Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsZS97_11G0098500 | OGI:11012660 | 2/16 | Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | Chr11:6219074-6222939 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
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Transcripts
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| OsZS97_11G0098500 | OsZS97_11T0098500-mRNA-1 | Chr11 | 6219074 | 6221526 | + | makerRMon | ||
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| OsZS97_11G0098500 | OsZS97_11T0098500-mRNA-5 | Chr11 | 6219074 | 6222939 | + | makerRMon | ||
| CDS seq | ATGGCTACTCCCGCTAGGTTTTCAACTAAGCCTCATATTTTCGATGGAACTGATTTTCCTCATTGGTGTAGTAAGATACAATCTTACATTATGGCTGAAAATTGTGATATTTGGAGGAAAGTTTCTCATCCTAATGTGATTTCTGAAGCCATTAATACTGATGCTTTAAAAACTGAATTTGAAAACAATTGCAAAGCTCGTAATATTCTTTTGAGTGGGATTTCTCGTTCTGATTATGATCGTGTTGCACATCTTGAAACTGCTCATGAGATTTGGAATACTTTAAAAAACTTTCATCAAGGAACAAATAATATTAAAGAGCTTCGTCGAGATCTTTTTAAAAAGGAGTACATTAAATTTGAGATGAAATCTGAAGAGGCTTTGGATGACTATCTTTCTAGATTTAATAAAATTTTGAGTGATCTTAGATCTGTTGATTCTTCTTATGATGCTAATTATCCACAATCTGAGATTTCTCGTCACTTTTTGAATGGTCTCAACATGTCTATTTGGGAGATGAAAGTTACATCTATTCAGGAGTCTGTTAACATTTCTACTTTGACTTTGGATTCACTTTATACTAAATTGAAAACACATAAGATGAATATTCTTTCTCGCAAAGTTGATTCTAAATCGAGTGCTTTGGTTTCTTCTTCTTCTTCTTTGGTTGTTGATGCTTCTTCAGCTATGCCTTCTTTTCTTGCTACTTTTAATGCCACATCCGATGATCAACTCGAACAAATCAAGGAGGAGGATTTGGCTTTGGTCGCTAACAGAATTGCTCGAGCTATGAATAATGCCAGGAACAGGAAAAGAGGTGGTCCAAATCGTTGCTTTGAATGTGGTTCAATTGATCATCTTCGTTCGCATTGTCCTAAGCTTGGGAGAGGCAAAAGAGAAGACAAAGATGGTGAGAAGACCAACAACAACAAGCCCAACAACTACAAGTCGAAGGGTTCTAATCAAGGGAGGAAGATGGAGAATCTTAGGAAGGCTTTTCAACAAGTTTGCGCCGCTTTCGAGCCACTAAGTGATGTAGATGGTGAAAGTGGAGATGATGACAAGGGAAATAACGTCTCCGATGTTTGCTTCATGGCGCGTGGTGAATCTGACACAGAGCATGAAGACAATGAGGTGGGTGCTTTTGAGGAAGCTATTAATATCTTTAAAATAAAAAGTGAATTTATTATTGAATCTCTTAAATCTGAAATTGATAGGTTAAAATCTCTTATTCCTAATGATGATGATTGTGAAAATTGTGAGGTTTTAATGAATGAGATTTCAAAAATTAGAGATGTTAGTGCTGCAAATGATTTGAAAAATGGATCTTCTCTTGCTTGTTGTTTTGCTTTGCACACACGCACTTTGGATGAGTTGCTTTTAACTAAAAAGTTGTTGCAAAAATATCAAATTGCTTTTCATGCTAGTTTGATGTTTAACATGATTTCTGCTAAAAAGTTAAAACAACCTTATGATGTTTTGGATTGCTCAACATGTAATTTGAACAAGATGAAACTAAAAGATGCTTTAGGTCGTGTTGAGTATATGGAAGATGTTGTGAAAAACAATGAAGTGCTTTCTTGCCCCAAATGTCGTAAAAGCAAAAGTGTCCTGGTAGATTGTGAAAATTGTGCTAATTTGGAAAAAGAGGTTTCTTATTTGAAAAATTCCTTGCTAAGATTTTCTGATGCTTTGGCGGCAAGGAAAGAGAACGTGTGGATCGTGGATTCCGGTTGTTCGCGGCACATGACCGGTGATAAAAATTGGTTCTCCTCCCTCAAAAAGGCATCCAAGACTGAATCAATTGTCTTTGCTGATGCTTCTACTAGTGCCGTTGTCGCTACAGGTTTGGTTAAGAAAACTGGAAGTAAAGTTTTTGATTCTTGTGGTGATTCTGTGCTGAATATTTCTCGCTATGGAAGAGTGTTTAAAGCTGATTTTGAAAATTCTGTTTCACCTATGATAACATGTTTGGTTGCTAATTTTGATAAAGATGTGATGTTTTGGCATCGTAGACTTGGACATGTTGGTTTTGATCATCTCACTAGGTTAAGTGGTTTGGATCTTGTTCGTGGTTTGCCTAAACTTAAGAAAGATCTTGATTTGGTTTGTACACCGTGTCGTCATGCTAAGATGGTTTCTACTTCACATGTTCCTATTGTTTCTGTGATGACGGATGCACCGGGACAGCTATTACATATGGACACTGTTGGTCTAGCTAGAGTGCAATCTGTTGGAGGAAAGTGGTATGTGTTGGTTATAGTTGACGATTTTTCTCGATATTCTTGGGTTTTCTTTATGGCAACTAAGGATGAAGCTTTTCAACACTTTCGTGGTTTGTTTCTTCGATTGGAGCTTGAATTTCCTGGTTCTTTGAAAAGAATTCGAAGTGATAATGGTGGAGAGTTTAAAAATGCTTCATTTGAACAATTTTGCAACGAAAGAGGTCTTGAACATGAATTTTCTTCTCCTCGTGTTCCTCAACAAAACGGTGTTGTTAAAAGGAAAAATCGTGTTTTGGTTGAGATGGCTAGAACGATGTTGGATGAATACAAAACTCCTAGAAAATTTTGGGCTGAGGCGATTAACACTGCTTGCGATATTTCAAATCGAGTTTTCTTGCGTTCTAAACTTGGAAAAACTTCTTACGAACTTCGATTTGGTCATCAACCCAAAGTTTCACATTTGCGTGTTTTTGGTTGCAAATGTTTTGTCTTGAAATCTGGAAATTTGGATAAGTTTGAGGCACGTTCTACCGATGGATTGTTTCTTGGTTACCCCGCACATACTCGTGGCTATCGTGTACTTATTTTAGGGACTAACAAAATTGTCGAGACTTGCGAAGTTTCTTTTGATGAGGCTAGTCCTGGTACTAGACCCGATACTGCAGGTACACTGTCACAGGTTCAGGGGGAGGATGGTCGTATTTTTGAAGATGAGAGCGACTACGACGACGACGACGAGGTCGGCTCGGCCGGTCAGACCGGGCGCTAG
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| Protein seq | MATPARFSTKPHIFDGTDFPHWCSKIQSYIMAENCDIWRKVSHPNVISEAINTDALKTEFENNCKARNILLSGISRSDYDRVAHLETAHEIWNTLKNFHQGTNNIKELRRDLFKKEYIKFEMKSEEALDDYLSRFNKILSDLRSVDSSYDANYPQSEISRHFLNGLNMSIWEMKVTSIQESVNISTLTLDSLYTKLKTHKMNILSRKVDSKSSALVSSSSSLVVDASSAMPSFLATFNATSDDQLEQIKEEDLALVANRIARAMNNARNRKRGGPNRCFECGSIDHLRSHCPKLGRGKREDKDGEKTNNNKPNNYKSKGSNQGRKMENLRKAFQQVCAAFEPLSDVDGESGDDDKGNNVSDVCFMARGESDTEHEDNEVGAFEEAINIFKIKSEFIIESLKSEIDRLKSLIPNDDDCENCEVLMNEISKIRDVSAANDLKNGSSLACCFALHTRTLDELLLTKKLLQKYQIAFHASLMFNMISAKKLKQPYDVLDCSTCNLNKMKLKDALGRVEYMEDVVKNNEVLSCPKCRKSKSVLVDCENCANLEKEVSYLKNSLLRFSDALAARKENVWIVDSGCSRHMTGDKNWFSSLKKASKTESIVFADASTSAVVATGLVKKTGSKVFDSCGDSVLNISRYGRVFKADFENSVSPMITCLVANFDKDVMFWHRRLGHVGFDHLTRLSGLDLVRGLPKLKKDLDLVCTPCRHAKMVSTSHVPIVSVMTDAPGQLLHMDTVGLARVQSVGGKWYVLVIVDDFSRYSWVFFMATKDEAFQHFRGLFLRLELEFPGSLKRIRSDNGGEFKNASFEQFCNERGLEHEFSSPRVPQQNGVVKRKNRVLVEMARTMLDEYKTPRKFWAEAINTACDISNRVFLRSKLGKTSYELRFGHQPKVSHLRVFGCKCFVLKSGNLDKFEARSTDGLFLGYPAHTRGYRVLILGTNKIVETCEVSFDEASPGTRPDTAGTLSQVQGEDGRIFEDESDYDDDDEVGSAGQTGR
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.006186 | 0 | 0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g07800 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | NA | NA | NA | NA | NA |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0099700 | SBH | 0.2578545 | 0.6772905 | 0.120578 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0097300 | RBH | 0.0122875 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
