Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
Os10g0132700 | OGI:10007330 | 16/16 | Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Chr10:2044042-2057059 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | ATTTCTCCCCTTCTCTCCCCCGATCCAATCTCCCGGCGAGCGAGCGAGTGGAATCGGCGGCGATCATGGCGGCGACGGCGTTCCGGCGAGGTGGAGCACGCGTGCGACGACAAGCGCCGAGCGGCTTCCATTTGCCGTGGCTGGGGGCGCAGCCGAGAAGGGCGCCAAGCCGTGCCATGGCGTTGGCGGTCCGGCGAGGCGGCGGAGCCCGAAGGTAGCTGCCAAGCCGGCGCTTATCGTCCCCGGCGAGGGACGGTGAGGAGGGGACTCCAAGGCGGCGCGCGCATGGACGTCAACCAGCGCGACCGTGATGGAGAGGCGGCGAGGGCACGCCGAGGCACACGTGGGCGAAGGAGTTGCCCGTGCGGCGACGACGACGATGCCTTCTTCCCGGCGAAGCCCGTACGGCGGCGCTAATGTCGTGCGGCATCTCCGGTGGCTTAGGGCTTCAACGATCCGGTAAATTCCCGAACTCAAAACCCTAATCTTGAGTTTTATTTGGATTTAATTCGGGCTTTGGTCTTAGGGTTCTTAGAACCGAAATTAGGGTTCTTCGAATTTTGGGGATTTTAGGCCGATTTGCTCCGGCTTATTGGGGAAATTTCAATCTTGTTTATTCCCTTTTGCTTAATAGTGGGGAATTTCAATCTAGTTTATCCCCTTTCTTGTTTTGCTGAGTGCAAGCCGAAAGATTAGCTTCGGTCTAGGAATTCTTAGTGTGAGATTGGGAATTTCAATCTTGTTTATCCTAAACCTCTTCTTCTCTTAAATTCTACTACTAAGCAACGAAATTAAACCCTTCAATAATTTTGCTTCTACTGTTTGCCGAGACCACCAGCATAATATGGCTTAATATGCAACCAAGACTTAAGGAAATTAATCTAATCTTATTCAAAATTGCATCATGCCGAATCAATCTTGAACTTTGTAAGGGTGGCTTCTAATCACAGGGATGATGTGATTACGAGGGAACATGAAGGCTAAAATAAAGCTCTGATACCACAATGTTGGAATTTAATCCAATTAATTAATTGAGTCTTAACCTAAATATGATTACCTCTTGCTTATGCGGAAACTAATTGATCACTGACCTGAGATGAAGCATTGCTTTTCTTCTTTCTTCTCCTTTGTTTCTTCTGTTGTGAGATACCTCACGAACCCCTTCCAGTGTCTAATCGATCGGGCGATTGATTTAGGGTTTAGGGTTGGAGAGAGTTGAGTGGTCACCTGCCTCCCTCCTTTCTCTTTCTTTTATATAGCGACACTGGTGGGGCTCGGAGGTTTATCTCAATCTAAAATTCGAATCTATTTTGTACCGATCACATAAAACAGATTTATCTCTTAGTTTGTTTCTTGTTAGGGCCTGTTTGGTATAGCTCCAACTCCTAAATTTAACTCCAAGAGTTGAGTCTGGAGTGGAGTTGTGGAGCTGCCTAAACCCAGCTCCACAACTCTAGTTCATTTTGTGAGAGAGCTCCACCCAGCTCCACTCCCAGTTTTGGTGGAGCCGAAACTGTTTGGCTGAGCTCCAGCTCCAGAAGAGGTGAAGCTGGAGCTGGAGCTGTGCCAAACAGGCCCTTAGAATAGGAAAACCGGTGGGATTTTAACCTTATCCTAACTAACCGGCATTAGCCGATAAAATCAACCAACAGCTAGGTCTGGGTAGTGCTAGAGAAAGAGACGATCGATGTGAGAGCGTAATTACTTTACTGGGAGTGGATGGACTACTGATCACTAGTGATGAGTTTAGTCATGCTTTTCTTGGCCGGTTCATGTCAGAGCAGGCTGCAAGTTTGGCACACACAGTAAGCTGCACGGTTGGTGGTGGTTTGGTAATTCGGTGGTGTATCAAGCTTCATCCAATAAGAGATTAGGAGTAGCTATATTTATCACGTTATATTTTTTGCCACGAAATAGTGAGATCATTTTACATTGTAAAAGATTTTATACGTGTCTAATTTTATTCCAATACAATAGCTTCAATTCCTCTGTTTTAGAACTCAACTTTCCCATTTCGAAATTCCTCTTTTCAAATAGGACATCATTTTCTAAATTATGCACAAACTTATTTTTAGGAAATTTCCTCTATCTTTCTTCCTTCCTCCCTTTTCCCTTCCCCACCTCTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTATCTTTCCTCATTCCTTTCCTCTTCTTTTTCCCTCTCCTATCTCTAGGCTGACGTATTCTGCTTTCTTCCTTTAGCATACAAACGTTCATAAACTACAAGGATTAGGGATCTACCAAACATGCCCTTAGTACGAGGAATGCCAATATTAGAGTGACAAGTAGCACTATTCATAATAAATTTATTTTTTTATGATCTTAGTATGTTATTGTCTATAAAAGTGTCATGTTAGAGGTTGCAACAATAAGTAGTGAGTCCTTGATCAAGTGAAAACACGTCCACCACAAGGGAGCACAAAATATGAATATATGATCAACTCCACATCCCTTCGCCTACTAATCATGTGGCAGCTCATCCAGTTGCTCTTAAGATATGTCACCTATGTACCGTAAAATGGTAAAGTGATGTAGCCATCCATATGTGAAGGCCCATGAAACATATTTATAGACTAGTAGTGGCTTCTGACGTAGAAAGAGTGATATGGTCTATCTTAAACATATCTTAGTTGTGCAGGCATCTGTTGTAACTTCCGAGTGACAATCCATTTGCTCTTTAGAAAACAACATATTCGTTGATATAAATTAAGCTGCCAACATGAATTTGACGCGCATGCGTGAAGACCCATAGGGAAACATATGTATAGAATTTACAAGTTTTGTTGACAATAAAAGGAGTGATCCAATGCATGTGGGGAAATAATTGTGATTTTTCACGGTTTCTTTTTAATGGAAAAGTGAAGCCTCACGCTGTCACGCATGACTAGAAGACGGAGCAGGATTTGTCTTTTTTAAACCGGAGTGGGAACACACACAATTTATTTTAGGATTAGTAAATAGAAATGGATGCAGTCAGTGGATGCAAAATAGGATGAATAATGAGTCATGATCGGCGCAGGCAGAAAATATTATTTGATTCGCAAAAGCTTTGCGCGTCAATGGCTAAGAAAATTCAATTTACAACCGCGTCATGCTAGGTACTCCCTCCGTTTCATGTTACTACTCTAAGTTTGACTAACTCTATGGAAAAAAGTAATAGTACTTACAACACCAGCATAGTTTTACTAAATCTACAGTAAACCATCTTTGGTCGGTCAACAGATTTCACAGTAGTCTCGGTTGTATTAAAAACCGGGACTAAAAACATCTTTAGTCCCGGTTTAAAAGCTCAGGTGTACTTTTTGATCTTTAGTCCCGGATAATGTTATCAACCGGGACTAAAGATCTATTTGTTACCAACTGGGAAAAAAGATTGACATAAGCTTTACTCCCGGTTGGTACACCAACCGAGACTAAAGATCTATTTGTAGTCCCGGTTGATAACACTAACCGGGAAGTTACCAACCGGGAAAAAAGATCGACATACACGGAGAGACGTGCGTGTGGATCAGATCGACACATATCTCCTCCTCCCTCTCGGTTCTATCTCCTCCTCCTCCTTTAACTCCTCTCCTCCCCTCCTCACACCCTATCTCTTCCTCTCCTCCTCTCCCTTCCCCCTTCTCCCCATTTGCAGCGGCGGCGCACGGCGGCCGTGCGCGGAGGGCCAAGCGACCGGCGTGGCGGTGGCTGGCGGCCTCGCGGCGGCGCGCCGGGCTGCCTCGCGGAGGGTTGGGCGGCCTCGCGGGGTCGCGGCGGCTGGCGGCGCACAGGCGGGTGGCGTAGGCGCTTTTTTTTTTTTAAGATTTATGACTCGGATTGAGATTTATTTGATTTGTGTGTGATATGAATATATAATGTATTTGTGATGAATTTTGTAAAAGTTGTGATGTAATTTTTTTTTTAAGATTTTGTGATGTATTTGGAGATGATCAATTTGAGGATTTAGAGGTGATAATCAATTTGATATTTTACAATTCGGGAATGATTGATTTGGGATTTTGGGGGCGGGATGGAGTGAAATCAATATTAAAAAAAATAAAATGAAAAAAAGAATAAAAGAGCAACCGGATCTAGGCTGGCTGTTACCAATCAGGACTAAAAAGGCTCTATCTTTATTCCTAGTTGGTAACACTAACTAGGACTAAAAATAAATTTTTACTCCTCGTTATTTCACCCGGGACTAAAGATAGCGATCTTTAGTCCTGGATTTGTTTTCCAACCGGGACTACATGGGGTTACGAACCAAACCGGAAGTAAAAACTACTTCTCCACTAGTGCTATAATTAAATAAATTTTCATAATACATTCGTCTTGTGTTAAAAATATTACTACTTTTTACTATCAAACATAGAGTAGTTTGACTTTAACTAAAGTCAAAACATATTCTAACCTGAAACGGAGGGAGTAGTAGGCACTAGGGGAGAGAGCTTACGCGGCAGTTAGCAACTAAGTAAAGACGCGTCCCCTAGAAAAGCAAATGAGGAGGAAAAGATCGCAAGGGTGGATCTACTCCAAAAAGATCTCCCAGGAGCAGAGTACACTACTAAAAAAGGGAAAAAAGTTTCTCCATATGGCCCAAAACCTATTTTCGTATGCATAATGTTAGCCCGTCTGCCCCAAATGGTATGCGGAAATCTGAATTTTATGTACAGGTAGCACGTAAAAATAAAAATCCAAAAAAATAATAATATTAATAAAAAGAAACCCTAGGAATCTCGGCGGCGGCGGCGCAGATCCGGCCGTCGCTGTGTCGGTTGCCGCCGTCCGACGAGCTACTCACCGTTGCGCCTACCACCGCCCGAGTACCCGAGGAAGGTAGAGCCGTCCGCTATTCACCGCCGGCCCTCGCAGTCCACCGAGCTCACCGCCGCGCCCGCCACTACCCCGTTGGCACTCCCGGCTGCGGCGGCCACCGCCGCTTCTCCCCGAGCCCGTCGACGTCGCTGTTGCCCACCGTGCAACACCCGGCCAGGCCTGGCCTCTTCCGAGCGGAAGCCGCTGCTCCCAGCCATTCCCGCCCGCTGCCGTTGCTCCCTGAGCGTGTCGCCAAAGCCGTCACGTGCCGTCGTCGCGCAGCCGCCGTTGCCACCCCGTTGTCGCCGGGAAGTGAGGATGAGAGGAGATGAGAATGAGAGGAGGTGAGGAGGAAAAACAATCTACTCTCAACCCAATTTAACCAATTGAATCGTTTTTTCAATGTTGCAGCTACTTTTCACCTAGTTTGTCCATCTTTGTCGATTTGCGCTGTAAATCGTCTGCCTTCGCTGCGAGAGTACGAAATCCCTTTGTAGGTTTGTCCCGTAAACCTTTCATTTGCCCATGAGATGGGTGTTTATCCCTAGTTTCATCTAAATCAGCTCTGCTAGCCGGTTTAGTCTATCAAAACCCATCTTGATATCACCACATAGCATTTAGGTGTTCTGATCATTTATGTCTTTTTGCCAAAAAAAAGTTAAACATGATTTTTGGCAACTCCACTATGGATATAGTTCATCAACATCATGACCAAGCGTGAAGTGGATCAAAGCAATATCCTCCCCGTCACTTTGGAGGATTTGAACGAGGAACAACGCCAAGAGATAGAATGACATATGAAGGCGACACAAGAGGTGCTTTTGGCGGGATGCTTCGTCAAGACTCATTAAGGAGTTACTCGAAAGCCTGACCCAATGCCCCGTGTCGTTGTTAATGAGGTAAGCATTGCTGACATTGCTCTTTAGCATATTCCGTACATGAATCCGTTAATGCTACTTTTAATAATAAACTTGAGGCTGCTATGAGTTCATCTTTTGATAGGAGAGTTGAATCTTTTATGAGTTCCAAATTCGGCTCTCTCATGGCCGATTTGCCATCAAATTATATTCGATGTACTAGCCCAACCCCCATTCATCACATCTATAGCAAAACTGATGGAGCGGCTACACAATATACTAGGAGCGAGGCTAACCCTAGCACCACGGGCGGTCCAGCCATTCCTTTGGCTGGTCTGACCTGCTCTCCTGCCTTCGGTTTGACCAGCCATTAGACTGCTCTGACCGTGTAGACCTACAGTCCGACCACACCTCTGACTGCCGGTCAGACCGGGCCCTAGACCGATCAGACCGACACAATCATGCTCTGATAATTCTGTTTTGCACCATTATCCAGTACCTAATCCACTAGTAGCTCCTGCTAATCCATATATTCATCGACATGTGCCTAATGTTTGCAATGATCCTAATGGTGGATACCCTCAAGATGTTAGATATGGCCAATATAGCAATATTGCGCTGACACCTCCTTTTAGGCCATAAAATCCACAACCAAGGCCTGAAAATATGGAGGAGTGTGTGAGGAATATTATTAGAGAAACTTTCGGGATTGAGTCGTATCTTGATTATTTTGATAATATCCCATATCCTTGTGGTTTTAGAGTTCCTGAATTTACTAAGTTCAATGGTGAGGATAGTAGGCCACATGGGACCACATAGGCCAATTTTTAGCACAATGTGGTGAAGCTAGTAAGACAGATGCTTCTAAATTATGCTTGCTTTCTTTATGTTTGTATGGTACTGCTTTTACATGGTTTAATTCTTTACCGGCAAATTCTATTCATACTTCGGCTCAATTAGAACAAAATTTTTTTTGATTATTTCATACATGGTTTACTGCTTCCTACTAAAGAAAGATTAGATGGCCAATAATTTCTTAATGTTAGTCAACTTATGCAAAAAGCTCTAGCTCAAGAAAGCCGAGTTAAAGAAACTAAGATGTTTGTTAGGTCTAATGATAAGAAGCCTAATGTTAGTATTGTTGATTTCCATGATGAGAATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGGTGATCATGATATTTATATTGTTGAGTGGTCATGGACTAATAAGAATAAAACTTTTGTTTGTTCTAATTTGATGCCTACTCCTCGCAAGGATCGACAAAGTGAGATTAAGCATAGCTTTCACGTGGTCAAGTGTGATAAGATTTCTGACTATCTTTTACAATAAAAACAAATTAGGTTACCCGAAGGCCATGTCATACCATCTTTGGAGGAATTGAACTGTCATTCTTGTTGTAAGTGGCATGATTCTTATTCCTATACTACTAATGAATATAATGTGTTTCGTCGACAGGTTCAATCGGCTATAGAAGAAGAACGATTGAAATTAACTGAAGGTTCTAAGATGAAGCTAGATCATGATCCTTTTCATGTGAACACTATTGATTTTAATGATAAAAATGTGTTGATTCGGCTAGAAGTAGGTAGTGATTGGAGAGCCTAGGCCTAAGATGATTGTGCCAAAAAGTCCAGGAGTTGGTGTATGGAAGGAAAATAGAGGTGAAGCTTCGAGGTCAAGAACATCACAAAAGCCAAACGTGTCTTCTGAGATGCTTTTGAACAAGTATGAGAAGAGAATTGCTGAGCAACGTTCTAACAAGGGTAAAAGACCAAGATCACCTCCTAGGAGAGATTTGGTTAATCCCCAAGACAAGTGGAGCTGCCTTTTCCTTACAATCCACAAAGTCATGCAATGGGGGCCTTGTCCAATGCCGCCGCCGGGTTATCCTTTTCCTTACTTCATGCCATGGGGGGCACCGCCACCAATGTACGAGTTCGTGCCACCAACGGTGCTAATGCAATTTCATCAAAGTTGGGTGGAGCCATGAATGTCAGTGCATGAGCAGTTGTTTTCGTCAAACAAAGACTGGTTTCAATCAAAGAATCGGTTTGAGGAGGAAAGAGGTGGAGGAAAGCGCGCCAAGGTGGAGACAAGGACTTCAGAGCTGATTGTTGTCAAAGTGGGGTCTCATGATTGTGCCAATACCTACTGGAGATGAAGCCAGGGTGGTTCAAAGCGAGAAAACTGAAGCCGAGACAATCACGGCGTAGGACACCAGTGAAGGTGGATGCCTAAGAATTTGACGGCTTCACAAAATAGGAGGTTGCAATGTCTTCGTGCTCATGAGTTGAAAGAAAAGAAAACAGAAGTGTGGAGAGATAGGAGATTTAATGAGTTGCGGCTGCCGCCAAGGCAAGAGTGGAGACCTAAGCCAATGGAGATTGAAAAGCCGGTGGTTGCTCAAGATGAAGAGGGAGACTTGAAAGAGGATGAGCCACCGGTTGTTAATTAGCAATGATTCACCACCAACGGAGAACATGGATGTCAATATGGTGTGCATGTTGCCTATGGAGTTCCGTGCCACGGATGAGGCTAGAATTGCCTAATTTCACAAGGACCAAGAGATGCAGCTTTTGAGAAGCCCGATGAGTCTAACCGTCATATGAGGCCTCTCTACCAAAAGGGTCACATTGATGGGAAGCCGATCTCTAGGATGTTGGTGTATGGAGGTGTCGCTGTGAATTTAATGCCATACTCACTATTCAAGAAGTTGGGGCGTGGAGATGAGGATTTGAAGAAGACCAACATACCACTCAACGGCTTTAATAGTGAACCAATGGAGGCCAAAGGTATCTTTTCTATGTAGCTTGCCCTGGGGAACAAAACGTTGCCAACCGCTTTCTTCATCGTCGACGTCCAAGGTAACTATAGTTTTTGTGTTAGAGGTGACACATAGTGGCAGGTGAGCGTTCAAGAATATATTTATGTCACGTGCTTTTTATGGAAATTTGAATGCCATGCAAAATGTAGTAGTATGGTGCGTAGCTATATTTTTTTTGTCATGTTGAATTTATTAACGCGTTGAATTTATAAATTTTATTCCCTTCGATACCATCTATCTAATTTATTTTTGTAAAATGTTTTCAACGATATATATTATTCATTTTCAATTTCTTACAATGTTTTATTGCTATTTGGTTGCCATTAAAAGAATAGGGTTCTATGACCAAATGATTATTGTCATATATAGCATATAATATGAGCAATATTGATCTCAAATTATTGGTTTATATTTCTTAAAACTCATGGCAAACTATCTAATTGTATGTATGTAATGGAGGGAGAATACACATGTATATATTTGAGGAAAGACATGATACATGTAGAAGGGGATGGAAGGTATTTGTGTATTTTTAGTTTGATCTAATCCATCACGTACGGACAGGCAAGTGGAGGTGGGAAGGATCCTTTAAGGATTAAGGGTTAATTGGATACATGTCACAGCAACTTTGCAAAATTAAAAAAAATGCCACTATTATTTATCATATTAGCTACATGCCACTAGAAATTTTTAAAATTGAAACCATACCATTCCCGCCCCTTTTCTGTCTCCTCTCTCACATCCCCCTTCCGTGAGGAGGCGGAGGCTGCCCCACGCTCTTGTCCATCGGCGACGACGGTGCCACGGCGGAGCGCCGCCCAGTAGCGGGGGTGGCGGGGGGTCGTCGGGGTCATCGAGTTGGAGAACAAGATGGTGGTTGGAGGAGGGGGGTCGGTGGCGCCGAGCGGGGCGAAGCTGACGTGCCTCACCATTGACCACCGTTGGAGGGCTCGGGAGCCGCTCCAAACCGTCCTTGACGCCATCTGCGGCGGGATGTCTCTGGAGCTGTCGCCGCCGCCGTCCTCGATGCCATCCGCGCAGGAGGGCTCGAGAGCCGCTGCCGCTGTCCTCGATCTACGACGGGAGTGCTCGGGAGCCGCCGCCTTCGTTGCCGTTGTCCTCTTTGCAGTCGCGCCAGATGGAAGAAAAGATGGGGAGATGGAACTGACATGTGGGATGGGAATGGAGACGGCGCGAGAGAGGAGACGGAAGAAGGGACAGGAGTGGCATGATTCCAATTTTAGAAATTTCCAGTGGCGTGTAGCCAATATGACGAATAGTAGTGATATTTTTTAAATTTTGTAAAGTTACACAGTGGCATGGATCCAATTAACCCTATAATATAACGGATGAAAATAATGGGTCCACTTTTTTTTCTTAGAATTTTTGCCTTTTTTCCCAATTTATTAGTGTGACACGTGGCAGTCTTAGAGCATTTGTAGGAGTGCCACGTGGAGGCTTAGGAGCGTTTGTAGGAAGTTTAATTGACTTTTAGTATTTAATAGAAGATAATAGATAATAGATAGATATTTGCACCTAATGAATTGATAATTTAGCTAATGTATTTTTTTAGTTGTACTTGAATTGTACTCCATTTATTCAGGGTGGTGATCAAATTGATTCTTTAATTGCTTTTGTTCATTTGTTCACTTTAATTTGTCCGATTGATAAGATTTAACATACTGATTTGCAAACAAATTACTCCAATATATAGCACGATGTAAAGTGTTTTCAAAAAGTTTAAAACATTACGTACTTTTATTATTATAGTATTATTCAAAGTTTTAGGACGCTACAACGTTCTCCCTCAGATCAGCCGCCACCGACACCCATGCTCACCATAGGGGATCGATCACCTGTGTGTAGCCATCGTCCATCCGCACGTCACCCGGCCGCCGTCGCCTGCGTGACCGGGGTGAGCGTCAGAATGGGGAACTTCCAGAGGCCAGAGCGTGTGCCTTAGCGACGCCTCATCCGTCAGCGACAGGTTGTAATGTTGTACTTGTAGAGGTGAAGGTGGACGATCTCGTCAAATATCGTGTGTAGTCTTGCGAGTTGCACTCGTTTCTCCAGCACAAGTTTCAGTCAGGCTTTAGTGACATGGAATTTTAATTGTTCCTGGCTGGTTCGGTGGTCTGCAGGTAGTGATGACATAAGAAGGATATGATACTCCCGGGTTGGGGATTTTCCATTTTCTGTTAAAGCACCAGATTACATTTGTCGGCCACCACACTTTAATTTACATGACAGTCACTTCTTCCACTTGCCAACTTGGAGCCATTCTCTCTAATCTAATATATCCACCTTGTTGTACAGAAGGTCCTGCATTACTGCAAACGGATCCTCATCAGGGGAAAGCAGTACAATGGAGCGTCGTTGACTGATCACCAACCCCAGCAAACACTAGATGCAGCATACAAATGGCTTAGCTGAGCACAAGAAGTTATAGGCTGATGGTAGAAGCTAGGAAGGAATCTGAAGGAGCTCTGGTTCCTGGCTTGATTGATCTTGCTGCTGCTTCTCCGATCCTCCGGCCTCTGCTATGTTCCTCGACTCCTGCTCCGGTTGCTATCTCACACATCTCTCTCAATTTCTACTGATATATTTTTTCAGTCCTTTATTTCCAGACCACCAAAGAACAAACTAAAGCTCAGATCGATCGGTAGCCATGGATGCCGTGGTGAGTGTCTCACATGGGGCACTGGGGCCGCTACTGGGCAAGCTCAGTACCTTGCTCGCAGACAAGTACGCGTGCTTGAAAGGTGTCCGCCGTGAGATCCATTCCCTAAGATCGGAGCTGAGCAACATGCAAGCGGCGCTCCACAAGTATGCGTCACTCGAGGACCCTGACATCCAGGTGAAGGCCTGGATCACCGAGCTGAGGGAGCTTGCCTATGACATCGAGGACTGCATAGACAAGTTTATGCACCAACTTGGTGCCAACGGTGAGCAGCACCGCACCAGTAATAGCATCGAGGACTTCTTTAGGAAGAGTATACAACGTCTCAAAACTCTTGGCCCGAGGCATAATATTGCTGGCGAGATTGAGGAACTGAAGGCACGAGTTATCTCGGTGAGAGATCAAAAGAACAGCTACAAGCTTGACGATATTTTTTGCAGTAGCTCTAGCAATACCAATGCTTCTGTTGATCCACGGTTGGCTACTCTCTTCGCGGAAGAGAACCATCTTGTCGGTATAGATGGCCCAAGGGTTGAACTTGTCAATTGGTTGGATGCAGAGAGCAGGTTGATAAAGTGTCGCAAGGTATTATCTATTGTGGGGTTTGGAGGTCTTGGGAAGACAACTCTAGCGAATGAGGTATATCGTAGGGTTAAAGTTCATTTTGACTGCCATGCATTTGTGTCAGTGTCACAAAAGCCCGATTTCAAGAATATCTTCAAGGATATAACATACAATATGCCTACGAAAGATGGTTTCCTCAAAGATATTGACACATGGAATGAAAAGAAATTTATTGAAAAGCTAAGAGAACTACTTGTGGATAAGAGGTAATTCTCTAGTTCTTTTTTCCCCTCTTCGATAAAGTTGTATACCCACACTCATGATATAATAGAGTGGTTTTTCATTCACAAACTTATATTGTTGATAAACTTTAACTAGGTATCTTGTTATAATTGATGATGTATGGTCTATTTCGGCATGGAAAGCTATCACGGTTGCATTCCCGGATAATGACTGTTCCAGTACAATTATAGTTACTACACGCGTTTCCGATGTTGGATGGTCATGCTGCTTAAATGGCATTGACCGCAATTATCAGATGGAACCTCTAAGTGAAGTTCACTCTGGAAGACTATTTTGCAAGAGAATTTTCAGTACAAATGAGGATGGCTGCCCAGATATTTTACAGGAAGTTTCAACAGATATATTGAAGAAATGTGGCGGTCTTCCATTAGCAATTATTAGCATATCTGGCTTATTAGCAAATAGACCAGTTATCAAGGAAGAGTGGGAGAAAGTGAAAGAATCGATTGGTTTTGCATTGGACAAGAACCAAAATCTAGAAGGAATGAAAATCATACTGTCCCTTAGCTTTAATAACCTTCCAAACTATCTCAAGACTTGTTTGCTATATTTGAGCATATTTCCAGAGGATTGTATTATTGAAAGAAACATGGTAGTATGGCGATGGATAGCTGAAGGCTTTATCTCTGAAGACTGTGGGCAGAAATTGGAAGATGTTGCGGAGAGCTACTTTTATGAGCTCATCAACAAAAGTCTGGTTCAACCTGTGGACATTGGTTTTGATGGTAAGGCTCGTGCATGCCGTGTCCATGATATAATGCTTCAATTTATCTCCTCAAAAGCAACAGAAGAGAATTTTGTTACATTATTAGGTGGCCAAACTAGAAAAACGAATTCGCATCATTATGTTCGGCGATTATCCATTCAGGACACTAATAATCATTTGTCAACTCTGTTAGCAAACAAAAATTTATGCCATGTTCGATCCC
More
|
||||||||||
CDS seq | ATGGATGCCGTGGTGAGTGTCTCACATGGGGCACTGGGGCCGCTACTGGGCAAGCTCAGTACCTTGCTCGCAGACAAGTACGCGTGCTTGAAAGGTGTCCGCCGTGAGATCCATTCCCTAAGATCGGAGCTGAGCAACATGCAAGCGGCGCTCCACAAGTATGCGTCACTCGAGGACCCTGACATCCAGGTGAAGGCCTGGATCACCGAGCTGAGGGAGCTTGCCTATGACATCGAGGACTGCATAGACAAGTTTATGCACCAACTTGGTGCCAACGGTGAGCAGCACCGCACCAGTAATAGCATCGAGGACTTCTTTAGGAAGAGTATACAACGTCTCAAAACTCTTGGCCCGAGGCATAATATTGCTGGCGAGATTGAGGAACTGAAGGCACGAGTTATCTCGGTGAGAGATCAAAAGAACAGCTACAAGCTTGACGATATTTTTTGCAGTAGCTCTAGCAATACCAATGCTTCTGTTGATCCACGGTTGGCTACTCTCTTCGCGGAAGAGAACCATCTTGTCGGTATAGATGGCCCAAGGGTTGAACTTGTCAATTGGTTGGATGCAGAGAGCAGGTTGATAAAGTGTCGCAAGGTATTATCTATTGTGGGGTTTGGAGGTCTTGGGAAGACAACTCTAGCGAATGAGGTATATCGTAGGGTTAAAGTTCATTTTGACTGCCATGCATTTGTGTCAGTGTCACAAAAGCCCGATTTCAAGAATATCTTCAAGGATATAACATACAATATGCCTACGAAAGATGGTTTCCTCAAAGATATTGACACATGGAATGAAAAGAAATTTATTGAAAAGCTAAGAGAACTACTTGTGGATAAGAGGTAA
More
|
||||||||||
Protein seq | MDAVVSVSHGALGPLLGKLSTLLADKYACLKGVRREIHSLRSELSNMQAALHKYASLEDPDIQVKAWITELRELAYDIEDCIDKFMHQLGANGEQHRTSNSIEDFFRKSIQRLKTLGPRHNIAGEIEELKARVISVRDQKNSYKLDDIFCSSSSNTNASVDPRLATLFAEENHLVGIDGPRVELVNWLDAESRLIKCRKVLSIVGFGGLGKTTLANEVYRRVKVHFDCHAFVSVSQKPDFKNIFKDITYNMPTKDGFLKDIDTWNEKKFIEKLRELLVDKR |
||||||||||
Function | Disease resistance protein PIK6-NP [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2QZF1] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
Os10g0132700 | Os10t0132700-01 | Chr10 | 2044042 | 2057059 | + | irgsp1_rep | ||
CDS seq | ATGGATGCCGTGGTGAGTGTCTCACATGGGGCACTGGGGCCGCTACTGGGCAAGCTCAGTACCTTGCTCGCAGACAAGTACGCGTGCTTGAAAGGTGTCCGCCGTGAGATCCATTCCCTAAGATCGGAGCTGAGCAACATGCAAGCGGCGCTCCACAAGTATGCGTCACTCGAGGACCCTGACATCCAGGTGAAGGCCTGGATCACCGAGCTGAGGGAGCTTGCCTATGACATCGAGGACTGCATAGACAAGTTTATGCACCAACTTGGTGCCAACGGTGAGCAGCACCGCACCAGTAATAGCATCGAGGACTTCTTTAGGAAGAGTATACAACGTCTCAAAACTCTTGGCCCGAGGCATAATATTGCTGGCGAGATTGAGGAACTGAAGGCACGAGTTATCTCGGTGAGAGATCAAAAGAACAGCTACAAGCTTGACGATATTTTTTGCAGTAGCTCTAGCAATACCAATGCTTCTGTTGATCCACGGTTGGCTACTCTCTTCGCGGAAGAGAACCATCTTGTCGGTATAGATGGCCCAAGGGTTGAACTTGTCAATTGGTTGGATGCAGAGAGCAGGTTGATAAAGTGTCGCAAGGTATTATCTATTGTGGGGTTTGGAGGTCTTGGGAAGACAACTCTAGCGAATGAGGTATATCGTAGGGTTAAAGTTCATTTTGACTGCCATGCATTTGTGTCAGTGTCACAAAAGCCCGATTTCAAGAATATCTTCAAGGATATAACATACAATATGCCTACGAAAGATGGTTTCCTCAAAGATATTGACACATGGAATGAAAAGAAATTTATTGAAAAGCTAAGAGAACTACTTGTGGATAAGAGGTAA
More
|
|||||||
Protein seq | MDAVVSVSHGALGPLLGKLSTLLADKYACLKGVRREIHSLRSELSNMQAALHKYASLEDPDIQVKAWITELRELAYDIEDCIDKFMHQLGANGEQHRTSNSIEDFFRKSIQRLKTLGPRHNIAGEIEELKARVISVRDQKNSYKLDDIFCSSSSNTNASVDPRLATLFAEENHLVGIDGPRVELVNWLDAESRLIKCRKVLSIVGFGGLGKTTLANEVYRRVKVHFDCHAFVSVSQKPDFKNIFKDITYNMPTKDGFLKDIDTWNEKKFIEKLRELLVDKR
More
|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | None | None | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_10g0132700 | RBH | 2.224965 | 3.007854 | 2.847011 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os10g04342 | RBH | 1.600915 | 1.859511 | 0.773343 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os10g0131000 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_10g0001660 | RBH | 0.845731 | 2.095128 | 3.416203 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_10g0001630 | RBH | 0.608830 | 0.891640 | 4.772571 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_10g0001620 | SBH | 2.580737 | 6.798419 | 5.609202 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_10g0001560 | SBH | 0.279214 | 0.112165 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_10g0001460 | SBH | 1.738933 | 3.630061 | 4.305751 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_10G0033900 | SBH | 0.6370025 | 3.3276555 | 4.9562595 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_10g0001710 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.030543 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_10G0040800 | SBH | 0.0244975 | 0.069343 | 0.007359 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_10g0001500 | SBH | 0.0 | 0.056308 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_10g0001640 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_10g0001690 | RBH | 0.0 | 8.486369 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_10g0001480 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_10g0001540 | SBH | 0.0 | 0.520800 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_10G001550 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.291640 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_10g0001420 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.231602 |