAAACGAGCGGCGAAGAAGATATGAGGTTGATGGGTCCACATCTGGAACCACAACCACACTCTATTCTGGTTTAGATGAGCTTGTAGGAATCAAGGGTCCAAGGGATTGTATAATCAAGTTGCTAACTTATGAAGCTGATAGTGGCCCATCAAGACAGCAACTCAAAGTAGTGTCCATTGTGGGATGTGGAGGTCTGGGCAAGACAACACTTGCCAATCAAGTCTATAAGGAAATCAATGGCCAATTTGATTGTAAGGCTTTTGTGTCTATGTCCCAGAAACCAGACATGAGGAAGATCTTAATGGATCTACTATCTCAAATACTGGGGAATGGTAGCCCCATGTGCTTTGATGAACAGCGACTCATTGACAAGCTTCGGGAGTTCCTAAAAGATAAGAGGTACCTGATCGTTATTGATGATATTTGGAGCACATCAGCATGGGAGATTGTGAAGTCTGCATTTCCTGATAATAATCTTCGCAGCAGAATAATTACAACAACGCGCATCATGGATGTAGCTAAATCATGTTCTGCTAATCTCCAGGAATATGTTTACACCATCAAACCACTTAATCATCAAGACTCTAGCAAGCTGTTTGTTAAAAAAATTTTCCCTTCTGGGTGTGGTGTTCCTCAACATCTGAAAGAAGTTTCGAATGCAATACTGAAAAAATGTGGTGGTTTGCCACTGGCTATACTTATTATAGCTGGTTTGTTGGCTAGTAAGTATGATAGGAAGGATGAGTGGGAGGCAGTGCATAATTCTATTGGCTCTGAACTTGGCAAAAATCATACTTTGGAAGGATTCAGAAGGATTTTGATGCTTAGTTTTTATGACCTGCCTCATGATTTGAAAACCTGCTTCTTATATCTAAGTATATTCCCGGAGGATGACCTGATTGTAAGAAAACAATTGGTGTGGAAATGGGTTGCGGAAGGGTTTATTAGAAAAGTGCGTGGTAAAAGACCAGATCAAGTTGCAGAGAGCTACTTTTACGATCTTATCAATAGAAACATGATCCAAGCAGTGGGTGTTCAGTACAAAGGTAACATATATGGTTGTCGAGTTCATGATTTAGTGCTTGACCTTATCAGATCTCTATCAGCACAAATCAACTTTGTTATCGCGATTGATGATAAAGGGTATGAATCTTCTCCTAGGAAGATTCGTCGGCTGTCCTTGCAAGCTAGTAATTTGGAAGATCAAGAAATGCAGAAACTTGTGAGTAATCAATCCCATATCCGCTCACTCATTATGTTCAGGGCCTTTAAGAAAGCACCTGATCTTTTCAAGTTCCATGCTCTGCGTATTTTGGATTTATCCGAGTGCAATTGTTTGGAGGACCACCACATTACATGTATAGTGAATTTGTTTCAGCTGAGGTATCTGAGCCTCCCTTGCAGAATCACTGAACTCCCCGAGCAAACCGGGAACTTGCAACATCTAGAGGTACTGAACATCAGGCGTTGCATGATCAAAACATTGCCAGAACCCATTGTTAAACTTGGGAAACTCATGTGCCTACACGTGAAGTCTGGGGTGAAACTGCCGGATGAGATTGGGAGAATGCAAGCTCTCCAGGAGCTGGAGAGTATCTCCATCCCATGTAACTCTGTGAGGTTAATTGAGGAGATTGGTAGGCTGACAAGATTGCGAAGACTTACTGTTGAAACAACAAGCACTACTGAGAAAATGGGAGACCAAGAAGTGAGGTTCAGGGAAATGTTGGTCAGTTCCCTCACCGAGTTGGGCAGAAATGGCCTTGAGTCACTCTGTATCAGCTACCCTCATGGACAGAACTTCATCCTGGATTCATTGTTTGGCTCTGGCTGCTCTCTTCCAAAGTTTCATGAGCTTGACATAAAGAATTACCTTTGTTGGGTTCCAAGGTGGATAACTATGCTTAGTAGCCTTGTGCACTTATGCCTATCCATGTATGATATTGACGAGGAAGATATGCGAGTTCTGAATGGCATCTCCACCCTGCTATTTCTCCATTTAGAATTAAGGAATCCACCTGAAGAGAGGCTAGTCATTGGTTGCGATGGACTCAGACATCTGAACGAGCTACATGTGTTCTGCCAACATTCCACAATGCCATTGACGTTCGCGCCTGGAGCAATGCCAGAGCTCCACCGTTTACGCCTCGAATTCGGGGCGAGGGAGACGTTGCGCATGTATGGTGATTTTGATTTCGGCATCGAGCATCTTTCGGGACTCCGGGATATCAGAGTTGACATTAACTACTACTCTGGTGGCACTGACATGGATGCAGAAGCAGTGGCTGCCAAGGATGCTATCACCACTGCTTCCATCATCCATCCAAACCGCCCCTTACATGATGTCCGAATGCATGTCACCATGATGTTTACCCTGAAGGAGGCTGCTCAGTCGGTTGGGCTCCAAAGCGCCACGAAAGAATTGAATTTAGGGACGGATTTTCAGCGCACTTTCGTCCAAATTGAAGACCTTGATAATCCAGAAGTTCTGCGAAAACTACAGCAGCTATTATCACCTGAGTCTTCGACACGGAACCAGTAG
More
|
||||||||||
| Protein seq | MMVGATVSASAGVMNSLLGKLSTLLDKEYTKHKNVEKDVMFLQRELPSMEAVLQKHAMQDELDVQLKAWVSELRELAYDIEDSIDAFMVRIEHYSDESAGIKGFMSKKIHKLKKLRCHHKFSAVFLELKERVVEANERRRRYEVDGSTSGTTTTLYSGLDELVGIKGPRDCIIKLLTYEADSGPSRQQLKVVSIVGCGGLGKTTLANQVYKEINGQFDCKAFVSMSQKPDMRKILMDLLSQILGNGSPMCFDEQRLIDKLREFLKDKRYLIVIDDIWSTSAWEIVKSAFPDNNLRSRIITTTRIMDVAKSCSANLQEYVYTIKPLNHQDSSKLFVKKIFPSGCGVPQHLKEVSNAILKKCGGLPLAILIIAGLLASKYDRKDEWEAVHNSIGSELGKNHTLEGFRRILMLSFYDLPHDLKTCFLYLSIFPEDDLIVRKQLVWKWVAEGFIRKVRGKRPDQVAESYFYDLINRNMIQAVGVQYKGNIYGCRVHDLVLDLIRSLSAQINFVIAIDDKGYESSPRKIRRLSLQASNLEDQEMQKLVSNQSHIRSLIMFRAFKKAPDLFKFHALRILDLSECNCLEDHHITCIVNLFQLRYLSLPCRITELPEQTGNLQHLEVLNIRRCMIKTLPEPIVKLGKLMCLHVKSGVKLPDEIGRMQALQELESISIPCNSVRLIEEIGRLTRLRRLTVETTSTTEKMGDQEVRFREMLVSSLTELGRNGLESLCISYPHGQNFILDSLFGSGCSLPKFHELDIKNYLCWVPRWITMLSSLVHLCLSMYDIDEEDMRVLNGISTLLFLHLELRNPPEERLVIGCDGLRHLNELHVFCQHSTMPLTFAPGAMPELHRLRLEFGARETLRMYGDFDFGIEHLSGLRDIRVDINYYSGGTDMDAEAVAAKDAITTASIIHPNRPLHDVRMHVTMMFTLKEAAQSVGLQSATKELNLGTDFQRTFVQIEDLDNPEVLRKLQQLLSPESSTRNQ |
||||||||||
| Function | Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R8L1] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_11g0009750 | OsARC_11g0009750.02 | Chr11 | 8803160 | 8809873 | + | NAM | ||
| CDS seq | ATGTCACTCGTCAGCCACTTCCGGTGTCCATCCAATTCCCCAGCAACCGCGGCGCCGATCGAGTTCTTGGGCTCCGGCGGCAGCCGGCCGGTGTTGGGCGCGCGACGGAGCCCCGGCCACCTGCAGCTAGCCGTACAGCCGCCGGCGGCCGCTTCAGCGGGGGTGATGAACTCTCTGCTTGGGAAGCTCTCCACCTTGCTGGACAAAGAGTATACAAAGCACAAAAATGTGGAAAAGGATGTGATGTTCCTGCAAAGGGAGCTACCCAGCATGGAGGCTGTGCTGCAGAAACATGCAATGCAGGACGAGCTTGATGTTCAATTGAAGGCCTGGGTGAGTGAGTTGAGAGAGCTGGCATATGACATTGAGGACTCCATTGATGCTTTCATGGTGCGCATTGAGCACTATAGTGATGAGTCTGCTGGAATTAAGGGGTTTATGAGTAAGAAAATCCACAAGCTCAAGAAGCTCCGTTGTCACCATAAATTTTCGGCGGTGTTTCTTGAACTAAAAGAGCGTGTCGTTGAAGCAAACGAGCGGCGAAGAAGATATGAGGTTGATGGGTCCACATCTGGAACCACAACCACACTCTATTCTGGTTTAGATGAGCTTGTAGGAATCAAGGGTCCAAGGGATTGTATAATCAAGTTGCTAACTTATGAAGCTGATAGTGGCCCATCAAGACAGCAACTCAAAGTAGTGTCCATTGTGGGATGTGGAGGTCTGGGCAAGACAACACTTGCCAATCAAGTCTATAAGGAAATCAATGGCCAATTTGATTGTAAGGCTTTTGTGTCTATGTCCCAGAAACCAGACATGAGGAAGATCTTAATGGATCTACTATCTCAAATACTGGGGAATGGTAGCCCCATGTGCTTTGATGAACAGCGACTCATTGACAAGCTTCGGGAGTTCCTAAAAGATAAGAGGTACCTGATCGTTATTGATGATATTTGGAGCACATCAGCATGGGAGATTGTGAAGTCTGCATTTCCTGATAATAATCTTCGCAGCAGAATAATTACAACAACGCGCATCATGGATGTAGCTAAATCATGTTCTGCTAATCTCCAGGAATATGTTTACACCATCAAACCACTTAATCATCAAGACTCTAGCAAGCTGTTTGTTAAAAAAATTTTCCCTTCTGGGTGTGGTGTTCCTCAACATCTGAAAGAAGTTTCGAATGCAATACTGAAAAAATGTGGTGGTTTGCCACTGGCTATACTTATTATAGCTGGTTTGTTGGCTAGTAAGTATGATAGGAAGGATGAGTGGGAGGCAGTGCATAATTCTATTGGCTCTGAACTTGGCAAAAATCATACTTTGGAAGGATTCAGAAGGATTTTGATGCTTAGTTTTTATGACCTGCCTCATGATTTGAAAACCTGCTTCTTATATCTAAGTATATTCCCGGAGGATGACCTGATTGTAAGAAAACAATTGGTGTGGAAATGGGTTGCGGAAGGGTTTATTAGAAAAGTGCGTGGTAAAAGACCAGATCAAGTTGCAGAGAGCTACTTTTACGATCTTATCAATAGAAACATGATCCAAGCAGTGGGTGTTCAGTACAAAGGTAACATATATGGTTGTCGAGTTCATGATTTAGTGCTTGACCTTATCAGATCTCTATCAGCACAAATCAACTTTGTTATCGCGATTGATGATAAAGGGTATGAATCTTCTCCTAGGAAGATTCGTCGGCTGTCCTTGCAAGCTAGTAATTTGGAAGATCAAGAAATGCAGAAACTTGTGAGTAATCAATCCCATATCCGCTCACTCATTATGTTCAGGGCCTTTAAGAAAGCACCTGATCTTTTCAAGTTCCATGCTCTGCGTATTTTGGATTTATCCGAGTGCAATTGTTTGGAGGACCACCACATTACATGTATAGTGAATTTGTTTCAGCTGAGGTATCTGAGCCTCCCTTGCAGAATCACTGAACTCCCCGAGCAAACCGGGAACTTGCAACATCTAGAGGTACTGAACATCAGGCGTTGCATGATCAAAACATTGCCAGAACCCATTGTTAAACTTGGGAAACTCATGTGCCTACACGTGAAGTCTGGGGTGAAACTGCCGGATGAGATTGGGAGAATGCAAGCTCTCCAGGAGCTGGAGAGTATCTCCATCCCATGTAACTCTGTGAGGTTAATTGAGGAGATTGGTAGGCTGACAAGATTGCGAAGACTTACTGTTGAAACAACAAGCACTACTGAGAAAATGGGAGACCAAGAAGTGAGGTTCAGGGAAATGTTGGTCAGTTCCCTCACCGAGTTGGGCAGAAATGGCCTTGAGTCACTCTGTATCAGCTACCCTCATGGACAGAACTTCATCCTGGATTCATTGTTTGGCTCTGGCTGCTCTCTTCCAAAGTTTCATGAGCTTGACATAAAGAATTACCTTTGTTGGGTTCCAAGGTGGATAACTATGCTTAGTAGCCTTGTGCACTTATGCCTATCCATGTATGATATTGACGAGGAAGATATGCGAGTTCTGAATGGCATCTCCACCCTGCTATTTCTCCATTTAGAATTAAGGAATCCACCTGAAGAGAGGCTAGTCATTGGTTGCGATGGACTCAGACATCTGAACGAGCTACATGTGTTCTGCCAACATTCCACAATGCCATTGACGTTCGCGCCTGGAGCAATGCCAGAGCTCCACCGTTTACGCCTCGAATTCGGGGCGAGGGAGACGTTGCGCATGTATGGTGATTTTGATTTCGGCATCGAGCATCTTTCGGGACTCCGGGATATCAGAGTTGACATTAACTACTACTCTGAAGACCTTGATAATCCAGAAGTTCTGCGAAAACTACAGCAGCTATTATCACCTGAGTCTTCGACACGGAACCAGTAG
More
|
|||||||
| Protein seq | MSLVSHFRCPSNSPATAAPIEFLGSGGSRPVLGARRSPGHLQLAVQPPAAASAGVMNSLLGKLSTLLDKEYTKHKNVEKDVMFLQRELPSMEAVLQKHAMQDELDVQLKAWVSELRELAYDIEDSIDAFMVRIEHYSDESAGIKGFMSKKIHKLKKLRCHHKFSAVFLELKERVVEANERRRRYEVDGSTSGTTTTLYSGLDELVGIKGPRDCIIKLLTYEADSGPSRQQLKVVSIVGCGGLGKTTLANQVYKEINGQFDCKAFVSMSQKPDMRKILMDLLSQILGNGSPMCFDEQRLIDKLREFLKDKRYLIVIDDIWSTSAWEIVKSAFPDNNLRSRIITTTRIMDVAKSCSANLQEYVYTIKPLNHQDSSKLFVKKIFPSGCGVPQHLKEVSNAILKKCGGLPLAILIIAGLLASKYDRKDEWEAVHNSIGSELGKNHTLEGFRRILMLSFYDLPHDLKTCFLYLSIFPEDDLIVRKQLVWKWVAEGFIRKVRGKRPDQVAESYFYDLINRNMIQAVGVQYKGNIYGCRVHDLVLDLIRSLSAQINFVIAIDDKGYESSPRKIRRLSLQASNLEDQEMQKLVSNQSHIRSLIMFRAFKKAPDLFKFHALRILDLSECNCLEDHHITCIVNLFQLRYLSLPCRITELPEQTGNLQHLEVLNIRRCMIKTLPEPIVKLGKLMCLHVKSGVKLPDEIGRMQALQELESISIPCNSVRLIEEIGRLTRLRRLTVETTSTTEKMGDQEVRFREMLVSSLTELGRNGLESLCISYPHGQNFILDSLFGSGCSLPKFHELDIKNYLCWVPRWITMLSSLVHLCLSMYDIDEEDMRVLNGISTLLFLHLELRNPPEERLVIGCDGLRHLNELHVFCQHSTMPLTFAPGAMPELHRLRLEFGARETLRMYGDFDFGIEHLSGLRDIRVDINYYSEDLDNPEVLRKLQQLLSPESSTRNQ
More
|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_11g0009750 | OsARC_11g0009750.01 | Chr11 | 8803124 | 8809873 | + | NAM | ||
| CDS seq | ATGATGGTGGGAGCAACGGTTTCAGCTTCAGCGGGGGTGATGAACTCTCTGCTTGGGAAGCTCTCCACCTTGCTGGACAAAGAGTATACAAAGCACAAAAATGTGGAAAAGGATGTGATGTTCCTGCAAAGGGAGCTACCCAGCATGGAGGCTGTGCTGCAGAAACATGCAATGCAGGACGAGCTTGATGTTCAATTGAAGGCCTGGGTGAGTGAGTTGAGAGAGCTGGCATATGACATTGAGGACTCCATTGATGCTTTCATGGTGCGCATTGAGCACTATAGTGATGAGTCTGCTGGAATTAAGGGGTTTATGAGTAAGAAAATCCACAAGCTCAAGAAGCTCCGTTGTCACCATAAATTTTCGGCGGTGTTTCTTGAACTAAAAGAGCGTGTCGTTGAAGCAAACGAGCGGCGAAGAAGATATGAGGTTGATGGGTCCACATCTGGAACCACAACCACACTCTATTCTGGTTTAGATGAGCTTGTAGGAATCAAGGGTCCAAGGGATTGTATAATCAAGTTGCTAACTTATGAAGCTGATAGTGGCCCATCAAGACAGCAACTCAAAGTAGTGTCCATTGTGGGATGTGGAGGTCTGGGCAAGACAACACTTGCCAATCAAGTCTATAAGGAAATCAATGGCCAATTTGATTGTAAGGCTTTTGTGTCTATGTCCCAGAAACCAGACATGAGGAAGATCTTAATGGATCTACTATCTCAAATACTGGGGAATGGTAGCCCCATGTGCTTTGATGAACAGCGACTCATTGACAAGCTTCGGGAGTTCCTAAAAGATAAGAGGTACCTGATCGTTATTGATGATATTTGGAGCACATCAGCATGGGAGATTGTGAAGTCTGCATTTCCTGATAATAATCTTCGCAGCAGAATAATTACAACAACGCGCATCATGGATGTAGCTAAATCATGTTCTGCTAATCTCCAGGAATATGTTTACACCATCAAACCACTTAATCATCAAGACTCTAGCAAGCTGTTTGTTAAAAAAATTTTCCCTTCTGGGTGTGGTGTTCCTCAACATCTGAAAGAAGTTTCGAATGCAATACTGAAAAAATGTGGTGGTTTGCCACTGGCTATACTTATTATAGCTGGTTTGTTGGCTAGTAAGTATGATAGGAAGGATGAGTGGGAGGCAGTGCATAATTCTATTGGCTCTGAACTTGGCAAAAATCATACTTTGGAAGGATTCAGAAGGATTTTGATGCTTAGTTTTTATGACCTGCCTCATGATTTGAAAACCTGCTTCTTATATCTAAGTATATTCCCGGAGGATGACCTGATTGTAAGAAAACAATTGGTGTGGAAATGGGTTGCGGAAGGGTTTATTAGAAAAGTGCGTGGTAAAAGACCAGATCAAGTTGCAGAGAGCTACTTTTACGATCTTATCAATAGAAACATGATCCAAGCAGTGGGTGTTCAGTACAAAGGTAACATATATGGTTGTCGAGTTCATGATTTAGTGCTTGACCTTATCAGATCTCTATCAGCACAAATCAACTTTGTTATCGCGATTGATGATAAAGGGTATGAATCTTCTCCTAGGAAGATTCGTCGGCTGTCCTTGCAAGCTAGTAATTTGGAAGATCAAGAAATGCAGAAACTTGTGAGTAATCAATCCCATATCCGCTCACTCATTATGTTCAGGGCCTTTAAGAAAGCACCTGATCTTTTCAAGTTCCATGCTCTGCGTATTTTGGATTTATCCGAGTGCAATTGTTTGGAGGACCACCACATTACATGTATAGTGAATTTGTTTCAGCTGAGGTATCTGAGCCTCCCTTGCAGAATCACTGAACTCCCCGAGCAAACCGGGAACTTGCAACATCTAGAGGTACTGAACATCAGGCGTTGCATGATCAAAACATTGCCAGAACCCATTGTTAAACTTGGGAAACTCATGTGCCTACACGTGAAGTCTGGGGTGAAACTGCCGGATGAGATTGGGAGAATGCAAGCTCTCCAGGAGCTGGAGAGTATCTCCATCCCATGTAACTCTGTGAGGTTAATTGAGGAGATTGGTAGGCTGACAAGATTGCGAAGACTTACTGTTGAAACAACAAGCACTACTGAGAAAATGGGAGACCAAGAAGTGAGGTTCAGGGAAATGTTGGTCAGTTCCCTCACCGAGTTGGGCAGAAATGGCCTTGAGTCACTCTGTATCAGCTACCCTCATGGACAGAACTTCATCCTGGATTCATTGTTTGGCTCTGGCTGCTCTCTTCCAAAGTTTCATGAGCTTGACATAAAGAATTACCTTTGTTGGGTTCCAAGGTGGATAACTATGCTTAGTAGCCTTGTGCACTTATGCCTATCCATGTATGATATTGACGAGGAAGATATGCGAGTTCTGAATGGCATCTCCACCCTGCTATTTCTCCATTTAGAATTAAGGAATCCACCTGAAGAGAGGCTAGTCATTGGTTGCGATGGACTCAGACATCTGAACGAGCTACATGTGTTCTGCCAACATTCCACAATGCCATTGACGTTCGCGCCTGGAGCAATGCCAGAGCTCCACCGTTTACGCCTCGAATTCGGGGCGAGGGAGACGTTGCGCATGTATGGTGATTTTGATTTCGGCATCGAGCATCTTTCGGGACTCCGGGATATCAGAGTTGACATTAACTACTACTCTGGTGGCACTGACATGGATGCAGAAGCAGTGGCTGCCAAGGATGCTATCACCACTGCTTCCATCATCCATCCAAACCGCCCCTTACATGATGTCCGAATGCATGTCACCATGATGTTTACCCTGAAGGAGGCTGCTCAGTCGGTTGGGCTCCAAAGCGCCACGAAAGAATTGAATTTAGGGACGGATTTTCAGCGCACTTTCGTCCAAATTGAAGACCTTGATAATCCAGAAGTTCTGCGAAAACTACAGCAGCTATTATCACCTGAGTCTTCGACACGGAACCAGTAG
More
|
|||||||
| Protein seq | MMVGATVSASAGVMNSLLGKLSTLLDKEYTKHKNVEKDVMFLQRELPSMEAVLQKHAMQDELDVQLKAWVSELRELAYDIEDSIDAFMVRIEHYSDESAGIKGFMSKKIHKLKKLRCHHKFSAVFLELKERVVEANERRRRYEVDGSTSGTTTTLYSGLDELVGIKGPRDCIIKLLTYEADSGPSRQQLKVVSIVGCGGLGKTTLANQVYKEINGQFDCKAFVSMSQKPDMRKILMDLLSQILGNGSPMCFDEQRLIDKLREFLKDKRYLIVIDDIWSTSAWEIVKSAFPDNNLRSRIITTTRIMDVAKSCSANLQEYVYTIKPLNHQDSSKLFVKKIFPSGCGVPQHLKEVSNAILKKCGGLPLAILIIAGLLASKYDRKDEWEAVHNSIGSELGKNHTLEGFRRILMLSFYDLPHDLKTCFLYLSIFPEDDLIVRKQLVWKWVAEGFIRKVRGKRPDQVAESYFYDLINRNMIQAVGVQYKGNIYGCRVHDLVLDLIRSLSAQINFVIAIDDKGYESSPRKIRRLSLQASNLEDQEMQKLVSNQSHIRSLIMFRAFKKAPDLFKFHALRILDLSECNCLEDHHITCIVNLFQLRYLSLPCRITELPEQTGNLQHLEVLNIRRCMIKTLPEPIVKLGKLMCLHVKSGVKLPDEIGRMQALQELESISIPCNSVRLIEEIGRLTRLRRLTVETTSTTEKMGDQEVRFREMLVSSLTELGRNGLESLCISYPHGQNFILDSLFGSGCSLPKFHELDIKNYLCWVPRWITMLSSLVHLCLSMYDIDEEDMRVLNGISTLLFLHLELRNPPEERLVIGCDGLRHLNELHVFCQHSTMPLTFAPGAMPELHRLRLEFGARETLRMYGDFDFGIEHLSGLRDIRVDINYYSGGTDMDAEAVAAKDAITTASIIHPNRPLHDVRMHVTMMFTLKEAAQSVGLQSATKELNLGTDFQRTFVQIEDLDNPEVLRKLQQLLSPESSTRNQ
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| A5 | Chr11 | 8809397 | 8809700 | + | OsARC_11g0009750.01 | OsARC_11g0009750.01,OsARC_11g0009750.02 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.264485 | 0.056267 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0266500 | RBH | 2.605401 | 2.375007 | 2.089475 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g16530 | RBH | 1.074478 | 1.023408 | 0.349811 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0266500 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0010030 | RBH | 0.526450 | 9.907660 | 2.917598 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0009920 | RBH | 0.808779 | 1.519399 | 1.861646 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0009940 | RBH | 1.428960 | 3.468363 | 6.269007 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0009890 | RBH | 5.078450 | 0.0 | 5.926070 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0140000 | RBH | 3.0084565 | 20.921252 | 3.5429855 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0009860 | RBH | 0.480690 | 0.046411 | 0.319770 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0141100 | RBH | 2.282643 | 51.407671 | 4.088903 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0009990 | RBH | 0.364934 | 0.186711 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0010100 | RBH | 0.409760 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0009870 | RBH | 17.522301 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0009700 | RBH | 0.447906 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0009880 | RBH | 0.386127 | 4.477249 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G010030 | RBH | 0.546820 | 0.634227 | 0.690761 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0009790 | RBH | 1.320475 | 23.868324 | 1.988293 |
