Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
LOC_Os09g08660 OGI:09014050 | 16/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU Chr09:4534955-4543655
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Phosphoglycolate phosphatase 2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8GWU0]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
LOC_Os09g08660 LOC_Os09g08660.1 Chr09 4534955 4543655 - MSU_osa1r7
CDS seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.444212 1.723615 1.029452

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_09g0261300 RBH 2.130085 3.256931 6.031669
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g23150 RBH 2.063411 0.848078 0.152056
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os09g0261300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_09g0002860 RBH 2.377946 12.853234 7.533482
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_09g0002870 RBH 0.347443 0.000000 3.936204
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_09g0002850 RBH 1.964018 18.753944 9.539349
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_09g0002740 RBH 0.134626 0.626617 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_09g0002910 RBH 12.636082 43.213577 17.527519
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_09G0077300 RBH 8.781132 9.959559 8.198149
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_09g0002800 RBH 0.420142 1.173194 2.288378
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_09G0079800 RBH 8.5291875 7.306274 13.0499795
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_09g0002840 RBH 0.653524 0.320604 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_09g0002870 RBH 1.420572 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_09g0002890 RBH 3.139760 18.941591 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_09g0002780 RBH 0.886853 0.0 0.773790
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_09g0002900 RBH 0.619378 4.299351 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_09G002850 RBH 1.120274 6.611367 3.948854
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_09g0002890 RBH 1.759207 7.820889 10.330972
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