Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
LOC_Os10g21070 OGI:10002700 | 16/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU Chr10:10666916-10675967
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Uncharacterized mitochondrial protein AtMg00310 [UniProtKB/Swiss-Prot:P93295]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
LOC_Os10g21070 LOC_Os10g21070.1 Chr10 10666916 10675967 + MSU_osa1r7
CDS seq

ATGGAGGCCGTAGCACTCTCGGCGCAACACGGACGCCAGCGGTTTGCGGAGGGTACGATTGTGGAGGAGAAAAGTGGCATCAGGCGAGATGTAACACTGGCTCGGTCCCCCTGCTCAGATTTCACACTGTGGCGGCCGGCGGCGGAGCAGAGAAATGACAGCATTGTTCATGCAAGGTTTGTTGTTTGTGTTGAGCTCAAGCTCCTTAGATTCAGTGGCGAACTCCGTGGAGAATTCCTGCTGAGCCTGGTGAAGCCCACAAGAAAATTTGTAGTTCATCAACAAACCTTCAATTGTGCTTTTTATGGAGGCCAACAAAAGGGATTACAGGTTATTAAGCGGGGCTGCAAGGAAGAAAAAACAAAGGCAACTGCCAATGACATAAGCAATCCCAATGGTAAATTGGCAATCCTATTGGTCGATTTCAGGGTTGGAAACCTCGATCTTGTGAACGAGGGTCGGCTCTATGCCGGGGTCATGGATCTGGATGGGGATCCACCCCTGGAGGATGAGCATGAAGTAGTCCACTCTCAACTTCCAGAGATTGCCACCTCTCTGGAAGCGATGACAATCACACCAACAAAGGAGATCAGAGTGAGGTTGCAACAGTCTCCTGAAACGGCAACAGTTCAAGCCACTCACAACCTCCTCATGAAGGTTGGACATTCTGGAGGCCAGCAGAGGCAGATCCCTTTGGAGGCTTTGAAGAAATCAATGGCAAAAGCTTGGCAAAGAGTTTATCTTGACATCTCTCAGGTAGAAAGCAATCTCTTTATGGCTCATTTTCGTAATTATGAAGATCTGTCCTGGGTTTGGCAAAAGCAACCGTGGTCTTTTGGCAGTGATGTTTTTCTGCTTGAATGGGTTTCTTTGGATGAGAAAATTAAACCTATGTCAGCTTACACTTTCAAGCATCTTATGGTTAATGTGCGTATCTATGGCATTCCCCCAAGTCTTAGAAATGTTAAGAATGTCAAGTTGGCTGCTGAAAACATAGGTCAAATCTCAAAAGCTGAACCAATAGATCCAGATAGTTTGCTGAGGAATCAGAAATTTGTTTCTATTAGAATCAGGATTGATGTGGAAAAACCAGTTCCTGATCATGTTATCTTGGAGCTTCCTGATAAATCTGAACTTAAAGCTTTTCTGCATTATGAAAGAACTCCCATAATATGTACTTTTTGTGGTCTCCTCTTCCATAATGTTCAGGTCTGTCCTCAAAGACAAAGAATTATCATTCAATTTCCAGATGCATCCGAGGAAGATCTTAAAGATAAACTAGGAAAGTGGATCACTCAGATCGATTATATGCCATCAGAGGCATTTTTGGATATGGAGGAATCCAACAAAAATTCAATTGTGGAAAAATTCAGGCAACATTTTTCTTCTCCTCAATTCAAGAACATTCAAGAACAGCAGAAGCAGCAAGAGAGAGGAAGTGGGACCAGCCAGTCATTAATGCCCAAGCTAGATTGGAAAAAAGCGAGTGAGAAAGCTTTGACTTTAGCTGGTTGCAGCACTGTTCAAGGGCCCCCAAGTCAAGCTGTTCACACTACCACAGTAGGCAAACAATGTGAGAAAAAAGACAAAGAACCTGATATACAAAGTACACCAGAAGTTGGTACCGAAGAGATGTTAGTACATGGAAGTACAGAGAAAAAGAAGCTGGTTTCAAGTACTATAGAGGATCATGTCAGCTGCAACTCAAAGAATGTCAATACTGCTGGTAAGGTGCATCAGATGGAACCAGTCCAGTCTGTTCCATTGGTTCACCGAGTTTCACCCAGTGCAAGTGCCCATCAGAACAGTTTAGTTAACCCTGCTATTGGCACCAACGAAGTGCAACACAGAAGAAGCACAAGAGCTACCAAGATTTATGAGACAGCCTCACAACATTTAAGTAAGAAGAGAGGGTTTCATGAAGCAGCCCATGAATCTACCAAACGCCATTGCTCCCCAACTACTTCAGCTACCTCTTCCTTCTCGATTGTGGGAGGTGAAGAACATGGAGGGATTGAATCAAGAAGAGCTTCTCCAACTAACCATCATTCAGCACCAATCAGGGTTCCAAGTAGAAGAGGTGGGCAGAGAGCTACAAGATGGGATCAGAGAGGAGGTTATGGTGGTGGAATGGTGACCTCCACTTCTTGGAGACCTCTTGCTGCTGCTCATTCTGATGTCATTCAAAGAGATGCTCCAAGATCCCCTCAAAGCATTAACAATTTTCATAGCAGGAAGCATACTTGGAGTGCTTTGGAGGTGCATCATGATATCTTTGTTGATCAAGCTGCTGGAGATACTCAAGGGGGTGGTGCAAGTGATGCTGGAGCTAGCTCCAGGCTGATACTGGCTACAGATCCTAGGGAATGCAATGTTTCAGAGATTCAGCTTGTTGATCCCAGTGCTGGAAACGAAACAAAAAGCTCTAAAGTCACTGCTTCTGATCTGATCCATCATTTTCATGTAGCTAATAGTCATGTGGTTCCTGTTGATCAAGCTTCTGGTGGTCTGTGGCTGATGTGGGATGAAGACATGGATCTTACTATAGTTCAGTCTAGTATTAATTATATCTTAGCTTATGGAGTCTATAAGAACTCTGGTCCTATTTTCAATCTTCTTTGTATTTATGGTGATCCTAGTCACAGGGCCACTAGTGCCATGTGGAGTGAAATCTCCTCTTTTGTTGTACATAGTAGTCACAAACCTACCTTTTGTATGGGAGACCTTAATGAGATCATGCATGCTAATGAAAAGTATGGTTTGGCCCCTCCTAATCAGAATCGTATTAATATTTTTAAGCATCATGTCAATAATCTGGGGCTTATGGATATGGGTTATAATGGTCCAGCTTACACTTGGTCCAATAAGCAACAGGGTAAGGATCTGGTTTTGGAAAGGTTGGACAGATGTCTTGCAAATGTGGAATGGTGTTTTAATTATCCAAATACCACTGTTTATCACTTGCCCATGTTGTATAGTGATCATGCTCCCATCATTGCCATTCTCAATCCGAAGAACAGGAGGCCTAAAAGATCTTTCATGTTTGAAAATTGGTGGCTGCTTGAACCAGATTTTAATCAGCATGCTCATTCAGCCTGGCTGCAGTCTGTAAACTGTCATTTTCAGAGAAGAACAACCTTGTTAGCAAGATCCTTAACCTCTTGGAGCAAAAAGAAGAAACCTCTTCAGCAGCAATTGGATCAGTTGGAAGAAGATCTGTTGAAAATTCAGAGTTCCCCCGACAGAGAACATTTGTACTTTGAGGAGAAAAGGATTGTGCAACAACATGATATTACCATGCAGAAGCTGGCCGATTATCACAAACAGAGAAATGATGCCACTCCTTCTATGGATCAAAATGACAATGATGTAATTTTTCCTCCCCCTGAAATCCCTTCTGAAAATGACATCCTAGAAATTCTAAAGCAAATGCGAAGAGATGCCTCCCCAGGGCCAGATGGTCTCAATGTTGCATTTTATAGAGCTGCCTGGAATTGGATAAAAGACGATGTTACTGCCATGGTAGGCTCCTTCTATGAAACAGCTCATCGAGGTATTCGTCAAGGTTGTCCTTTATCGCCTTATCTTTTTGTCCTTGCGATTAATGAACTTTCTGACCAGCTTGCAGATGCAATTCAAAGGAACCACATTTCAGTAATAAAGTTAGGACAAAATGGTCCTTCCATTCATTCTCTGATGTTTGCAGATGATCTAATCATTGTGGGGCAGGCCCAACAAGAGGAAGTCAGGAAAACCTCTGAAATAATCAATTCCTTTTGTCTCAGATCAGGCCAGACTCCAAATTGGGGCAAATCTTCCATCCTGTTCAGCAAAAGTACTCCTGAAGAGCACAAAGCATCTAGGGCATCCTCTTCTGGTAGGCTTGCCCTCATTAAATCTGTCTTTGCTTCCATTCCTATTTATTACATGTCCATCATGCTTTTCTCAAAAAAATTGATTGCTAAACTAACTGCTATTATAAGGAAATTTTGGTGGACAGGAATTCAAGCAGATGGTGGCAAAAAAGGAATGGCTCTTAGGTCTTGGAAAGACATTTGCAAACCTGTTTCTGAGGGAGGCTTGGGCATAAGAGATTTGATGGCTGTAAATAAAAGTATCCTTGTCCAATCTGCCTGGAGAATTCTTACTAATCCAAATGATCTTCTATCCTCTGTCCTAAAATCAAAATATTTTCCAAACACTTCCTTTTGGAAGGCTAGAACAGATATGCCAAAATCTGCTTTCTGGTCTTCTATTCTTCAGGTTCAGATTATGCAGGGAGAGGAGGAAGATAGGCTTTGCTGGAAGTACACACCCTCAGGAGTTTGTTCAGCCAAGAGTGCTTACAAGACAATTTACAATGAAATGTACCCCAATCAAAATCAGATTTGGAAAGCAAGGAATGATATCAACTTCAAAACAAAGATTTGGGAGCCACAACAAGTGTGCAATGCTGCGCAGGCAATGGCAAAGACATATGAAAGTGTTCATCAAATGGAAGAAGACAGTTGCCAAGACTTCAATCGGGCTGAAGAGAATAATATAAGAAATTCTATTGTTAAAATTCCTACAGGAACAAGAGTTTATGTGGATGCCTCTTGGAAGGAAGAGAAAATAGGAGTAGGGATCTTCATCCACAACCCTAGCAATCACAATGCTATTGTCATCAAAGCTCAAAGTCTCAATGCAGGAACTCCTTTGCTAGCAGAAGCTGAAGGATTATTTTTAGCTATGCAAATTGCTCGTCATCTTCAGCTGCAAGACCCTATTTTTCTCTCAGATAACAGTGAGATAGTGAATGTTGTGCAGAACGAGGACTACATACAAAACCCCGGACATTGGTCTCTGAGACCAATTCTTTCAAGAATTAAAAATTTTCTGCAGGATCAACAAGTTCGAATCATTTGGATCTCTAGAGAGCTCAACAAAGTTGCAGATGGCCTTGCAAAGTCAGCAAGACAAGCTCAGACTAACAGCTGCTTAGCTTTTGATTGCTCTAA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More
Protein seq

MEAVALSAQHGRQRFAEGTIVEEKSGIRRDVTLARSPCSDFTLWRPAAEQRNDSIVHARFVVCVELKLLRFSGELRGEFLLSLVKPTRKFVVHQQTFNCAFYGGQQKGLQVIKRGCKEEKTKATANDISNPNGKLAILLVDFRVGNLDLVNEGRLYAGVMDLDGDPPLEDEHEVVHSQLPEIATSLEAMTITPTKEIRVRLQQSPETATVQATHNLLMKVGHSGGQQRQIPLEALKKSMAKAWQRVYLDISQVESNLFMAHFRNYEDLSWVWQKQPWSFGSDVFLLEWVSLDEKIKPMSAYTFKHLMVNVRIYGIPPSLRNVKNVKLAAENIGQISKAEPIDPDSLLRNQKFVSIRIRIDVEKPVPDHVILELPDKSELKAFLHYERTPIICTFCGLLFHNVQVCPQRQRIIIQFPDASEEDLKDKLGKWITQIDYMPSEAFLDMEESNKNSIVEKFRQHFSSPQFKNIQEQQKQQERGSGTSQSLMPKLDWKKASEKALTLAGCSTVQGPPSQAVHTTTVGKQCEKKDKEPDIQSTPEVGTEEMLVHGSTEKKKLVSSTIEDHVSCNSKNVNTAGKVHQMEPVQSVPLVHRVSPSASAHQNSLVNPAIGTNEVQHRRSTRATKIYETASQHLSKKRGFHEAAHESTKRHCSPTTSATSSFSIVGGEEHGGIESRRASPTNHHSAPIRVPSRRGGQRATRWDQRGGYGGGMVTSTSWRPLAAAHSDVIQRDAPRSPQSINNFHSRKHTWSALEVHHDIFVDQAAGDTQGGGASDAGASSRLILATDPRECNVSEIQLVDPSAGNETKSSKVTASDLIHHFHVANSHVVPVDQASGGLWLMWDEDMDLTIVQSSINYILAYGVYKNSGPIFNLLCIYGDPSHRATSAMWSEISSFVVHSSHKPTFCMGDLNEIMHANEKYGLAPPNQNRINIFKHHVNNLGLMDMGYNGPAYTWSNKQQGKDLVLERLDRCLANVEWCFNYPNTTVYHLPMLYSDHAPIIAILNPKNRRPKRSFMFENWWLLEPDFNQHAHSAWLQSVNCHFQRRTTLLARSLTSWSKKKKPLQQQLDQLEEDLLKIQSSPDREHLYFEEKRIVQQHDITMQKLADYHKQRNDATPSMDQNDNDVIFPPPEIPSENDILEILKQMRRDASPGPDGLNVAFYRAAWNWIKDDVTAMVGSFYETAHRGIRQGCPLSPYLFVLAINELSDQLADAIQRNHISVIKLGQNGPSIHSLMFADDLIIVGQAQQEEVRKTSEIINSFCLRSGQTPNWGKSSILFSKSTPEEHKASRASSSGRLALIKSVFASIPIYYMSIMLFSKKLIAKLTAIIRKFWWTGIQADGGKKGMALRSWKDICKPVSEGGLGIRDLMAVNKSILVQSAWRILTNPNDLLSSVLKSKYFPNTSFWKARTDMPKSAFWSSILQVQIMQGEEEDRLCWKYTPSGVCSAKSAYKTIYNEMYPNQNQIWKARNDINFKTKIWEPQQVCNAAQAMAKTYESVHQMEEDSCQDFNRAEENNIRNSIVKIPTGTRVYVDASWKEEKIGVGIFIHNPSNHNAIVIKAQSLNAGTPLLAEAEGLFLAMQIARHLQLQDPIFLSDNSEIVNVVQNEDYIQNPGHWSLRPILSRIKNFLQDQQVRIIWISRELNKVADGLAKSARQAQTNSCLAFDCSNISHICSRDVCPTKRALSFTPNGAVNEQLPLKLNL

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.0 0.000000

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_10g0351414 RBH 0.000000 0.0 0.431616
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g30310 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os10g0351414 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0010110 SBH 0.0 0.0 1.977255
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0010880 SBH 0.0 0.0 0.204246
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_10g0007470 RBH 0.000000 0.0 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0010270 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0010510 SBH 0.0 0.0 5.095877
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_10G0187100 RBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0018070 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_10G0200100 RBH 0 0 0.040727
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0017990 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_08g0005840 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G009580 SBH 0.0 1.588812 2.123213
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0009600 SBH 0.0 2.084946 5.989265
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