Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
LOC_Os09g03620 OGI:09005030 | 16/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU Chr09:1803961-1810819
Gene Symbol RLCK259, OsRLCK259
DNA seq

ATCCAAGCTGACTCGACTAAAATGGCTTGATATTTCTCTCTCTTCTTCCCCTCCTCCAACTACTAGCACTATGCTCCTCCTCCTCCTCAATTCTTCCCTTCCCTTTGCTACCCTATCCTACCCTTCGATCTGATTCATTCGCCGCCGCCGAATCCCGGCCGCCGGCGGTAGCTGCTCCGACTTTTCTTCCTTCTCTCGACTCCACTGGGTCTGGATATAGATAAGAGTCTTCCTTGTTTCTTTGCTGTGACCAGTTAAATCCAAGTCTTCATCTTCCCCCTCGATTCCCTTTTCTGCTTCTCGGGGTTTGGTGGTGTTCTAGCAGGCAGTTCGTTCCCCACAAAATTCTAAGCTCACCCTTGCTTTCTTCTCCCCCTTGTTCTTGACTAGGATTTTCTTTTCATTTCCGTAAGGAAAAGGAGATCACGAGTTAGCAATCTTGTGCTCGCGTTAATTTCATTCGATTTGTGGATTCCGAAGATGATATCTCTGTGAATTCGAAAGGGTCAAGAAGATTGTTTATCAGTATCGATGGCATCTTTTCCTCTTTTCCCTGCTCTCCTCCTCCTTCTGTGCTCTTCCTCCCTGGCTTTGGACTCCGTCTCCGAGCCAACCCTCTCATGGACCTGCGGAGACGACCAAGTTGCCATCTTGGACACATCCGATGGCGGCCGCAACCTGTCCGTCAATGGGGAATTGGTTCAGGATCGTGTTCTTGGCTGCCAGAAGCTCCGGTCGTACTACGTGAGCCGCTGCCTCCGCTGCGGCCAGCAGTCAGAGGCATGGAGGGGCGCCTGGAAGCACTACTGCCGTGAAGGGAGTGAATCAAGCAACGGTGAGTTTCATCCTGTTGATTAGCTTTTGGTAACGAGCTTCAATTGTGCTAAGAATAATGCCCGGGTTTTGAATTTGTGTACTTTCTTGGTATCATGTTGTATTGTATAGAATTAAAGTTGAGAGAGCCAATATAGATCTGCTCATGGTAAATTATTGATATGATGTTGTGAGAGAGCACCTTTATTTGTGTACTTTCTTGGTATGATGTTGTACACACAAAGATTTTCTTTCCTTCTAAATTGTGTGTACTCATGGTTTCATGGGAATTATTGTAACTGCAGCACAAAATATACCAAGGAAGCTTTTAAGGCAGCCCTCAATGAATGATGCAAAAATTGAAGATGACCCATGTAAAAACATGGGAATTCATGGACATAATCAGGATGATAATGATTCTTTGGAAGGGCAGGATCATCTACTAGCTGTGCCAGGTGTGATTCTCCTATGCTGTGGTCTGATGATACCGTGCTTTCATGCTGAGAAAAAGGAAGTCAGCAGGCATAACACTACATCCATTCAGCGCAATGCAGGTGAGTCCACACATCATGAGTACCTTGCACTATATTACTGCTGAAAAAAAAAACCATTTGGTTGTCACCCACTCATGCTGATGGTGGACTAGAAATTAAATACACACAATTATTGATTTTTCATATCATGACAGTTGAAGTAAAAAGTGTGTTGAAGACTTACTGATGTCGTAAATGACAAGTAATAAGAGGGAGTATATAGTATTTCTGTTCTTCAAACTGTTTCACGGCAAGAGTCAGATGAATAGCTATTTTGTAAGGATTAAAATCCACATGTATTCTGTGCAATTTGTTGTCATAGGGAACTGGTTGTCTAAAGCTTTCTCTCATCATGAGTTAAATACATGCTCAAATGCTCCCTGTTCTAGTATGTTGAGTATGTCAGTTCAATCTTGTGCTATCCTAACCATCTTCTGCATGGTATAGTTTGTGATGGCACATTGGGACCTTTAGAGCTAACTCTGATGGATTACTAGTATGTGTTTACAAATTTCTTACCTACCATTTACTTACCAAACTAGCAACTCCCGGCTAGTATGTGGATTTACAGAGAACCATAGTGGATCATCTCTACCAATTCCTAACTTGGTCTGTGCTACTTAGGAAGGAGTGGCATCTAGTGCAGAAAAAGAACTTATATAATAGTCCGTAACTAATAGAACAAAATCTGTTTGTTTGATTAACTGTCATCCTGTAATTTTTAACTCATGTGCTGCTATTCCTTCCAGCCTCATTTGTGTCGTTAGCTCTATACACACAGCAGAATGAAATAATTGCTACCTAAGTTTTAGGTGTGCCCATCTCTCTGACACCCCTACTAGTTAGCAATTAATAGGGTTATTGAGAACTCAATGTTTCCTAGAAGAACCAAGAAAAAGTATTTGTAATAAAACTTCTTTGCAAAGCCATTTATATTTTGCACATTATGTATTTTAATATATGTTGCAGAATATCTCAATTCTGGTATGCAGCTCTGACTGTTAAGCTGTTTGCAAGATTAATGTTCTCCTACCGTACTAGCACCATTTTGATTCAGTGTCAAACTCAAAAGCATTGTTGGGATCTTGTCCTTAACAACCAAACTTCTTTTTTCCAGTCGAATCGATTGCATCCTTGGATGTAAGCACGTCATCTGAGAAGGTTCCACCAACTCCACACCGAATACCCCCAAGTCCATCTAGATTCGCACAATCTCCACAAATTGCTCGAGTTGGATCTGTGAACTTAACTGTGCAGCAGATTCTGAGGGCTACTCAGAATTTCTCACCTTCATTTAAGTTAGGTGAAGGAGGATTTGGGACAGTCTACAGAGCTGTATTGCCAGATGGCCAGGTGGTTGCAGTAAAGAGAGCCAAAAAGGTAATTCCATCAGCTCACTCAATCTGTGATTTTACCTTCTTTTTTTTTTTTTTACCTCTAATCAATTTGTTGATTCATCATCAATCATGTTGATTGTAATGTATTATCCCAGTTTGATTTAGATTATGAATGGATTATTGCGCAGATTATCTACTCGATTATAGTGATAAATTAAATATTTTAAGAAATAAATTTAACAAATGGTTTGAAATAAGTGGTCTAGGCAATGCGGTAGAAGAATTTTAAAGAAACTGTGTTTTCCGAAGCGTGGAGCAAATGATCTGGTGAATAAGCTGAAAAGAACAGGGCCAATGCGTAAAGTACACTAGCGGCCCTCTTACAGTGTCAGTCATGCCACTAAACTTTTAAATTGCAGATTTAGGTTCTTAAACTTGTTTATCATAACTCTCTAGAGAGCGATGTGATATGCCAACTTAGAGCCGACATGGTGTGTGGGAACACATAAGCTATGTGTGAGCTTGGTATAGATGGGATATATGCATATATTCCCTTCTACACTGCTCATGTCATCTTGTATGTCACGTCAGCTCCAAGTTAGCATGCCACATAGGCTCTTGAAGAGGGTATGGGCACATTTGGACTCATGATGGTACGTTAAACAACTATAAAGGCCTAAATCTGCAATTTGAAAGTGTAGGGACCTGGATGACACTATTCGGCAAGTTTAAGGACCACTGGTACACGTTGCTCCTTTTATATCACTATGTTGGGGTTAATTAGAATATCTATGGGTGAATACACTGCTCTTAGGATTTGGATTAAGTTACTCCCTCAGGTAAAAAATGATGTTTGATTTTTTTTTTCGTGGTCCTCAAGGTGCCTTACCCATAATTTTATATGAGAATAAATTTATATAATATTGTAAGTGTTTACACCCAAATTTGGCACCTAGGTTCAAATTAAGGAATTATTGCCAAGATTTGGAAAAATTGCCGGTTTCCTCCACAGGGCCGGTCAGACCGCCGTATGTTGGCCGGTCAGACCGTTGCTTGAGGGCCGGTCTGACCGGCGGTGCGTGCCGCCGGTCAGACCGGCTGAGTCCGAGCCCGAGTCTGTTTTTCGTCGGGTCTCGGGTTTCCTTGCTCGGGAAGGCATGTTTCGGGTTTCCATTGGTTTCTACCCCGAGTTGGACGTGGAGGACTTGTAGGAGGCAAGACCAACCCCTATCTAAGGGACAAGGCCGGTTTGATCGAGATATTTCTCTTCCTCAAACACAATCGAATCGTTCTTTTATCTTTACTTTAGCCATGTTTTCTACTTTACTCTAGTTTTAGTTCATCTTTGTCGATTTGCGCCGTAAATCGTCTGCCGTCGCTCGAGAGTGCAATTACCCCTTTGTAGGTTTGTCCCGTAAACCTTCCGTTTGCCCACGAGACGGGCAGTTATCCTCATATCGATCTAAATCAGCTTAGAGGCTGATTTTGATCTCTAAATCGGCTCCGCTGGCCGGTTTAGCTTTTTTTTCTACAAAACCCATCTTGATTTGTCTTTTGGCTAGATTGGGGTGGTTGGCGATTCCATATCACCGCAAGGCGTTTAGGTGTCCCGATCGTGATTGTCTTCTTGTCAAAAAAAAGTTGCCAACAATAAGTTTATGATGTTATGAAATTACATTTCAGGATAAATCTACGTACCATTTTTATGTTTTCAAACTTAGTACTTTATTAGAAGTCGCTGATAGTCAGATCCTATCCAAAACATCAAGTATTTATGACCAGACGAAGTATTTGGTTTACTGCCTGCTAATGGGTTTGACTATTTTTTGTGCACAGGATCAATTCGCAGGTCCCAGAGATGAGTTTAGCAATGAAGTAGAATTGCTTGCTAAGATTGACCACCGGAATTTGGTGAGGTTGCTGGGATTTACTGATAAGGGACATGAACGTATCATTATCACTGAGTATGTTCCAAATGGCACTCTGAGGGAGCATCTTGATGGTACATTGCACTTTCTGATTTATTCTCTTCATTGCCATTTGTGTGTTTCCAAATTTCCATATTAATAAATATTTCTGCATTCTGCAGGCCAATATGGAAGAACCCTGGATTTTAATCAGCGTCTCGAAATCGCAATTGATGTTGCACATGCACTGACTTATCTTCATCTATATGCTGGTAAGCCATCTCTGTTTTTCCTTGGATCAATATTGATGTGATGCGCTCATCTATACCTTCTATAGAGATGTGCCTGCCAGCACAACTCTAATGCCCATCGGACTACTAAATCACCAGCACCATTAAGTTCCTTGTGTA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CDS seq

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Protein seq

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Function Calmodulin-binding receptor-like cytoplasmic kinase 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9ASQ5]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
LOC_Os09g03620 LOC_Os09g03620.1 Chr09 1803961 1810819 + MSU_osa1r7
CDS seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 5.117244 4.217218 1.502485

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_09g0123300 RBH 7.716194 6.454807 5.954856
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g63280 SBH 0.299036 0.072212 0.120409
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os09g0123300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_09g0001030 RBH 1.871329 32.279766 14.615758
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_09g0001010 RBH 0.933918 10.647852 3.973910
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_09g0001060 RBH 5.606057 28.666597 16.302794
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_09g0000930 RBH 0.863556 1.148813 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_09g0001130 RBH 19.214983 34.920395 26.238838
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_09G0025500 RBH 20.5827615 24.1510445 18.571479
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_09g0001130 RBH 1.088076 2.639260 2.088837
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_09G0035100 RBH 17.1967445 23.658349 16.9801755
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_09g0001070 RBH 0.808117 0.420532 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_09g0001050 RBH 2.330314 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_09g0001170 RBH 12.324747 23.013758 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_09g0001080 RBH 1.774292 0.0 1.694348
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_09g0001090 RBH 1.721682 18.619204 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_09G001140 RBH 2.219581 6.726701 7.124458
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_09g0001100 RBH 4.448780 36.389194 10.190804
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