Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_02g0035200 OGI:02092810 | 16/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:32794559-32801837
Gene Symbol OsCLVATA, CLVATA, RLCK85, OsRLCK85, OsER2, ER2
DNA seq

cttcacgccaaagcctccctctcccatctctccctctctctccctcccctgcgcccatagctcgcagctttgcagcagccaagccaagaagccaactcaacccatcagaactgcagaaaccccagccgcggcgttggttaaaccacagcaaagcgtcgttgatgcccccgcgcggacgcctcgcctcggcgccatgacgacgaccaccaccactcgcctcctcctcgctgccattctcctcgcggtggccgccgccgacgatgacggtgggtggccgcgtgccgttcccttttgctctgctcgcctgcgtgcgttggcgagggagggagggagaaggaaggatgatggattatagtggggagggagggggttgggtttgggtggcttcgtgttttggtgTttttttagtgctgcgagtgcgcgccttttggtctttgtttatgtcttgctccctattggccggcgccgcctaagaatggcctaatactagattaatcccagcctcctgttcgtagcatctcttcttctgttcttcttccctatccaggggacagttgctgtactttttttttgttttgTtttttaaatgcggctttatttttgaactattttttttctgttttgtttcgttcatggataaggtttctatattgttcttggagatcaaatgctcatttctgaaatgccgccgctgtttgtggaagtttagggagtgattttttttttgtgtGgggtttttggttatcgagttttggatccggaaatggttttaaattattttggaagttattctccgattcctcctccgaaaccagattcctgtttcctcgcgatgtttggtacttcgattctgctgtttatcaatctggtttgctcttgcgtgttttccaggacaaacgctactggagatcaagaagtccttccgcaatgtggacaacgtgctgtacgattgggccggcgatggcgcgccgcggcgctactgctcgtggcgcggcgtgctctgcgacaacgtcaccttcgccgtcgcggcgctgtgagtttcctgccaacctattgcttggcttgcctggctgcagtgcccgtggttactgacgtgttttcttgcggtggaatgcagcaacctctcggggctcaatcttgggggcgaaatctccccggccatcgggaatctgaaaagcgtcgagtcgatgtacggtggcacgttgtctcctggaatgaaatgtttctttcattcagctgcttaattagtgtgctcaactcgttctccctgtttgtttgattacatatatgcagcgacttgaagtcgaatgaactttctgggcagatccctgatgagattggcgattgcacgtcgcttaaaactctgtaagtgagattcagttttggttcgcagtgttgttttgaggatgtagaacagtagaagtaatgcgtgccgcaaccctcccctgttcttttattcaagggacctgtcctctaacaatctaggaggagatataccattttccatatctaagctgaagcaccttgagaacttgtaagatttaccctgctgaaactaggagaagtattttgcagcatttctttcatcgtaagcactgctgttacttgaatatataggatcttgaagaacaaccagctggtggggatgatcccgtcgacactctctcagctaccaaatttgaagattttgtaagttgcggctgaactgttctgagggcttaatttggatcaattctaatgtgatatatgccccagggacttggctcaaaacaagctaaatggtgagattccgaggttaatctactggaatgaggttcttcagtacttgtgagtactaagtagtcgatgattctgttccctactttaaagaacttcttttttttgtttcagtacttaaactgcagacaatatgtaggagctattagtgctaatcagatctagtttgtgtaaattataggcggttgaacatatgtaatgtagggcaaatagttcggtaagatcatattgtcatatccaattgtgctaatctgattttcatatgacaggggattacggagcaataatttagaaggaagcctctctcctgagatgtgccagttgactggcctgtggtacttgtgagtgtattgcttccttttgtttattattagctctacatgtttgttttctttgttcctttcacaaacttgattttgtttgacttagtgatgtgaagaacaatagcttaacgggtataataccagatactattgggaactgtacgagctttcaggtcttgtatgtacataccttctactccttctgaattatatgtccccctttctttgacatgtcaatcattcctgaccttatggtatttttagggatctgtcttacaaccggctcacgggagaaatcccattcaacattggcttcctacaagtggctacattgtatgtggtagtcattttactaacaaaaagagtatccaacctgtcgtaattaatgaaaccaactacttgaactgctatgcactattttgtaccaggtctttgcaagggaacaatttctctggccctattccatcagtaattggccttatgcaggcgctcgcagtgctgtaagtccaatgataattgatgtgcttgtcttaatttatgggctgagagtgagaggtattaccatagcccttgaatgcaagttttcacctgtaccttctatttgttgatacagtgatctgagtttcaaccaattgtctgggccaataccatcaatacttggcaacttaacatacactgagaaactgtaagcctgcccttgtgtgtgtgttttcctagcctttgataaatataatattcttaattatgtcaagaagttaacatcatagtatcttgttttcttaggtacctccaaggcaataggctaactggatcaataccacccgagcttggtaatatgtcgacacttcattacttgtaagcctctacctttaaaattttgttgcttcttgattgttaattgattagcgcactaccctctttttgagacaatatctggtttcagagaactgaatgacaatcagctgaccgggttcattccgcctgagcttggaaagttgacgggcttatttgatctgtataactctactcatcctttatcaattgatgcttacctggaatgctaaatcagtcagtggaccatatcatttgtttttcacaggaacctggcaaacaacaaccttgaaggaccaatccctgataatataagctcatgcatgaatctcattagcttgtaagtttcatttgttctcctgaagttctatatcctctccgatggcagggcacttaactttagctttgtaacagcaatgcttatggcaataaattaaatgggaccgttccacgttcattgcacaaacttgagagtataacttatttgtaagtgttattggttttaggtgatttttcttcaagcctgctataaatttagttctgttcatagtgtctaatgatttttgttttcatcctaacttctaggaatctatcatcaaactatcttagtggagccattcccattgaactagcaaaaatgaaaaacttggacacattgtaagtaccagaagttaatctgcaattgcttttgaataagtgattctcatgatatgacgtgtttgctggatatatttgaagggacttatcctgtaacatggttgctggtccaattccctcagcaattgggagcttagagcatcttttgagactgtaagttctataatattactccttgttataaaaaaataaaataaaatacttgtatcatgtcatgacagcattctcttattcctaaagaaattttagcaataataatttggttggatacatccctgctgagtttggaaacttgaggagtatcatggagatgtaagtaccttctcacctaaatgcgttgtctgctctgtacctttgggagtaatgcagattcctcttcctctgttttagtgatttgtctagtaatcaccttggtggtttgattccacaagaggttggcatgctgcaaaacctgatattgctgtaagtctatgttttaccctctatcctataaagtagtattgcatggtttcaaaaggctgtttgcattggactgcatattaatttgagtattctgtttctcattactgcatattgatttacgtgaatttttttttgtcTtttttcagaaaactggaaagtaataatataactggggatgtttcttcacttattaactgcttcagtctcaatgtcttgtaagttatacacttgaaaagcaatatgaaatgatttcacacaattttttttggccatgaacctgtaagcttcatactgatagtgtgttactgcagaaacgtatcatacaacaacctggctggcattgtaccaacagacaataatttttcacgattttcaccggacaggtattttccttggggattaatcgatcgcttgaaaaagaactcgtaatacttaggcatctcaggcctcatcaataatctgatctttaattcagcttcttgggtaatcctggactctgtggctattggcttggttcttcgtgctactccaccagtcatgtgcagagatgtcagtaaaatgttacagctgttgcgttgctccgaagtgtaacttcacactgataaactttctaattttatatcctggatttttatgcagcctctgtctcaaggtctgcaattcttgggattgctgtagctgggcttgttatcctgctgatgatcctagctgctgcttgctggccacactgggcacaagttcccaaagatgtgtctttaagcaaaccaggtgatgcatctgcagaggtcccagtccattgattttacccatcaatttcggtagctgtttggcaagtgtcctctcgtcacactcaaccttgcaaatgatctattacatgtctcagactattgcatatgttcgccctctacttgatagatgcatttggttgttaacagagtgatattattattt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CDS seq

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Function LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ER2 [UniProtKB/Swiss-Prot:I1Z695]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_02g0035200 OsARC_02g0035200.01 Chr02 32794559 32801837 + NAM
CDS seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0777400 RBH 0.0 0.0 5.005215
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g53720 RBH 0.0 0.0 1.033815
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0777400 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0035660 RBH 0.026422 0.0 11.536481
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0035760 RBH 0.000000 0.0 4.930929
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0035640 RBH 0.081022 0.0 17.592972
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_06g0007120 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0035320 RBH 0.0 0.0 20.848778
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0537900 RBH 7.994918 0.128745 38.89032
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0035160 RBH 0.0 0.0 2.117641
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0568300 RBH 8.568282 0.031409 81.16082
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0035410 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0035240 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0035490 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0035450 RBH 0.0 0.0 1.661330
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0035030 RBH 0.068999 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G035700 RBH 0.0 0.0 8.810646
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0035410 RBH 0.0 0.0 6.637568
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