Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
LOC_Os04g31790 OGI:04060730 | 16/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU Chr04:19020396-19037720
Gene Symbol -
DNA seq

GATCTTGCTTCTAGAATCTTCTTCCCTTCTTCCCAAACCAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAATCTTCTTCTCCGACCCGCCCCGCCGGTGGGGAGGCGGCGGGGCCGCGGGAATCCGGCAAAGCGACGGCGATGGCCGCCGCCCGTGGTTGCCTCGTCTCTCCGCCTACATAAGGGGGCGCCTCTCCGGGCTCCGGCGCGTCGGATTGGGAGGTCGGGATGGGGAGGCGGGGGCGGGTGGTGCTGCGGCGGATCGAGGACCGGGTGCGGGCGGGATCTGCTTCCGGAAGAGGCTCGCCGGGCTGGAGAAGAAGGCGGAGGAGCTCGCCGTGCTCTGCGACGCCCACGTCGGCTTCGTCGTCCTCTCCTGCTCCGACGACGACCGCCTCCACCATTTCGCCGCGCCCGCCACGTACGCTCTTTCCCCTTGAAGTTGAATCTGCTCAACTCTTGCTGAAGTGTATAGTAGTACTGGCTACCTTAGCTCGATTTTGTCATTTTGACTGGTATATTCAAATATCGTTGGGTATTATATTACTCGGTTCGATTTTGACTATTCCAAGGCTAGCTGCACGCCTAGCCTCTTTAGTGTGTTTTTTTTAAAAAAAATCATGTTCCGCTCATTTTTTTTCAATTTTTTTATTTTTATTTTCACGCTCCATTAGGCCAGTCACAATGGCTAGTGTCATTGCACGGCTACCCAAAATATTATACCATCTTCTCTCAAATGAAATCTTTTATGAAACAATCCCCACAGTGGAGGGGTTTCACTTTGACGTTTCCAAGACTAAGCAAAGCATTTAATTGATACAAGTTGCTGGGATCATTTGTACCCAAAATCCGGCGCGGCGCGGGAGAATGCAGAGGTCGCACGGCGGAGGCGGACGCAAGAGATCCGGTGAATGAAACGAATCGGCCTCAACGGGGGTTTCACTCTGTTACCGAGGACTTGGAAACGACGCTGACGAGTTTCACCAGGATGAAACTCTTTCCTTCTCTCTCATCCCCATTTCATGCAAATAATCATTTTTTATTCAGTCTTACCCCTATTAAATGTGCATGACACACCAGTGAAACCCCCATTGTGACTGGCCTTAGAGCGCTCCGGCCGGGCAAAATGCTTTCTTGTATCTGGCTGCTTGCAGAGTTGCAGTAAGTGATGCTGTTATTTTTCTTCTTCTTCAGTTCTTGATCTGGAGTAGTCGAGCGCTTTAATTTGTGCCTTTTGTGTGGTGAGCTGGGTCAATGTTCTCGTGTTAATTGTCTTCTGCTTTCAGAGTTTCAGTTCAATGACGAACTTGCTGAAATTAATGCTTATTTTCAGAGAAACATAGAATCGCCGATATAAGTTAGGAAGAAACAAGTGCTTGTTTCATAGTAGTATTATTATGGTTTAATTTATCCTACCATCCAATACAATAGAACCCAAAATCCAAGTAGCTCATTTACCAGTTTAATTACCACCCGTTGAAATGATCTGACCTTGGACTTTTAATAACTTCCGTTGGATATCTCTTTATGTAGGAACAGAATTGTTTCTAGATGATATGCAAATCCGTTCTTTCATTAACACTGTCGACACACACACACATACACATCATATATATATATATATTATATTTTGAATTTCGATTGCACAGTTCTCAAAAAGAAAAAGTCGCTTGCACACATGTGTATAATACACATGGATGCTAACCGGGAATATAGCTAGAGAGCTAAGGGCCGAAATTTTGTTAAAAGTAACCTCCAGAAAGAATTTGTTTACAGATGTTTGTCGAGTGACCTAGTACCAGTTTATTCCAGTTCAGAATGTAAACCCACATACAATAGTCAAAATATTTGTGATACAATAATGTGTTTGTATGCATATATAATACGGGTAATGGAATTAGGGGTAGTGCTTATATATAGTGGTAGTACTATTGAGGACAGGGAATATCCAGTTGAGGCAAGATGACCTATCTATGATTTGATGTGCATTTTGTGGATGATTTACAGTTTGGAGTGATTTTTTATATTTAGTATTTGCTGCCATATGAGATGTAAATATTCAGTTTAGTGGAACTTTCCAAGATCAACACCAGATAGTATCCTTTGGATTGATATTGATGTAGTCAATCTGTAATTAAGTTGTCTTCTTGTGTTTTATAATTAGAAACTATAATTAGTGACTTCCAGACCATTATATATTTAGACAAATTAGCAGTTGAGTAGTCTGTATAAATTAAATGTCTTCGATTATTGATTCTCTAAGTGGTTGGGAGTGAATTACTACATGTAGTAGATCATTTAGAGATCTTGCGAAATAAAATAACCATTTGCGATAGTATAAATCGTTTACAATATATACAAAACATAATGAAAACACGCTGGTGCTATACGTACTGACTATGCAAGGGACATGTATCTATAAGTTAGAGAAAATTTCATATATACCAAGTTTTTAGCTTGTACTAATAAATACTACTATAAAATATGTGTACCTCCTACGAATATCACTTGGACCTTATAATTCTTCACTTTTGGTCTCTCACCTAATGGATGTCACCCAAAGTTCGAAGTGTCCCTTTTGTTGAATATAGGGGTAGAGCTACATTGGAGGGCGGCCCGGGGGGGGGGGGTATTTATATTATTTACCTATAGTTCATATATTTTTATCATATGCACACCCCCGTTAATCCAAAGCGCCCACATCAGTCCTACAAAGCAAGTGAGTGGAACCATCCTTCATTTATCGCCCATTGTTGAATATATAGGAGGTTTTTGAAAACTCATTTGGCCAAAATAATTTTATGTGGGATTAAAATTACATTTGTTTTCCATGAAAGATCCAATGCCTAGGTCTCTTCTAGTGCACCAACAACCTAAGTTTAGGTCAATTTTGCAAACATGTGATGATGTGTACACAATTCAATTATAGGAATGTAAATTGCATAAATTAATGTTGAAAATAATGAGCGCAAGATAGACATCCGATGCATTTAGGTTCGAAAATTTGTTGATTTCTGACTTATGGGGGTAAGCTTCGCTTGACCATTCTACCAAACCACTAGATCTCCGGCACAAGATGAATTTGGTCTAGTACTAGCTCTAAAATTGAGCTTTGTGGGCCTTGATCACTAGAGATTGATCTTCCCTTAATTTTAGGTAGGTGGGCTCAAAACCTTCATAATCAAAGCCTCAGGGTTTTCCATAGCCTTCTTAAAGAAATTACAGGCACAACTCCTAGCCATTTATGAGGCAACAACCTACTAGAGTTAGAAGTGGATGGCGCTTTCTTAATGTTGATCAATTGCCACACTTGCTTAATATGATACAATGTATTTGGTTTGGCTCAACTAATTCTCACCTCTCAAATGGAAGCTAAGTGCTTAAGAGTGTTAGAGTTCCCTTGGTACGTACAATAGGGGCGAATTATCCGTACCCATCCAACCAAATCTAGCCATTGGGGACCAAAAACCCCTTCATCCCGAGGCTAATGGTTAGACCGCTATTAGAGCTCTCGACGGTCAGACCACTGGTAATTTACCCTAATAAGGTTTTATTTCGATGGGGCTTCTATCCCTTCTTGTGCATATGTAGTGGCCAAGTATTAAACTATAATATTGGTTACATGCTCATGGACGACCATGATTTTAGCCAATCCAAATAAGGCCTAAAGAAGGAGAAGTGAAGATGCGCATGCAATGGGCCAACATTTTAGTATATCCAAATAAGGCCTAAAGTGTGAGTAGTGAAGAGTAGGGAAAACAATTTGTTGCAAAATTTATTAGTACTTTGTGACTTGAATCTCCCTTTCGGAGTTGATTGAATTATGGTAATTTGTTGGTGCAATTGCATATAGAAACTTTGGTGTTTGGCTAACTATATTCCTTGTGATTTTATTACATCAAAGTTGTTTAATGCTCCATGTCTCAAAAATCTTAGGCCAAATACTACATGCAATAGATCACACACATGCATAAACCCTACTTATACTATTTTCCCTACATGTTGGTTTATTTCTAGGGGCGTAAGTATGTGTGTGTCTTGCATCCATATCTTTGTGTCTACCTCTCTCAAGGTGGCAATGTGGGACTAAAATAAATTATTGTCTCATATCCATATGTTAGTTTCGATGTTCATACCTTTTTCCATTGGCTAGGATGTCAGAAGGAACGTGTGAGAGTAGCAATCAGCGGATAATAGTTGTCTAAATTTATTTTGATTTATCAAACGAGATATAATAGTTTCCACATCATATTTGGACAATGGCTTAAAATGTAGAGTAAATGGCATCTTCACATGTTTTCAATATACACGTGGATTAATTTATAATTTGACTTTTCACAAGGATGAAAAAAATAAGTCATACTACCATAAGCCTTGATCATGTTCATGAAGTTAGGCGTTGGTCCCACCATCCTATCTAACCTAGACACTAGTATTTATGGTGAGTGAAGGGTCCTTACTCCTGCAATTGTATGTTTACCTTTGCATCTTTAGTTCACATGCAATTTAGTGTGCGGGGTTGGGGGGGGCGAGGGGGACGGGATTGCGGTGTTCTCCACATAGTTGGCATGATACAAGTAAGGGTCTTCCTCCCCAACTACCAAGGAGTTGCCTCCTACTCTACTATGTGAAGGATCGAACACAAGAACCAAGCCTACTAGAGGGGGGAGGTGAATGGTAGGAACACCAAAAACAAAAAACGTTTAGCGGAAATAAAAGTTACCTTCTAACTTGATGAAGTTGCCTTGTAGCTCGGTTTGACCGTCAGATTAACTCCGGTCTGACCGTCAGATTATCTCCAGTTTGACCGCAGTATAGCTGCCGGTCTGACTGCTTGTCCGCCACTGGTCTAACCGCTGCCTTGCCACTGGTTGGACCGCCGCTTCGCCATCGGTGTGACCACCCATCGATCTCCTTGCCTACTTGGCGCCGCCGCCTGTCTAATTGCCCATTGTAATCCGGTTAGATCGTCAAGATCCAGAAAAACACAAACTGATGAAACTCTTGAAAGTAGATCAACTTTATTGTATCAATATGTGTTTAAAAGAGCATCTAAAGCACTCCACTCTCAACTCACGAACTAGGATTGAATCTTCGAAGCAAACCCTAACTTTTCTCTCCCAAAAAATCGATATCTTCTAGTCTCAATCCCTCATCTATTTATACAAACTAGGGAAACAACATCCTCATACAATTCCTCACTCCAATCTTTCCAAACTTCGACTCCAATCCAAATTTGACTCATCTTTCCATACGCACACAACACCATGTGTATGCCATATGAAAACCTTCACCTCCACGTGCATTGTTCTCTAGCCTTAGCATCCTGCATGATATCCTTGACCGTGTGGAACTCAACTTCTCTCAAGCCTAGTCCCAATCCATCGCCGTCTATACTCTTATGGCCTCAAGCAACACTTGCACATGAACAACAAAGGAACTCCCATATCCGAGTACAAGTTAAGCTGGAACAACTTCACTCACATCAGCACACAGTATCACATAAGAATAGAAACCATCTAGAAGTTATAAACATGAAGCAATCGAGAAATTTCACGAAGACAATCTAAAACCGACTCCAACCCGGAGTCTGCCGGTCTGACCATCGGACACCTCCAGTCTGTCTGGTGGCACCTGACTGGTCTGACCGACCACGCAGTGCCGACTGCATTTCGCCGACCGAAAACACTATTCACCATGTTTTCAATAAACACTTACCTTTGATAATTGTTCATCACATAGATTAAACCAATATCTTGATTTCACAGTGGCGTAACCCCTTGATAACTATGCAAGAGTTTTGAAGACATACTTTGTTCATAATATGGCCATAATATGTGGCTTTAATGAAGATGAAAGTAGAAGCAAACTTAAAGCTCAATATGTTCCCAACCTTTTTATGTGGAATTTTACAGGGATCTTTGTTCTTATTTTCTGCCTTTTGTTGATACTTGGTATACTATAAAGTTATCTTTTGCATTTTGGGGATATTTGTAAGCTTAATTTGGATTATATATTTTTTTACAATCCAACTTTGTGGTTCTTCTAAGGTAGATTTTGATGAATCTTCCCATCCTAGGCCCCCTTCTCTTGTGCCAGTGACTAACGCCCTTCACCTCTCTTAGTCATGCCACTAATTTGCTTTGGCAACCACTGCTCCTATCACCCACTCCCTTTCGCCGGTGGTTTTTCTCACCTTTCTTCCACACCATACATCATATTATGGTTTCCCTTGCCCTCTAGGATGGAATTCATGCAGTGGTTCTTCCAAAGAACAACCAACGAGCGTTGCTGGTGGGAATCATCGATCTAGAGGGATGATTTAGTCGGTTGCTATGCTATTAACCCATAACAAAGACAAGGTTGTCTACTTTGTGGATGGAACTCTGCAATCCTAGTCACTTGTCTTGTTGCCATATGTTGACATACCCAGACATCATAGTCGCCATAACCTTTGCTTCCTCTGATATTTCCTATGACTAACATGGTTCAAAGGCCTTGTCCTCTAGCTCATTTAGATGTCACTTCTAGATCATTTGACTGTTGCTATAGTGTGGAGGTCTTCGCCACGTAGGTGGATTCATCAAAGGGTTGACATGGAGAAATCTAGGTGCACTAGCGTAACCTTGCACACCCACCTCTTGTATCACTCACTAAGGACCTTTGACTGTCTCTGCTTCAACTGCTTCTCTATCGATCATATCCATGTAGTTTGAAAGTGGAGAGTCCATCCATGTATTGGAAGATTGCCTACATTTCTACCTCCACTATTTAACATCGTTAGGGTTATTTCGCACCGCCTTTGCATGATCCAGGGTTTCCACATCTTCATTCAGGGGGATTTTTTTTATTAGCTCATGCAAAAGACACCATCGGGGCCTAAGAGTAGTTGCTTGCCTTCATGGCACAATACCAGAAGGCCATTGTGGCACCCTGTCTAGGTGGCCGCTGAGTCACACGCTTAGTGCATGTTGGACACCACCACGAGGGATGCCTAAATCTCAATCTCCATTACCACCTCCAATAGTTTGCCCCTCCCCTCGCTCTCTAGGTCCACTAGAAGGTAGGGGCAAACTTCTTAATAGCTTTTCACAAACTAGTTCCCATGTGAAATGTTATTTTGTGTTGCAACCTGACATCCCCTTGTTCTAGATGAGTAATGATGTGCGTGTCCATCTAGATGCGCTCAACAAATGTTGCACTCCATACTTTTCTGGTTGCTACTGCCTTTGTCTTACGTTCATCAATGATTGTAGATGTGGTGGAGGTTGCACTAAGAACTGAATGGGGGCAGATCTCTCTACCAAGATGCTCATTTCACTCCACTAGAACTTCCTCGTTCGTGTCTAGACCCATAGCTTTTGGACTTCTCCCTTCACAATAGCCTCCACTATGCCTAGATTTCAAGCTTTCCCTCAAGCCATGGACTAGGCTAGGTCTGATCTTGTGACACCTCATCCATCTACATCTTGAAAGATCCTGATTTTACGCACGGCAAATCTGATTCTTGAATGTTATTTTAAGGTCAAGTCAATTGACCTAGAAACCTTGGCATTTTATTATGTTGAGGTTTTAGATGATTGCTTGTTCATAGATCTATGCACAAGCGCCAAAGCATAAGACTCGGTTCATTTATGAGTAGGCTGAAGATCCAGCTAGTATTGTTTGCATGTTGGATGCATACACAATTGCTCAGGAAAAGGCCGTGTCTATTTCTAAGTAGGTTGAAGATACATCTAGTAGGAGCAAGATGTTTTGTTTATTATAATGTTAGCATTTGATGAACCATGGTTGAGGACCAAGCACAATAGTCGATGGCTTCCCAGAAGTTTGCACCATTGAGCAACGAATGTGGACATGGTGGGATATTGTCCTATGACTACGACAATTGTGACACTCACTCTAGTCACTTCTTGAACACCCCTTCTTGGACAAGGGAGATCTCACCATCAGTGGTAGACCAGATCGACACCTTTTGGTAGAGAAAAGCTCCTAGGGATACTTGTCATGATGGTGTGGTTGAAGTTTGTTGGCATACAATCGTCATATTTGCGCGCAGTGGGAAGCATGACTATGATGATAAAAATGACAAGCTACAACGTGAAAAAGGGCCCAAACACAACATATTTTCTTTTTATTTTGCAAGAAAAAAGCTCTAGAAACCTAGATTTCCTCTCCTTAGATGAGTCATTGGATGGTAGATGATGATTCTCAGTGTCCCGATATTTCAATGAGAGGAGATAACTTTTCAATTATGAAGGAAAAAAGTCCACATTTCGTCTTTCAACTATGACCTTGGTTCGATTTGGGTCCTTCAACTACAAAACAACTTACTAATGGTCCTCAACTCTTGGGACGGTCTATATTTCATCCCTAGGCTTAAACTTGGGTGGTTTTGAGTGATGTGGTTTTAAATAATATATAAGATCAAGAGAGATATGAAGGGGGAAAGGAAGCAATGTTGACAATTGGGTTGCAATATTTTCTTCTTCTCTCTTTATTTTATTGTTTAATATCGATTGGTGTTTCATGTCATTACCTATTTGCCCATATGTACTCCATGCATGGGACTCATCATCGAAAACCACTTAGGTTTGAACTCAAGGATGAAATGTGGACGGTTTTAAGAGTTGAAGGACCAATAAGTAGATAGTTTCATTCTTGAGGAATCAAAATCGGACTAAGGCCATAGTTGAGGGACCAAATGTATGATTTTCTCAGTTATATAAAGAAATGTCAATGAGCCAACTACGCATGCATGATATTTTGAACCTTAGTGTTGACATAACCACTCTAGCAGGTCGTTGATCTTAACGGCACATGGTCAACTTTAGTCCTACAAGCAATCAAAAAAAGCAAGAGCTAGATGAAGGCTAGCCGAAATTTGTGAATATAAGAGGAAGTTTAATCTGAACACAAACTTGGTGGATTTCCAAAACTAAGAAATGGAAAGTCTAGTCGACACGTGCATCGACATGGAGAAGTCAAAGATGGGAAACGGAAAGTCTAGGCAATATGTATATTTACACGGTAAAGTAGGGACGTAGATGCTAATTTGAAGTGAACAAAACCCGAGAACCCTTAAGGGTTGACTACTTATTCATAGGAGAAGAATAGCTACGAGGTGGTGTATTGCGCATTTTTCCCTCGTTCCCAAGAATATTTTCGATATTGTTTCATTCATTGTAACCGGCTTAGAGGTGGACAGGGATCTACTGGAAAATGCATGAAGAGGGTTTTCAATCAATTAAATAGGACCCAAGGCAGACTTCTAGAGTAAAAGTCATGCTTCTTTTTTGTTGTGGCTATATAGGAGGCCGTACTAGCGAAGTAATACTTTCATCATTGTTTTTTTGTGTTCCTACCTTTCGTTCCTAAGCATAATAGCATCAAGTAACATTTCATTATATTTTGCAAATCATGTTTATGGAAGCCTAATAATGAATTTACCTAATAGCTCAATTGATACGCATGAGTTTGTCTGAGTCGTATTTGTATAATATATTCAACTTAGAATAGTTGAACTATAGGCGATTGTAAGCAAGGTAGGGATGTCCTCATTTATAGGTCTAGACAATAAAGGCTCCCATGTTGACACGTTGCAATGTCTAGCAAGCATGGTAAGGATGTTCCTTCATCAATAGATCTAGACAAGGAAGCTTGCCGTGTTGACACGTTGCTTAGTTCAGTACTTTTTCCTTAACTTGGGAGTCTACAAAAACATATGTTCGATGCTCATGTTGGGAGTCTTTCATTGAGGTCCCACTAGTTGGGCGACTAACTATGTAGGGGGAAGCAATGGTCTAGTGGATGCCAAGTGGATGCCAAGAAACATTAACTAAACAACATACAAAGCAATCACCTAGGGCGTCATCTCGTCCTTCCTTTAGATCCTTAGGTTAAGGAGCATAATAAGGTTTTTGTCACACCCGCACCTACTTGAAGAGGCTTTGTTAGCCGATGTGTGGTTATGAACATTAGTTTCACGAAGAGTAAATATGAGGGAGCTCTGCATGTTTGGTAAAATGAGATGATATCTGCACAGTGGTCAATGGAACTAAGTGTTTGGTCATTAGCCACTAGGAAAATGAACTAGATGATGGCCTCTACTACCTCACATGCTCCAATACTAGGGGTATTCTACATTAGTGACATCCAAGGTCATCTTCCATGGGAAATTATCTCACAATGAAGCTCTCATTCTCATATGGAGCTAGCTATTGGACTACCATCAATTGTGATCCACGGGATGACGTGGATAAAATCTGTTTGTTCAATGAGATCCGAGACATCAAATTTACCACTGACCCTTGGATGTTGGTGGGCGACATAACCTTGATCTATCAAGATTAGAATAATAATAATAATAATAACTATTGTTCCGATAGGCACATGATGGGTCTATTTCGTCACATTTTGGATGATCTAGAGCTAAAGGAACTCAATCCCAACAGGTGCAATATCACTTGGTTGAAAGATAGAGAAAGGCACATCTTTGTGTGATTTAACATGCTTTCCCCTACTTAGCATGGGAAAACATGTTTTCCCAATAACTTCCTCTTTCGCACCCTCTCTCCTATGGTCTTTGACAATATACCTAGAAACATCCTACTCAGCAAAGGGCAAACAAAGGTTTCACATAGAATATTTCTAGTGCAAAATAGTAAAAAACCTTAGCTGGACCAATGCTTGATTGCCAATCATTTTCACAGCCGAGATAGACATTTGCATCGAACTACGAGGGCATTGTTTTTCTCGAAAACGCAAGAGAATTGCATTTCATTTTATTAAGAGGAAAAAATAAAGGAAAAAAATACAAAGTAGGAGAGACCAAATCCCTCATACACACCCACACCCCGGCCAACCCCGGCCAATTAGGTGCATAGGTTTGTCGAACTACTAAGAAACTTTTGGAGGGCAGACGCCCCCCGCTAAACACCAAAGATTACCCTCATTCTCTACCACCTGCAAGATCGTCACAACATTAGGACTAGTGCCATTGAAAACATAGTTATTGCAATGCTTCCAAATCTCCCAAGCCACTAAGATAATCAAGGAGTTGAGTCCTTTTCGCACATCCTTTGGCCGATATTTTGTAGATTGGCTCCACTACCTCAAAAAACGATGGTTGAAGGTTGAGGCACTATACCAGAGATCCCTAGCTTCAAGAACAGAGCTGTCCACACTTAGCGGGAAAAGACACAAGAGATCAAAATGTGTTGGATGGATTATTCACTTTGATCACAAAGGGGATAGGCCGCGGGGTGCTGCAGTCCGCGCTTTGCAAGCCTGTCGGCTGTCCAACATCTATTATTGACGGCCAACCAGAGGAAGAACTTATAGCGAAGAGGAGCCCAACTCTTCCAAATGCATTTGCAAGGAGCAAACTTGATCGATCCCAGGAAATAAGTTTCATAGGTAGATTTACAAGTATGCATCCCATCAGCGGTTAGCTTCCAAACATGCTGGTCTTGTACATCTTGTAGCAGAACCACCTCGTCTACCAAAGTCCAAATGGTCAAGTACTCATAAAGGACCTGAACAGATAGTCCCCCATGTATGTCAGCCACCCATCTTCTGTTTTCCAAAGCCTGCACCACAGTATGTTGCTTCCTTGCCCTCTTGAAGATCAAGGCAAAGGGATTAGAGGCTAGCTCTGCTACTGTTTTACCATGTAGCCACCTATCACTTCAAAACTTGGTATTTTCTCCATTTCCAACCATAGTTTTGACAACGACATTAAAAAGAGAATGGACATTCTGAGGCACATGAATAGACAAACCGGCCCAAGGCCTAGCAAAATCAGTTTTTTGAAGCCATAACCATCTCATGCGTAGTGCCCTTTTAGAGTTGAACTAACAAGAAATTAAATACATAAATATCCATAGTTAGCAAGGTTTTGCCACAGACAGGCATCCTCGTCAAGAAATGGAAATTCTCATTGCTAGAGTGATTGGATATGGGAGTTCAAAATGGAATTACAATAGCCTAACAACAAGTGAGGATTGCTTTGATCAAAAAAGGTGATGCAAACACTAGTTTCTTTTATTACCACACAACTCACAGCAATTGACACACCTTCATCCAACAACTCTTAGATGATATCCAACCATATGGTCGCAAGAAGAAAAGGCCTTGTTGGCACATTAGTCTACAAGCCTTATTTGGTTCTCCACAAGACTAATCCAACTCCTTGAATTGGTTCTCCACAAGACTAATCCAACTCCTTGAATTTAAACTTGATTGAGGCAAAAATGGCAAGTACGCAGAGCTAGAGGCCAAGTCCTCGGAGAAAGATGTTCGGGTAGAAACTAAGGCAATACGAGAAGAGAAGACAAGGATCCGATGGTTTCTCGAGTCTCTTCTATCACCAATGATGGAAAACGAAAGATATCCTGACAACAACCAACCGACATTTATGAATGGACGTAACTAGCTTCAAGAAGTCGAATCGGACATTCATCCCATTGATTCTTATGAAAACCAATGCTACTACTTTATGGTATTATTGGATAATAAACTTGCTCCTCATCTTCTCCAAGTTGTTCTCGAATATCTTGGCACTTCAACATGCACTACTATGAAGTTGGTTGCCAAGAACTAGAGTGCCTTTATGAAAGACCGCTTCACACATTACAACTTCGAGTTAGTACGCCAAACAATGAAGAAGCTACATAGCGGTAAAATTTTCATTTCTTCTTTTTCAAATTCAGTAAGTTCAAACATTCAAATCATTTCAATGGTCATTTCTCATGGATGGGATGCTTGGGGATGATATCTGGCATGAACAAGGAGTCCACTAGCGGACCCCTTGTCGCCACAAATATTGATACTTGTAATCACATCCAAAACACGTTCTTCAAGAAGCATTGCAAGAAAGGCTCTTCTCCGTACTAAACATTATTCCTAGAATAGCCCTTCTCATCAATCCAACTTGCTTAAAGCTATATCAAACTAAGTAAATCCTTCGAATCTTGGTGGGGCATTGGCCAAGTAAACTACTATAAATGTTCAGTGGAGCAAATACATTGCAGCAATGACAAGCTAACAATTATCACTGAGGAGCTCCGATGTGAGGTGTTACAAGTCCGCACATTCACCAGGCAATAAGAGCCACAACCTAAATACACATACGCTTGAGCTAGTTGAGTAGGAAAGAAGTATTGTAAACCTACAACAAATGCTTCTAGGCAAAATCATGTGCCACTATTGCTTGTGTGTATTACTAGAACCAAGAATCACATGATGCTAGCGGCAAGTCAAGCAAGAAAGAAAGTATTGTCCAAGCAGCCACATGAACGGATCGCTAGCCATTTGAGTCCCACAGGAAGGTAGGCTATCCATTCATGCGGCATCGAGCTTGCCATGGGACGGCATGAATCGCATGAGATTTAGGACAAGAAAAAGGAGTAGGACGGGGCGGCTGGGTAGAATGGAAAGGAAAAGGGAGAAGGGATTAGAGATCCAATAAGCACCAGCACGTGGCTATACATGTGTTGGGCCTTCTTGTAAGTTTTGTTTGGGCCTCCTGTGGGGAATGGGGACAGAGAGTGGGGGAGCACCCCGACCACAATGGAACAGGGAATAGATGGCCAATCTCCAACCCCTAATAGAGGAATTCCCTGACATGTAACGGAGTATGAAGTCCTATTTTGTTATCCCTAAACATAAATTTCCTTAACATCCTAGTAAGTAAGTTGATTCAGTTATATGTTCCATCCAGCTCCTAACTCCAAAGAATTGTGCAATAGATGTGTCAGGTAAAAGCTAAATACTCAATAGCAATCCAATGGATAGCACCATCACTAAGCACAAGGCAAGAAAATGATTGGCCGATTTTCTTATAAATATTTAGGACTACCTATGGGCATACAAAAAAAATGAAGGGAAATTTACACCTAGTCATCGATAAGGTCATGAGAAGATTGTTGAGCTGAAAATGAGAGCACCTCAAACCATTGAAACCAAATTAGAAAATCGAAGTTGTTCTGATGAACTAGTCAGTCCTTGGTTCATGGTACCCTAGTTTAACCATAGTCCAATGATGAATAACTTGGTTCAAATATATTATCTTTAGTTTTTTATGTTCAAATTACTGGTATGTAAGGTAAAAATTGCTAGTATTAAGTTAACTAACTTTCACTTTTCAATGTATTCATGAATGTGGTATGGCTTCGATGATCTTTCACATGTAGAGTGACAAACATGGTCATTGATTTTATCCTTTCCTTTCGTGCGAAACGAAAAATTATATTTATCGCTAGTTTTTCCCTCTAATCTTTTTAACTAACCGATCATAGCATGCTTTGCCCTTAGTTTTTTCTTCTCCTGTCTAGCTTTCGTCATTGTGATCCGAAAAAATTATGCCAACTAAGCCAGTCCTAACTTAAATAACAGTTTACTACTAATCACCATGGAGCCCACTAAATGGACTATCAAGGAAATTAACAAAAACCATAAGAGGGTTCCTTTTAGAGGTCATGGCCATGCCACGGCAAAGCATTGTTGGATAGCTTGGTCTAATGTGCTCACCAACTTTGCAATCTGGAAATTTTAGTGCAAACTCTATGAGTGAAATGGATTTGGTACTAGCGCAACACTAAGAAATCATAGTTCAGGCAACAAAGAACAACATTAAAAGCAATGTCAATGTTCTTCAAGCTTGGATCCACTTTTAGTAGAAGGATGACAAGTACTATCTTGTTTCCGGAAGACAAATGAACTGACATAGAATGGGTTGAATCCATTTCCACAACACTATATCAACGCATTTGTAAGCCCATCCGGTGTCAAATATGTCATTGGATCCACAACTTTCAGGTAGCTCTTAGGATGCAAGGGCTTGACCCAAGCATTGTGGTGATCAATAATACATCGGTCATGAAATTGTTATATGAGAATTACAAGTTGTAATCTACAGATACTGATGGGTGGCCTTTTTGCACACAGGTCATGGGTTGTCATGAACTTCATTTGCATTTTTCTCTTAATACCATGATACATAAATCTTTTCCGTATTTGTGAGAAAAAATAGCATCCACTTTTATGCCTCCTTTTTCTTTAGCCTGTGATTGTCCACTCATTTTCTTTATAAATTTATATCACTGACTTAGCAACTTTTTTGCAGTATAGAAAACATTGTGGAACGTTATGAGAATTCTCTAACAGCACAAAAGGGAGTACATGGCAGGCGCACTCCGGAAAAGGTAAAATGCGGATAATAGCAACAGAAATAAAACACTATATAAGAAGTGCCTTTGTTCGCATTTTAATCGGGATAAACGGATATATAATTTCTCTGATCCTGTGCCATGAATTTATTTTTAATAGTAGTTCAATCATTCTATGGTTATATCATATTTACCTTTTTTTTCAGAGTAGAAACATCACTACCTGAGACAAAAAGACTCATTTTTACTGTGTAAAACATTTTACAAAGTATGGCTAACAGGTGCTGGCAGAAATTTCAACTAATTAAAAGAAGTGTGGCTAGTTACAAATTTGACACTTGACCCATGTATTTGTATAAAAAAATTGAATCATGTTGTGATTTTAGTGGCTTTGTCCGATAAGTTAATTATATATTGTACACTTGCAGAGAGACACTCATTGGTGAAAATTTTCCTGCCGGTGCTGATGATAATTATTTTACCATACCAAGGGCAAGGATTTTCATGTTCCCAAGGAAACAACAGATAAAGGGTCGAACGATGATGACATGCGGTATCTGACAAGTGCCTCTGCAAGTAACAACTTCAACCAAAAATATTTTCAAACAGTTGACTAAATATGAGAAAATTGCAGATCTATTGATGAAACAGACATATCCACATTGAACATGGACCAGCTTAGCCAAATTGAAAGATTACTGGAAGATGAACTAAGGTGGACAAGGGCAAGAAAGGTATGTGGCACCTTAGTAATAGACAGAATAGAAGAAGACAACATGTATCTCTTTAGAACATGAATATTTCATTTATTTTAACTTATTAGATTATGTGCATCACATAAAGATTTTTGCGTAGACATTCCATTTCTTTTCCAGGAAAGTGTTTACCTTACTATTGTACCTTGGAAGATCTTCCTTAGCTGTCTCACTATTTTACTTGATAGAAATACCAAAATATTGTTCAGTTTGGTCCTTTCTGTGATTCACAACTCACAAGTTAGTCTCTGTCACACGGTAATTTGTAAGAATGGTTTGTCCAAAATGTTCCTTTTCTCATCTAATGCTGATTCATTACTACAATCTAGAAGAAACACTAGTGTGTTCCTTAGGATAATAATCTAGTATTTCAAACCGATCAATTTGAGGCAATATTAATTGCCCATTCTGAATTCCTGATGGAAGAAAATACTTGCTATCCCAATACATCATTGTGTACTCAAACAGTGGATGTATCAACTTGCTGCATTACTCTTTCAGTGTCCTTGAGAGAATTTTGGTTTGATCTGCAACCAAATTCACTTCAAATCTGACAGTATATCTTTGTACGGACATAGGTGGTGGTGGATAGAAGTGCCAGATTACAAAAAAAGGTATGCACTGAGTAGTCTGTACCAAAACTAAGTTTTGTAAAACGTAAGTTAGCTCGATTTGTAGTCCATACAAGTGAAAACTGGTGCATGTCAGCAATAATCAGAATCCCTGATGTCCATTTGGAAATCATGAACAAATTGACCATGCTACGCATGCTTTGCAGGTGCAGGGGAAAGCGGCGATTGTTGAGGTTGAGAGGGGCTCCATGGAGATTCCCATAGAATCTGGGCAGGAGAAGGTGATCACTGGATGCAGTAACTATTTCTGTCAGTCACAAACACTCCAATCTTTCTGCAAACCCTGCAAACATTCACTTGCTACTCTGCTTGTAAGCAGGAACAGATAGGAGGGGAGGCTGTGGAGGAGCAACGGAGCCGGACTACGCCGTTGGACCTCAACATGCCTTGCTGGGACGCAGGTCCTCTGCAGTAAACGTAGATAACATTATCTTTGCACAGCAATCTGAGTCTGTCTAACGTTAGTCGCTACTACTGTCCCCGGTACTAACAGTGTCGTAAGTTACTGTTGCTGGGAAACTACTACTACGCTTTGCTAATCTTTTTTTACTGTAGCCGTTCATATCCAGGATACTGTGCCGTAACTGGAGCACACCAGATTCAAATCAAATGTACTGTGACACCATTGTATTTTAAAATGTGTTTTTCTCCTACTTCCTACTAGTTCTAGTTCATGTTCGGTGGAAAATTGTAAACCAAATAAACCGGCATCGGTATTGGTCGATGTGTACCCGTGGGCTCTGTAATAAGACTGTCCGTGCCTGCAAATTAGTACTG

More
CDS seq

ATGCGATCTATTGATGAAACAGACATATCCACATTGAACATGGACCAGCTTAGCCAAATTGAAAGATTACTGGAAGATGAACTAAGGTGGACAAGGGCAAGAAAGGTGGTGGTGGATAGAAGTGCCAGATTACAAAAAAAGGTGCAGGGGAAAGCGGCGATTGTTGAGGTTGAGAGGGGCTCCATGGAGATTCCCATAGAATCTGGGCAGGAGAAGGAACAGATAGGAGGGGAGGCTGTGGAGGAGCAACGGAGCCGGACTACGCCGTTGGACCTCAACATGCCTTGCTGGGACGCAGGTCCTCTGCAGTAA

Protein seq

MRSIDETDISTLNMDQLSQIERLLEDELRWTRARKVVVDRSARLQKKVQGKAAIVEVERGSMEIPIESGQEKEQIGGEAVEEQRSRTTPLDLNMPCWDAGPLQ

Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
LOC_Os04g31790 LOC_Os04g31790.1 Chr04 19020396 19037720 + MSU_osa1r7
CDS seq

ATGCGATCTATTGATGAAACAGACATATCCACATTGAACATGGACCAGCTTAGCCAAATTGAAAGATTACTGGAAGATGAACTAAGGTGGACAAGGGCAAGAAAGGTGGTGGTGGATAGAAGTGCCAGATTACAAAAAAAGGTGCAGGGGAAAGCGGCGATTGTTGAGGTTGAGAGGGGCTCCATGGAGATTCCCATAGAATCTGGGCAGGAGAAGGAACAGATAGGAGGGGAGGCTGTGGAGGAGCAACGGAGCCGGACTACGCCGTTGGACCTCAACATGCCTTGCTGGGACGCAGGTCCTCTGCAGTAA

More
Protein seq

MRSIDETDISTLNMDQLSQIERLLEDELRWTRARKVVVDRSARLQKKVQGKAAIVEVERGSMEIPIESGQEKEQIGGEAVEEQRSRTTPLDLNMPCWDAGPLQ

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.577330 0.392714 0.478153

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0011170 RBH 0.0 0.0 0.000000
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0011950 RBH 0.0 1.280246 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0011650 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0011320 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0011560 RBH 0.000000 4.083606 0.000000
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0303200 RBH 0.171687 2.554403 14.1562615
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0010510 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0299600 RBH 3.00095 5.116234 0.063361
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0011160 RBH 0.0 0.288828 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0010750 RBH 0.0 6.275567 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0010790 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0011280 RBH 0.000000 0.0 0.429238
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0011490 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G010650 RBH 0.0 0.0 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0010720 RBH 0.0 0.0 0.0
Powered by

© 2021- Rice Gene Index @Zhang Lab. All Rights Reserved.

National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement

Huazhong Agricultural University

Any comments and suggestions, please contact us.