Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
LOC_Os01g37580 OGI:01066220 | 3/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU Chr01:21010563-21022694
Gene Symbol -
DNA seq

ATGTTCGCCCCCTCCTCGCCCCCTTTTTTCCCTCTTCCTTATGCGCGCATTCGACGGGAACGGGCAGCTCGGTCGCTGATGGGTGGCCCTGCCGCTGTGTACGGTGGGTGGCCCTGCTGCTATAGTTGGGGTGGGTAGATGTTGCCCTGTGAAAATTGCCCAGGTGTGCGTTTTTTGATCGCGCGTGTGGTGGTGGGCAGACGTGTGGGTCCCATTTTTTATGGCGAGGGTGGTTGTGGACAGAGGGGTGGGCCCCACAAATGTACTGCTTGGCCAATCGGTGTTAGACAACGTGGTACAGATCTGCCCGAGACGGCGTCCCACGCAAGAAAGGCGCCATATTTTTCTCCTCTTCTTTTCTTCCGCTTCTTCTCCAGCCTAATCCTCTTTGCTTCGACTGTACTGCTCTTCCGTCTTGCTGTCCCTTTTGTTCCGCTTCTTCTCCGGCCTCTCTGTTGCTGTTCGTGGCTATGGCGAGGTATGTGCTATCCTCGCATCGACTGTGCTTGGTGGCGGAGTTCCTTGTGCTTACTTCGTGTGTGCTTCTTGCAGCGACCTCACTGCCGATTGATAGGAGGACACCTTCTTGTGTGATTTCGCGTTTTGGCCAGGTCAGCGACACCTTTGTTTCTTCTTTTTCTTGATCCATCTTATGCTTGCTTCATCTTTTGTTTGTGTGCTGTGCAGGGAGGGCTTCTTTCCGTCCGAACCGGCTGAGGTCCTTTCTTTCCTCTGGTTTTCTTCCTCCTTGTGGCGGGTGCTGTGACAGTTCCGGTGCGTGGCGGCGAAGGTGCTTTCTTGCTCTGGCTGTTATTTAAAATTTTTGGGTGCTTGCATTTTTTTTTGCGCACCTTTATTCCTTGCTCTATTGCATTATATGTTTGGTGGGTGAGAGGGGCCGGGGAGTGGGGGGGGCGCTAACCGTTGGTGGGGCTGACGCATCGTCAGCGCTTTTTTTCCCACGCTTGACGAAAGGGACAGATATAGTGTCTCCTGGTCTTGGCCCTGTATACTTGCCCTATATGTTGCTTCTTGACGATTTCTTCTTGCACACTGCCTCCTTCCTCACCTTCATCCTTTAAAGTACTGTTTAAGGGTGGTTTATCTCCTGTTTGAAAACTCTCTCTGCAATTCGCAGTGCTGTTGGTGGGATGGCCGTTGTTGGGGTTTCGTTCGTTTCGTTGTTGAATGCTGCAGCTTCTCATTGCCGGTTGCCCTTGGTGTCATACCTTTGGGAGCTTGATGGGCATGGTACGCTGTTAGCTGGTGTAGAGCTTATCCTTCCGCCTGAAGACCCTGCCAGTGGTCAGGCTCACCCATCCAACAATCTGGCTAGGAAGTTCTTTTGGGTTGCTGCAACAGATCCGCTAATTGTTTCACACGAGATGGTTGCTCAGCAGGTTGTTAGGTTCATGCAAGCAAAGTACCGGTTCGCTGTTCATGACTACAATTTTCACATGCTGCTTTCCTATAGAAAGATTGCATCCTCTGCAGTGGATGCTGCTCTCACAGCGGCTTCATGTCTTGCTAGGCTCCAGTCACGCTATGGGGCGCTAGATCTGCCGTGTGAGGGTGTGCTGGGCCAGTGCAAATCACTTTGGTTTAGTTTTCTTAGGGAAGAACACTTCTTCTATAGCACACAACAACCTTAGAGCAGAGTTTGGGTTTACTTTGTAATGCTGAGTTGGTTTGTATTGCCAGGATCCTTGCAGTTAATTTAGCTATTTCTGTTCCGTGCATTCATTCTTTTGTGTATACATGCTTGCGTTGAGATTGTGTTCTGAGCTGGATTGTTTGATGCATTTGTCTTTCAAGAAACGTTGCAGGGAACAGTGTTTTGTGATTTAGGATTTGTGGCAGATGTCAGGTCGTGCAGCATTGCGTGTTCAGCGCGCACGTGAAAGCCGGCTAAGGCGGCATGCTTCCATAGGCCAGGGTCTGTTGTCCATGCGTTTCTGATATATGTTTGCTTTTGGTTTCTGGGACAGGTAAGTAAACATATTGGTTTGGTCCAATAGGCTACTTGCAGGCTCCCATTTTTGCTGCCGTAGGTTCTAGCTCCTCACAGTCAGTCAACCATTCCATGTGTTCTGTCCTGGTTCAATCTGTACATGTTGGGCAGCAGGGTACCAGTGCTGGTGCAGGACCATCCATGGAACAGCCCATTGACAGTGAGCCTTTGGTAGGAAATGCCAAAAGTAAGCCAGATTTTGATAAAATAAACCGAAAAACTATTTTGACCAAACAAACGAAGCGAGGCTCGGATAGTGCTCTAAGTATTTTTGAACACATAGGGAAAAGTTCATTGCTAGATATACCACGAAGTGCTGCTGCCGTTAATAGGGAAAGGCGGCGTATGAAAATATCTGGTGGTCAGACAAACCATTCTCTCGATGGTATTCTTAACGGTACGATTTTTCGGTGTCCCTTACCTTGGTTATGCCTTCCATGTGTCCCTGCGGGGTAAAAAAGGGTTGACTCACCGCATACTGCTTATTTTGCACACAATTTTGGTTCGCATAGGTCCCACGCCCAGTGCTGATGACATCTTGCCTTTGCCAAAAGACTATATTGCGTCCTTGAAAGGTTTGTTGTGTTGCATACTACACCAATTTCTTCAGCTTTACTGTCTGTCGTACTCTCATATCAATGCTGTGCAGCTTTGTACCCTCATCAGTCCTACTATGGTGGTCCATCTCATGAATGTCCACACTGCGGTGCCGTTTTCTGGTACCAGGAGAGGGTAAAGAAAGGATCTGTAGTCTCGCAGCGCAAGATTCTGTACAACCTATGCTGTAGAGGTGGTAAGATTAGTCTGCCTGAATTGAAAAAACCACCTTCTTTGCTAGCAGAACTGTTAAAATTTGATGGTAGTGTGCGATCAAAAAGATTCTTACGCCAGATCCGATCATATAACTCTCTTTTTGCGTTTACTTCCTCAGGAGCCAACATTGATAAGACGATAAACAATGGGACCGCACCTTGTGTGTTCAAGATTAATGGGGTTGTCCACCAAGGTATTGGCAGCCTGCTGCCACAGCAAGGCTCACGACCTAAATTTGCACAACTTTACATATATGACACTGAAAATGAAACTGCAAACAGAATGAATATTTACGAAAAAGACAATCCTTCTGATGAACCAGACCCAGACATTGTTAATGGGCTTAGTTCTATGCTTGATGAGCATAATGATTTGGTTAAGGCATTCCGCTTTGCTAGAGATCGGCTAAAAGATAATGGTGATCAAAAGATTGCACTTAGATTGCTTGGTTGTGATTCAAGAGATGAAATCCAGTACAATTTGCCAACGAGTGGTGATATTGCTGGTATAGTAGCTGGAGATTACTCAGCTGGCGAATACATGTATGATGTGATGGTTTAGTCTTGCGATGCTAGATTGCGACGTGTCTCAGCTTTGCACCCATCCTATATGGCTCTTCAGTACCCTTTGCTCTTTCCTTATGGTGAACGAGGATTCCATCTAGGTATAAAGTACACTGACTTTCCTAGCATCACTGGTGCCTCCAGACGCTATGTTACCATGCTTGAGTACTACCACTATCGTTTACATTACCGATTGAACAAACCAAATCCATATACTTGCTGTGGTCGTCTTAGCGATTCCTTATGTGTTGACTCATACTCAACTGTTGAGTAATCTAGGCTTAAGTACATTTTCGACAACCAGCCCGACCTGCGTTCTGAATCTGTCCAGGGAATAGCTGATGCGATTGATCATGGTCTTGATTCCGGGGATTCTGTCGGCCAATGATATGTGCTGCCCTCCAGTTTTACTGGAGGGCGTCGTTACATGGTTCAAAATTACCAAGATGCGATGGCTATTTGTCGGGTTTTTGGTTCACCTGATCTTTTTGTGACCTTTACATGCAACTCAAAGTGGCAAGAAATATATGATGCTTTGCTGTTTGAGCCAGGCCAGGTGCCAAGCGATCGTTCCGATATGATTGTGAGGGTGTTTAACATGAAAGTGAATGAATTCATTTCAGATATTAGAGAAGGAAAGACATTTGGTCCAGTCCTTGCTAGTAGGATGTTTACCTAGTTTCTAAGTTCCATTTTTATGTTCTGTATAGGTCCTAACATTGGCTATCCCTATATGTAGTGTTATATACAGTTGAGTTCCAAAAGCGTGGCCTTCCTCATATCCATTGCCTGGTTTGGCTTGCTGCAGGAAATATTGAGTTTAGTGCTCCTATTGTCGATGGTTTTATTTCCGCTGAAATACCTGATGTGCTAACCGACCCTTTAGGCTATGCCTTGGTTGATGAATTTATGATCCATGGCCCTTGTGGCGATGTGAACAAAACATGCTCCTGTATGAAGAAGGGAGAGTGCTCTAAGCATTTCCCTAAATCTTTTCAAGAAGAGACCATCATGGATGAATTTGTATTCACTGTTTACAAACGTAGCAATGATGGTCGGTATGTTCTCAAAAATGGTATTAAACTTGACAACAGATGGGTTGTTCCCTACAACATGGAACTTCTGAAAAAATACCAGGCTCAGATTAATGTAGAATGGTGCAATAAATCTAATATGATTAAATATCTCTTCAAATATGTCACTAAAGGGGCGGATAGAACAAAAGCATTCTTTGAGATTTCTGGAAATGCACCGAACAAACCAGCTGAAAACTGTACTGCTCCACGAAATGAAATACAAGAATATATCGATGCAAGATTTCTGTCCACCTGTGAGTCCCTTTGGCATGCATTTGAATTTGACATTCACTACAGAGTGCCTTCTGTAGAACGCCTAGCTGTGCACCTTCCAAACATGAACTTTGTCCGATACAAAAAAGGTTCTGACCTAAAGTCCTTGCTATCCAGCCCTGTAGCCAAAAAAACGATGCTAACCGAGTGGTTCGAGGCTAACAGAAAACATAACAGTGCACGAACGCTTACTTACTGTGATTTTCCGAGAGAGTGGACATGGGACAGCATCTCACGTAGTTGGCGTCCTAGAACACCATGTGAAAAAATAGGCAGGATATACTATGTCAGCCCAGTTAGCGGTGAGCTCTACTACCTACGAATGCTATTAATGATAGTGAAAGGTGCAACGTGCTATGCTGATGTTAGGACCTATGATGGTATCGTTTATCCGACCTTTAGGCAAGCATGCGAGGCAAGAGGCCTACTTGAAAGCGATAACGAATGGCACTTGCTATTTGATGAGGCTATAGTATCTGCGTCTTCGGGCCAATTGAGACAGTTGTTTGCTCCCGTTGTAATGTTTTGTTCTGTTGGATATGTGCGCTCGCTCTTTGAAAAATATTGGACATATTTTACCGATGACATTCAGCGACGTGTCAGAACTGCTTTATCGAATCCTTCGTACGTAATACCTCCTGATAGGCTCCTGTCTCTATTAATGAAAGAACTTCACATTGTGTTTTCAAACAGTGGTGGTAGCATTGATGATTACGACTTACCGCAGCCGGCAATTTATTCAGATGACATTACAGGAAATAGGATGGTTGACGAAGAACTTGCTCTTGATGTTGCGGCCCTAACTGCAGAAGCTAATTTGAATATACCTAGGCTAAATACTGATCAAAGAAATGTTTTCAACACAATCATGCAACGGGTGAACGAAAACAGGCCTGGGTTATTCTTTGTCTATGGCCATGGTGGGACAGGCAAAACATTTTTGTGGAATACACTGATTTCTAAAATAAGATCCGAGAAAAAAATTGTTCTAGCGGTTGCCTCCTCAGGGGTTGCCTCTCTACTCCTACCTAGAGGGCGCACTGCTCATTCTAGATTTAAAATCCCGATCGACATAGATGAAAACAACATTTGCACCATTAAAAGAGGAACTATGCTTGCAGATTTGATTCAGAAAACGTCTCTTATAATCTGGGATGAGGCTCCCATGACTCATAGACGATGCTTTGAGGCCTTAGATCGAACGTTACGTGATTTGCTTTCTGAGCACACGCCTTCTAACAGCATTGTTCCGTTCGGTGGTAAAGTTGTTGTTCTTGGAGGTGATTTCCGTCAAATATTGCCGGTCATAAGAAAAGGTTCACGTGCTTCTATAGTCGATGCATCCATCACGAACTCTCCTCTTTGGCGGCATGTTGTTCTTCTTAGACTGACAATAAACATGAGACTTCTTCATGGTAACGTTACTGACCAAAACCGTGTCGATCTTAGCAACTTTGGCGATTGGGTCCTAGCACTTGGTGACGGTAGGTTGCCTGCAACAAAAAAGCTTGACGAATTTGAGCCAACATGGATTGATATCCCTGATGACCTTTTGATCAAGACATGCGGTGACAAAATAAGGGCTATAGTAGATGAGATCTTTCCACACTTTGCAAATTGCTATACAGATCATTCTTACCTTGCATGTCGGGCAATTGTTTGCCCGAATAACTCAACAGTTGATGAAATAAATGATTGTATTGTTGACATGATACCCAGCGACGCAAAGGAGTATTTAATATGTGATACAATTTCAAAATCAAGAGATCATTTACCTGACTTTGACATCCTTTACCCCCTGAATTTTTGAATTCAATTAATGTCAACAACTTCCCATCGCACAAGCTTGTGCTCAAAAAAGGTGTGACGATTATGCTACTACGAAACCTAAATCAATCTATGGGTCTATGCAATGGGACAAGGTTATTGGTCACTTCTCTTGGTAATAGGTTGTTAGAGTGTGTAATTTTAACTGGGACAAATATTGGCGAGACAACATTCATACCACGAATTGCACTTACCACCACAAGTCCTAAGTGGCCTTTTACGCTTTAGAGAAGACAGTTCCCTGTTCGTGTTTGTTATGCAATGACGATTAACAAGAGCCAAGGACAAACCCTTTCACGAGTCAGCGTGTACTTGAAAAAACCTGTGTTCACACATGGGCAACTTTATGTTGCTGTTTCTAGATCAACATCAAGAGAAGGTCTTAGGATTCTCATAGAGGATGAGGACGAGGCATGTTGTACGAAAACCAAAAATGTTGTTTACCAAGAAGTACTGCAAGCAGTCACATCTATGGTATACTTTGATGTCTGGTTTTCCTGGATGATCCCTAGCTAAATTACCAGGATGCCATACCATGCACTAATATATTAAATCTTTACAATTGCAGGATGTTTGTACCTAGCTATCACTCGCACTACCCATGTTTGATGCTGTTGTGCGCCTCTGTTTTTCTGCTCTTCATTGTCCATGTGAATTTTTTTCCGTATATTCATCTAATGACCTCTTAACTTGCACACTTAGCTTCTTCAAAATTTCAATGTGCGCTGATCTCTCAAACCAAATGTTTTTTTTGCTATGTTTACATATGGGTGAAGTACAGATTCCTAACCTTGAGCTCGGTGATGGGAATCCAACTCTATTGGTACGTGTATCAAGGTTATGGGAATATCATGACCAGGACGATGAAGGCGACTTACGCCATATTGGTCTTGTTTTGGTTGGTGAGAAGGTGATTGCTTTGCGAACTTTATCTGCTGTAAAACCTGAGCAATATGTCATTTGTTTTACTGACAGTATTGTTTCATTAGGGATATGCCATTGCTGCTATGATTTATCCTCCATGGGGCAAGAAATTCAAACCACTGATCAGCGAAGGCAAGGTCTACTTGCTTACCTACTATCGGGTCAAGCCATGCACCAAACATTACAGGCCAGTTGACAACAAGATGATGATCAATTTCACCAGATGGACTGGTATAGAAGAATATGTTGACGTACAAGCTGGCTTTGGTCACTATGCTTATACTCTCACACCTTACCAAGAGCTCCGCTCTCGTGTCGACAGGAAAGACTCTTTCACAGGTACTGCAGATATGGTTCTATAATTGGTTATCTATTATATTACTACCTCTGGTTTGCTCACACATGTGTTTTGTTCTTGCTCTCAAAATAACAGATGTGATTGGAGTGATCACTGACATATCATCTGTGACAACTGTTCGGACACGTGTTAGAGACAGTGACAGTTTAAAAAGGAATGTCTACATGCGCAATGCTGAGTTAGCACTCATCCCTTATTTACTACTCCATATTATTAATGCATTTTCTGATGTTTTCTAACCCCTCTCAAATAATCTGTCATCTACATCAGACAATCACTGTCATAACATTTTTCTTTCATACTGGGCATATTGCCTTGCCCTGACAACTGCTTTTATTCCAACACACCACTGTTTTGGGTTTGAGACTAACTACTTACCATACCACAATTCCTCTTTGATTTCTTTTAAACATACACAACATAGAAATGAGACAACAAATATTGTGTTATGGGGAGAAAGAGCTACAAGCTTTCCTGCAGATGAAATTCTCAGTGCTGGCAAGGAGAAGCCACAGATAGTTATCTTTGTTGGCACACTTGTCAGGGGACATGGATGTAAGTCAATTAGCTTCCTTGCTTGCATTTTGTCCTATGTTTTCAGCTGTTGTTCTCATAGCGTGGGACACTGTTGTTATAGGGAATGTTTCGTTGTCGGGTAACTCTGCTTGCAAATGGTACATAAATATTGATGTGCCAGAGGTCAACACCCTCGCTGCTAGGTTTATTCTCTACACTTCGCTATCAGACAATGTTCTCTTAGCTTACTTTGTCCTGATTTTTTGAGCTAAACTGATTCTTTTTGTGCAGTGTTGAAGGGAATTACGAGGCAATCAAATGGATTGATCTCCCAGCTGCACCTATTCTTCAGAACAACTGTGAACAGAAGACAATCGCTGAGATAAGAGACCCGCACCCTTTTAAGTTCAAGGTGTGACCTTGCTATAGTCACTTCATGAACTTATAATCTGCATTATGCCATGAACTGTGTTAACTGTTTCCGTCTGATGTTAATAGAAACATGAATTCTCAGTGACTGTCGTGATAAAGAAACTTAACATGGAGTATTCTTGGTGGTATACTGCATGCGATATATGCAAGAAGACAGCAAAGCCATATGGAAATCTATATAGGTGTGGAAACAGCACATGCCCCCCAACTGGCTCAGCTTCACCTAGGTGAGTCGTGATAAAGCAATTGAAGCAATACAGACACCGATACATTACAGCTAATGCTACATTACATTCTGTAGGTTCAAACTCAGTGTGATAGCAGGAGATGACACAGGAGATACTACATTTATTATCTTTGGGCATTTAGCGCAGAGGCTGATTGGTCGTTCAGTTGAGGCACTGATGCTGGAAAATCCAACTGGCAAGGGCTGCATATCCAGAGAGATCACTGATCTGCTTGAGAAAGAATTTGTGTGGAATGTGAGTTTCACAGAGAACACGGTCTCTAGCGGCATTGTTGCTTTTCAAGTGAACAGAGTTGTTAAGGGTGCTCAGAGTCATTCCCTTGCTCTCTTGCAATCTCCATCTGGATCCCAGACATCTTCTCTGATGCCTTGCATGGCTCTATCGCCGGTTGCATCTCAGGATACTTCCATTGGCCAGCCCATAGCAGCCAGCCCATCAGCTGGGTTCAGTGATGCTCAACGCACTCTGAGTAGCCCACCAATCAATACAGAAAAGGATAAGAACACAGGAAATGAATATGCATCCAAGAGTCCTGCACAGGATGCTGGTGATAATGAAGATTGTTATGAGGTCAGTTTGTTTTATGCCTGACTTTGTAGCATATATATATTGCATATCATATTTGCTAACTCTATCTACTGTCAAATAGGATGATGAGGCAGTCAGCCTTACACAAGTGGCTTCTGCCCCTGCAACTAAGAACAGCACCTCAAAGGCGTACAAAAAAAGGTACATCACTTCATTTCTTTATCCATCAGAGTACCGGGTGCAAACCTTTCTGCCAAGCTAACTGGAAACCGAAACACACAAAAACAGGCCTAGGCCATCTCCTGGAACTGGTGCTGCTAAGAAACTGTTCAAAGATGATGCTGCTGATGATACTGATGGTGCCACTGGTGGCAGGTATAATGATAGTGGTTGTCTCTGACGGTATATGAAAGATCTTCTGCATCTCTAACATGATGTTTCCTACATACTTGCAGTGCCATCAGCAAGGCCTGATACATCAAGCAGAATGGCTATTGTTTTTTGCTCTGTTAGCCTTGATCCTGAGAAGCCCAGCATTACTAAAAGGCTTTTCTTCACACCGATCAAAAGGAATCTATGGCTAATGTTATTATGATAATTCTAGAGACTGCGTTGTTGCCGTGTTGCATGAGTGCATGTCAAACCAATTAAGCTAGACTTACTCCTTTTGCAAACAGACTTTTAGGTGAACATCCATTATCTATGTGGCTGGGATTCCACATTATCATGATTCATCGTGATAATGCTGAATGCTGTCAGATGGTAACAAACTGTAGCTTTTGCAATGGCAACATAACTCTGTATGGCTAGATTATCATGATCAGTCGTAATGATGTTGGATGCTAACAGATGGTGGCAAATATTATATCTCCTCGCATGTTAGCATTGCCTCGCATAGCTGGTATTGACTGCTATTAAACTATCGTAACATGTGTGCTATTTCTCACATAGAAGCGTGCAAAAAACTTATCAGCTCCAGCGTTTTAGATAGACATAACAACCCAAATCTTAAACCACACAATTCACATGGCAAACAAAATTGATTCGTTCTCCAAACCGTAACCAACATCACCCAACCTACACAGTATGAAAACAATAAACATAATTATGCTCAGCTGCCACCTGCCCTCGAAAAGACTTGGAAAAGACAACACAGGTAGCAGCATGGCAAGCTATTCCCCTATTCTTTCCAGACCCCCATACTCTAATCCTGCTCTATCACTATCCATTTCTCTAGCAAGTTCTCTCTCCCTAGCTCTCCCCCTCTTTCGTTTCTGAGAAACCATCCTTCTCTTCTTTCATCTTCTTCAGTCCATTTTTCATCTCCACCTATTTTTTCTCTGATTGTTCCCTCATCTTCAACTCTTCTTTGCGGATTCCTACTTACAAGACAGGGGCAACATCTTCTTTGTTCCCCTTTCGTCGTCTTAATCAGTGCTAGGTACCACAAAGCATTGAATCTACCTTACTTCTATCTAATTTCAATCTTCATATTATGTTTGTCGGCTCTATTATTGCCTGATACAGATAAGAAGAGAAACCCAGAGTAGATGTACCTTTAGGAAAACCTAAACTCCCGATAGACAAGATAGTTGTTTTTTGCATGTCAAATGCAAACACATTTACTAGCAATCTTCTTTGTTATTCTGTACAGCAACATGGAACCCGACAGCAACAGGCAGATTACAATGCCGGTAACACAACCATCATCTTATGCAAGGAAACGACCCCTAGCAGCAGCAAAGTTTTCAGACAGAAAAGAAACCTCGCAATTGCTAGTAGATATTATATACCGAGACTCAGTAGTTGTCAAGGTACTTGGAGCTGGCAATCCAAGCACCACACAAATATCTGCAATGGTAGGGTTTGTGTGTGACTGTCAAACTGATGATTTTGCCTTGCTTCCATTCCGGCACAGAATGTACCTTATTATTTTCATGGATCACAGCAAACAAGAAGAGCAACAGCAGAAAGCAATAGCCCAAAAAACATTCACTTTCCGAACAACAAAGCTTGAATTTGGACCCTTCGAAATGAATTTCGGCAGCACTGCAAGTCCATTGCGCCAGAGAGTGATACTGGCATTAGAAGGGGTTCCACCTGAATCATGGAACAAGGAAGCTATATCAGACCTGCTTGACAACAACTGCAGAATTGAAAAAATATATGCAGAGAGCACCATATCCAAGATCTTTCTGTGTTTAGATTGGCTGCATGGACAACAAACTGTGATCTTATCCCCAAGATTATAGAATGGAACATTGAGACAAATCAGGAAGGGGAGCAATGTACTGATCTCAAGTGGAAACCAAACGGTGATCTATCTATCATACTTATTCACATTGAAAAGTTATTCGACTATAGCAATGAAAACAATACAACTGAAGACAATCAAGGAGATCTCACAGAGTATGAGAAGACAAAGCAGCGCTTGCCGATCATGAAGACATTCCAATGGACCCCTGGTCAGATTGACTCTGATTATGGTCCAATCGAAGGAGGGTCACCGTTAGTGCCACCTCTCGACCTTGACAAAAAAAACTGGTTTGATCCTGACCAGTAG

More
CDS seq

ATGTTCGCCCCCTCCTCGCCCCCTTTTTTCCCTCTTCCTTATGCGCGCATTCGACGGGAACGGGCAGCTCGGTCGCTGATGGGTGGCCCTGCCGCTGTGTACGGGAGGGCTTCTTTCCGTCCGAACCGGCTGAGGTCCTTTCTTTCCTCTGGTTTTCTTCCTCCTTGTGGCGGGTGCTGTGACAGTTCCGCTTCTCATTGCCGGTTGCCCTTGGTGTCATACCTTTGGGAGCTTGATGGGCATGGTACGCTGTTAGCTGGTGTAGAGCTTATCCTTCCGCCTGAAGACCCTGCCAGTGGTCAGGCTCACCCATCCAACAATCTGGCTAGGAAGTTCTTTTGGGTTGCTGCAACAGATCCGCTAATTGTTTCACACGAGATGGTTGCTCAGCAGGTTGTTAGGTTCATGCAAGCAAAGTACCGGTTCGCTGTTCATGACTACAATTTTCACATGCTGCTTTCCTATAGAAAGATTGCATCCTCTGCAGTGGATGCTGCTCTCACAGCGGCTTCATGTCTTGCTAGGCTCCAGTCACGCTATGGGGCGCTAGATCTGCCGTGTGAGGGTTCTAGCTCCTCACAGTCAGTCAACCATTCCATGTGTTCTGTCCTGGTTCAATCTGTACATGTTGGGCAGCAGGGTACCAGTGCTGGTGCAGGACCATCCATGGAACAGCCCATTGACAGTGAGCCTTTGGTAGGAAATGCCAAAAGGAAAAGTTCATTGCTAGATATACCACGAAGTGCTGCTGCCGTTAATAGGGAAAGGCGGCGTATGAAAATATCTGGTGGTCAGACAAACCATTCTCTCGATGGTATTCTTAACGGTCCCACGCCCAGTGCTGATGACATCTTGCCTTTGCCAAAAGACTATATTGCGTCCTTGAAAGCTTTGTACCCTCATCAGTCCTACTATGGTGGTCCATCTCATGAATGTCCACACTGCGGTGCCGTTTTCTGGTACCAGGAGAGGGTAAAGAAAGGATCTGTAGTCTCGCAGCGCAAGATTCTGTACAACCTATGCTGTAGAGGTGGAGCCAACATTGATAAGACGATAAACAATGGGACCGCACCTTGTGTGTTCAAGATTAATGGGGTTGTCCACCAAGGTATTGGCAGCCTGCTGCCACAGCAAGGCTCACGACCTAAATTTGCACAACTTTACATATATGACACTGAAAATGAAACTGCAAACAGAATGAATATTTACGAAAAAGACAATCCTTCTGATGAACCAGACCCAGACATTGTTAATGGGCTTAGTTCTATGCTTGATGAGCATAATGATTTGGTTAAGGCATTCCGCTTTGCTAGAGATCGGCTAAAAGATAATGGTGATCAAAAGATTGCACTTAGATTGCTTGGTTGTGATTCAAGAGATGAAATCCAGTACAATTTGCCAACGAGTGGTGATATTGCTGGAAATATTGAGTTTAGTGCTCCTATTGTCGATGGTTTTATTTCCGCTGAAATACCTGATGTGCTAACCGACCCTTTAGGCTATGCCTTGGTTGATGAATTTATGATCCATGGCCCTTGTGGCGATGTGAACAAAACATGCTCCTGTATGAAGAAGGGAGAGTGCTCTAAGCATTTCCCTAAATCTTTTCAAGAAGAGACCATCATGGATGAATTTGTATTCACTGTTTACAAACGTAGCAATGATGGTCGGTATGTTCTCAAAAATGGTATTAAACTTGACAACAGATGGGTTGTTCCCTACAACATGGAACTTCTGAAAAAATACCAGGCTCAGATTAATGTAGAATGGTGCAATAAATCTAATATGATTAAATATCTCTTCAAATATGTCACTAAAGGGGCGGATAGAACAAAAGCATTCTTTGAGATTTCTGGAAATGCACCGAACAAACCAGCTGAAAACTGTACTGCTCCACGAAATGAAATACAAGAATATATCGATGCAAGATTTCTGTCCACCTGTGAGTCCCTTTGGCATGCATTTGAATTTGACATTCACTACAGAGTGCCTTCTGTAGAACGCCTAGCTGTGCACCTTCCAAACATGAACTTTGTCCGATACAAAAAAGGTTCTGACCTAAAGTCCTTGCTATCCAGCCCTGTAGCCAAAAAAACGATGCTAACCGAGTGGTTCGAGGCTAACAGAAAACATAACAGTGCACGAACGCTTACTTACTGTGATTTTCCGAGAGAGTGGACATGGGACAGCATCTCACGTAGTTGGCGTCCTAGAACACCATGTGAAAAAATAGGCAGGATATACTATGTCAGCCCAGTTAGCGGTGAGCTCTACTACCTACGAATGCTATTAATGATAGTGAAAGGTGCAACGTGCTATGCTGATGTTAGGACCTATGATGGTATCGTTTATCCGACCTTTAGGCAAGCATGCGAGGCAAGAGGCCTACTTGAAAGCGATAACGAATGGCACTTGCTATTTGATGAGGCTATAGTATCTGCGTCTTCGGGCCAATTGAGACAGTTGTTTGCTCCCGTTGTAATGTTTTGTTCTGTTGGATATGTGCGCTCGCTCTTTGAAAAATATTGGACATATTTTACCGATGACATTCAGCGACGTGTCAGAACTGCTTTATCGAATCCTTCGTACGTAATACCTCCTGATAGGCTCCTGTCTCTATTAATGAAAGAACTTCACATTGTGTTTTCAAACAGTGGTGGTAGCATTGATGATTACGACTTACCGCAGCCGGCAATTTATTCAGATGACATTACAGGAAATAGGATGGTTGACGAAGAACTTGCTCTTGATGTTGCGGCCCTAACTGCAGAAGCTAATTTGAATATACCTAGGCTAAATACTGATCAAAGAAATGTTTTCAACACAATCATGCAACGGGTGAACGAAAACAGGCCTGGGTTATTCTTTGTCTATGGCCATGGTGGGACAGGCAAAACATTTTTGTGGAATACACTGATTTCTAAAATAAGATCCGAGAAAAAAATTGTTCTAGCGGTTGCCTCCTCAGGGGTTGCCTCTCTACTCCTACCTAGAGGGCGCACTGCTCATTCTAGATTTAAAATCCCGATCGACATAGATGAAAACAACATTTGCACCATTAAAAGAGGAACTATGCTTGCAGATTTGATTCAGAAAACGTCTCTTATAATCTGGGATGAGGCTCCCATGACTCATAGACGATGCTTTGAGGCCTTAGATCGAACGTTACGTGATTTGCTTTCTGAGCACACGCCTTCTAACAGCATTGTTCCGTTCGGTGGTAAAGTTGTTGTTCTTGGAGGTGATTTCCGTCAAATATTGCCGGTCATAAGAAAAGGTTCACGTGCTTCTATAGTCGATGCATCCATCACGAACTCTCCTCTTTGGCGGCATGTTGTTCTTCTTAGACTGACAATAAACATGAGACTTCTTCATGGTAACGTTACTGACCAAAACCGTGTCGATCTTAGCAACTTTGGCGATTGGGTCCTAGCACTTGGTGACGCTTGTGCTCAAAAAAGGTGTGACGATTATGCTACTACGAAACCTAAATCAATCTATGGGTCTATGCAATGGGACAAGATTCCTAACCTTGAGCTCGGTGATGGGAATCCAACTCTATTGGTACGTGTATCAAGGTTATGGGAATATCATGACCAGGACGATGAAGGCGACTTACGCCATATTGGTCTTGTTTTGGTTGGTGAGAAGGGATATGCCATTGCTGCTATGATTTATCCTCCATGGGGCAAGAAATTCAAACCACTGATCAGCGAAGGCAAGGTCTACTTGCTTACCTACTATCGGGTCAAGCCATGCACCAAACATTACAGGCCAGTTGACAACAAGATGATGATCAATTTCACCAGATGGACTGGTATAGAAGAATATGTTGACGTACAAGCTGGCTTTGGTCACTATGCTTATACTCTCACACCTTACCAAGAGCTCCGCTCTCGTGTCGACAGGAAAGACTCTTTCACAGATGTGATTGGAGTGATCACTGACATATCATCTGTGACAACTGTTCGGACACGTGTTAGAGACAGTGACAGTTTAAAAAGGAATGTCTACATGCGCAATGCTGAAAATGAGACAACAAATATTGTGTTATGGGGAGAAAGAGCTACAAGCTTTCCTGCAGATGAAATTCTCAGTGCTGGCAAGGAGAAGCCACAGATAGTTATCTTTGTTGGCACACTTGTCAGGGGACATGGATCTGTTGTTCTCATAGCGTGGGACACTGTTGTTATAGGGAATGTTTCGTTGTCGGGTAACTCTGCTTGCAAATGTGTTGAAGGGAATTACGAGGCAATCAAATGGATTGATCTCCCAGCTGCACCTATTCTTCAGAACAACTGTGAACAGAAGACAATCGCTGAGATAAGAGACCCGCACCCTTTTAAGTTCAAGAAACATGAATTCTCAGTGACTGTCGTGATAAAGAAACTTAACATGGAGTATTCTTGGTGGTATACTGCATGCGATATATGCAAGAAGACAGCAAAGCCATATGGAAATCTATATAGGTGTGGAAACAGCACATGCCCCCCAACTGGCTCAGCTTCACCTAGGTTCAAACTCAGTGTGATAGCAGGAGATGACACAGGAGATACTACATTTATTATCTTTGGGCATTTAGCGCAGAGGCTGATTGGTCGTTCAGTTGAGGCACTGATGCTGGAAAATCCAACTGGCAAGGGCTGCATATCCAGAGAGATCACTGATCTGCTTGAGAAAGAATTTGTGTGGAATGTGAGTTTCACAGAGAACACGGTCTCTAGCGGCATTGTTGCTTTTCAAGTGAACAGAGTTGTTAAGGGTGCTCAGAGTCATTCCCTTGCTCTCTTGCAATCTCCATCTGGATCCCAGACATCTTCTCTGATGCCTTGCATGGCTCTATCGCCGGTTGCATCTCAGGATACTTCCATTGGCCAGCCCATAGCAGCCAGCCCATCAGCTGGGTTCAGTGATGCTCAACGCACTCTGAGTAGCCCACCAATCAATACAGAAAAGGATAAGAACACAGGAAATGAATATGCATCCAAGAGTCCTGCACAGGATGCTGGTGATAATGAAGATTGTTATGAGGATGATGAGGCAGTCAGCCTTACACAAGTGGCTTCTGCCCCTGCAACTAAGAACAGCACCTCAAAGGCGTACAAAAAAAGGCCTAGGCCATCTCCTGGAACTGGTGCTGCTAAGAAACTGTTCAAAGATGATGCTGCTGATGATACTGATGGTGCCACTGGTGGCAGCAACATGGAACCCGACAGCAACAGGCAGATTACAATGCCGGTAACACAACCATCATCTTATGCAAGGAAACGACCCCTAGCAGCAGCAAAGTTTTCAGACAGAAAAGAAACCTCGCAATTGCTAGTAGATATTATATACCGAGACTCAGTAGTTGTCAAGGTACTTGGAGCTGGCAATCCAAGCACCACACAAATATCTGCAATGGTAGGAGAGCACCATATCCAAGATCTTTCTGTGTTTAGATTGGCTGCATGGACAACAAACTGTGATCTTATCCCCAAGATTATAGAATGGAACATTGAGACAAATCAGGAAGGGGAGCAATGTACTGATCTCAAGTGGAAACCAAACGGTGATCTATCTATCATACTTATTCACATTGAAAAGTTATTCGACTATAGCAATGAAAACAATACAACTGAAGACAATCAAGGAGATCTCACAGAGTATGAGAAGACAAAGCAGCGCTTGCCGATCATGAAGACATTCCAATGGACCCCTGGTCAGATTGACTCTGATTATGGTCCAATCGAAGGAGGGTCACCGTTAGTGCCACCTCTCGACCTTGACAAAAAAAACTGGTTTGATCCTGACCAGTAG

More
Protein seq

MFAPSSPPFFPLPYARIRRERAARSLMGGPAAVYGRASFRPNRLRSFLSSGFLPPCGGCCDSSASHCRLPLVSYLWELDGHGTLLAGVELILPPEDPASGQAHPSNNLARKFFWVAATDPLIVSHEMVAQQVVRFMQAKYRFAVHDYNFHMLLSYRKIASSAVDAALTAASCLARLQSRYGALDLPCEGSSSSQSVNHSMCSVLVQSVHVGQQGTSAGAGPSMEQPIDSEPLVGNAKRKSSLLDIPRSAAAVNRERRRMKISGGQTNHSLDGILNGPTPSADDILPLPKDYIASLKALYPHQSYYGGPSHECPHCGAVFWYQERVKKGSVVSQRKILYNLCCRGGANIDKTINNGTAPCVFKINGVVHQGIGSLLPQQGSRPKFAQLYIYDTENETANRMNIYEKDNPSDEPDPDIVNGLSSMLDEHNDLVKAFRFARDRLKDNGDQKIALRLLGCDSRDEIQYNLPTSGDIAGNIEFSAPIVDGFISAEIPDVLTDPLGYALVDEFMIHGPCGDVNKTCSCMKKGECSKHFPKSFQEETIMDEFVFTVYKRSNDGRYVLKNGIKLDNRWVVPYNMELLKKYQAQINVEWCNKSNMIKYLFKYVTKGADRTKAFFEISGNAPNKPAENCTAPRNEIQEYIDARFLSTCESLWHAFEFDIHYRVPSVERLAVHLPNMNFVRYKKGSDLKSLLSSPVAKKTMLTEWFEANRKHNSARTLTYCDFPREWTWDSISRSWRPRTPCEKIGRIYYVSPVSGELYYLRMLLMIVKGATCYADVRTYDGIVYPTFRQACEARGLLESDNEWHLLFDEAIVSASSGQLRQLFAPVVMFCSVGYVRSLFEKYWTYFTDDIQRRVRTALSNPSYVIPPDRLLSLLMKELHIVFSNSGGSIDDYDLPQPAIYSDDITGNRMVDEELALDVAALTAEANLNIPRLNTDQRNVFNTIMQRVNENRPGLFFVYGHGGTGKTFLWNTLISKIRSEKKIVLAVASSGVASLLLPRGRTAHSRFKIPIDIDENNICTIKRGTMLADLIQKTSLIIWDEAPMTHRRCFEALDRTLRDLLSEHTPSNSIVPFGGKVVVLGGDFRQILPVIRKGSRASIVDASITNSPLWRHVVLLRLTINMRLLHGNVTDQNRVDLSNFGDWVLALGDACAQKRCDDYATTKPKSIYGSMQWDKIPNLELGDGNPTLLVRVSRLWEYHDQDDEGDLRHIGLVLVGEKGYAIAAMIYPPWGKKFKPLISEGKVYLLTYYRVKPCTKHYRPVDNKMMINFTRWTGIEEYVDVQAGFGHYAYTLTPYQELRSRVDRKDSFTDVIGVITDISSVTTVRTRVRDSDSLKRNVYMRNAENETTNIVLWGERATSFPADEILSAGKEKPQIVIFVGTLVRGHGSVVLIAWDTVVIGNVSLSGNSACKCVEGNYEAIKWIDLPAAPILQNNCEQKTIAEIRDPHPFKFKKHEFSVTVVIKKLNMEYSWWYTACDICKKTAKPYGNLYRCGNSTCPPTGSASPRFKLSVIAGDDTGDTTFIIFGHLAQRLIGRSVEALMLENPTGKGCISREITDLLEKEFVWNVSFTENTVSSGIVAFQVNRVVKGAQSHSLALLQSPSGSQTSSLMPCMALSPVASQDTSIGQPIAASPSAGFSDAQRTLSSPPINTEKDKNTGNEYASKSPAQDAGDNEDCYEDDEAVSLTQVASAPATKNSTSKAYKKRPRPSPGTGAAKKLFKDDAADDTDGATGGSNMEPDSNRQITMPVTQPSSYARKRPLAAAKFSDRKETSQLLVDIIYRDSVVVKVLGAGNPSTTQISAMVGEHHIQDLSVFRLAAWTTNCDLIPKIIEWNIETNQEGEQCTDLKWKPNGDLSIILIHIEKLFDYSNENNTTEDNQGDLTEYEKTKQRLPIMKTFQWTPGQIDSDYGPIEGGSPLVPPLDLDKKNWFDPDQ

Function Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit [UniProtKB/Swiss-Prot:Q5R7Q4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
LOC_Os01g37580 LOC_Os01g37580.1 Chr01 21010563 21022694 + MSU_osa1r7
CDS seq

ATGTTCGCCCCCTCCTCGCCCCCTTTTTTCCCTCTTCCTTATGCGCGCATTCGACGGGAACGGGCAGCTCGGTCGCTGATGGGTGGCCCTGCCGCTGTGTACGGGAGGGCTTCTTTCCGTCCGAACCGGCTGAGGTCCTTTCTTTCCTCTGGTTTTCTTCCTCCTTGTGGCGGGTGCTGTGACAGTTCCGCTTCTCATTGCCGGTTGCCCTTGGTGTCATACCTTTGGGAGCTTGATGGGCATGGTACGCTGTTAGCTGGTGTAGAGCTTATCCTTCCGCCTGAAGACCCTGCCAGTGGTCAGGCTCACCCATCCAACAATCTGGCTAGGAAGTTCTTTTGGGTTGCTGCAACAGATCCGCTAATTGTTTCACACGAGATGGTTGCTCAGCAGGTTGTTAGGTTCATGCAAGCAAAGTACCGGTTCGCTGTTCATGACTACAATTTTCACATGCTGCTTTCCTATAGAAAGATTGCATCCTCTGCAGTGGATGCTGCTCTCACAGCGGCTTCATGTCTTGCTAGGCTCCAGTCACGCTATGGGGCGCTAGATCTGCCGTGTGAGGGTTCTAGCTCCTCACAGTCAGTCAACCATTCCATGTGTTCTGTCCTGGTTCAATCTGTACATGTTGGGCAGCAGGGTACCAGTGCTGGTGCAGGACCATCCATGGAACAGCCCATTGACAGTGAGCCTTTGGTAGGAAATGCCAAAAGGAAAAGTTCATTGCTAGATATACCACGAAGTGCTGCTGCCGTTAATAGGGAAAGGCGGCGTATGAAAATATCTGGTGGTCAGACAAACCATTCTCTCGATGGTATTCTTAACGGTCCCACGCCCAGTGCTGATGACATCTTGCCTTTGCCAAAAGACTATATTGCGTCCTTGAAAGCTTTGTACCCTCATCAGTCCTACTATGGTGGTCCATCTCATGAATGTCCACACTGCGGTGCCGTTTTCTGGTACCAGGAGAGGGTAAAGAAAGGATCTGTAGTCTCGCAGCGCAAGATTCTGTACAACCTATGCTGTAGAGGTGGAGCCAACATTGATAAGACGATAAACAATGGGACCGCACCTTGTGTGTTCAAGATTAATGGGGTTGTCCACCAAGGTATTGGCAGCCTGCTGCCACAGCAAGGCTCACGACCTAAATTTGCACAACTTTACATATATGACACTGAAAATGAAACTGCAAACAGAATGAATATTTACGAAAAAGACAATCCTTCTGATGAACCAGACCCAGACATTGTTAATGGGCTTAGTTCTATGCTTGATGAGCATAATGATTTGGTTAAGGCATTCCGCTTTGCTAGAGATCGGCTAAAAGATAATGGTGATCAAAAGATTGCACTTAGATTGCTTGGTTGTGATTCAAGAGATGAAATCCAGTACAATTTGCCAACGAGTGGTGATATTGCTGGAAATATTGAGTTTAGTGCTCCTATTGTCGATGGTTTTATTTCCGCTGAAATACCTGATGTGCTAACCGACCCTTTAGGCTATGCCTTGGTTGATGAATTTATGATCCATGGCCCTTGTGGCGATGTGAACAAAACATGCTCCTGTATGAAGAAGGGAGAGTGCTCTAAGCATTTCCCTAAATCTTTTCAAGAAGAGACCATCATGGATGAATTTGTATTCACTGTTTACAAACGTAGCAATGATGGTCGGTATGTTCTCAAAAATGGTATTAAACTTGACAACAGATGGGTTGTTCCCTACAACATGGAACTTCTGAAAAAATACCAGGCTCAGATTAATGTAGAATGGTGCAATAAATCTAATATGATTAAATATCTCTTCAAATATGTCACTAAAGGGGCGGATAGAACAAAAGCATTCTTTGAGATTTCTGGAAATGCACCGAACAAACCAGCTGAAAACTGTACTGCTCCACGAAATGAAATACAAGAATATATCGATGCAAGATTTCTGTCCACCTGTGAGTCCCTTTGGCATGCATTTGAATTTGACATTCACTACAGAGTGCCTTCTGTAGAACGCCTAGCTGTGCACCTTCCAAACATGAACTTTGTCCGATACAAAAAAGGTTCTGACCTAAAGTCCTTGCTATCCAGCCCTGTAGCCAAAAAAACGATGCTAACCGAGTGGTTCGAGGCTAACAGAAAACATAACAGTGCACGAACGCTTACTTACTGTGATTTTCCGAGAGAGTGGACATGGGACAGCATCTCACGTAGTTGGCGTCCTAGAACACCATGTGAAAAAATAGGCAGGATATACTATGTCAGCCCAGTTAGCGGTGAGCTCTACTACCTACGAATGCTATTAATGATAGTGAAAGGTGCAACGTGCTATGCTGATGTTAGGACCTATGATGGTATCGTTTATCCGACCTTTAGGCAAGCATGCGAGGCAAGAGGCCTACTTGAAAGCGATAACGAATGGCACTTGCTATTTGATGAGGCTATAGTATCTGCGTCTTCGGGCCAATTGAGACAGTTGTTTGCTCCCGTTGTAATGTTTTGTTCTGTTGGATATGTGCGCTCGCTCTTTGAAAAATATTGGACATATTTTACCGATGACATTCAGCGACGTGTCAGAACTGCTTTATCGAATCCTTCGTACGTAATACCTCCTGATAGGCTCCTGTCTCTATTAATGAAAGAACTTCACATTGTGTTTTCAAACAGTGGTGGTAGCATTGATGATTACGACTTACCGCAGCCGGCAATTTATTCAGATGACATTACAGGAAATAGGATGGTTGACGAAGAACTTGCTCTTGATGTTGCGGCCCTAACTGCAGAAGCTAATTTGAATATACCTAGGCTAAATACTGATCAAAGAAATGTTTTCAACACAATCATGCAACGGGTGAACGAAAACAGGCCTGGGTTATTCTTTGTCTATGGCCATGGTGGGACAGGCAAAACATTTTTGTGGAATACACTGATTTCTAAAATAAGATCCGAGAAAAAAATTGTTCTAGCGGTTGCCTCCTCAGGGGTTGCCTCTCTACTCCTACCTAGAGGGCGCACTGCTCATTCTAGATTTAAAATCCCGATCGACATAGATGAAAACAACATTTGCACCATTAAAAGAGGAACTATGCTTGCAGATTTGATTCAGAAAACGTCTCTTATAATCTGGGATGAGGCTCCCATGACTCATAGACGATGCTTTGAGGCCTTAGATCGAACGTTACGTGATTTGCTTTCTGAGCACACGCCTTCTAACAGCATTGTTCCGTTCGGTGGTAAAGTTGTTGTTCTTGGAGGTGATTTCCGTCAAATATTGCCGGTCATAAGAAAAGGTTCACGTGCTTCTATAGTCGATGCATCCATCACGAACTCTCCTCTTTGGCGGCATGTTGTTCTTCTTAGACTGACAATAAACATGAGACTTCTTCATGGTAACGTTACTGACCAAAACCGTGTCGATCTTAGCAACTTTGGCGATTGGGTCCTAGCACTTGGTGACGCTTGTGCTCAAAAAAGGTGTGACGATTATGCTACTACGAAACCTAAATCAATCTATGGGTCTATGCAATGGGACAAGATTCCTAACCTTGAGCTCGGTGATGGGAATCCAACTCTATTGGTACGTGTATCAAGGTTATGGGAATATCATGACCAGGACGATGAAGGCGACTTACGCCATATTGGTCTTGTTTTGGTTGGTGAGAAGGGATATGCCATTGCTGCTATGATTTATCCTCCATGGGGCAAGAAATTCAAACCACTGATCAGCGAAGGCAAGGTCTACTTGCTTACCTACTATCGGGTCAAGCCATGCACCAAACATTACAGGCCAGTTGACAACAAGATGATGATCAATTTCACCAGATGGACTGGTATAGAAGAATATGTTGACGTACAAGCTGGCTTTGGTCACTATGCTTATACTCTCACACCTTACCAAGAGCTCCGCTCTCGTGTCGACAGGAAAGACTCTTTCACAGATGTGATTGGAGTGATCACTGACATATCATCTGTGACAACTGTTCGGACACGTGTTAGAGACAGTGACAGTTTAAAAAGGAATGTCTACATGCGCAATGCTGAAAATGAGACAACAAATATTGTGTTATGGGGAGAAAGAGCTACAAGCTTTCCTGCAGATGAAATTCTCAGTGCTGGCAAGGAGAAGCCACAGATAGTTATCTTTGTTGGCACACTTGTCAGGGGACATGGATCTGTTGTTCTCATAGCGTGGGACACTGTTGTTATAGGGAATGTTTCGTTGTCGGGTAACTCTGCTTGCAAATGTGTTGAAGGGAATTACGAGGCAATCAAATGGATTGATCTCCCAGCTGCACCTATTCTTCAGAACAACTGTGAACAGAAGACAATCGCTGAGATAAGAGACCCGCACCCTTTTAAGTTCAAGAAACATGAATTCTCAGTGACTGTCGTGATAAAGAAACTTAACATGGAGTATTCTTGGTGGTATACTGCATGCGATATATGCAAGAAGACAGCAAAGCCATATGGAAATCTATATAGGTGTGGAAACAGCACATGCCCCCCAACTGGCTCAGCTTCACCTAGGTTCAAACTCAGTGTGATAGCAGGAGATGACACAGGAGATACTACATTTATTATCTTTGGGCATTTAGCGCAGAGGCTGATTGGTCGTTCAGTTGAGGCACTGATGCTGGAAAATCCAACTGGCAAGGGCTGCATATCCAGAGAGATCACTGATCTGCTTGAGAAAGAATTTGTGTGGAATGTGAGTTTCACAGAGAACACGGTCTCTAGCGGCATTGTTGCTTTTCAAGTGAACAGAGTTGTTAAGGGTGCTCAGAGTCATTCCCTTGCTCTCTTGCAATCTCCATCTGGATCCCAGACATCTTCTCTGATGCCTTGCATGGCTCTATCGCCGGTTGCATCTCAGGATACTTCCATTGGCCAGCCCATAGCAGCCAGCCCATCAGCTGGGTTCAGTGATGCTCAACGCACTCTGAGTAGCCCACCAATCAATACAGAAAAGGATAAGAACACAGGAAATGAATATGCATCCAAGAGTCCTGCACAGGATGCTGGTGATAATGAAGATTGTTATGAGGATGATGAGGCAGTCAGCCTTACACAAGTGGCTTCTGCCCCTGCAACTAAGAACAGCACCTCAAAGGCGTACAAAAAAAGGCCTAGGCCATCTCCTGGAACTGGTGCTGCTAAGAAACTGTTCAAAGATGATGCTGCTGATGATACTGATGGTGCCACTGGTGGCAGCAACATGGAACCCGACAGCAACAGGCAGATTACAATGCCGGTAACACAACCATCATCTTATGCAAGGAAACGACCCCTAGCAGCAGCAAAGTTTTCAGACAGAAAAGAAACCTCGCAATTGCTAGTAGATATTATATACCGAGACTCAGTAGTTGTCAAGGTACTTGGAGCTGGCAATCCAAGCACCACACAAATATCTGCAATGGTAGGAGAGCACCATATCCAAGATCTTTCTGTGTTTAGATTGGCTGCATGGACAACAAACTGTGATCTTATCCCCAAGATTATAGAATGGAACATTGAGACAAATCAGGAAGGGGAGCAATGTACTGATCTCAAGTGGAAACCAAACGGTGATCTATCTATCATACTTATTCACATTGAAAAGTTATTCGACTATAGCAATGAAAACAATACAACTGAAGACAATCAAGGAGATCTCACAGAGTATGAGAAGACAAAGCAGCGCTTGCCGATCATGAAGACATTCCAATGGACCCCTGGTCAGATTGACTCTGATTATGGTCCAATCGAAGGAGGGTCACCGTTAGTGCCACCTCTCGACCTTGACAAAAAAAACTGGTTTGATCCTGACCAGTAG

More
Protein seq

MFAPSSPPFFPLPYARIRRERAARSLMGGPAAVYGRASFRPNRLRSFLSSGFLPPCGGCCDSSASHCRLPLVSYLWELDGHGTLLAGVELILPPEDPASGQAHPSNNLARKFFWVAATDPLIVSHEMVAQQVVRFMQAKYRFAVHDYNFHMLLSYRKIASSAVDAALTAASCLARLQSRYGALDLPCEGSSSSQSVNHSMCSVLVQSVHVGQQGTSAGAGPSMEQPIDSEPLVGNAKRKSSLLDIPRSAAAVNRERRRMKISGGQTNHSLDGILNGPTPSADDILPLPKDYIASLKALYPHQSYYGGPSHECPHCGAVFWYQERVKKGSVVSQRKILYNLCCRGGANIDKTINNGTAPCVFKINGVVHQGIGSLLPQQGSRPKFAQLYIYDTENETANRMNIYEKDNPSDEPDPDIVNGLSSMLDEHNDLVKAFRFARDRLKDNGDQKIALRLLGCDSRDEIQYNLPTSGDIAGNIEFSAPIVDGFISAEIPDVLTDPLGYALVDEFMIHGPCGDVNKTCSCMKKGECSKHFPKSFQEETIMDEFVFTVYKRSNDGRYVLKNGIKLDNRWVVPYNMELLKKYQAQINVEWCNKSNMIKYLFKYVTKGADRTKAFFEISGNAPNKPAENCTAPRNEIQEYIDARFLSTCESLWHAFEFDIHYRVPSVERLAVHLPNMNFVRYKKGSDLKSLLSSPVAKKTMLTEWFEANRKHNSARTLTYCDFPREWTWDSISRSWRPRTPCEKIGRIYYVSPVSGELYYLRMLLMIVKGATCYADVRTYDGIVYPTFRQACEARGLLESDNEWHLLFDEAIVSASSGQLRQLFAPVVMFCSVGYVRSLFEKYWTYFTDDIQRRVRTALSNPSYVIPPDRLLSLLMKELHIVFSNSGGSIDDYDLPQPAIYSDDITGNRMVDEELALDVAALTAEANLNIPRLNTDQRNVFNTIMQRVNENRPGLFFVYGHGGTGKTFLWNTLISKIRSEKKIVLAVASSGVASLLLPRGRTAHSRFKIPIDIDENNICTIKRGTMLADLIQKTSLIIWDEAPMTHRRCFEALDRTLRDLLSEHTPSNSIVPFGGKVVVLGGDFRQILPVIRKGSRASIVDASITNSPLWRHVVLLRLTINMRLLHGNVTDQNRVDLSNFGDWVLALGDACAQKRCDDYATTKPKSIYGSMQWDKIPNLELGDGNPTLLVRVSRLWEYHDQDDEGDLRHIGLVLVGEKGYAIAAMIYPPWGKKFKPLISEGKVYLLTYYRVKPCTKHYRPVDNKMMINFTRWTGIEEYVDVQAGFGHYAYTLTPYQELRSRVDRKDSFTDVIGVITDISSVTTVRTRVRDSDSLKRNVYMRNAENETTNIVLWGERATSFPADEILSAGKEKPQIVIFVGTLVRGHGSVVLIAWDTVVIGNVSLSGNSACKCVEGNYEAIKWIDLPAAPILQNNCEQKTIAEIRDPHPFKFKKHEFSVTVVIKKLNMEYSWWYTACDICKKTAKPYGNLYRCGNSTCPPTGSASPRFKLSVIAGDDTGDTTFIIFGHLAQRLIGRSVEALMLENPTGKGCISREITDLLEKEFVWNVSFTENTVSSGIVAFQVNRVVKGAQSHSLALLQSPSGSQTSSLMPCMALSPVASQDTSIGQPIAASPSAGFSDAQRTLSSPPINTEKDKNTGNEYASKSPAQDAGDNEDCYEDDEAVSLTQVASAPATKNSTSKAYKKRPRPSPGTGAAKKLFKDDAADDTDGATGGSNMEPDSNRQITMPVTQPSSYARKRPLAAAKFSDRKETSQLLVDIIYRDSVVVKVLGAGNPSTTQISAMVGEHHIQDLSVFRLAAWTTNCDLIPKIIEWNIETNQEGEQCTDLKWKPNGDLSIILIHIEKLFDYSNENNTTEDNQGDLTEYEKTKQRLPIMKTFQWTPGQIDSDYGPIEGGSPLVPPLDLDKKNWFDPDQ

More
Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0646700 SBH 2.131787 1.586235 5.235670
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0646700 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0040120 SBH 0.673040 0.000000 4.264167
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0039580 SBH 0.267528 0.426021 3.273119
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0026120 SBH 0.000000 2.830213 12.929478
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0039450 SBH 0.414962 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0025160 SBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0356200 RBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0347400 RBH 0.002202 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0025220 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Powered by

© 2021- Rice Gene Index @Zhang Lab. All Rights Reserved.

National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement

Huazhong Agricultural University

Any comments and suggestions, please contact us.