Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_03g0035110 OGI:03087220 | 14/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr03:32972519-32982863
Gene Symbol RAP1B, MADS14, OsMADS14, FDRMADS6, RMADS211, AGL10
DNA seq

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TCTCGATCCGCTTCAGCTGCACCTTGCCCCGCCCCATCTTCCTCCTGTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCTCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTACCTCCAACCAAAATTAACCCTACCCACCTCGCTATCAGCGACGACCACTAGCCCTATAGCCACACCTATCCCCACACGGCAACTACTGGTGGTGGTGGCTGCTGGCTATCCGCCTATCCCCTAGCCCCGGCCCCCATCACGTGGACACGGCGAGACGGCGGCGGAATGCGTCGCGCGCGATGGGGGGGACCGATCGATCGATGGATGGATCGATCGAGTGGGGGAGACGACGACGACGA

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CDS seq

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Protein seq

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Function MADS-box transcription factor 14 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q10CQ1]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_03g0035110 OsARC_03g0035110.01 Chr03 32972519 32982863 - NAM
CDS seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.000000 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_03g0752800 RBH 0.000000 0.0 26.036764
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os03g54160 RBH 0.000000 0.000000 4.412238
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os03g0752800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_03g0035040 RBH 0.000000 0.000000 30.003639
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_03g0034710 RBH 0.000000 0.000000 22.836096
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_03g0034800 RBH 0.000000 0.000000 56.111012
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_03g0035120 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_03g0034680 RBH 0.000000 0.000000 116.304970
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_03G0532100 SBH 0.0253515 0.062101 52.4616335
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_03g0034460 RBH 0.000000 0.000000 9.219047
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_03G0531200 SBH 0.0200135 0.3700575 57.920042
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_03g0034880 RBH 0.000000 0.063056 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_03g0034920 RBH 0.000000 0.000000 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_03g0034620 RBH 0.000000 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_03g0034720 RBH 1.837163 0.0 4.323576
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_03g0034660 RBH 0.061321 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_03G034470 RBH 0.081573 0.000000 25.955439
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_03g0034310 RBH 0.000000 2.599812 60.933701
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